Doublet Group distance statistics: 52848

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.011, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N1	A	0, -0.003, 0.018, 0.039, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.018 std_dev=0.021
C2	A	0, -0.002, 0.025, 0.052, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.025 std_dev=0.027
C1'	A	0, -0.001, 0.027, 0.055, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.027 std_dev=0.028
C4	A	0, -0.002, 0.027, 0.055, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.027 std_dev=0.028
C6	A	0, -0.003, 0.026, 0.056, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.026 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.010, 0.060, 0.110, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.060 std_dev=0.050
O2	A	0, -0.005, 0.054, 0.114, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.054 std_dev=0.059
C5'	B	0, 0.001, 0.083, 0.165, 0.195 max_d=0.195 avg_d=0.083 std_dev=0.082
O5'	B	0, -0.003, 0.083, 0.168, 0.201 max_d=0.201 avg_d=0.083 std_dev=0.086
P	B	0, 0.005, 0.095, 0.185, 0.215 max_d=0.215 avg_d=0.095 std_dev=0.090
C2'	B	0, -0.001, 0.091, 0.182, 0.216 max_d=0.216 avg_d=0.091 std_dev=0.092
C3'	B	0, -0.003, 0.092, 0.187, 0.222 max_d=0.222 avg_d=0.092 std_dev=0.095
O3'	B	0, -0.011, 0.085, 0.181, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.085 std_dev=0.096
C4'	B	0, -0.007, 0.095, 0.196, 0.236 max_d=0.236 avg_d=0.095 std_dev=0.102
C5'	A	0, 0.007, 0.109, 0.210, 0.245 max_d=0.245 avg_d=0.109 std_dev=0.102
C4'	A	0, -0.003, 0.099, 0.201, 0.239 max_d=0.239 avg_d=0.099 std_dev=0.102
OP1	B	0, 0.001, 0.104, 0.207, 0.245 max_d=0.245 avg_d=0.104 std_dev=0.103
O4'	B	0, -0.011, 0.098, 0.206, 0.249 max_d=0.249 avg_d=0.098 std_dev=0.109
P	A	0, 0.017, 0.129, 0.241, 0.273 max_d=0.273 avg_d=0.129 std_dev=0.112
C1'	B	0, -0.013, 0.099, 0.212, 0.256 max_d=0.256 avg_d=0.099 std_dev=0.112
O2'	B	0, 0.007, 0.127, 0.247, 0.289 max_d=0.289 avg_d=0.127 std_dev=0.120
N1	B	0, -0.016, 0.104, 0.225, 0.273 max_d=0.273 avg_d=0.104 std_dev=0.121
O5'	A	0, 0.014, 0.141, 0.269, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.141 std_dev=0.127
OP1	A	0, 0.023, 0.151, 0.280, 0.315 max_d=0.315 avg_d=0.151 std_dev=0.129
C6	B	0, -0.014, 0.115, 0.245, 0.296 max_d=0.296 avg_d=0.115 std_dev=0.129
C3'	A	0, -0.009, 0.124, 0.256, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.124 std_dev=0.133
OP2	B	0, 0.010, 0.151, 0.292, 0.339 max_d=0.339 avg_d=0.151 std_dev=0.141
O4	A	0, -0.032, 0.114, 0.261, 0.321 max_d=0.321 avg_d=0.114 std_dev=0.147
C5	B	0, -0.019, 0.142, 0.303, 0.367 max_d=0.367 avg_d=0.142 std_dev=0.161
C2'	A	0, -0.028, 0.137, 0.303, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.137 std_dev=0.165
OP2	A	0, -0.003, 0.173, 0.349, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.173 std_dev=0.176
C4	B	0, -0.020, 0.161, 0.341, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.161 std_dev=0.181
O3'	A	0, -0.018, 0.197, 0.411, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.197 std_dev=0.215
N4	B	0, -0.021, 0.205, 0.431, 0.520 max_d=0.520 avg_d=0.205 std_dev=0.226
C2	B	0, -0.047, 0.185, 0.418, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.185 std_dev=0.232
N3	B	0, -0.039, 0.205, 0.450, 0.548 max_d=0.548 avg_d=0.205 std_dev=0.244
O2	B	0, -0.085, 0.264, 0.614, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.264 std_dev=0.349
O2'	A	0, -0.088, 0.307, 0.702, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.307 std_dev=0.395

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.03	0.09	0.03
C2	0.01	0.00	0.09	0.05	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.05	0.01	0.02	0.10	0.07	0.11	0.07
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.12	0.01	0.08	0.01	0.04	0.05	0.12	0.07	0.00	0.00	0.15	0.00	0.03	0.04	0.16	0.06
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.07	0.05	0.03	0.01	0.09	0.00	0.02	0.03	0.13	0.03
C4	0.02	0.00	0.12	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.09	0.00	0.01	0.10	0.06	0.11	0.06
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.01
C5	0.01	0.00	0.08	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.06	0.01	0.01	0.09	0.05	0.10	0.06
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.09	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.04	0.01	0.00	0.08	0.05	0.10	0.05
N1	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.03	0.01	0.01	0.08	0.05	0.10	0.05
N3	0.02	0.00	0.12	0.07	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.08	0.00	0.01	0.10	0.07	0.11	0.07
O2	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.04	0.00	0.05	0.12	0.10	0.11	0.10
O2'	0.04	0.10	0.00	0.03	0.16	0.10	0.12	0.09	0.06	0.05	0.15	0.07	0.00	0.01	0.21	0.09	0.04	0.04	0.14	0.00
O3'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.09	0.02	0.06	0.03	0.04	0.03	0.08	0.04	0.01	0.00	0.12	0.01	0.09	0.03	0.09	0.02
O4	0.02	0.01	0.15	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.12	0.00	0.02	0.09	0.05	0.11	0.05
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.02	0.00	0.07	0.04	0.07	0.03
O5'	0.05	0.10	0.03	0.02	0.10	0.01	0.09	0.00	0.08	0.08	0.10	0.12	0.04	0.09	0.09	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.03	0.07	0.04	0.03	0.06	0.02	0.05	0.02	0.05	0.05	0.07	0.10	0.04	0.03	0.05	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.09	0.11	0.16	0.13	0.11	0.08	0.10	0.05	0.10	0.10	0.11	0.11	0.14	0.09	0.11	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.07	0.06	0.03	0.06	0.01	0.06	0.01	0.05	0.05	0.07	0.10	0.00	0.02	0.05	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.03	0.07	0.08	0.05	0.08	0.14	0.07	0.14	0.05	0.02	0.04	0.08	0.06	0.10	0.06	0.06	0.06	0.03	0.04
C2	0.01	0.15	0.01	0.04	0.08	0.05	0.02	0.04	0.05	0.04	0.15	0.09	0.20	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.04	0.02
C2'	0.20	0.16	0.19	0.18	0.20	0.18	0.27	0.14	0.28	0.21	0.16	0.18	0.13	0.20	0.20	0.19	0.11	0.05	0.04	0.05
C3'	0.19	0.17	0.18	0.17	0.23	0.16	0.31	0.13	0.28	0.21	0.18	0.22	0.13	0.20	0.18	0.17	0.11	0.07	0.00	0.07
C4	0.01	0.17	0.04	0.08	0.08	0.08	0.02	0.06	0.05	0.04	0.16	0.10	0.25	0.02	0.10	0.03	0.07	0.10	0.00	0.05
C4'	0.13	0.08	0.14	0.13	0.17	0.12	0.26	0.11	0.23	0.14	0.10	0.17	0.03	0.14	0.14	0.12	0.10	0.07	0.01	0.07
C5	0.04	0.17	0.01	0.03	0.08	0.02	0.02	0.02	0.04	0.07	0.15	0.08	0.24	0.02	0.06	0.03	0.03	0.07	0.04	0.02
C5'	0.13	0.09	0.14	0.13	0.18	0.13	0.26	0.11	0.23	0.15	0.10	0.18	0.04	0.14	0.14	0.13	0.10	0.08	0.01	0.07
C6	0.04	0.14	0.02	0.01	0.06	0.01	0.03	0.00	0.04	0.06	0.13	0.06	0.21	0.03	0.04	0.03	0.01	0.04	0.07	0.00
N1	0.01	0.12	0.01	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.07	0.03	0.11	0.05	0.17	0.01	0.06	0.01	0.03	0.05	0.06	0.01
N3	0.01	0.17	0.03	0.06	0.09	0.07	0.01	0.05	0.05	0.04	0.18	0.11	0.24	0.01	0.08	0.04	0.06	0.08	0.02	0.04
O2	0.01	0.14	0.02	0.02	0.10	0.04	0.01	0.02	0.03	0.05	0.16	0.11	0.18	0.03	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.01
O2'	0.37	0.32	0.40	0.38	0.34	0.34	0.41	0.32	0.44	0.37	0.31	0.30	0.29	0.42	0.38	0.33	0.27	0.15	0.10	0.17
O3'	0.25	0.25	0.26	0.24	0.31	0.21	0.37	0.19	0.33	0.27	0.27	0.31	0.22	0.28	0.24	0.22	0.18	0.12	0.08	0.13
O4	0.09	0.11	0.13	0.17	0.05	0.15	0.06	0.12	0.10	0.03	0.12	0.08	0.20	0.12	0.20	0.11	0.13	0.16	0.06	0.10
O4'	0.07	0.02	0.08	0.09	0.08	0.09	0.18	0.08	0.17	0.07	0.01	0.07	0.07	0.08	0.10	0.08	0.07	0.06	0.02	0.04
O5'	0.14	0.07	0.12	0.14	0.09	0.15	0.15	0.12	0.16	0.12	0.05	0.06	0.04	0.12	0.16	0.15	0.11	0.09	0.00	0.08
OP1	0.18	0.16	0.17	0.17	0.21	0.16	0.25	0.14	0.23	0.19	0.17	0.22	0.13	0.19	0.18	0.17	0.13	0.10	0.03	0.09
OP2	0.25	0.21	0.24	0.24	0.22	0.24	0.26	0.21	0.26	0.24	0.20	0.18	0.18	0.25	0.25	0.24	0.20	0.19	0.12	0.17
P	0.17	0.13	0.16	0.16	0.16	0.16	0.21	0.13	0.20	0.17	0.12	0.14	0.09	0.17	0.18	0.17	0.12	0.10	0.02	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02
C2	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.03	0.04	0.01	0.03	0.03	0.02
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.05	0.06	0.05
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.05	0.04
C4	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.07	0.08	0.07
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01
C5	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.08	0.09	0.09	0.10
C5'	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.01	0.05	0.04	0.02	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00
C6	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.07	0.08	0.08	0.09
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.04
N3	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.02	0.03	0.05	0.05	0.04
N4	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.08	0.09	0.08
O2	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.04	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02
O2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.05	0.00	0.04	0.06	0.09	0.06
O3'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.05	0.00	0.01	0.05	0.08	0.06	0.06
O4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00
O5'	0.02	0.01	0.04	0.03	0.06	0.01	0.08	0.00	0.07	0.03	0.03	0.06	0.02	0.04	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.03	0.03	0.05	0.05	0.07	0.03	0.09	0.02	0.08	0.05	0.05	0.08	0.01	0.06	0.08	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.02	0.03	0.06	0.05	0.08	0.01	0.09	0.01	0.08	0.04	0.05	0.09	0.02	0.09	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.02	0.05	0.04	0.07	0.01	0.10	0.00	0.09	0.04	0.04	0.08	0.02	0.06	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00