Doublet Group distance statistics: 52860

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 1, 1, 2, 2, 6, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C2	A	0, -0.003, 0.011, 0.024, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.011 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.014, 0.034, 0.053, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.034 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.009, 0.029, 0.049, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.029 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.019, 0.045, 0.070, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.045 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.014, 0.042, 0.069, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.042 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.065, 0.137, 0.209, 0.268 max_d=0.268 avg_d=0.137 std_dev=0.072
C4'	A	0, 0.110, 0.200, 0.290, 0.314 max_d=0.314 avg_d=0.200 std_dev=0.090
C2'	A	0, 0.053, 0.159, 0.266, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.159 std_dev=0.106
C6	B	0, 0.166, 0.329, 0.492, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.329 std_dev=0.163
C5	B	0, 0.157, 0.342, 0.528, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.342 std_dev=0.185
N1	B	0, 0.255, 0.450, 0.644, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.450 std_dev=0.194
C4	B	0, 0.239, 0.454, 0.668, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.454 std_dev=0.215
C5'	A	0, 0.239, 0.476, 0.713, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.476 std_dev=0.237
C3'	A	0, 0.022, 0.270, 0.518, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.270 std_dev=0.248
O2'	A	0, 0.029, 0.289, 0.549, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.289 std_dev=0.260
C1'	B	0, 0.291, 0.551, 0.811, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.551 std_dev=0.260
O4'	B	0, 0.312, 0.578, 0.844, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.578 std_dev=0.266
N4	B	0, 0.278, 0.560, 0.841, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.560 std_dev=0.282
C2'	B	0, 0.293, 0.584, 0.875, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.584 std_dev=0.291
O5'	B	0, 0.246, 0.539, 0.832, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.539 std_dev=0.293
C3'	B	0, 0.318, 0.615, 0.913, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.615 std_dev=0.297
C4'	B	0, 0.330, 0.649, 0.968, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.649 std_dev=0.319
N3	B	0, 0.295, 0.622, 0.949, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.622 std_dev=0.327
C2	B	0, 0.291, 0.627, 0.962, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.627 std_dev=0.336
O5'	A	0, 0.252, 0.591, 0.930, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.591 std_dev=0.339
C5'	B	0, 0.309, 0.651, 0.993, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.651 std_dev=0.342
O2'	B	0, 0.334, 0.746, 1.157, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.746 std_dev=0.411
P	B	0, 0.185, 0.613, 1.041, 2.247 max_d=2.247 avg_d=0.613 std_dev=0.428
O3'	B	0, 0.364, 0.814, 1.263, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.814 std_dev=0.449
P	A	0, 0.380, 0.845, 1.310, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.845 std_dev=0.465
OP2	A	0, 0.501, 0.982, 1.463, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.982 std_dev=0.481
O2	B	0, 0.348, 0.847, 1.345, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.847 std_dev=0.499
O3'	A	0, -0.099, 0.414, 0.926, 2.603 max_d=2.603 avg_d=0.414 std_dev=0.512
OP2	B	0, 0.390, 0.913, 1.437, 2.221 max_d=2.221 avg_d=0.913 std_dev=0.523
OP1	A	0, 0.477, 1.165, 1.853, 1.997 max_d=1.997 avg_d=1.165 std_dev=0.688
OP1	B	0, -0.163, 0.921, 2.005, 4.784 max_d=4.784 avg_d=0.921 std_dev=1.084

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.01	0.10	0.05	0.35	0.10
C2	0.03	0.00	0.04	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.17	0.18	0.05	0.18	0.09	0.30	0.10
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.09	0.05	0.06	0.04	0.05	0.06	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.09	0.11	0.35	0.10
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.01	0.13	0.02	0.12	0.19	0.08	0.03	0.14	0.19	0.10	0.02	0.01	0.02	0.19	0.20	0.11	0.10
C4	0.02	0.01	0.03	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.10	0.02	0.19	0.10	0.31	0.09
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.04	0.03	0.05	0.04	0.14	0.01	0.00	0.01	0.06	0.25	0.06
C5	0.01	0.02	0.04	0.13	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.15	0.07	0.02	0.23	0.17	0.31	0.13
C5'	0.04	0.05	0.09	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.08	0.10	0.07	0.04	0.09	0.11	0.06	0.05	0.10	0.01	0.01	0.08	0.19	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.08	0.02	0.22	0.17	0.29	0.14
C8	0.02	0.02	0.06	0.19	0.01	0.05	0.01	0.10	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.09	0.13	0.05	0.25	0.18	0.34	0.15
N1	0.03	0.01	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.12	0.04	0.21	0.13	0.29	0.11
N3	0.03	0.01	0.05	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.19	0.06	0.17	0.07	0.31	0.08
N6	0.02	0.01	0.06	0.14	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.18	0.10	0.03	0.23	0.23	0.30	0.17
N7	0.01	0.02	0.06	0.19	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.12	0.13	0.04	0.26	0.22	0.32	0.18
N9	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.06	0.01	0.19	0.10	0.33	0.09
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.14	0.14	0.15	0.05	0.17	0.09	0.18	0.16	0.18	0.12	0.09	0.00	0.04	0.09	0.15	0.08	0.33	0.04
O3'	0.14	0.18	0.02	0.01	0.10	0.01	0.07	0.10	0.08	0.13	0.12	0.19	0.10	0.13	0.06	0.04	0.00	0.09	0.21	0.34	0.06	0.16
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.04	0.06	0.03	0.04	0.01	0.09	0.09	0.00	0.04	0.07	0.36	0.14
O5'	0.10	0.18	0.09	0.19	0.19	0.01	0.23	0.01	0.22	0.25	0.21	0.17	0.23	0.26	0.19	0.15	0.21	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.05	0.09	0.11	0.20	0.10	0.06	0.17	0.08	0.17	0.18	0.13	0.07	0.23	0.22	0.10	0.08	0.34	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.35	0.30	0.35	0.11	0.31	0.25	0.31	0.19	0.29	0.34	0.29	0.31	0.30	0.32	0.33	0.33	0.06	0.36	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.10	0.10	0.10	0.09	0.06	0.13	0.01	0.14	0.15	0.11	0.08	0.17	0.18	0.09	0.04	0.16	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.41	0.07	0.13	0.29	0.10	0.11	0.13	0.10	0.15	0.46	0.34	0.58	0.10	0.19	0.06	0.16	0.27	0.30	0.14
C2	0.26	0.16	0.29	0.25	0.14	0.25	0.16	0.25	0.24	0.22	0.17	0.25	0.18	0.32	0.24	0.24	0.26	0.51	0.42	0.24
C2'	0.09	0.39	0.05	0.10	0.25	0.08	0.10	0.13	0.11	0.14	0.44	0.30	0.58	0.09	0.13	0.05	0.18	0.34	0.29	0.17
C3'	0.14	0.41	0.12	0.16	0.24	0.14	0.15	0.21	0.17	0.18	0.43	0.27	0.61	0.15	0.18	0.11	0.26	0.40	0.27	0.28
C4	0.13	0.22	0.18	0.20	0.20	0.18	0.09	0.19	0.17	0.08	0.33	0.29	0.30	0.20	0.19	0.13	0.22	0.35	0.38	0.18
C4'	0.19	0.47	0.15	0.07	0.31	0.06	0.14	0.10	0.11	0.23	0.47	0.33	0.66	0.19	0.14	0.12	0.12	0.37	0.19	0.15
C5	0.12	0.17	0.15	0.17	0.15	0.16	0.11	0.19	0.18	0.08	0.26	0.24	0.24	0.16	0.15	0.12	0.23	0.39	0.42	0.19
C5'	0.28	0.49	0.28	0.16	0.33	0.16	0.19	0.14	0.17	0.30	0.48	0.35	0.64	0.30	0.15	0.21	0.12	0.43	0.19	0.15
C6	0.19	0.11	0.20	0.19	0.07	0.20	0.17	0.22	0.23	0.17	0.13	0.16	0.14	0.21	0.16	0.18	0.26	0.52	0.47	0.25
C8	0.09	0.36	0.09	0.09	0.25	0.07	0.11	0.11	0.11	0.14	0.39	0.28	0.47	0.12	0.10	0.06	0.16	0.26	0.36	0.12
N1	0.26	0.18	0.26	0.23	0.11	0.24	0.19	0.25	0.25	0.23	0.13	0.18	0.18	0.28	0.21	0.23	0.27	0.57	0.46	0.27
N3	0.21	0.16	0.26	0.24	0.18	0.23	0.12	0.23	0.20	0.15	0.28	0.29	0.22	0.29	0.25	0.20	0.24	0.41	0.38	0.21
N6	0.18	0.13	0.18	0.18	0.10	0.19	0.20	0.23	0.22	0.17	0.11	0.12	0.13	0.18	0.15	0.17	0.27	0.57	0.54	0.28
N7	0.08	0.26	0.11	0.12	0.20	0.11	0.11	0.15	0.12	0.09	0.31	0.24	0.34	0.12	0.12	0.07	0.20	0.29	0.42	0.14
N9	0.06	0.34	0.09	0.14	0.25	0.12	0.09	0.15	0.12	0.10	0.41	0.31	0.47	0.12	0.16	0.06	0.18	0.27	0.33	0.15
O2'	0.12	0.42	0.09	0.12	0.32	0.10	0.13	0.13	0.10	0.17	0.49	0.39	0.61	0.13	0.19	0.09	0.16	0.33	0.32	0.16
O3'	0.18	0.48	0.14	0.09	0.30	0.06	0.12	0.16	0.11	0.21	0.50	0.34	0.70	0.25	0.16	0.09	0.22	0.46	0.28	0.28
O4'	0.14	0.46	0.07	0.13	0.32	0.09	0.15	0.12	0.11	0.21	0.48	0.35	0.64	0.09	0.22	0.08	0.13	0.30	0.26	0.15
O5'	0.23	0.47	0.24	0.09	0.34	0.05	0.20	0.09	0.17	0.28	0.47	0.35	0.61	0.29	0.02	0.13	0.14	0.44	0.26	0.19
OP1	0.04	0.24	0.09	0.04	0.19	0.12	0.12	0.18	0.10	0.10	0.26	0.22	0.34	0.10	0.02	0.08	0.16	0.76	0.13	0.23
OP2	0.11	0.33	0.18	0.05	0.26	0.16	0.16	0.30	0.13	0.17	0.35	0.29	0.41	0.19	0.02	0.10	0.26	0.56	0.31	0.30
P	0.07	0.27	0.12	0.01	0.19	0.08	0.10	0.16	0.08	0.12	0.28	0.21	0.37	0.14	0.01	0.03	0.13	0.55	0.20	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.26	0.15	0.06
C2	0.01	0.00	0.09	0.09	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.05	0.06	0.47	0.32	0.10
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.07	0.03	0.08	0.06	0.15	0.00	0.02	0.01	0.04	0.14	0.13	0.05
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.03	0.08	0.06	0.14	0.02	0.01	0.02	0.04	0.21	0.10	0.06
C4	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.07	0.04	0.11	0.65	0.47	0.18
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.06	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.03
C5	0.02	0.02	0.06	0.07	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.03	0.12	0.64	0.47	0.19
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.07	0.11	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.11	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.07	0.04	0.10	0.51	0.36	0.14
N1	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.06	0.42	0.28	0.09
N3	0.02	0.01	0.08	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.06	0.09	0.58	0.41	0.14
N4	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.09	0.05	0.12	0.72	0.53	0.20
O2	0.02	0.01	0.15	0.14	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.12	0.16	0.06	0.05	0.39	0.28	0.06
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.07	0.06	0.12	0.00	0.05	0.03	0.03	0.15	0.07	0.05
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.07	0.01	0.07	0.03	0.07	0.03	0.11	0.09	0.16	0.05	0.00	0.02	0.06	0.42	0.18	0.13
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.06	0.05	0.06	0.03	0.02	0.00	0.05	0.25	0.10	0.06
O5'	0.03	0.06	0.04	0.04	0.11	0.01	0.12	0.01	0.10	0.06	0.09	0.12	0.05	0.03	0.06	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.26	0.47	0.14	0.21	0.65	0.09	0.64	0.11	0.51	0.42	0.58	0.72	0.39	0.15	0.42	0.25	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.32	0.13	0.10	0.47	0.10	0.47	0.23	0.36	0.28	0.41	0.53	0.28	0.07	0.18	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.10	0.05	0.06	0.18	0.03	0.19	0.02	0.14	0.09	0.14	0.20	0.06	0.05	0.13	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00