Doublet Group distance statistics: 52863

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 5, 4, 0, 4, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.011, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.007, 0.014, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.006, 0.013, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.019 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.013, 0.027, 0.042, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.016, 0.030, 0.045, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.008, 0.026, 0.043, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.026 std_dev=0.017
O4'	A	0, 0.065, 0.179, 0.293, 0.433 max_d=0.433 avg_d=0.179 std_dev=0.114
C2'	A	0, 0.052, 0.195, 0.339, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.195 std_dev=0.143
N1	B	0, 0.143, 0.327, 0.511, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.327 std_dev=0.184
C4'	A	0, 0.118, 0.307, 0.497, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.307 std_dev=0.189
O2'	A	0, 0.024, 0.232, 0.439, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.232 std_dev=0.208
C3'	A	0, 0.106, 0.332, 0.558, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.332 std_dev=0.226
C6	B	0, 0.284, 0.534, 0.783, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.534 std_dev=0.250
C2	B	0, 0.278, 0.528, 0.778, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.528 std_dev=0.250
C3'	B	0, 0.335, 0.595, 0.854, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.595 std_dev=0.260
C2'	B	0, 0.392, 0.663, 0.934, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.663 std_dev=0.271
C5	B	0, 0.563, 0.846, 1.128, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.846 std_dev=0.282
O3'	B	0, 0.453, 0.737, 1.022, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.737 std_dev=0.284
C1'	B	0, 0.273, 0.572, 0.871, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.572 std_dev=0.299
C4	B	0, 0.587, 0.899, 1.211, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.899 std_dev=0.312
N3	B	0, 0.426, 0.748, 1.071, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.748 std_dev=0.322
C5'	A	0, 0.169, 0.498, 0.828, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.498 std_dev=0.329
O3'	A	0, 0.160, 0.522, 0.884, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.522 std_dev=0.362
O2	B	0, 0.422, 0.807, 1.191, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.807 std_dev=0.385
P	A	0, 0.257, 0.667, 1.077, 1.838 max_d=1.838 avg_d=0.667 std_dev=0.410
O4'	B	0, 0.337, 0.768, 1.200, 1.791 max_d=1.791 avg_d=0.768 std_dev=0.432
O2'	B	0, 0.541, 0.973, 1.405, 1.677 max_d=1.677 avg_d=0.973 std_dev=0.432
OP2	A	0, 0.515, 0.967, 1.419, 1.923 max_d=1.923 avg_d=0.967 std_dev=0.452
C4'	B	0, 0.328, 0.782, 1.235, 1.906 max_d=1.906 avg_d=0.782 std_dev=0.454
O5'	A	0, 0.161, 0.641, 1.121, 2.146 max_d=2.146 avg_d=0.641 std_dev=0.480
N4	B	0, 0.810, 1.296, 1.783, 2.013 max_d=2.013 avg_d=1.296 std_dev=0.487
OP1	A	0, 0.419, 0.928, 1.437, 1.887 max_d=1.887 avg_d=0.928 std_dev=0.509
C5'	B	0, 0.303, 0.928, 1.553, 2.492 max_d=2.492 avg_d=0.928 std_dev=0.625
O5'	B	0, 0.273, 0.901, 1.528, 2.451 max_d=2.451 avg_d=0.901 std_dev=0.628
P	B	0, 0.466, 1.196, 1.926, 2.758 max_d=2.758 avg_d=1.196 std_dev=0.730
OP2	B	0, 0.835, 1.681, 2.526, 2.721 max_d=2.721 avg_d=1.681 std_dev=0.845
OP1	B	0, 0.548, 1.599, 2.651, 3.122 max_d=3.122 avg_d=1.599 std_dev=1.052

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.08	0.33	0.11
C2	0.02	0.00	0.12	0.15	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.19	0.02	0.27	0.18	0.27	0.16
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.02	0.06	0.06	0.09	0.12	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.16	0.20	0.21	0.06
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.10	0.13	0.12	0.15	0.10	0.12	0.06	0.02	0.01	0.01	0.21	0.29	0.14	0.13
C4	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.10	0.01	0.28	0.16	0.26	0.14
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.09	0.06	0.07	0.07	0.09	0.04	0.07	0.03	0.00	0.02	0.13	0.28	0.07
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.02	0.38	0.23	0.27	0.21
C5'	0.02	0.10	0.02	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.11	0.15	0.10	0.09	0.14	0.15	0.08	0.07	0.04	0.01	0.01	0.17	0.23	0.02
C6	0.01	0.00	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02	0.39	0.26	0.29	0.24
C8	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.14	0.03	0.38	0.18	0.25	0.16
N1	0.02	0.00	0.09	0.12	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.16	0.02	0.33	0.23	0.28	0.21
N3	0.02	0.00	0.12	0.15	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.18	0.02	0.22	0.14	0.27	0.12
N6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.13	0.03	0.44	0.31	0.33	0.30
N7	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.14	0.03	0.43	0.24	0.27	0.24
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.26	0.13	0.28	0.10
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.07	0.07	0.06	0.07	0.08	0.03	0.11	0.13	0.07	0.03	0.02	0.00	0.05	0.06	0.07	0.18	0.25	0.08
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.10	0.03	0.11	0.04	0.12	0.14	0.16	0.18	0.13	0.14	0.07	0.05	0.00	0.03	0.17	0.38	0.14	0.17
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.06	0.03	0.00	0.06	0.10	0.42	0.20
O5'	0.11	0.27	0.16	0.21	0.28	0.02	0.38	0.01	0.39	0.38	0.33	0.22	0.44	0.43	0.26	0.07	0.17	0.06	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.08	0.18	0.20	0.29	0.16	0.13	0.23	0.17	0.26	0.18	0.23	0.14	0.31	0.24	0.13	0.18	0.38	0.10	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.27	0.21	0.14	0.26	0.28	0.27	0.23	0.29	0.25	0.28	0.27	0.33	0.27	0.28	0.25	0.14	0.42	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.16	0.06	0.13	0.14	0.07	0.21	0.02	0.24	0.16	0.21	0.12	0.30	0.24	0.10	0.08	0.17	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.19	0.22	0.18	0.23	0.18	0.22	0.22	0.21	0.17	0.25	0.29	0.25	0.35	0.18	0.19	0.38	0.53	0.56	0.43
C2	0.13	0.14	0.15	0.13	0.24	0.16	0.27	0.36	0.20	0.12	0.16	0.34	0.24	0.27	0.11	0.12	0.48	0.75	0.98	0.62
C2'	0.19	0.20	0.18	0.11	0.24	0.11	0.22	0.18	0.18	0.15	0.25	0.30	0.25	0.33	0.10	0.14	0.32	0.48	0.56	0.37
C3'	0.15	0.21	0.15	0.09	0.18	0.09	0.13	0.15	0.11	0.12	0.23	0.22	0.30	0.28	0.11	0.10	0.25	0.50	0.53	0.31
C4	0.14	0.15	0.16	0.13	0.22	0.16	0.24	0.32	0.19	0.13	0.17	0.27	0.22	0.26	0.10	0.12	0.44	0.65	0.83	0.55
C4'	0.16	0.26	0.14	0.07	0.18	0.10	0.12	0.10	0.12	0.13	0.27	0.21	0.37	0.29	0.11	0.12	0.24	0.48	0.42	0.29
C5	0.14	0.16	0.16	0.18	0.19	0.24	0.24	0.42	0.20	0.14	0.17	0.22	0.22	0.22	0.16	0.18	0.50	0.72	0.93	0.61
C5'	0.28	0.35	0.29	0.18	0.19	0.20	0.12	0.14	0.15	0.24	0.31	0.19	0.48	0.40	0.17	0.24	0.19	0.60	0.42	0.29
C6	0.14	0.17	0.15	0.20	0.19	0.27	0.26	0.48	0.22	0.14	0.19	0.24	0.23	0.21	0.18	0.21	0.54	0.82	1.07	0.68
C8	0.16	0.18	0.18	0.16	0.16	0.19	0.22	0.31	0.19	0.15	0.16	0.17	0.24	0.25	0.13	0.16	0.42	0.56	0.65	0.48
N1	0.12	0.16	0.14	0.17	0.21	0.23	0.27	0.44	0.21	0.12	0.16	0.28	0.24	0.23	0.14	0.16	0.52	0.82	1.08	0.68
N3	0.16	0.15	0.17	0.13	0.25	0.14	0.26	0.30	0.19	0.13	0.18	0.35	0.22	0.30	0.11	0.12	0.44	0.67	0.86	0.56
N6	0.17	0.19	0.18	0.26	0.21	0.35	0.25	0.57	0.24	0.16	0.24	0.29	0.24	0.20	0.25	0.28	0.59	0.91	1.17	0.75
N7	0.17	0.18	0.20	0.23	0.17	0.28	0.22	0.44	0.20	0.16	0.18	0.20	0.22	0.23	0.21	0.23	0.50	0.66	0.84	0.57
N9	0.16	0.17	0.18	0.13	0.21	0.14	0.22	0.26	0.19	0.14	0.20	0.24	0.23	0.28	0.10	0.13	0.41	0.57	0.67	0.48
O2'	0.29	0.24	0.28	0.19	0.29	0.23	0.25	0.21	0.23	0.23	0.29	0.36	0.28	0.44	0.19	0.26	0.32	0.50	0.53	0.37
O3'	0.14	0.21	0.14	0.10	0.18	0.11	0.14	0.15	0.12	0.12	0.23	0.23	0.29	0.27	0.13	0.11	0.24	0.59	0.54	0.32
O4'	0.16	0.25	0.17	0.18	0.19	0.17	0.16	0.19	0.15	0.12	0.27	0.23	0.37	0.32	0.22	0.15	0.34	0.47	0.45	0.38
O5'	0.21	0.34	0.22	0.12	0.30	0.09	0.25	0.12	0.23	0.25	0.35	0.31	0.39	0.23	0.02	0.15	0.21	0.66	0.49	0.34
OP1	0.07	0.16	0.11	0.03	0.15	0.11	0.23	0.22	0.21	0.09	0.15	0.18	0.28	0.20	0.03	0.07	0.27	0.95	0.60	0.46
OP2	0.17	0.23	0.17	0.09	0.37	0.12	0.43	0.23	0.39	0.26	0.29	0.40	0.18	0.13	0.02	0.13	0.27	0.86	0.64	0.49
P	0.07	0.14	0.10	0.02	0.18	0.05	0.23	0.13	0.22	0.12	0.15	0.20	0.20	0.13	0.00	0.03	0.20	0.80	0.50	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.24	0.48	0.36	0.27
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.08	0.04	0.36	0.74	0.65	0.43
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.02	0.07	0.02	0.08	0.02	0.05	0.04	0.13	0.00	0.02	0.01	0.16	0.34	0.29	0.18
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.11	0.02	0.12	0.05	0.06	0.07	0.11	0.02	0.01	0.02	0.12	0.39	0.25	0.18
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.03	0.47	0.94	0.90	0.58
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.04	0.07	0.04	0.08	0.02	0.00	0.03	0.24	0.20	0.05
C5	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.08	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.04	0.49	0.92	0.90	0.59
C5'	0.04	0.10	0.02	0.02	0.17	0.01	0.19	0.00	0.16	0.11	0.14	0.19	0.08	0.08	0.05	0.02	0.01	0.27	0.36	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.15	0.04	0.45	0.79	0.71	0.51
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.36	0.68	0.58	0.41
N3	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.04	0.41	0.86	0.80	0.51
N4	0.02	0.02	0.04	0.07	0.00	0.07	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.10	0.04	0.49	1.00	0.98	0.62
O2	0.04	0.00	0.13	0.11	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.14	0.15	0.06	0.29	0.66	0.57	0.37
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.05	0.08	0.05	0.08	0.06	0.03	0.08	0.06	0.14	0.00	0.03	0.05	0.11	0.34	0.25	0.15
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.09	0.02	0.15	0.05	0.15	0.05	0.07	0.10	0.15	0.03	0.00	0.02	0.14	0.64	0.35	0.26
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.04	0.06	0.05	0.02	0.00	0.22	0.46	0.27	0.25
O5'	0.24	0.36	0.16	0.12	0.47	0.03	0.49	0.01	0.45	0.36	0.41	0.49	0.29	0.11	0.14	0.22	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.48	0.74	0.34	0.39	0.94	0.24	0.92	0.27	0.79	0.68	0.86	1.00	0.66	0.34	0.64	0.46	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.36	0.65	0.29	0.25	0.90	0.20	0.90	0.36	0.71	0.58	0.80	0.98	0.57	0.25	0.35	0.27	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.27	0.43	0.18	0.18	0.58	0.05	0.59	0.02	0.51	0.41	0.51	0.62	0.37	0.15	0.26	0.25	0.01	0.00	0.00	0.00