Doublet Group distance statistics: 52861

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 4, 3, 0, 4, 7, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.005, 0.010, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N7	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.002, 0.013, 0.025, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.010, 0.026, 0.042, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C2'	A	0, 0.058, 0.130, 0.201, 0.240 max_d=0.240 avg_d=0.130 std_dev=0.071
O4'	A	0, 0.053, 0.136, 0.219, 0.281 max_d=0.281 avg_d=0.136 std_dev=0.083
O2'	A	0, 0.058, 0.144, 0.230, 0.253 max_d=0.253 avg_d=0.144 std_dev=0.086
C3'	A	0, 0.101, 0.234, 0.367, 0.433 max_d=0.433 avg_d=0.234 std_dev=0.133
C4'	A	0, 0.094, 0.233, 0.372, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.233 std_dev=0.139
C2	B	0, 0.262, 0.455, 0.648, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.455 std_dev=0.193
C2'	B	0, 0.304, 0.498, 0.692, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.498 std_dev=0.194
O3'	A	0, 0.139, 0.338, 0.538, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.338 std_dev=0.199
O5'	A	0, 0.217, 0.431, 0.645, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.431 std_dev=0.214
N1	B	0, 0.250, 0.464, 0.679, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.464 std_dev=0.214
C5'	A	0, 0.165, 0.384, 0.602, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.384 std_dev=0.219
N3	B	0, 0.313, 0.534, 0.755, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.534 std_dev=0.221
C1'	B	0, 0.314, 0.542, 0.769, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.542 std_dev=0.228
O2'	B	0, 0.415, 0.643, 0.871, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.643 std_dev=0.228
O2	B	0, 0.239, 0.482, 0.726, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.482 std_dev=0.243
C3'	B	0, 0.277, 0.534, 0.791, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.534 std_dev=0.257
C6	B	0, 0.284, 0.547, 0.809, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.547 std_dev=0.262
O3'	B	0, 0.277, 0.545, 0.813, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.545 std_dev=0.268
P	A	0, 0.226, 0.498, 0.771, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.498 std_dev=0.272
C4	B	0, 0.338, 0.615, 0.891, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.615 std_dev=0.276
C5	B	0, 0.338, 0.630, 0.922, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.630 std_dev=0.292
C4'	B	0, 0.364, 0.686, 1.007, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.686 std_dev=0.321
OP2	A	0, 0.249, 0.571, 0.893, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.571 std_dev=0.322
OP1	A	0, 0.271, 0.597, 0.923, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.597 std_dev=0.326
O4'	B	0, 0.361, 0.687, 1.013, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.687 std_dev=0.326
N4	B	0, 0.412, 0.765, 1.118, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.765 std_dev=0.353
C5'	B	0, 0.397, 0.811, 1.226, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.811 std_dev=0.414
O5'	B	0, 0.396, 0.821, 1.246, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.821 std_dev=0.425
P	B	0, 0.494, 0.996, 1.498, 1.943 max_d=1.943 avg_d=0.996 std_dev=0.502
OP2	B	0, 0.346, 0.897, 1.449, 2.086 max_d=2.086 avg_d=0.897 std_dev=0.552
OP1	B	0, 0.670, 1.238, 1.805, 2.141 max_d=2.141 avg_d=1.238 std_dev=0.567

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.10	0.10	0.18	0.07
C2	0.03	0.00	0.10	0.13	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.16	0.05	0.18	0.14	0.25	0.15
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.05	0.08	0.10	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.14	0.20	0.09
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.02	0.12	0.07	0.13	0.12	0.12	0.08	0.06	0.02	0.01	0.01	0.10	0.17	0.19	0.12
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.02	0.18	0.13	0.23	0.14
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.06	0.05	0.03	0.08	0.07	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.12	0.12	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.02	0.21	0.17	0.26	0.18
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.10	0.09	0.05	0.13	0.12	0.06	0.03	0.03	0.01	0.01	0.14	0.06	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.14	0.02	0.22	0.19	0.28	0.20
C8	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.08	0.03	0.20	0.13	0.22	0.15
N1	0.02	0.00	0.08	0.13	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.16	0.04	0.20	0.17	0.27	0.18
N3	0.03	0.00	0.10	0.12	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.05	0.16	0.12	0.23	0.13
N6	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.15	0.02	0.24	0.23	0.31	0.24
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.22	0.18	0.26	0.19
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.16	0.11	0.21	0.11
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.07	0.07	0.04	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.05	0.13	0.18	0.07
O3'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.11	0.02	0.11	0.03	0.14	0.08	0.16	0.14	0.15	0.09	0.06	0.04	0.00	0.01	0.18	0.25	0.23	0.18
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.05	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.12	0.12	0.16	0.08
O5'	0.10	0.18	0.07	0.10	0.18	0.02	0.21	0.01	0.22	0.20	0.20	0.16	0.24	0.22	0.16	0.05	0.18	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.10	0.14	0.14	0.17	0.13	0.12	0.17	0.14	0.19	0.13	0.17	0.12	0.23	0.18	0.11	0.13	0.25	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.25	0.20	0.19	0.23	0.12	0.26	0.06	0.28	0.22	0.27	0.23	0.31	0.26	0.21	0.18	0.23	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.15	0.09	0.12	0.14	0.03	0.18	0.01	0.20	0.15	0.18	0.13	0.24	0.19	0.11	0.07	0.18	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.12	0.19	0.16	0.18	0.17	0.20	0.17	0.19	0.15	0.14	0.21	0.16	0.28	0.17	0.18	0.21	0.27	0.29	0.24
C2	0.27	0.24	0.25	0.20	0.24	0.22	0.26	0.20	0.25	0.24	0.23	0.27	0.28	0.31	0.20	0.24	0.31	0.35	0.36	0.32
C2'	0.16	0.12	0.16	0.13	0.17	0.14	0.20	0.15	0.19	0.14	0.13	0.20	0.15	0.25	0.14	0.14	0.25	0.33	0.34	0.29
C3'	0.14	0.11	0.15	0.14	0.16	0.14	0.19	0.16	0.18	0.12	0.12	0.18	0.14	0.24	0.15	0.13	0.28	0.36	0.36	0.31
C4	0.23	0.18	0.24	0.20	0.19	0.21	0.22	0.20	0.22	0.20	0.15	0.21	0.21	0.30	0.20	0.22	0.29	0.32	0.32	0.29
C4'	0.16	0.16	0.15	0.12	0.18	0.13	0.20	0.14	0.19	0.15	0.17	0.20	0.19	0.25	0.13	0.15	0.22	0.28	0.29	0.24
C5	0.25	0.21	0.26	0.24	0.18	0.24	0.23	0.23	0.23	0.22	0.16	0.19	0.25	0.29	0.23	0.24	0.34	0.37	0.36	0.34
C5'	0.21	0.21	0.20	0.14	0.20	0.16	0.21	0.15	0.21	0.20	0.20	0.20	0.24	0.28	0.14	0.18	0.22	0.28	0.27	0.23
C6	0.27	0.26	0.27	0.25	0.24	0.25	0.27	0.25	0.26	0.26	0.24	0.23	0.29	0.30	0.24	0.26	0.38	0.42	0.40	0.38
C8	0.20	0.13	0.25	0.23	0.15	0.22	0.20	0.22	0.19	0.16	0.11	0.19	0.19	0.29	0.22	0.21	0.29	0.32	0.32	0.29
N1	0.27	0.27	0.26	0.23	0.26	0.24	0.28	0.23	0.26	0.26	0.25	0.27	0.30	0.30	0.22	0.26	0.35	0.40	0.39	0.37
N3	0.25	0.21	0.24	0.19	0.22	0.21	0.24	0.19	0.23	0.22	0.19	0.25	0.24	0.31	0.19	0.23	0.27	0.31	0.32	0.29
N6	0.28	0.28	0.28	0.28	0.27	0.29	0.30	0.29	0.29	0.28	0.28	0.27	0.31	0.30	0.27	0.30	0.44	0.48	0.46	0.45
N7	0.24	0.18	0.27	0.26	0.16	0.26	0.21	0.25	0.22	0.21	0.14	0.19	0.23	0.29	0.24	0.25	0.36	0.37	0.35	0.34
N9	0.20	0.12	0.22	0.19	0.16	0.19	0.20	0.19	0.19	0.16	0.11	0.20	0.17	0.29	0.19	0.19	0.25	0.30	0.30	0.27
O2'	0.18	0.14	0.16	0.14	0.19	0.15	0.20	0.15	0.19	0.15	0.16	0.22	0.17	0.25	0.14	0.16	0.22	0.31	0.33	0.26
O3'	0.16	0.11	0.16	0.16	0.16	0.16	0.20	0.19	0.19	0.13	0.12	0.18	0.15	0.25	0.18	0.15	0.30	0.40	0.39	0.34
O4'	0.17	0.15	0.17	0.15	0.20	0.16	0.21	0.17	0.20	0.15	0.18	0.22	0.17	0.26	0.17	0.16	0.20	0.26	0.28	0.22
O5'	0.19	0.21	0.20	0.09	0.25	0.07	0.28	0.09	0.27	0.22	0.23	0.27	0.20	0.22	0.01	0.12	0.28	0.33	0.31	0.28
OP1	0.04	0.08	0.08	0.03	0.15	0.09	0.19	0.21	0.17	0.08	0.11	0.18	0.11	0.15	0.02	0.06	0.23	0.37	0.36	0.30
OP2	0.12	0.19	0.13	0.08	0.24	0.12	0.27	0.22	0.24	0.18	0.21	0.27	0.19	0.12	0.02	0.13	0.36	0.45	0.37	0.38
P	0.06	0.09	0.09	0.02	0.16	0.06	0.20	0.14	0.18	0.10	0.12	0.18	0.10	0.11	0.01	0.04	0.25	0.33	0.29	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.09	0.11	0.10	0.09
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.05	0.04	0.22	0.22	0.23	0.22
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.02	0.07	0.02	0.07	0.02	0.04	0.05	0.10	0.00	0.02	0.01	0.13	0.15	0.10	0.11
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.09	0.01	0.12	0.03	0.12	0.05	0.06	0.10	0.08	0.02	0.01	0.01	0.18	0.20	0.11	0.15
C4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.09	0.03	0.34	0.37	0.39	0.37
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.10	0.04	0.05	0.09	0.04	0.04	0.03	0.00	0.02	0.08	0.15	0.03
C5	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.10	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.14	0.05	0.37	0.38	0.38	0.38
C5'	0.02	0.08	0.02	0.03	0.16	0.01	0.18	0.00	0.16	0.09	0.11	0.18	0.05	0.05	0.05	0.01	0.01	0.11	0.22	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.10	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.13	0.06	0.32	0.30	0.25	0.29
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.21	0.20	0.18	0.20
N3	0.02	0.00	0.04	0.06	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.06	0.03	0.28	0.29	0.32	0.30
N4	0.02	0.02	0.05	0.10	0.00	0.09	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.11	0.04	0.38	0.42	0.46	0.42
O2	0.04	0.01	0.10	0.08	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.12	0.11	0.07	0.16	0.16	0.18	0.16
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.04	0.05	0.05	0.05	0.02	0.06	0.05	0.12	0.00	0.04	0.04	0.06	0.09	0.10	0.06
O3'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.09	0.03	0.14	0.05	0.13	0.05	0.06	0.11	0.11	0.04	0.00	0.02	0.15	0.23	0.18	0.16
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.03	0.04	0.07	0.04	0.02	0.00	0.06	0.10	0.17	0.11
O5'	0.09	0.22	0.13	0.18	0.34	0.02	0.37	0.01	0.32	0.21	0.28	0.38	0.16	0.06	0.15	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.11	0.22	0.15	0.20	0.37	0.08	0.38	0.11	0.30	0.20	0.29	0.42	0.16	0.09	0.23	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.23	0.10	0.11	0.39	0.15	0.38	0.22	0.25	0.18	0.32	0.46	0.18	0.10	0.18	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.22	0.11	0.15	0.37	0.03	0.38	0.02	0.29	0.20	0.30	0.42	0.16	0.06	0.16	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00