Doublet Group distance statistics: 52862

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 2, 3, 2, 1, 2, 1, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.009, 0.019, 0.028, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.010, 0.021, 0.031, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.018, 0.035, 0.053, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.035 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.017, 0.035, 0.054, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.035 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.021, 0.039, 0.058, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.039 std_dev=0.019
O4'	A	0, 0.126, 0.226, 0.326, 0.395 max_d=0.395 avg_d=0.226 std_dev=0.100
C2'	A	0, 0.110, 0.221, 0.331, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.221 std_dev=0.111
C4'	A	0, 0.208, 0.354, 0.500, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.354 std_dev=0.146
C3'	A	0, 0.205, 0.381, 0.556, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.381 std_dev=0.176
O2'	A	0, 0.139, 0.320, 0.501, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.320 std_dev=0.181
C5'	A	0, 0.369, 0.616, 0.864, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.616 std_dev=0.248
C5	B	0, 0.256, 0.538, 0.819, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.538 std_dev=0.282
N3	B	0, 0.173, 0.457, 0.741, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.457 std_dev=0.284
C4	B	0, 0.175, 0.465, 0.756, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.465 std_dev=0.290
O3'	A	0, 0.295, 0.587, 0.879, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.587 std_dev=0.292
N4	B	0, 0.207, 0.502, 0.797, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.502 std_dev=0.295
C6	B	0, 0.249, 0.551, 0.854, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.551 std_dev=0.303
C2	B	0, 0.161, 0.469, 0.776, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.469 std_dev=0.307
O5'	A	0, 0.285, 0.600, 0.915, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.600 std_dev=0.315
N1	B	0, 0.186, 0.506, 0.827, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.506 std_dev=0.320
C2'	B	0, 0.116, 0.486, 0.857, 1.752 max_d=1.752 avg_d=0.486 std_dev=0.371
O2	B	0, 0.119, 0.496, 0.873, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.496 std_dev=0.377
C1'	B	0, 0.117, 0.533, 0.949, 1.825 max_d=1.825 avg_d=0.533 std_dev=0.416
C3'	B	0, 0.189, 0.629, 1.068, 2.041 max_d=2.041 avg_d=0.629 std_dev=0.439
O2'	B	0, 0.060, 0.501, 0.941, 2.124 max_d=2.124 avg_d=0.501 std_dev=0.440
P	A	0, 0.223, 0.690, 1.156, 2.113 max_d=2.113 avg_d=0.690 std_dev=0.467
O3'	B	0, 0.223, 0.713, 1.202, 2.307 max_d=2.307 avg_d=0.713 std_dev=0.489
O4'	B	0, 0.144, 0.671, 1.197, 2.259 max_d=2.259 avg_d=0.671 std_dev=0.527
C4'	B	0, 0.179, 0.719, 1.259, 2.457 max_d=2.457 avg_d=0.719 std_dev=0.540
OP1	A	0, 0.222, 0.814, 1.405, 2.637 max_d=2.637 avg_d=0.814 std_dev=0.591
OP2	A	0, 0.111, 0.738, 1.365, 2.901 max_d=2.901 avg_d=0.738 std_dev=0.627
C5'	B	0, 0.247, 0.895, 1.543, 2.712 max_d=2.712 avg_d=0.895 std_dev=0.648
P	B	0, 0.185, 0.862, 1.539, 2.700 max_d=2.700 avg_d=0.862 std_dev=0.677
O5'	B	0, 0.179, 0.863, 1.548, 2.655 max_d=2.655 avg_d=0.863 std_dev=0.685
OP2	B	0, 0.164, 0.872, 1.581, 3.179 max_d=3.179 avg_d=0.872 std_dev=0.709
OP1	B	0, 0.161, 0.998, 1.835, 3.336 max_d=3.336 avg_d=0.998 std_dev=0.837

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.18	0.14	0.13
C2	0.03	0.00	0.10	0.13	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.15	0.04	0.16	0.16	0.36	0.20
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.01	0.04	0.06	0.07	0.10	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.10	0.11	0.19	0.05
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.10	0.01	0.12	0.01	0.12	0.14	0.12	0.11	0.14	0.14	0.08	0.02	0.01	0.01	0.17	0.14	0.25	0.15
C4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.10	0.02	0.15	0.16	0.33	0.19
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.05	0.04	0.09	0.10	0.05	0.07	0.02	0.00	0.01	0.18	0.03	0.08
C5	0.02	0.01	0.03	0.12	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.15	0.02	0.20	0.23	0.43	0.26
C5'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.10	0.01	0.14	0.00	0.15	0.15	0.13	0.08	0.18	0.17	0.09	0.07	0.03	0.01	0.01	0.09	0.04	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.12	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.16	0.03	0.21	0.26	0.48	0.29
C8	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.09	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.17	0.04	0.19	0.20	0.35	0.23
N1	0.03	0.00	0.07	0.12	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.15	0.03	0.19	0.22	0.44	0.25
N3	0.04	0.00	0.10	0.11	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.13	0.04	0.13	0.15	0.30	0.16
N6	0.02	0.01	0.04	0.14	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.18	0.03	0.24	0.33	0.55	0.34
N7	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.10	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.19	0.03	0.22	0.28	0.46	0.30
N9	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.13	0.14	0.26	0.16
O2'	0.02	0.16	0.01	0.02	0.09	0.07	0.07	0.07	0.10	0.04	0.14	0.15	0.09	0.04	0.03	0.00	0.05	0.07	0.04	0.24	0.07	0.11
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.10	0.02	0.15	0.03	0.16	0.17	0.15	0.13	0.18	0.19	0.08	0.05	0.00	0.02	0.23	0.25	0.31	0.23
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.13	0.27	0.13	0.20
O5'	0.08	0.16	0.10	0.17	0.15	0.01	0.20	0.01	0.21	0.19	0.19	0.13	0.24	0.22	0.13	0.04	0.23	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.18	0.16	0.11	0.14	0.16	0.18	0.23	0.09	0.26	0.20	0.22	0.15	0.33	0.28	0.14	0.24	0.25	0.27	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.36	0.19	0.25	0.33	0.03	0.43	0.04	0.48	0.35	0.44	0.30	0.55	0.46	0.26	0.07	0.31	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.20	0.05	0.15	0.19	0.08	0.26	0.01	0.29	0.23	0.25	0.16	0.34	0.30	0.16	0.11	0.23	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.19	0.25	0.26	0.20	0.25	0.22	0.27	0.23	0.20	0.20	0.21	0.22	0.26	0.28	0.23	0.32	0.37	0.38	0.27
C2	0.25	0.24	0.24	0.23	0.26	0.24	0.27	0.26	0.25	0.24	0.23	0.31	0.26	0.28	0.23	0.25	0.44	0.32	0.23	0.28
C2'	0.17	0.19	0.17	0.16	0.19	0.16	0.20	0.16	0.19	0.17	0.20	0.22	0.23	0.21	0.17	0.16	0.23	0.31	0.39	0.21
C3'	0.13	0.18	0.12	0.07	0.22	0.08	0.23	0.08	0.19	0.15	0.20	0.25	0.22	0.21	0.09	0.11	0.16	0.33	0.47	0.24
C4	0.21	0.18	0.21	0.22	0.22	0.22	0.24	0.24	0.23	0.20	0.19	0.24	0.19	0.23	0.22	0.21	0.40	0.30	0.23	0.24
C4'	0.15	0.20	0.12	0.09	0.19	0.08	0.20	0.11	0.17	0.15	0.20	0.21	0.29	0.23	0.14	0.11	0.16	0.42	0.51	0.30
C5	0.18	0.15	0.18	0.21	0.18	0.20	0.22	0.24	0.21	0.17	0.15	0.21	0.18	0.20	0.22	0.19	0.47	0.34	0.22	0.29
C5'	0.29	0.27	0.31	0.15	0.22	0.19	0.23	0.12	0.21	0.23	0.24	0.24	0.37	0.47	0.15	0.24	0.11	0.45	0.57	0.34
C6	0.18	0.18	0.18	0.21	0.19	0.21	0.23	0.26	0.22	0.18	0.17	0.23	0.22	0.20	0.23	0.19	0.52	0.39	0.28	0.36
C8	0.16	0.15	0.18	0.21	0.14	0.20	0.17	0.22	0.17	0.14	0.16	0.17	0.21	0.21	0.22	0.18	0.39	0.30	0.27	0.22
N1	0.22	0.21	0.21	0.21	0.23	0.21	0.26	0.26	0.24	0.21	0.20	0.28	0.25	0.24	0.22	0.22	0.49	0.37	0.27	0.34
N3	0.26	0.23	0.25	0.24	0.26	0.24	0.26	0.26	0.26	0.24	0.23	0.29	0.24	0.29	0.24	0.25	0.39	0.31	0.23	0.24
N6	0.17	0.18	0.17	0.23	0.16	0.22	0.22	0.28	0.20	0.17	0.18	0.19	0.22	0.18	0.26	0.19	0.59	0.48	0.39	0.46
N7	0.17	0.15	0.19	0.23	0.14	0.22	0.16	0.25	0.17	0.15	0.16	0.17	0.19	0.20	0.25	0.19	0.48	0.34	0.22	0.29
N9	0.19	0.16	0.20	0.22	0.18	0.21	0.21	0.24	0.21	0.18	0.17	0.21	0.19	0.22	0.23	0.20	0.35	0.31	0.29	0.23
O2'	0.26	0.24	0.26	0.26	0.22	0.26	0.23	0.26	0.24	0.24	0.23	0.23	0.29	0.30	0.28	0.27	0.27	0.42	0.44	0.30
O3'	0.15	0.18	0.14	0.11	0.23	0.12	0.25	0.12	0.21	0.15	0.20	0.28	0.22	0.23	0.14	0.13	0.16	0.41	0.55	0.32
O4'	0.14	0.19	0.16	0.24	0.18	0.20	0.19	0.24	0.19	0.14	0.20	0.20	0.27	0.19	0.30	0.16	0.28	0.43	0.46	0.31
O5'	0.17	0.20	0.19	0.08	0.23	0.08	0.26	0.12	0.23	0.18	0.21	0.25	0.24	0.27	0.02	0.12	0.18	0.44	0.58	0.36
OP1	0.07	0.10	0.11	0.01	0.18	0.05	0.21	0.17	0.16	0.09	0.14	0.22	0.13	0.20	0.01	0.04	0.26	0.61	0.76	0.54
OP2	0.11	0.24	0.11	0.08	0.32	0.14	0.31	0.25	0.25	0.19	0.30	0.35	0.24	0.10	0.01	0.13	0.26	0.45	0.61	0.38
P	0.05	0.13	0.09	0.01	0.19	0.05	0.21	0.13	0.17	0.10	0.17	0.22	0.15	0.15	0.01	0.02	0.16	0.44	0.65	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.27	0.22	0.16	0.17
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.02	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.06	0.03	0.43	0.32	0.22	0.33
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.03	0.06	0.05	0.10	0.00	0.02	0.01	0.15	0.17	0.30	0.09
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.10	0.05	0.06	0.08	0.07	0.02	0.01	0.01	0.09	0.18	0.40	0.14
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.11	0.02	0.57	0.47	0.40	0.48
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.04	0.07	0.04	0.05	0.03	0.00	0.02	0.14	0.30	0.06
C5	0.01	0.02	0.05	0.10	0.01	0.08	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.14	0.03	0.59	0.49	0.41	0.50
C5'	0.05	0.12	0.02	0.02	0.18	0.01	0.19	0.00	0.16	0.11	0.15	0.19	0.09	0.05	0.05	0.03	0.01	0.26	0.26	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.03	0.53	0.41	0.26	0.40
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.42	0.31	0.18	0.30
N3	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.08	0.03	0.50	0.40	0.32	0.41
N4	0.02	0.02	0.05	0.08	0.00	0.07	0.01	0.19	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.07	0.12	0.03	0.60	0.53	0.49	0.54
O2	0.04	0.00	0.10	0.07	0.02	0.04	0.02	0.09	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.14	0.09	0.05	0.35	0.27	0.19	0.27
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.06	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.09	0.07	0.14	0.00	0.05	0.04	0.04	0.22	0.38	0.16
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.11	0.03	0.14	0.05	0.12	0.05	0.08	0.12	0.09	0.05	0.00	0.03	0.15	0.34	0.60	0.35
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.00	0.24	0.26	0.14	0.19
O5'	0.27	0.43	0.15	0.09	0.57	0.02	0.59	0.01	0.53	0.42	0.50	0.60	0.35	0.04	0.15	0.24	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.22	0.32	0.17	0.18	0.47	0.14	0.49	0.26	0.41	0.31	0.40	0.53	0.27	0.22	0.34	0.26	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.22	0.30	0.40	0.40	0.30	0.41	0.26	0.26	0.18	0.32	0.49	0.19	0.38	0.60	0.14	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.33	0.09	0.14	0.48	0.06	0.50	0.01	0.40	0.30	0.41	0.54	0.27	0.16	0.35	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00