Doublet Group distance statistics: 52857

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 2, 5, 8, 18, 27, 6, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.011, 0.022, 0.034, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.022 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.012, 0.027, 0.042, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.027 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.016, 0.032, 0.048, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.032 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.018, 0.041, 0.065, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.041 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.023, 0.047, 0.071, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.047 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.028, 0.056, 0.084, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.056 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.025, 0.144, 0.262, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.144 std_dev=0.119
C2'	A	0, 0.060, 0.180, 0.300, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.180 std_dev=0.120
C2	B	0, 0.327, 0.494, 0.661, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.494 std_dev=0.167
N1	B	0, 0.375, 0.551, 0.727, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.551 std_dev=0.176
N3	B	0, 0.465, 0.648, 0.832, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.648 std_dev=0.183
C4'	A	0, 0.060, 0.248, 0.436, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.248 std_dev=0.188
C4	B	0, 0.699, 0.894, 1.089, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.894 std_dev=0.195
C2'	B	0, 0.357, 0.558, 0.758, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.558 std_dev=0.200
C6	B	0, 0.599, 0.834, 1.068, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.834 std_dev=0.234
O2'	A	0, 0.059, 0.300, 0.541, 1.810 max_d=1.810 avg_d=0.300 std_dev=0.241
C3'	A	0, 0.039, 0.288, 0.537, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.288 std_dev=0.249
C5	B	0, 0.752, 1.012, 1.272, 1.409 max_d=1.409 avg_d=1.012 std_dev=0.260
C1'	B	0, 0.494, 0.759, 1.025, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.759 std_dev=0.265
C5'	A	0, 0.173, 0.453, 0.734, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.453 std_dev=0.280
C3'	B	0, 0.536, 0.820, 1.105, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.820 std_dev=0.285
O5'	A	0, 0.229, 0.515, 0.802, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.515 std_dev=0.287
N4	B	0, 0.938, 1.230, 1.521, 1.913 max_d=1.913 avg_d=1.230 std_dev=0.291
O2	B	0, 0.425, 0.718, 1.011, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.718 std_dev=0.293
P	A	0, 0.411, 0.714, 1.018, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.714 std_dev=0.303
OP2	A	0, 0.678, 1.024, 1.370, 1.794 max_d=1.794 avg_d=1.024 std_dev=0.346
O3'	B	0, 0.518, 0.869, 1.221, 1.802 max_d=1.802 avg_d=0.869 std_dev=0.351
O2'	B	0, 0.852, 1.211, 1.570, 2.309 max_d=2.309 avg_d=1.211 std_dev=0.359
OP1	A	0, 0.367, 0.746, 1.126, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.746 std_dev=0.379
O4'	B	0, 0.846, 1.242, 1.638, 2.106 max_d=2.106 avg_d=1.242 std_dev=0.396
O3'	A	0, 0.041, 0.479, 0.918, 2.805 max_d=2.805 avg_d=0.479 std_dev=0.438
C4'	B	0, 0.956, 1.416, 1.877, 2.508 max_d=2.508 avg_d=1.416 std_dev=0.461
O5'	B	0, 1.361, 1.916, 2.472, 3.147 max_d=3.147 avg_d=1.916 std_dev=0.556
C5'	B	0, 1.385, 1.983, 2.581, 3.359 max_d=3.359 avg_d=1.983 std_dev=0.598
P	B	0, 1.954, 2.729, 3.505, 4.321 max_d=4.321 avg_d=2.729 std_dev=0.775
OP2	B	0, 1.058, 2.170, 3.281, 4.480 max_d=4.480 avg_d=2.170 std_dev=1.112
OP1	B	0, 2.952, 4.088, 5.224, 5.528 max_d=5.528 avg_d=4.088 std_dev=1.136

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.11	0.07	0.36	0.12
C2	0.02	0.00	0.12	0.12	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.18	0.06	0.24	0.14	0.33	0.15
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.07	0.08	0.10	0.12	0.07	0.07	0.03	0.00	0.04	0.01	0.21	0.20	0.31	0.14
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.10	0.01	0.14	0.03	0.14	0.17	0.13	0.10	0.16	0.18	0.10	0.02	0.01	0.01	0.24	0.26	0.22	0.15
C4	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.10	0.03	0.25	0.14	0.33	0.16
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.04	0.04	0.07	0.09	0.05	0.12	0.03	0.00	0.02	0.10	0.30	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.12	0.02	0.33	0.21	0.34	0.22
C5'	0.03	0.05	0.07	0.03	0.07	0.01	0.11	0.00	0.11	0.13	0.08	0.04	0.14	0.15	0.07	0.05	0.09	0.01	0.01	0.12	0.26	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.13	0.03	0.34	0.23	0.35	0.24
C8	0.01	0.01	0.08	0.17	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.13	0.15	0.05	0.34	0.20	0.33	0.21
N1	0.02	0.00	0.10	0.13	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.15	0.05	0.30	0.19	0.34	0.20
N3	0.02	0.00	0.12	0.10	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.17	0.06	0.21	0.11	0.33	0.13
N6	0.01	0.01	0.07	0.16	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.18	0.16	0.04	0.38	0.28	0.37	0.29
N7	0.01	0.01	0.07	0.18	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.15	0.16	0.04	0.38	0.25	0.35	0.27
N9	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.07	0.01	0.23	0.12	0.33	0.14
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.13	0.12	0.15	0.05	0.17	0.13	0.17	0.15	0.18	0.15	0.09	0.00	0.08	0.09	0.13	0.18	0.33	0.12
O3'	0.11	0.18	0.04	0.01	0.10	0.03	0.12	0.09	0.13	0.15	0.15	0.17	0.16	0.16	0.07	0.08	0.00	0.08	0.23	0.38	0.27	0.23
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.05	0.06	0.04	0.04	0.01	0.09	0.08	0.00	0.07	0.09	0.41	0.19
O5'	0.11	0.24	0.21	0.24	0.25	0.02	0.33	0.01	0.34	0.34	0.30	0.21	0.38	0.38	0.23	0.13	0.23	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.14	0.20	0.26	0.14	0.10	0.21	0.12	0.23	0.20	0.19	0.11	0.28	0.25	0.12	0.18	0.38	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.36	0.33	0.31	0.22	0.33	0.30	0.34	0.26	0.35	0.33	0.34	0.33	0.37	0.35	0.33	0.33	0.27	0.41	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.15	0.14	0.15	0.16	0.06	0.22	0.02	0.24	0.21	0.20	0.13	0.29	0.27	0.14	0.12	0.23	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.19	0.18	0.16	0.17	0.15	0.18	0.16	0.16	0.14	0.18	0.20	0.30	0.27	0.17	0.15	0.32	0.50	0.61	0.34
C2	0.16	0.22	0.15	0.15	0.22	0.14	0.28	0.23	0.22	0.15	0.22	0.29	0.36	0.23	0.15	0.14	0.45	0.82	1.15	0.64
C2'	0.14	0.19	0.14	0.14	0.17	0.13	0.19	0.17	0.17	0.13	0.19	0.20	0.30	0.23	0.14	0.12	0.35	0.53	0.62	0.36
C3'	0.14	0.17	0.14	0.16	0.17	0.15	0.20	0.18	0.19	0.14	0.18	0.19	0.26	0.22	0.18	0.14	0.35	0.56	0.50	0.32
C4	0.13	0.21	0.14	0.15	0.17	0.14	0.22	0.21	0.19	0.13	0.21	0.20	0.34	0.20	0.16	0.12	0.43	0.67	0.96	0.54
C4'	0.16	0.19	0.15	0.11	0.18	0.12	0.18	0.11	0.17	0.15	0.20	0.19	0.26	0.25	0.13	0.13	0.24	0.47	0.36	0.19
C5	0.14	0.22	0.14	0.20	0.16	0.21	0.23	0.30	0.22	0.15	0.24	0.17	0.31	0.16	0.21	0.17	0.52	0.76	1.11	0.66
C5'	0.28	0.27	0.28	0.21	0.22	0.22	0.22	0.17	0.24	0.25	0.25	0.21	0.32	0.36	0.20	0.25	0.23	0.54	0.34	0.17
C6	0.15	0.22	0.14	0.22	0.18	0.23	0.28	0.35	0.25	0.16	0.25	0.19	0.31	0.16	0.22	0.20	0.56	0.90	1.30	0.77
C8	0.15	0.21	0.16	0.21	0.15	0.20	0.18	0.26	0.19	0.15	0.21	0.16	0.29	0.17	0.22	0.17	0.45	0.60	0.77	0.48
N1	0.15	0.23	0.14	0.18	0.20	0.19	0.29	0.30	0.24	0.16	0.24	0.24	0.33	0.19	0.18	0.17	0.52	0.91	1.29	0.74
N3	0.16	0.22	0.15	0.14	0.21	0.13	0.25	0.18	0.19	0.14	0.21	0.27	0.36	0.25	0.14	0.13	0.40	0.70	1.00	0.54
N6	0.19	0.22	0.16	0.26	0.21	0.31	0.29	0.43	0.28	0.19	0.27	0.25	0.28	0.16	0.27	0.26	0.64	1.00	1.46	0.88
N7	0.16	0.22	0.16	0.25	0.17	0.26	0.21	0.34	0.22	0.16	0.24	0.19	0.28	0.16	0.26	0.21	0.55	0.71	1.01	0.63
N9	0.14	0.20	0.15	0.16	0.15	0.14	0.19	0.19	0.17	0.13	0.19	0.18	0.31	0.21	0.16	0.13	0.39	0.56	0.76	0.44
O2'	0.19	0.22	0.18	0.15	0.20	0.15	0.20	0.16	0.17	0.16	0.22	0.24	0.34	0.29	0.15	0.16	0.29	0.49	0.62	0.31
O3'	0.18	0.22	0.17	0.17	0.19	0.16	0.21	0.20	0.20	0.17	0.23	0.22	0.32	0.26	0.20	0.16	0.35	0.64	0.50	0.33
O4'	0.15	0.18	0.16	0.16	0.18	0.15	0.17	0.16	0.16	0.13	0.20	0.20	0.26	0.25	0.20	0.14	0.26	0.44	0.43	0.25
O5'	0.16	0.22	0.16	0.10	0.26	0.07	0.27	0.10	0.25	0.20	0.25	0.27	0.25	0.23	0.02	0.12	0.29	0.62	0.40	0.27
OP1	0.04	0.11	0.08	0.02	0.10	0.07	0.12	0.15	0.11	0.05	0.12	0.12	0.18	0.15	0.02	0.04	0.25	0.95	0.55	0.30
OP2	0.12	0.23	0.16	0.06	0.21	0.10	0.18	0.21	0.15	0.16	0.24	0.23	0.28	0.16	0.02	0.09	0.37	0.88	0.47	0.36
P	0.04	0.11	0.07	0.01	0.10	0.04	0.11	0.10	0.11	0.05	0.12	0.11	0.17	0.13	0.01	0.02	0.25	0.76	0.41	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.08	0.65	0.23	0.22
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.08	0.02	0.19	0.90	0.60	0.38
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.12	0.01	0.02	0.01	0.12	0.36	0.20	0.12
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.03	0.07	0.06	0.11	0.02	0.01	0.01	0.16	0.32	0.20	0.12
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.03	0.28	1.07	0.96	0.53
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.23	0.26	0.08
C5	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.03	0.30	1.08	0.98	0.56
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.09	0.01	0.11	0.00	0.09	0.05	0.07	0.10	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.18	0.39	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.03	0.26	0.98	0.73	0.48
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.18	0.86	0.52	0.36
N3	0.02	0.00	0.06	0.07	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.23	1.00	0.80	0.46
N4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.07	0.03	0.29	1.11	1.10	0.57
O2	0.03	0.00	0.12	0.11	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.14	0.04	0.15	0.82	0.47	0.31
O2'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.06	0.05	0.11	0.00	0.05	0.04	0.05	0.34	0.28	0.12
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.06	0.02	0.08	0.03	0.08	0.03	0.08	0.07	0.14	0.05	0.00	0.01	0.14	0.54	0.39	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.06	0.66	0.16	0.23
O5'	0.08	0.19	0.12	0.16	0.28	0.02	0.30	0.01	0.26	0.18	0.23	0.29	0.15	0.05	0.14	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.65	0.90	0.36	0.32	1.07	0.23	1.08	0.18	0.98	0.86	1.00	1.11	0.82	0.34	0.54	0.66	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.60	0.20	0.20	0.96	0.26	0.98	0.39	0.73	0.52	0.80	1.10	0.47	0.28	0.39	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.38	0.12	0.12	0.53	0.08	0.56	0.02	0.48	0.36	0.46	0.57	0.31	0.12	0.16	0.23	0.00	0.01	0.01	0.00