Doublet Group distance statistics: 52870

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 2, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C2	A	0, -0.001, 0.010, 0.021, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.010 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.002, 0.013, 0.025, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.016 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.001, 0.015, 0.030, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.001, 0.017, 0.034, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.017 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.003, 0.023, 0.043, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.023 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.006, 0.028, 0.051, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.028 std_dev=0.022
N7	A	0, -0.001, 0.024, 0.048, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C8	A	0, -0.002, 0.030, 0.062, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.030 std_dev=0.032
O4'	A	0, -0.007, 0.138, 0.283, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.138 std_dev=0.145
C2'	A	0, 0.012, 0.168, 0.323, 0.390 max_d=0.390 avg_d=0.168 std_dev=0.156
O2'	A	0, 0.048, 0.229, 0.411, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.229 std_dev=0.182
C4'	A	0, 0.007, 0.241, 0.475, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.241 std_dev=0.234
C3'	A	0, 0.015, 0.253, 0.491, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.253 std_dev=0.238
C5	B	0, 0.039, 0.318, 0.597, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.318 std_dev=0.279
C4	B	0, 0.059, 0.349, 0.639, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.349 std_dev=0.290
N1	B	0, 0.069, 0.368, 0.667, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.368 std_dev=0.299
C2'	B	0, 0.077, 0.380, 0.683, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.380 std_dev=0.303
C6	B	0, 0.043, 0.358, 0.673, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.358 std_dev=0.315
C2	B	0, 0.106, 0.439, 0.773, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.439 std_dev=0.333
N4	B	0, 0.093, 0.429, 0.765, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.429 std_dev=0.336
O3'	A	0, 0.030, 0.368, 0.705, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.368 std_dev=0.338
O2'	B	0, 0.101, 0.455, 0.809, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.455 std_dev=0.354
C3'	B	0, 0.075, 0.432, 0.789, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.432 std_dev=0.357
N3	B	0, 0.102, 0.460, 0.818, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.460 std_dev=0.358
C1'	B	0, 0.096, 0.458, 0.819, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.458 std_dev=0.361
P	A	0, 0.086, 0.458, 0.830, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.458 std_dev=0.372
O3'	B	0, 0.078, 0.465, 0.853, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.465 std_dev=0.387
O5'	A	0, 0.027, 0.419, 0.811, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.419 std_dev=0.392
C5'	A	0, 0.008, 0.408, 0.808, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.408 std_dev=0.400
O2	B	0, 0.139, 0.567, 0.996, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.567 std_dev=0.428
OP2	A	0, 0.134, 0.570, 1.005, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.570 std_dev=0.435
O4'	B	0, 0.096, 0.563, 1.029, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.563 std_dev=0.467
C4'	B	0, 0.111, 0.591, 1.071, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.591 std_dev=0.480
OP1	A	0, 0.016, 0.518, 1.020, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.518 std_dev=0.502
C5'	B	0, 0.136, 0.724, 1.311, 1.724 max_d=1.724 avg_d=0.724 std_dev=0.587
O5'	B	0, 0.116, 1.006, 1.896, 2.397 max_d=2.397 avg_d=1.006 std_dev=0.890
OP1	B	0, 0.125, 1.148, 2.172, 2.808 max_d=2.808 avg_d=1.148 std_dev=1.023
P	B	0, 0.094, 1.133, 2.173, 2.866 max_d=2.866 avg_d=1.133 std_dev=1.040
OP2	B	0, 0.055, 1.269, 2.483, 3.173 max_d=3.173 avg_d=1.269 std_dev=1.214

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.12	0.07	0.35	0.13
C2	0.03	0.00	0.17	0.18	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.22	0.03	0.22	0.15	0.38	0.20
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.10	0.01	0.09	0.02	0.12	0.06	0.15	0.16	0.12	0.07	0.04	0.00	0.02	0.01	0.17	0.15	0.26	0.07
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.11	0.00	0.11	0.03	0.14	0.08	0.17	0.15	0.15	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.22	0.22	0.20	0.09
C4	0.02	0.01	0.10	0.11	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.12	0.02	0.23	0.14	0.37	0.19
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.08	0.07	0.06	0.10	0.08	0.04	0.07	0.02	0.00	0.03	0.10	0.31	0.06
C5	0.01	0.01	0.09	0.11	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.02	0.29	0.22	0.38	0.24
C5'	0.02	0.10	0.02	0.03	0.09	0.01	0.13	0.00	0.15	0.13	0.13	0.08	0.18	0.15	0.08	0.07	0.04	0.01	0.01	0.11	0.30	0.02
C6	0.02	0.00	0.12	0.14	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.17	0.02	0.29	0.25	0.40	0.26
C8	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.09	0.04	0.29	0.18	0.36	0.21
N1	0.03	0.00	0.15	0.17	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.21	0.03	0.27	0.21	0.40	0.24
N3	0.03	0.00	0.16	0.15	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.19	0.04	0.20	0.12	0.37	0.18
N6	0.02	0.01	0.12	0.15	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.12	0.18	0.03	0.32	0.31	0.41	0.29
N7	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.10	0.03	0.32	0.25	0.38	0.26
N9	0.00	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.21	0.11	0.36	0.17
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.09	0.07	0.08	0.07	0.12	0.04	0.16	0.15	0.12	0.05	0.03	0.00	0.03	0.06	0.12	0.17	0.27	0.09
O3'	0.02	0.22	0.02	0.01	0.12	0.02	0.12	0.04	0.17	0.09	0.21	0.19	0.18	0.10	0.05	0.03	0.00	0.02	0.18	0.28	0.17	0.12
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.08	0.08	0.38	0.16
O5'	0.12	0.22	0.17	0.22	0.23	0.03	0.29	0.01	0.29	0.29	0.27	0.20	0.32	0.32	0.21	0.12	0.18	0.08	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.07	0.15	0.15	0.22	0.14	0.10	0.22	0.11	0.25	0.18	0.21	0.12	0.31	0.25	0.11	0.17	0.28	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.35	0.38	0.26	0.20	0.37	0.31	0.38	0.30	0.40	0.36	0.40	0.37	0.41	0.38	0.36	0.27	0.17	0.38	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.20	0.07	0.09	0.19	0.06	0.24	0.02	0.26	0.21	0.24	0.18	0.29	0.26	0.17	0.09	0.12	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.25	0.18	0.21	0.14	0.18	0.16	0.20	0.16	0.15	0.25	0.15	0.34	0.21	0.23	0.16	0.72	0.80	0.92	0.82
C2	0.18	0.22	0.16	0.23	0.24	0.25	0.28	0.33	0.25	0.19	0.26	0.29	0.27	0.17	0.24	0.22	0.83	0.99	1.08	0.99
C2'	0.12	0.26	0.12	0.18	0.16	0.16	0.16	0.20	0.16	0.14	0.27	0.17	0.38	0.14	0.21	0.13	0.69	0.80	0.96	0.82
C3'	0.10	0.24	0.09	0.18	0.13	0.17	0.15	0.23	0.16	0.12	0.24	0.14	0.36	0.08	0.22	0.13	0.60	0.72	0.91	0.74
C4	0.16	0.22	0.16	0.22	0.18	0.22	0.23	0.28	0.23	0.17	0.26	0.19	0.28	0.17	0.24	0.19	0.82	0.96	1.05	0.97
C4'	0.13	0.27	0.10	0.16	0.18	0.15	0.17	0.18	0.16	0.16	0.27	0.18	0.39	0.08	0.20	0.13	0.54	0.62	0.79	0.64
C5	0.18	0.20	0.15	0.23	0.18	0.26	0.25	0.34	0.26	0.19	0.23	0.18	0.23	0.15	0.25	0.24	0.83	1.01	1.09	1.01
C5'	0.28	0.33	0.27	0.24	0.21	0.24	0.20	0.23	0.23	0.27	0.30	0.19	0.43	0.25	0.24	0.26	0.43	0.52	0.72	0.53
C6	0.19	0.19	0.15	0.24	0.19	0.29	0.26	0.39	0.26	0.19	0.22	0.21	0.21	0.15	0.26	0.26	0.82	1.04	1.11	1.02
C8	0.20	0.22	0.17	0.22	0.15	0.24	0.20	0.28	0.25	0.20	0.22	0.14	0.25	0.16	0.25	0.23	0.80	0.93	1.00	0.93
N1	0.19	0.20	0.16	0.24	0.22	0.29	0.28	0.38	0.27	0.20	0.24	0.25	0.23	0.16	0.25	0.26	0.82	1.02	1.10	1.01
N3	0.17	0.24	0.16	0.21	0.23	0.22	0.25	0.28	0.22	0.18	0.28	0.26	0.30	0.18	0.23	0.19	0.82	0.95	1.05	0.96
N6	0.21	0.17	0.16	0.25	0.18	0.33	0.25	0.44	0.27	0.19	0.20	0.20	0.18	0.16	0.27	0.30	0.79	1.06	1.10	1.02
N7	0.21	0.20	0.15	0.23	0.17	0.27	0.23	0.34	0.27	0.20	0.22	0.18	0.22	0.15	0.25	0.26	0.82	1.01	1.07	1.00
N9	0.16	0.23	0.16	0.21	0.14	0.20	0.18	0.24	0.20	0.16	0.24	0.14	0.29	0.18	0.23	0.18	0.79	0.90	0.99	0.91
O2'	0.20	0.30	0.21	0.24	0.19	0.22	0.18	0.22	0.19	0.20	0.30	0.18	0.42	0.22	0.26	0.20	0.68	0.75	0.92	0.79
O3'	0.12	0.26	0.11	0.19	0.14	0.18	0.15	0.23	0.16	0.13	0.26	0.16	0.39	0.11	0.23	0.14	0.56	0.67	0.89	0.70
O4'	0.09	0.24	0.12	0.19	0.18	0.16	0.16	0.18	0.15	0.12	0.25	0.20	0.32	0.16	0.24	0.12	0.63	0.69	0.81	0.71
O5'	0.17	0.26	0.23	0.09	0.19	0.06	0.19	0.14	0.16	0.15	0.25	0.22	0.36	0.37	0.02	0.11	0.51	0.63	0.84	0.64
OP1	0.07	0.19	0.13	0.02	0.11	0.09	0.13	0.21	0.11	0.07	0.18	0.13	0.30	0.19	0.03	0.04	0.53	0.42	0.70	0.48
OP2	0.17	0.28	0.21	0.10	0.33	0.17	0.34	0.33	0.31	0.24	0.32	0.36	0.29	0.20	0.01	0.16	0.54	0.62	0.80	0.60
P	0.06	0.15	0.13	0.01	0.12	0.06	0.15	0.17	0.13	0.06	0.15	0.14	0.23	0.18	0.01	0.03	0.47	0.49	0.70	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.27	0.27	0.20	0.20
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.11	0.04	0.52	0.53	0.56	0.50
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.03	0.08	0.07	0.12	0.00	0.01	0.01	0.27	0.33	0.31	0.27
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.10	0.10	0.12	0.03	0.01	0.01	0.35	0.43	0.36	0.35
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.04	0.74	0.80	0.85	0.79
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.07	0.09	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.16	0.19	0.06
C5	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.11	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.12	0.04	0.79	0.83	0.84	0.83
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.15	0.01	0.17	0.00	0.15	0.08	0.11	0.16	0.06	0.06	0.06	0.02	0.01	0.27	0.35	0.02
C6	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.10	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.04	0.69	0.68	0.62	0.66
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.51	0.50	0.47	0.47
N3	0.02	0.00	0.08	0.10	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.04	0.64	0.67	0.73	0.65
N4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.09	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.12	0.04	0.79	0.90	0.97	0.88
O2	0.03	0.00	0.12	0.12	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.15	0.04	0.39	0.40	0.46	0.37
O2'	0.01	0.06	0.00	0.03	0.04	0.05	0.05	0.06	0.05	0.02	0.05	0.04	0.10	0.00	0.05	0.04	0.08	0.16	0.22	0.14
O3'	0.02	0.11	0.01	0.01	0.11	0.02	0.12	0.06	0.11	0.05	0.12	0.12	0.15	0.05	0.00	0.02	0.30	0.38	0.46	0.31
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.00	0.20	0.17	0.16	0.08
O5'	0.27	0.52	0.27	0.35	0.74	0.01	0.79	0.01	0.69	0.51	0.64	0.79	0.39	0.08	0.30	0.20	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.27	0.53	0.33	0.43	0.80	0.16	0.83	0.27	0.68	0.50	0.67	0.90	0.40	0.16	0.38	0.17	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.20	0.56	0.31	0.36	0.85	0.19	0.84	0.35	0.62	0.47	0.73	0.97	0.46	0.22	0.46	0.16	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.20	0.50	0.27	0.35	0.79	0.06	0.83	0.02	0.66	0.47	0.65	0.88	0.37	0.14	0.31	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00