Doublet Group distance statistics: 52859

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 1, 6, 11, 11, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.009, 0.021, 0.032, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.015, 0.028, 0.040, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.028 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.016, 0.032, 0.048, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.032 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.024, 0.042, 0.060, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.042 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.035, 0.061, 0.086, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.061 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.031, 0.059, 0.088, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.059 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.043, 0.073, 0.104, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.073 std_dev=0.031
N1	B	0, 0.268, 0.411, 0.554, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.411 std_dev=0.143
O4'	A	0, -0.021, 0.132, 0.284, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.132 std_dev=0.153
C1'	B	0, 0.143, 0.320, 0.496, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.320 std_dev=0.176
C2'	A	0, 0.063, 0.247, 0.431, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.247 std_dev=0.184
C2	B	0, 0.349, 0.548, 0.747, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.548 std_dev=0.199
C2'	B	0, 0.105, 0.318, 0.530, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.318 std_dev=0.213
C4'	A	0, 0.065, 0.286, 0.508, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.286 std_dev=0.221
C4	B	0, 0.478, 0.708, 0.938, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.708 std_dev=0.230
N3	B	0, 0.501, 0.740, 0.979, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.740 std_dev=0.239
C6	B	0, 0.577, 0.831, 1.084, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.831 std_dev=0.254
O2'	A	0, 0.158, 0.416, 0.675, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.416 std_dev=0.258
C3'	A	0, 0.107, 0.379, 0.652, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.379 std_dev=0.272
C5	B	0, 0.609, 0.889, 1.169, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.889 std_dev=0.280
O4'	B	0, 0.216, 0.497, 0.778, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.497 std_dev=0.281
C3'	B	0, 0.204, 0.495, 0.786, 1.655 max_d=1.655 avg_d=0.495 std_dev=0.291
O2	B	0, 0.478, 0.782, 1.086, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.782 std_dev=0.304
N4	B	0, 0.582, 0.899, 1.216, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.899 std_dev=0.317
O2'	B	0, 0.133, 0.455, 0.777, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.455 std_dev=0.322
C4'	B	0, 0.275, 0.651, 1.028, 1.951 max_d=1.951 avg_d=0.651 std_dev=0.377
O3'	B	0, 0.220, 0.598, 0.977, 2.136 max_d=2.136 avg_d=0.598 std_dev=0.379
P	A	0, 0.212, 0.596, 0.980, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.596 std_dev=0.384
C5'	A	0, 0.088, 0.480, 0.871, 1.760 max_d=1.760 avg_d=0.480 std_dev=0.391
OP1	A	0, 0.325, 0.717, 1.109, 1.733 max_d=1.733 avg_d=0.717 std_dev=0.392
O3'	A	0, 0.206, 0.601, 0.996, 1.828 max_d=1.828 avg_d=0.601 std_dev=0.395
OP2	A	0, 0.274, 0.672, 1.070, 1.848 max_d=1.848 avg_d=0.672 std_dev=0.398
O5'	A	0, 0.064, 0.493, 0.922, 2.036 max_d=2.036 avg_d=0.493 std_dev=0.429
C5'	B	0, 0.491, 0.982, 1.474, 2.490 max_d=2.490 avg_d=0.982 std_dev=0.492
O5'	B	0, 0.616, 1.125, 1.634, 2.419 max_d=2.419 avg_d=1.125 std_dev=0.509
P	B	0, 1.047, 1.599, 2.151, 2.992 max_d=2.992 avg_d=1.599 std_dev=0.552
OP2	B	0, 0.290, 1.050, 1.809, 3.441 max_d=3.441 avg_d=1.050 std_dev=0.760
OP1	B	0, 2.118, 3.008, 3.898, 4.874 max_d=4.874 avg_d=3.008 std_dev=0.890

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.11	0.11	0.22	0.09
C2	0.02	0.00	0.13	0.14	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.18	0.05	0.22	0.18	0.20	0.16
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.02	0.07	0.07	0.10	0.14	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.17	0.20	0.13	0.09
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.00	0.08	0.02	0.10	0.12	0.12	0.13	0.10	0.10	0.06	0.02	0.01	0.01	0.23	0.27	0.11	0.15
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.10	0.03	0.24	0.18	0.20	0.15
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.05	0.07	0.08	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.10	0.22	0.05
C5	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.09	0.02	0.31	0.23	0.22	0.21
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.09	0.01	0.12	0.00	0.12	0.13	0.10	0.07	0.14	0.15	0.08	0.06	0.03	0.02	0.01	0.10	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.12	0.03	0.31	0.24	0.24	0.23
C8	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.12	0.03	0.32	0.21	0.19	0.19
N1	0.02	0.00	0.10	0.12	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.15	0.04	0.27	0.21	0.22	0.20
N3	0.02	0.00	0.14	0.13	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.16	0.05	0.19	0.16	0.20	0.13
N6	0.03	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.02	0.14	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.12	0.03	0.35	0.28	0.28	0.27
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.12	0.02	0.35	0.25	0.24	0.25
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.22	0.16	0.19	0.13
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.08	0.06	0.06	0.06	0.09	0.05	0.12	0.14	0.08	0.04	0.02	0.00	0.04	0.06	0.09	0.17	0.15	0.07
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.10	0.02	0.09	0.03	0.12	0.12	0.15	0.16	0.12	0.12	0.05	0.04	0.00	0.02	0.21	0.34	0.14	0.19
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.05	0.03	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.09	0.11	0.30	0.16
O5'	0.11	0.22	0.17	0.23	0.24	0.02	0.31	0.01	0.31	0.32	0.27	0.19	0.35	0.35	0.22	0.09	0.21	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.18	0.20	0.27	0.18	0.10	0.23	0.10	0.24	0.21	0.21	0.16	0.28	0.25	0.16	0.17	0.34	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.20	0.13	0.11	0.20	0.22	0.22	0.23	0.24	0.19	0.22	0.20	0.28	0.24	0.19	0.15	0.14	0.30	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.16	0.09	0.15	0.15	0.05	0.21	0.02	0.23	0.19	0.20	0.13	0.27	0.25	0.13	0.07	0.19	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.22	0.19	0.18	0.14	0.18	0.13	0.21	0.11	0.14	0.19	0.18	0.34	0.29	0.19	0.17	0.28	0.42	0.47	0.30
C2	0.17	0.23	0.15	0.15	0.18	0.16	0.18	0.25	0.16	0.17	0.23	0.23	0.30	0.23	0.16	0.17	0.37	0.48	0.73	0.37
C2'	0.14	0.22	0.13	0.15	0.15	0.13	0.13	0.20	0.10	0.12	0.22	0.20	0.35	0.25	0.18	0.12	0.31	0.40	0.54	0.32
C3'	0.08	0.16	0.11	0.18	0.16	0.15	0.17	0.25	0.15	0.09	0.18	0.21	0.27	0.21	0.22	0.10	0.32	0.42	0.54	0.33
C4	0.17	0.24	0.15	0.15	0.15	0.17	0.14	0.24	0.13	0.16	0.23	0.19	0.32	0.23	0.16	0.17	0.35	0.43	0.66	0.35
C4'	0.10	0.14	0.10	0.14	0.17	0.12	0.18	0.18	0.15	0.10	0.17	0.21	0.23	0.22	0.18	0.09	0.24	0.34	0.37	0.25
C5	0.17	0.24	0.16	0.18	0.16	0.20	0.15	0.29	0.15	0.18	0.24	0.19	0.30	0.20	0.19	0.19	0.39	0.43	0.74	0.39
C5'	0.25	0.24	0.26	0.22	0.25	0.22	0.27	0.24	0.27	0.24	0.24	0.26	0.27	0.30	0.22	0.23	0.23	0.34	0.32	0.22
C6	0.18	0.24	0.16	0.19	0.18	0.22	0.17	0.32	0.18	0.18	0.25	0.20	0.29	0.20	0.20	0.21	0.42	0.45	0.82	0.42
C8	0.17	0.22	0.16	0.17	0.14	0.19	0.15	0.27	0.14	0.16	0.20	0.18	0.30	0.20	0.18	0.18	0.35	0.40	0.59	0.35
N1	0.17	0.23	0.15	0.17	0.18	0.20	0.19	0.29	0.18	0.18	0.24	0.20	0.29	0.21	0.18	0.19	0.41	0.47	0.80	0.41
N3	0.16	0.23	0.16	0.15	0.17	0.15	0.16	0.22	0.13	0.15	0.22	0.23	0.32	0.25	0.16	0.16	0.34	0.46	0.66	0.34
N6	0.19	0.23	0.17	0.21	0.20	0.25	0.19	0.37	0.20	0.19	0.25	0.24	0.27	0.19	0.24	0.23	0.47	0.46	0.89	0.47
N7	0.18	0.23	0.17	0.19	0.17	0.22	0.16	0.31	0.16	0.17	0.22	0.20	0.28	0.19	0.22	0.20	0.40	0.41	0.71	0.40
N9	0.17	0.24	0.16	0.16	0.14	0.17	0.13	0.23	0.11	0.15	0.21	0.18	0.33	0.24	0.16	0.16	0.32	0.42	0.57	0.33
O2'	0.20	0.25	0.18	0.19	0.17	0.18	0.15	0.21	0.14	0.17	0.23	0.19	0.38	0.29	0.21	0.18	0.28	0.41	0.48	0.30
O3'	0.09	0.14	0.12	0.19	0.15	0.16	0.17	0.26	0.14	0.07	0.17	0.20	0.25	0.24	0.24	0.10	0.32	0.45	0.55	0.34
O4'	0.09	0.15	0.13	0.18	0.16	0.16	0.15	0.20	0.11	0.07	0.17	0.21	0.25	0.24	0.22	0.11	0.26	0.40	0.37	0.28
O5'	0.17	0.22	0.20	0.07	0.30	0.05	0.32	0.13	0.27	0.20	0.25	0.34	0.26	0.34	0.02	0.09	0.24	0.39	0.39	0.26
OP1	0.06	0.14	0.10	0.02	0.20	0.08	0.22	0.18	0.18	0.11	0.18	0.24	0.19	0.14	0.03	0.05	0.14	0.46	0.26	0.17
OP2	0.11	0.17	0.17	0.07	0.20	0.17	0.23	0.33	0.19	0.12	0.19	0.25	0.23	0.19	0.02	0.13	0.25	0.62	0.40	0.33
P	0.06	0.13	0.11	0.01	0.20	0.07	0.22	0.18	0.19	0.10	0.16	0.23	0.18	0.17	0.01	0.03	0.15	0.43	0.26	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.12	0.46	0.23	0.17
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.05	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.24	0.58	0.41	0.26
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.02	0.07	0.02	0.07	0.03	0.06	0.07	0.12	0.00	0.02	0.01	0.10	0.31	0.12	0.14
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.02	0.13	0.07	0.11	0.13	0.12	0.02	0.01	0.01	0.14	0.21	0.08	0.13
C4	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.14	0.02	0.34	0.66	0.60	0.35
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.06	0.08	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.19	0.13	0.06
C5	0.01	0.02	0.07	0.13	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.16	0.03	0.35	0.66	0.62	0.35
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.06	0.09	0.13	0.06	0.06	0.03	0.01	0.01	0.08	0.19	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.14	0.03	0.30	0.62	0.49	0.29
N1	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.23	0.56	0.37	0.24
N3	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.12	0.02	0.30	0.62	0.51	0.31
N4	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.08	0.01	0.13	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.17	0.03	0.36	0.67	0.67	0.38
O2	0.03	0.01	0.12	0.12	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.12	0.14	0.04	0.20	0.54	0.35	0.23
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.06	0.04	0.06	0.04	0.02	0.07	0.06	0.12	0.00	0.04	0.05	0.04	0.23	0.10	0.08
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.14	0.02	0.16	0.03	0.14	0.07	0.12	0.17	0.14	0.04	0.00	0.01	0.15	0.23	0.17	0.13
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.05	0.01	0.00	0.12	0.44	0.25	0.16
O5'	0.12	0.24	0.10	0.14	0.34	0.02	0.35	0.01	0.30	0.23	0.30	0.36	0.20	0.04	0.15	0.12	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.46	0.58	0.31	0.21	0.66	0.19	0.66	0.08	0.62	0.56	0.62	0.67	0.54	0.23	0.23	0.44	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.41	0.12	0.08	0.60	0.13	0.62	0.19	0.49	0.37	0.51	0.67	0.35	0.10	0.17	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.26	0.14	0.13	0.35	0.06	0.35	0.01	0.29	0.24	0.31	0.38	0.23	0.08	0.13	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00