Doublet Group distance statistics: 52869

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 0, 0, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, -0.001, 0.007, 0.015, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.007 std_dev=0.008
C6	A	0, -0.001, 0.009, 0.019, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.009 std_dev=0.010
C1'	A	0, -0.003, 0.012, 0.027, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.012 std_dev=0.015
N3	A	0, -0.003, 0.014, 0.032, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.014 std_dev=0.018
C5	A	0, -0.005, 0.014, 0.033, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.014 std_dev=0.019
N1	A	0, -0.005, 0.015, 0.035, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.015 std_dev=0.020
C4	A	0, -0.007, 0.019, 0.045, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.019 std_dev=0.026
N9	A	0, -0.009, 0.021, 0.051, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.021 std_dev=0.030
N6	A	0, -0.005, 0.026, 0.058, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.026 std_dev=0.032
N7	A	0, -0.010, 0.032, 0.074, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.032 std_dev=0.042
C8	A	0, -0.015, 0.037, 0.090, 0.186 max_d=0.186 avg_d=0.037 std_dev=0.053
C5	B	0, 0.148, 0.375, 0.602, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.375 std_dev=0.227
C6	B	0, 0.157, 0.407, 0.658, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.407 std_dev=0.251
C2	B	0, 0.181, 0.460, 0.739, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.460 std_dev=0.279
N1	B	0, 0.162, 0.446, 0.730, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.446 std_dev=0.284
O2	B	0, 0.198, 0.504, 0.811, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.504 std_dev=0.307
C4	B	0, 0.115, 0.434, 0.754, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.434 std_dev=0.319
N3	B	0, 0.137, 0.471, 0.805, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.471 std_dev=0.334
C1'	B	0, 0.105, 0.521, 0.937, 1.588 max_d=1.588 avg_d=0.521 std_dev=0.416
C2'	B	0, 0.078, 0.501, 0.925, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.501 std_dev=0.424
N4	B	0, 0.042, 0.491, 0.940, 1.720 max_d=1.720 avg_d=0.491 std_dev=0.449
O4'	A	0, -0.221, 0.247, 0.715, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.247 std_dev=0.468
C3'	B	0, 0.038, 0.531, 1.023, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.531 std_dev=0.492
C2'	A	0, -0.261, 0.252, 0.766, 1.784 max_d=1.784 avg_d=0.252 std_dev=0.513
O4'	B	0, 0.050, 0.575, 1.101, 1.998 max_d=1.998 avg_d=0.575 std_dev=0.526
O2'	B	0, 0.017, 0.592, 1.168, 2.175 max_d=2.175 avg_d=0.592 std_dev=0.576
C4'	B	0, 0.012, 0.600, 1.187, 2.224 max_d=2.224 avg_d=0.600 std_dev=0.588
C5'	B	0, -0.003, 0.608, 1.220, 2.292 max_d=2.292 avg_d=0.608 std_dev=0.611
OP2	A	0, -0.038, 0.583, 1.205, 2.345 max_d=2.345 avg_d=0.583 std_dev=0.622
O3'	B	0, -0.035, 0.588, 1.211, 2.355 max_d=2.355 avg_d=0.588 std_dev=0.623
P	A	0, -0.092, 0.536, 1.164, 2.350 max_d=2.350 avg_d=0.536 std_dev=0.628
C3'	A	0, -0.312, 0.326, 0.963, 2.229 max_d=2.229 avg_d=0.326 std_dev=0.637
O3'	A	0, -0.349, 0.360, 1.070, 2.481 max_d=2.481 avg_d=0.360 std_dev=0.710
O5'	A	0, -0.274, 0.450, 1.175, 2.596 max_d=2.596 avg_d=0.450 std_dev=0.724
C4'	A	0, -0.372, 0.361, 1.095, 2.550 max_d=2.550 avg_d=0.361 std_dev=0.734
O5'	B	0, -0.136, 0.605, 1.346, 2.717 max_d=2.717 avg_d=0.605 std_dev=0.741
OP1	A	0, -0.134, 0.633, 1.399, 2.875 max_d=2.875 avg_d=0.633 std_dev=0.767
O2'	A	0, -0.391, 0.425, 1.242, 2.860 max_d=2.860 avg_d=0.425 std_dev=0.816
OP1	B	0, -0.272, 0.713, 1.697, 3.564 max_d=3.564 avg_d=0.713 std_dev=0.984
P	B	0, -0.302, 0.710, 1.723, 3.649 max_d=3.649 avg_d=0.710 std_dev=1.013
C5'	A	0, -0.583, 0.570, 1.724, 4.018 max_d=4.018 avg_d=0.570 std_dev=1.154
OP2	B	0, -0.598, 0.849, 2.296, 5.120 max_d=5.120 avg_d=0.849 std_dev=1.447

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.00	0.19	0.07	0.37	0.17
C2	0.02	0.00	0.29	0.36	0.00	0.09	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.14	0.12	0.15	0.17	0.51	0.24
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.14	0.01	0.03	0.11	0.09	0.18	0.20	0.31	0.04	0.12	0.02	0.00	0.03	0.02	0.44	0.45	0.12	0.25
C3'	0.01	0.36	0.00	0.00	0.29	0.00	0.30	0.01	0.35	0.15	0.37	0.32	0.34	0.23	0.18	0.01	0.01	0.01	0.26	0.39	0.16	0.12
C4	0.01	0.00	0.14	0.29	0.00	0.10	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.08	0.06	0.16	0.18	0.50	0.25
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.16	0.15	0.13	0.06	0.18	0.18	0.09	0.20	0.02	0.00	0.01	0.09	0.35	0.12
C5	0.01	0.00	0.03	0.30	0.00	0.16	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.12	0.01	0.14	0.28	0.54	0.29
C5'	0.03	0.19	0.11	0.01	0.18	0.00	0.27	0.00	0.29	0.23	0.25	0.14	0.34	0.30	0.14	0.09	0.11	0.01	0.01	0.17	0.29	0.01
C6	0.01	0.00	0.09	0.35	0.00	0.16	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.29	0.17	0.03	0.13	0.30	0.55	0.30
C8	0.01	0.00	0.18	0.15	0.00	0.15	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.32	0.03	0.10	0.16	0.27	0.51	0.29
N1	0.02	0.00	0.20	0.37	0.00	0.13	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.17	0.08	0.14	0.24	0.54	0.28
N3	0.02	0.00	0.31	0.32	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.09	0.12	0.16	0.13	0.47	0.21
N6	0.01	0.00	0.04	0.34	0.01	0.18	0.00	0.34	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.36	0.19	0.02	0.12	0.36	0.55	0.33
N7	0.00	0.00	0.12	0.23	0.00	0.18	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.37	0.10	0.08	0.14	0.34	0.54	0.32
N9	0.00	0.01	0.02	0.18	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.03	0.01	0.18	0.16	0.46	0.23
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.16	0.20	0.29	0.09	0.29	0.32	0.19	0.07	0.36	0.37	0.18	0.00	0.06	0.16	0.21	0.28	0.13	0.11
O3'	0.21	0.14	0.03	0.01	0.08	0.02	0.12	0.11	0.17	0.03	0.17	0.09	0.19	0.10	0.03	0.06	0.00	0.13	0.07	0.27	0.24	0.04
O4'	0.00	0.12	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.08	0.12	0.02	0.08	0.01	0.16	0.13	0.00	0.05	0.16	0.50	0.30
O5'	0.19	0.15	0.44	0.26	0.16	0.01	0.14	0.01	0.13	0.16	0.14	0.16	0.12	0.14	0.18	0.21	0.07	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.17	0.45	0.39	0.18	0.09	0.28	0.17	0.30	0.27	0.24	0.13	0.36	0.34	0.16	0.28	0.27	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.37	0.51	0.12	0.16	0.50	0.35	0.54	0.29	0.55	0.51	0.54	0.47	0.55	0.54	0.46	0.13	0.24	0.50	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.24	0.25	0.12	0.25	0.12	0.29	0.01	0.30	0.29	0.28	0.21	0.33	0.32	0.23	0.11	0.04	0.30	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.09	0.33	0.32	0.19	0.30	0.10	0.25	0.09	0.09	0.20	0.27	0.11	0.42	0.37	0.24	0.28	0.42	0.36	0.32
C2	0.10	0.20	0.20	0.23	0.30	0.16	0.17	0.14	0.11	0.11	0.32	0.42	0.22	0.24	0.30	0.09	0.53	0.67	0.86	0.65
C2'	0.09	0.10	0.13	0.05	0.20	0.05	0.18	0.08	0.11	0.06	0.16	0.25	0.11	0.28	0.08	0.05	0.59	0.81	0.65	0.65
C3'	0.11	0.26	0.08	0.04	0.21	0.04	0.14	0.04	0.11	0.16	0.27	0.22	0.32	0.08	0.03	0.09	0.48	0.67	0.32	0.45
C4	0.11	0.18	0.24	0.26	0.29	0.20	0.15	0.17	0.07	0.06	0.31	0.40	0.19	0.28	0.32	0.11	0.49	0.64	0.75	0.59
C4'	0.24	0.47	0.17	0.03	0.38	0.03	0.26	0.05	0.22	0.32	0.49	0.39	0.56	0.13	0.14	0.14	0.35	0.45	0.10	0.27
C5	0.13	0.18	0.24	0.28	0.30	0.21	0.15	0.19	0.08	0.10	0.30	0.43	0.19	0.27	0.33	0.12	0.55	0.74	0.91	0.68
C5'	0.53	0.63	0.53	0.32	0.44	0.32	0.34	0.19	0.36	0.52	0.58	0.40	0.75	0.56	0.19	0.43	0.52	0.63	0.07	0.37
C6	0.13	0.20	0.23	0.26	0.30	0.19	0.16	0.18	0.11	0.12	0.30	0.45	0.20	0.25	0.32	0.11	0.58	0.78	1.02	0.74
C8	0.18	0.15	0.29	0.33	0.25	0.27	0.13	0.24	0.06	0.09	0.25	0.33	0.16	0.32	0.37	0.19	0.47	0.66	0.69	0.56
N1	0.11	0.20	0.21	0.24	0.29	0.16	0.17	0.16	0.11	0.12	0.31	0.43	0.22	0.24	0.31	0.10	0.57	0.74	0.98	0.72
N3	0.09	0.19	0.21	0.23	0.29	0.17	0.17	0.15	0.09	0.08	0.32	0.40	0.21	0.26	0.30	0.09	0.48	0.61	0.74	0.58
N6	0.14	0.19	0.23	0.27	0.28	0.20	0.17	0.19	0.13	0.14	0.27	0.41	0.20	0.25	0.33	0.13	0.61	0.84	1.13	0.81
N7	0.16	0.17	0.27	0.31	0.28	0.24	0.15	0.22	0.08	0.11	0.27	0.38	0.18	0.29	0.35	0.16	0.54	0.76	0.89	0.68
N9	0.16	0.14	0.28	0.30	0.25	0.25	0.12	0.21	0.05	0.05	0.26	0.33	0.15	0.33	0.35	0.16	0.42	0.58	0.60	0.49
O2'	0.39	0.18	0.47	0.30	0.17	0.33	0.14	0.19	0.06	0.20	0.09	0.30	0.32	0.72	0.34	0.33	0.34	0.57	0.52	0.45
O3'	0.21	0.44	0.14	0.04	0.39	0.04	0.26	0.03	0.22	0.29	0.48	0.42	0.52	0.11	0.07	0.14	0.43	0.57	0.23	0.38
O4'	0.05	0.40	0.12	0.26	0.39	0.22	0.24	0.23	0.15	0.20	0.47	0.43	0.45	0.21	0.41	0.08	0.25	0.33	0.16	0.22
O5'	0.33	0.54	0.31	0.20	0.53	0.11	0.44	0.06	0.39	0.44	0.57	0.54	0.56	0.18	0.01	0.23	0.44	0.57	0.03	0.31
OP1	0.03	0.12	0.09	0.06	0.04	0.21	0.11	0.37	0.12	0.02	0.12	0.05	0.21	0.14	0.01	0.16	0.17	0.15	0.83	0.35
OP2	0.09	0.09	0.10	0.07	0.14	0.05	0.17	0.07	0.16	0.11	0.11	0.15	0.07	0.09	0.00	0.07	0.55	0.98	0.31	0.56
P	0.05	0.15	0.07	0.01	0.11	0.05	0.08	0.10	0.07	0.09	0.15	0.12	0.19	0.05	0.00	0.02	0.25	0.53	0.22	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.12	0.16	0.17
C2	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.33	0.28	0.56	0.39
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.20	0.24	0.06	0.17
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.03	0.04	0.04	0.06	0.02	0.00	0.01	0.27	0.38	0.03	0.20
C4	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.50	0.52	0.95	0.64
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.11	0.23	0.02
C5	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.55	0.58	0.98	0.68
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.05	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.24	0.29	0.01
C6	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.48	0.48	0.74	0.56
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.34	0.30	0.50	0.38
N3	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.01	0.41	0.39	0.77	0.52
N4	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.54	0.59	1.08	0.71
O2	0.01	0.00	0.06	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.02	0.23	0.15	0.40	0.27
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.05	0.02	0.05	0.02	0.01	0.04	0.03	0.06	0.00	0.04	0.04	0.05	0.08	0.19	0.04
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.05	0.04	0.07	0.04	0.00	0.01	0.20	0.40	0.24	0.12
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.00	0.05	0.04	0.06	0.07
O5'	0.15	0.33	0.20	0.27	0.50	0.01	0.55	0.00	0.48	0.34	0.41	0.54	0.23	0.05	0.20	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	0.28	0.24	0.38	0.52	0.11	0.58	0.24	0.48	0.30	0.39	0.59	0.15	0.08	0.40	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.56	0.06	0.03	0.95	0.23	0.98	0.29	0.74	0.50	0.77	1.08	0.40	0.19	0.24	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.39	0.17	0.20	0.64	0.02	0.68	0.01	0.56	0.38	0.52	0.71	0.27	0.04	0.12	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00