Doublet Group distance statistics: 52868

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 1, 2, 2, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.012, 0.024, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C2	A	0, -0.001, 0.013, 0.026, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.003, 0.022, 0.041, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.022 std_dev=0.019
C5	A	0, -0.003, 0.020, 0.042, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.020 std_dev=0.022
C4	A	0, -0.003, 0.025, 0.053, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.025 std_dev=0.028
N9	A	0, -0.006, 0.031, 0.068, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.031 std_dev=0.037
N6	A	0, -0.009, 0.039, 0.087, 0.193 max_d=0.193 avg_d=0.039 std_dev=0.048
N7	A	0, -0.008, 0.040, 0.089, 0.191 max_d=0.191 avg_d=0.040 std_dev=0.049
C8	A	0, -0.012, 0.051, 0.113, 0.246 max_d=0.246 avg_d=0.051 std_dev=0.063
O4'	A	0, 0.063, 0.178, 0.293, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.178 std_dev=0.115
C5'	A	0, 0.203, 0.367, 0.531, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.367 std_dev=0.164
C2	B	0, 0.255, 0.455, 0.654, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.455 std_dev=0.200
C2'	A	0, 0.028, 0.237, 0.447, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.237 std_dev=0.209
N3	B	0, 0.243, 0.459, 0.676, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.459 std_dev=0.217
C4	B	0, 0.240, 0.466, 0.693, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.466 std_dev=0.226
O2	B	0, 0.282, 0.510, 0.738, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.510 std_dev=0.228
C4'	A	0, -0.001, 0.227, 0.455, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.227 std_dev=0.228
N1	B	0, 0.213, 0.457, 0.701, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.457 std_dev=0.244
C5	B	0, 0.277, 0.535, 0.793, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.535 std_dev=0.258
C2'	B	0, 0.194, 0.456, 0.717, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.456 std_dev=0.261
N4	B	0, 0.244, 0.505, 0.767, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.505 std_dev=0.261
O2'	B	0, 0.249, 0.524, 0.799, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.524 std_dev=0.275
C6	B	0, 0.248, 0.532, 0.816, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.532 std_dev=0.284
C1'	B	0, 0.162, 0.472, 0.782, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.472 std_dev=0.310
C3'	B	0, 0.179, 0.562, 0.945, 1.422 max_d=1.422 avg_d=0.562 std_dev=0.383
O4'	B	0, 0.150, 0.567, 0.984, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.567 std_dev=0.417
O5'	A	0, 0.003, 0.428, 0.852, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.428 std_dev=0.424
C3'	A	0, -0.039, 0.397, 0.833, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.397 std_dev=0.436
O3'	B	0, 0.207, 0.646, 1.084, 1.661 max_d=1.661 avg_d=0.646 std_dev=0.439
P	A	0, 0.156, 0.618, 1.081, 1.639 max_d=1.639 avg_d=0.618 std_dev=0.462
C4'	B	0, 0.137, 0.628, 1.119, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.628 std_dev=0.491
OP1	A	0, 0.192, 0.722, 1.253, 1.878 max_d=1.878 avg_d=0.722 std_dev=0.531
O5'	B	0, 0.078, 0.617, 1.156, 1.958 max_d=1.958 avg_d=0.617 std_dev=0.539
OP2	A	0, 0.238, 0.792, 1.347, 2.152 max_d=2.152 avg_d=0.792 std_dev=0.554
O2'	A	0, 0.018, 0.596, 1.175, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.596 std_dev=0.578
P	B	0, 0.091, 0.714, 1.337, 2.426 max_d=2.426 avg_d=0.714 std_dev=0.623
C5'	B	0, 0.088, 0.721, 1.355, 2.110 max_d=2.110 avg_d=0.721 std_dev=0.633
OP2	B	0, 0.088, 0.722, 1.357, 2.455 max_d=2.455 avg_d=0.722 std_dev=0.635
OP1	B	0, 0.086, 0.880, 1.675, 3.107 max_d=3.107 avg_d=0.880 std_dev=0.794
O3'	A	0, -0.228, 0.697, 1.623, 3.016 max_d=3.016 avg_d=0.697 std_dev=0.926

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.24	0.01	0.20	0.17	0.33	0.22
C2	0.03	0.00	0.07	0.10	0.01	0.03	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.30	0.28	0.09	0.23	0.26	0.47	0.30
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.02	0.08	0.19	0.06	0.15	0.03	0.08	0.09	0.14	0.06	0.00	0.02	0.01	0.50	0.45	0.52	0.48
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.15	0.01	0.25	0.03	0.23	0.31	0.16	0.08	0.28	0.33	0.18	0.03	0.01	0.02	0.26	0.18	0.17	0.19
C4	0.02	0.01	0.03	0.15	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.25	0.14	0.05	0.25	0.27	0.46	0.31
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.13	0.03	0.03	0.09	0.12	0.06	0.26	0.05	0.01	0.03	0.10	0.16	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.25	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.32	0.11	0.05	0.25	0.33	0.50	0.35
C5'	0.08	0.12	0.19	0.03	0.13	0.01	0.15	0.00	0.15	0.17	0.13	0.11	0.16	0.18	0.12	0.10	0.18	0.02	0.01	0.13	0.16	0.03
C6	0.02	0.01	0.06	0.23	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.34	0.11	0.06	0.25	0.34	0.51	0.35
C8	0.01	0.01	0.15	0.31	0.00	0.13	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.27	0.20	0.08	0.28	0.33	0.47	0.36
N1	0.03	0.01	0.03	0.16	0.01	0.03	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.33	0.18	0.08	0.24	0.31	0.50	0.33
N3	0.03	0.00	0.08	0.08	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.31	0.10	0.23	0.24	0.44	0.28
N6	0.03	0.01	0.09	0.28	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.38	0.14	0.07	0.23	0.37	0.51	0.35
N7	0.01	0.01	0.14	0.33	0.00	0.12	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.33	0.22	0.07	0.27	0.37	0.52	0.38
N9	0.01	0.01	0.06	0.18	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.19	0.08	0.02	0.25	0.26	0.42	0.30
O2'	0.02	0.30	0.00	0.03	0.25	0.26	0.32	0.10	0.34	0.27	0.33	0.26	0.38	0.33	0.19	0.00	0.07	0.17	0.40	0.38	0.58	0.43
O3'	0.24	0.28	0.02	0.01	0.14	0.05	0.11	0.18	0.11	0.20	0.18	0.31	0.14	0.22	0.08	0.07	0.00	0.19	0.26	0.33	0.30	0.26
O4'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.08	0.08	0.10	0.07	0.07	0.02	0.17	0.19	0.00	0.14	0.16	0.25	0.14
O5'	0.20	0.23	0.50	0.26	0.25	0.03	0.25	0.01	0.25	0.28	0.24	0.23	0.23	0.27	0.25	0.40	0.26	0.14	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.17	0.26	0.45	0.18	0.27	0.10	0.33	0.13	0.34	0.33	0.31	0.24	0.37	0.37	0.26	0.38	0.33	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.47	0.52	0.17	0.46	0.16	0.50	0.16	0.51	0.47	0.50	0.44	0.51	0.52	0.42	0.58	0.30	0.25	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.30	0.48	0.19	0.31	0.03	0.35	0.03	0.35	0.36	0.33	0.28	0.35	0.38	0.30	0.43	0.26	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.24	0.10	0.17	0.15	0.14	0.13	0.14	0.13	0.12	0.24	0.15	0.36	0.11	0.24	0.11	0.18	0.26	0.14	0.15
C2	0.10	0.14	0.12	0.19	0.15	0.15	0.18	0.19	0.17	0.11	0.18	0.17	0.21	0.11	0.23	0.11	0.34	0.34	0.32	0.31
C2'	0.14	0.20	0.21	0.35	0.12	0.32	0.19	0.36	0.22	0.12	0.22	0.14	0.35	0.18	0.48	0.21	0.32	0.32	0.15	0.23
C3'	0.13	0.21	0.14	0.20	0.19	0.20	0.22	0.22	0.21	0.15	0.23	0.22	0.33	0.15	0.30	0.16	0.26	0.31	0.44	0.31
C4	0.09	0.16	0.13	0.21	0.11	0.17	0.15	0.19	0.16	0.09	0.20	0.13	0.25	0.12	0.26	0.12	0.30	0.30	0.21	0.24
C4'	0.14	0.18	0.15	0.17	0.11	0.19	0.13	0.18	0.15	0.13	0.17	0.11	0.29	0.17	0.24	0.15	0.13	0.27	0.27	0.18
C5	0.13	0.13	0.15	0.25	0.11	0.22	0.19	0.26	0.21	0.11	0.18	0.14	0.20	0.12	0.28	0.18	0.37	0.37	0.28	0.32
C5'	0.22	0.12	0.23	0.24	0.14	0.28	0.24	0.27	0.27	0.19	0.10	0.12	0.17	0.26	0.30	0.25	0.21	0.24	0.27	0.18
C6	0.14	0.11	0.14	0.24	0.10	0.22	0.21	0.28	0.22	0.13	0.15	0.12	0.16	0.10	0.27	0.19	0.42	0.43	0.39	0.39
C8	0.15	0.17	0.18	0.28	0.14	0.26	0.18	0.27	0.21	0.13	0.19	0.16	0.24	0.16	0.32	0.22	0.28	0.29	0.15	0.20
N1	0.12	0.12	0.13	0.22	0.13	0.19	0.21	0.25	0.20	0.12	0.15	0.14	0.17	0.10	0.24	0.15	0.39	0.41	0.39	0.38
N3	0.08	0.17	0.11	0.18	0.13	0.13	0.15	0.15	0.15	0.09	0.20	0.15	0.25	0.12	0.23	0.09	0.29	0.29	0.24	0.24
N6	0.17	0.11	0.15	0.26	0.09	0.27	0.22	0.34	0.24	0.15	0.13	0.14	0.14	0.12	0.28	0.23	0.47	0.51	0.47	0.47
N7	0.18	0.15	0.18	0.29	0.15	0.28	0.21	0.31	0.24	0.15	0.18	0.18	0.20	0.16	0.32	0.25	0.37	0.36	0.22	0.30
N9	0.09	0.18	0.13	0.21	0.12	0.18	0.14	0.19	0.16	0.09	0.20	0.14	0.29	0.13	0.27	0.13	0.24	0.27	0.14	0.18
O2'	0.11	0.32	0.10	0.27	0.28	0.21	0.30	0.31	0.25	0.17	0.35	0.32	0.50	0.17	0.37	0.12	0.35	0.39	0.30	0.32
O3'	0.22	0.38	0.19	0.18	0.23	0.18	0.14	0.20	0.15	0.22	0.37	0.25	0.54	0.22	0.26	0.19	0.26	0.45	0.48	0.38
O4'	0.13	0.20	0.14	0.17	0.15	0.16	0.14	0.16	0.15	0.15	0.19	0.15	0.28	0.13	0.19	0.14	0.16	0.35	0.23	0.21
O5'	0.23	0.23	0.25	0.10	0.15	0.11	0.20	0.05	0.20	0.19	0.18	0.15	0.34	0.32	0.01	0.18	0.19	0.29	0.35	0.24
OP1	0.07	0.10	0.11	0.02	0.14	0.06	0.24	0.20	0.21	0.07	0.09	0.16	0.23	0.22	0.01	0.03	0.25	0.29	0.26	0.22
OP2	0.07	0.17	0.06	0.06	0.29	0.12	0.37	0.22	0.33	0.18	0.21	0.32	0.21	0.10	0.02	0.13	0.27	0.32	0.33	0.29
P	0.06	0.09	0.09	0.02	0.15	0.03	0.24	0.13	0.22	0.08	0.09	0.17	0.20	0.16	0.00	0.03	0.22	0.27	0.28	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.15	0.18	0.13	0.10
C2	0.02	0.00	0.07	0.05	0.01	0.03	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.07	0.03	0.21	0.18	0.24	0.19
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.08	0.03	0.06	0.05	0.13	0.00	0.03	0.01	0.03	0.18	0.15	0.05
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.16	0.07	0.07	0.11	0.10	0.01	0.01	0.02	0.09	0.21	0.19	0.11
C4	0.02	0.01	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.03	0.26	0.27	0.39	0.30
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.11	0.05	0.05	0.09	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.18	0.11	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.11	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.16	0.05	0.28	0.32	0.44	0.34
C5'	0.03	0.11	0.01	0.01	0.20	0.00	0.23	0.00	0.20	0.12	0.15	0.21	0.07	0.05	0.04	0.01	0.01	0.21	0.14	0.03
C6	0.01	0.00	0.08	0.16	0.01	0.11	0.00	0.20	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.16	0.06	0.27	0.25	0.35	0.28
N1	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.21	0.18	0.23	0.19
N3	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.07	0.03	0.24	0.20	0.30	0.24
N4	0.02	0.02	0.05	0.11	0.01	0.09	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.11	0.04	0.27	0.31	0.43	0.33
O2	0.03	0.01	0.13	0.10	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.16	0.14	0.04	0.19	0.19	0.18	0.15
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.05	0.04	0.03	0.09	0.06	0.16	0.00	0.05	0.06	0.04	0.21	0.14	0.06
O3'	0.03	0.07	0.03	0.01	0.11	0.01	0.16	0.04	0.16	0.06	0.07	0.11	0.14	0.05	0.00	0.02	0.21	0.30	0.26	0.22
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.02	0.00	0.21	0.25	0.12	0.16
O5'	0.15	0.21	0.03	0.09	0.26	0.01	0.28	0.01	0.27	0.21	0.24	0.27	0.19	0.04	0.21	0.21	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.18	0.18	0.18	0.21	0.27	0.18	0.32	0.21	0.25	0.18	0.20	0.31	0.19	0.21	0.30	0.25	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.24	0.15	0.19	0.39	0.11	0.44	0.14	0.35	0.23	0.30	0.43	0.18	0.14	0.26	0.12	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.19	0.05	0.11	0.30	0.03	0.34	0.03	0.28	0.19	0.24	0.33	0.15	0.06	0.22	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00