Doublet Group distance statistics: 52873

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C2	A	0, -0.001, 0.013, 0.028, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.013 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.009, 0.026, 0.044, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.005, 0.022, 0.040, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.018
C1'	A	0, -0.001, 0.020, 0.042, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.020 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.001, 0.025, 0.049, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.025 std_dev=0.024
C2	B	0, 0.113, 0.270, 0.427, 0.430 max_d=0.430 avg_d=0.270 std_dev=0.157
C2'	A	0, 0.103, 0.271, 0.440, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.271 std_dev=0.169
O2	B	0, 0.126, 0.307, 0.488, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.307 std_dev=0.181
N1	B	0, 0.091, 0.288, 0.485, 0.551 max_d=0.551 avg_d=0.288 std_dev=0.197
N3	B	0, 0.107, 0.309, 0.512, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.309 std_dev=0.203
O4'	A	0, 0.079, 0.300, 0.520, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.300 std_dev=0.220
C1'	B	0, 0.110, 0.358, 0.606, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.358 std_dev=0.248
O2'	A	0, 0.147, 0.417, 0.687, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.417 std_dev=0.270
O4'	B	0, 0.100, 0.376, 0.651, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.376 std_dev=0.276
C3'	A	0, 0.112, 0.389, 0.666, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.389 std_dev=0.277
C6	B	0, 0.060, 0.358, 0.655, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.358 std_dev=0.298
C4	B	0, 0.054, 0.365, 0.676, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.365 std_dev=0.311
C2'	B	0, 0.122, 0.477, 0.833, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.477 std_dev=0.356
C5	B	0, 0.031, 0.394, 0.758, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.394 std_dev=0.363
O3'	A	0, 0.185, 0.559, 0.933, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.559 std_dev=0.374
C4'	A	0, 0.074, 0.473, 0.872, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.473 std_dev=0.399
N4	B	0, 0.056, 0.457, 0.857, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.457 std_dev=0.400
O2'	B	0, 0.150, 0.573, 0.995, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.573 std_dev=0.422
C4'	B	0, 0.107, 0.543, 0.979, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.543 std_dev=0.436
C3'	B	0, 0.109, 0.558, 1.007, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.558 std_dev=0.449
C5'	B	0, 0.107, 0.611, 1.114, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.611 std_dev=0.503
O3'	B	0, 0.132, 0.691, 1.250, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.691 std_dev=0.559
O5'	B	0, 0.079, 0.647, 1.215, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.647 std_dev=0.568
P	B	0, 0.139, 0.729, 1.319, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.729 std_dev=0.590
C5'	A	0, 0.052, 0.765, 1.478, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.765 std_dev=0.713
O5'	A	0, -0.010, 0.773, 1.555, 1.837 max_d=1.837 avg_d=0.773 std_dev=0.783
P	A	0, -0.100, 1.141, 2.381, 2.787 max_d=2.787 avg_d=1.141 std_dev=1.240
OP2	B	0, 0.217, 1.470, 2.723, 2.863 max_d=2.863 avg_d=1.470 std_dev=1.253
OP1	A	0, -0.033, 1.288, 2.609, 2.973 max_d=2.973 avg_d=1.288 std_dev=1.321
OP2	A	0, -0.123, 1.307, 2.738, 3.214 max_d=3.214 avg_d=1.307 std_dev=1.430
OP1	B	0, 0.030, 1.724, 3.418, 3.781 max_d=3.781 avg_d=1.724 std_dev=1.694

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.28	0.01	0.19	0.10	0.28	0.18
C2	0.04	0.00	0.04	0.06	0.01	0.15	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.07	0.34	0.13	0.16	0.13	0.46	0.24
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.05	0.01	0.07	0.14	0.06	0.08	0.06	0.03	0.07	0.08	0.05	0.00	0.10	0.02	0.31	0.16	0.36	0.28
C3'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.05	0.11	0.04	0.07	0.06	0.10	0.04	0.02	0.02	0.02	0.06	0.16	0.13	0.09
C4	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.29	0.07	0.25	0.23	0.51	0.34
C4'	0.02	0.15	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.13	0.11	0.15	0.05	0.10	0.03	0.10	0.07	0.00	0.03	0.11	0.05	0.03
C5	0.02	0.01	0.07	0.06	0.01	0.03	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.25	0.05	0.36	0.38	0.68	0.50
C5'	0.05	0.10	0.14	0.01	0.06	0.00	0.16	0.00	0.11	0.32	0.05	0.10	0.17	0.29	0.14	0.05	0.16	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.03	0.01	0.06	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.27	0.07	0.33	0.37	0.70	0.48
C8	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.13	0.01	0.32	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.14	0.19	0.08	0.49	0.47	0.72	0.60
N1	0.03	0.00	0.06	0.04	0.01	0.11	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.32	0.10	0.24	0.25	0.59	0.36
N3	0.03	0.00	0.03	0.07	0.00	0.15	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.34	0.12	0.14	0.10	0.39	0.20
N6	0.03	0.02	0.07	0.06	0.01	0.05	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.12	0.25	0.06	0.39	0.47	0.81	0.58
N7	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.10	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.14	0.20	0.05	0.48	0.53	0.82	0.65
N9	0.01	0.02	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.24	0.02	0.31	0.25	0.48	0.36
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.08	0.10	0.11	0.05	0.11	0.14	0.09	0.06	0.12	0.14	0.09	0.00	0.15	0.03	0.29	0.15	0.43	0.28
O3'	0.28	0.34	0.10	0.02	0.29	0.07	0.25	0.16	0.27	0.19	0.32	0.34	0.25	0.20	0.24	0.15	0.00	0.22	0.19	0.63	0.37	0.41
O4'	0.01	0.13	0.02	0.02	0.07	0.00	0.05	0.01	0.07	0.08	0.10	0.12	0.06	0.05	0.02	0.03	0.22	0.00	0.08	0.10	0.13	0.07
O5'	0.19	0.16	0.31	0.06	0.25	0.03	0.36	0.01	0.33	0.49	0.24	0.14	0.39	0.48	0.31	0.29	0.19	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.10	0.13	0.16	0.16	0.23	0.11	0.38	0.06	0.37	0.47	0.25	0.10	0.47	0.53	0.25	0.15	0.63	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.46	0.36	0.13	0.51	0.05	0.68	0.02	0.70	0.72	0.59	0.39	0.81	0.82	0.48	0.43	0.37	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.24	0.28	0.09	0.34	0.03	0.50	0.01	0.48	0.60	0.36	0.20	0.58	0.65	0.36	0.28	0.41	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.16	0.48	0.57	0.15	0.51	0.05	0.47	0.14	0.22	0.11	0.31	0.20	0.49	0.65	0.35	0.33	0.98	1.08	0.08
C2	0.24	0.17	0.31	0.25	0.08	0.24	0.06	0.16	0.08	0.15	0.12	0.15	0.24	0.35	0.29	0.20	0.10	0.63	0.80	0.23
C2'	0.36	0.16	0.49	0.60	0.12	0.56	0.04	0.55	0.16	0.22	0.11	0.28	0.20	0.51	0.71	0.38	0.40	1.05	1.05	0.19
C3'	0.43	0.20	0.56	0.68	0.12	0.66	0.08	0.66	0.24	0.29	0.12	0.27	0.23	0.58	0.78	0.47	0.56	1.15	0.98	0.33
C4	0.29	0.18	0.38	0.40	0.07	0.36	0.04	0.31	0.16	0.21	0.12	0.19	0.21	0.38	0.44	0.27	0.18	0.91	0.92	0.11
C4'	0.58	0.26	0.72	0.88	0.12	0.86	0.12	0.89	0.36	0.40	0.12	0.34	0.30	0.73	0.97	0.64	0.81	1.45	0.76	0.55
C5	0.28	0.19	0.34	0.36	0.11	0.33	0.15	0.30	0.21	0.23	0.14	0.09	0.20	0.34	0.39	0.27	0.20	1.02	0.84	0.13
C5'	0.73	0.32	0.82	1.02	0.08	1.08	0.29	1.19	0.56	0.54	0.12	0.32	0.33	0.83	1.09	0.87	1.19	2.08	0.22	1.04
C6	0.25	0.20	0.28	0.27	0.13	0.26	0.14	0.22	0.19	0.21	0.17	0.11	0.21	0.29	0.29	0.23	0.14	0.92	0.77	0.17
C8	0.31	0.18	0.40	0.46	0.08	0.42	0.16	0.41	0.24	0.25	0.10	0.11	0.18	0.39	0.51	0.32	0.33	1.20	0.92	0.15
N1	0.23	0.19	0.26	0.22	0.07	0.22	0.07	0.16	0.13	0.18	0.15	0.09	0.23	0.29	0.24	0.20	0.09	0.74	0.75	0.22
N3	0.28	0.17	0.38	0.36	0.14	0.32	0.09	0.23	0.07	0.17	0.14	0.23	0.23	0.40	0.42	0.24	0.09	0.69	0.91	0.18
N6	0.23	0.21	0.25	0.25	0.20	0.24	0.20	0.22	0.22	0.22	0.20	0.19	0.20	0.25	0.26	0.22	0.15	0.98	0.73	0.18
N7	0.29	0.20	0.36	0.41	0.15	0.38	0.21	0.36	0.26	0.25	0.14	0.08	0.18	0.35	0.44	0.30	0.29	1.18	0.85	0.15
N9	0.31	0.17	0.42	0.47	0.08	0.43	0.05	0.39	0.18	0.22	0.10	0.22	0.19	0.41	0.53	0.31	0.28	1.04	0.99	0.09
O2'	0.34	0.16	0.48	0.59	0.15	0.55	0.08	0.52	0.10	0.20	0.12	0.29	0.21	0.52	0.72	0.37	0.30	0.83	1.11	0.18
O3'	0.08	0.25	0.13	0.21	0.41	0.20	0.36	0.22	0.23	0.18	0.35	0.51	0.21	0.15	0.33	0.07	0.15	0.60	1.34	0.08
O4'	0.47	0.22	0.60	0.72	0.12	0.68	0.08	0.67	0.30	0.34	0.11	0.33	0.25	0.60	0.78	0.50	0.59	1.29	0.90	0.31
O5'	0.59	0.25	0.63	0.81	0.15	0.90	0.35	1.04	0.53	0.45	0.16	0.31	0.23	0.61	0.85	0.74	1.04	2.08	0.26	0.97
OP1	0.69	0.27	0.75	0.99	0.13	1.10	0.35	1.28	0.57	0.50	0.15	0.31	0.25	0.76	1.08	0.88	1.26	2.23	0.17	1.24
OP2	0.46	0.16	0.44	0.66	0.16	0.81	0.37	1.00	0.50	0.35	0.21	0.31	0.17	0.41	0.68	0.67	1.04	2.25	0.07	1.08
P	0.61	0.20	0.63	0.86	0.12	0.99	0.36	1.17	0.56	0.45	0.14	0.32	0.17	0.62	0.91	0.81	1.19	2.31	0.11	1.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.32	0.29	0.20
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.07	0.61	0.49	0.25
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.06	0.05	0.06	0.00	0.02	0.00	0.09	0.22	0.25	0.17
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.03	0.02	0.02	0.06	0.06	0.06	0.01	0.01	0.01	0.13	0.11	0.19	0.13
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.07	0.85	0.78	0.26
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.17	0.33	0.08
C5	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.06	0.86	0.80	0.26
C5'	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.37	0.39	0.01
C6	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.68	0.58	0.26
N1	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.55	0.42	0.24
N3	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.06	0.01	0.07	0.76	0.64	0.25
N4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.03	0.06	0.93	0.89	0.25
O2	0.01	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.07	0.52	0.41	0.24
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.06	0.06	0.07	0.00	0.03	0.03	0.07	0.16	0.23	0.13
O3'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.06	0.06	0.07	0.03	0.00	0.01	0.16	0.21	0.11	0.10
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.21	0.37	0.18
O5'	0.05	0.07	0.09	0.13	0.07	0.02	0.06	0.01	0.06	0.06	0.07	0.06	0.07	0.07	0.16	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.32	0.61	0.22	0.11	0.85	0.17	0.86	0.37	0.68	0.55	0.76	0.93	0.52	0.16	0.21	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.49	0.25	0.19	0.78	0.33	0.80	0.39	0.58	0.42	0.64	0.89	0.41	0.23	0.11	0.37	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.25	0.17	0.13	0.26	0.08	0.26	0.01	0.26	0.24	0.25	0.25	0.24	0.13	0.10	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00