Doublet Group distance statistics: 52875

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.011, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N1	A	0, -0.001, 0.006, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.006 std_dev=0.007
C4	A	0, -0.001, 0.007, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N9	A	0, -0.002, 0.009, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.010
C2	A	0, -0.002, 0.010, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.012
C1'	A	0, -0.003, 0.010, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.010 std_dev=0.013
N7	A	0, -0.001, 0.012, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.013
C8	A	0, -0.001, 0.013, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.014
N6	A	0, -0.002, 0.018, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.018 std_dev=0.020
C2'	A	0, -0.021, 0.082, 0.185, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.082 std_dev=0.103
O4'	A	0, -0.032, 0.099, 0.230, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.099 std_dev=0.131
C5	B	0, -0.120, 0.378, 0.876, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.378 std_dev=0.498
C6	B	0, -0.128, 0.387, 0.902, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.387 std_dev=0.515
C2'	B	0, -0.125, 0.401, 0.927, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.401 std_dev=0.526
C4	B	0, -0.138, 0.414, 0.966, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.414 std_dev=0.552
N4	B	0, -0.139, 0.438, 1.014, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.438 std_dev=0.577
C4'	A	0, -0.163, 0.415, 0.993, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.415 std_dev=0.578
N1	B	0, -0.152, 0.436, 1.023, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.436 std_dev=0.587
N3	B	0, -0.163, 0.456, 1.076, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.456 std_dev=0.619
C3'	B	0, -0.156, 0.473, 1.102, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.473 std_dev=0.629
C2	B	0, -0.168, 0.475, 1.118, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.475 std_dev=0.643
C1'	B	0, -0.176, 0.505, 1.186, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.505 std_dev=0.681
O2'	B	0, -0.154, 0.533, 1.221, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.533 std_dev=0.688
C5'	A	0, -0.201, 0.501, 1.204, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.501 std_dev=0.703
O2	B	0, -0.194, 0.548, 1.290, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.548 std_dev=0.742
O2'	A	0, -0.197, 0.552, 1.301, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.552 std_dev=0.749
OP2	B	0, -0.202, 0.569, 1.340, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.569 std_dev=0.771
O5'	B	0, -0.198, 0.590, 1.378, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.590 std_dev=0.788
O3'	B	0, -0.209, 0.583, 1.375, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.583 std_dev=0.792
O4'	B	0, -0.216, 0.610, 1.436, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.610 std_dev=0.826
C3'	A	0, -0.234, 0.595, 1.424, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.595 std_dev=0.829
P	B	0, -0.217, 0.621, 1.459, 1.805 max_d=1.805 avg_d=0.621 std_dev=0.838
C4'	B	0, -0.220, 0.628, 1.476, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.628 std_dev=0.848
OP1	B	0, -0.233, 0.677, 1.587, 1.964 max_d=1.964 avg_d=0.677 std_dev=0.910
C5'	B	0, -0.247, 0.709, 1.664, 2.059 max_d=2.059 avg_d=0.709 std_dev=0.955
P	A	0, -0.295, 0.773, 1.842, 2.284 max_d=2.284 avg_d=0.773 std_dev=1.069
OP2	A	0, -0.318, 0.797, 1.912, 2.373 max_d=2.373 avg_d=0.797 std_dev=1.115
OP1	A	0, -0.304, 0.812, 1.928, 2.391 max_d=2.391 avg_d=0.812 std_dev=1.116
O5'	A	0, -0.405, 1.007, 2.419, 3.004 max_d=3.004 avg_d=1.007 std_dev=1.412
O3'	A	0, -0.417, 1.096, 2.608, 3.235 max_d=3.235 avg_d=1.096 std_dev=1.512

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.00	0.15	0.14	0.67	0.20
C2	0.02	0.00	0.02	0.08	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.32	0.36	0.07	0.28	0.02	0.25	0.02
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.12	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.16	0.74	0.22
C3'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.21	0.00	0.37	0.02	0.34	0.53	0.21	0.03	0.43	0.53	0.28	0.02	0.01	0.01	0.35	0.21	0.28	0.12
C4	0.01	0.00	0.01	0.21	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.31	0.10	0.03	0.44	0.04	0.29	0.04
C4'	0.00	0.04	0.03	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.15	0.32	0.04	0.06	0.21	0.30	0.15	0.34	0.02	0.00	0.02	0.03	0.55	0.15
C5	0.00	0.00	0.00	0.37	0.00	0.18	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.39	0.15	0.00	0.68	0.21	0.02	0.25
C5'	0.00	0.10	0.12	0.02	0.17	0.01	0.31	0.00	0.30	0.38	0.20	0.05	0.38	0.42	0.19	0.18	0.13	0.02	0.01	0.02	0.37	0.02
C6	0.00	0.00	0.01	0.34	0.00	0.15	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.41	0.07	0.01	0.64	0.23	0.08	0.27
C8	0.02	0.00	0.03	0.53	0.00	0.32	0.00	0.38	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.29	0.43	0.06	0.84	0.24	0.17	0.29
N1	0.01	0.00	0.02	0.21	0.00	0.04	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.16	0.05	0.46	0.11	0.05	0.13
N3	0.02	0.00	0.02	0.03	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.27	0.39	0.07	0.22	0.07	0.38	0.09
N6	0.01	0.01	0.02	0.43	0.01	0.21	0.01	0.38	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.44	0.21	0.01	0.78	0.36	0.29	0.41
N7	0.01	0.00	0.02	0.53	0.00	0.30	0.00	0.42	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.38	0.43	0.04	0.90	0.35	0.12	0.42
N9	0.00	0.00	0.01	0.28	0.00	0.15	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.24	0.05	0.01	0.47	0.03	0.43	0.02
O2'	0.00	0.32	0.00	0.02	0.31	0.34	0.39	0.18	0.41	0.29	0.39	0.27	0.44	0.38	0.24	0.00	0.02	0.26	0.33	0.07	0.65	0.04
O3'	0.23	0.36	0.00	0.01	0.10	0.02	0.15	0.13	0.07	0.43	0.16	0.39	0.21	0.43	0.05	0.02	0.00	0.15	0.39	0.52	0.14	0.28
O4'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.26	0.15	0.00	0.08	0.23	0.79	0.33
O5'	0.15	0.28	0.16	0.35	0.44	0.02	0.68	0.01	0.64	0.84	0.46	0.22	0.78	0.90	0.47	0.33	0.39	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.14	0.02	0.16	0.21	0.04	0.03	0.21	0.02	0.23	0.24	0.11	0.07	0.36	0.35	0.03	0.07	0.52	0.23	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.67	0.25	0.74	0.28	0.29	0.55	0.02	0.37	0.08	0.17	0.05	0.38	0.29	0.12	0.43	0.65	0.14	0.79	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.20	0.02	0.22	0.12	0.04	0.15	0.25	0.02	0.27	0.29	0.13	0.09	0.41	0.42	0.02	0.04	0.28	0.33	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.03	0.16	0.07	0.06	0.10	0.20	0.08	0.26	0.17	0.02	0.01	0.05	0.22	0.01	0.14	0.07	0.14	0.12	0.09
C2	0.38	0.38	0.27	0.15	0.38	0.25	0.42	0.22	0.44	0.41	0.36	0.27	0.33	0.33	0.06	0.32	0.18	0.17	0.18	0.15
C2'	0.18	0.03	0.15	0.06	0.07	0.08	0.20	0.06	0.26	0.16	0.01	0.02	0.05	0.21	0.02	0.13	0.05	0.13	0.09	0.08
C3'	0.10	0.06	0.04	0.19	0.01	0.14	0.01	0.24	0.06	0.08	0.01	0.05	0.10	0.23	0.30	0.02	0.33	0.34	0.43	0.38
C4	0.23	0.14	0.16	0.04	0.17	0.10	0.30	0.08	0.33	0.25	0.10	0.10	0.08	0.20	0.06	0.16	0.06	0.10	0.10	0.07
C4'	0.15	0.05	0.10	0.05	0.02	0.01	0.09	0.07	0.14	0.12	0.01	0.01	0.03	0.24	0.15	0.08	0.11	0.09	0.15	0.12
C5	0.12	0.09	0.06	0.08	0.16	0.02	0.27	0.04	0.27	0.16	0.08	0.13	0.02	0.09	0.17	0.04	0.05	0.00	0.01	0.04
C5'	0.18	0.23	0.20	0.34	0.24	0.32	0.20	0.38	0.17	0.20	0.25	0.25	0.24	0.06	0.40	0.26	0.41	0.34	0.40	0.39
C6	0.17	0.17	0.09	0.05	0.26	0.03	0.34	0.01	0.30	0.21	0.18	0.23	0.12	0.12	0.14	0.09	0.02	0.01	0.02	0.02
C8	0.01	0.07	0.06	0.18	0.03	0.15	0.16	0.15	0.16	0.03	0.06	0.03	0.15	0.04	0.28	0.09	0.14	0.04	0.04	0.09
N1	0.29	0.31	0.19	0.07	0.38	0.16	0.42	0.14	0.39	0.33	0.32	0.34	0.26	0.24	0.03	0.23	0.10	0.10	0.12	0.08
N3	0.37	0.30	0.27	0.15	0.26	0.24	0.36	0.21	0.41	0.38	0.23	0.14	0.25	0.33	0.06	0.30	0.17	0.18	0.18	0.15
N6	0.09	0.13	0.02	0.12	0.23	0.07	0.28	0.10	0.22	0.14	0.16	0.25	0.08	0.05	0.22	0.01	0.11	0.09	0.08	0.12
N7	0.02	0.04	0.07	0.21	0.07	0.18	0.17	0.20	0.15	0.03	0.02	0.07	0.10	0.05	0.32	0.12	0.19	0.11	0.10	0.15
N9	0.14	0.02	0.10	0.02	0.08	0.03	0.21	0.02	0.26	0.15	0.01	0.03	0.05	0.13	0.11	0.07	0.01	0.08	0.07	0.04
O2'	0.01	0.03	0.09	0.13	0.20	0.12	0.32	0.09	0.28	0.09	0.04	0.22	0.20	0.15	0.27	0.04	0.00	0.06	0.17	0.07
O3'	0.41	0.55	0.24	0.10	0.45	0.00	0.38	0.16	0.38	0.46	0.54	0.43	0.63	0.42	0.35	0.24	0.26	0.43	0.44	0.37
O4'	0.17	0.03	0.16	0.10	0.02	0.12	0.15	0.11	0.22	0.13	0.07	0.03	0.12	0.20	0.04	0.14	0.11	0.18	0.16	0.14
O5'	0.21	0.01	0.23	0.02	0.19	0.08	0.18	0.09	0.07	0.04	0.10	0.26	0.11	0.58	0.01	0.12	0.31	0.29	0.55	0.39
OP1	0.05	0.02	0.10	0.02	0.06	0.08	0.04	0.21	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.17	0.02	0.05	0.27	0.26	0.38	0.31
OP2	0.17	0.15	0.34	0.02	0.03	0.17	0.01	0.44	0.04	0.13	0.10	0.01	0.21	0.45	0.01	0.09	0.58	0.63	0.75	0.69
P	0.12	0.03	0.19	0.01	0.07	0.05	0.06	0.22	0.00	0.05	0.03	0.10	0.06	0.33	0.00	0.01	0.32	0.32	0.45	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.02
C2	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.05	0.03	0.01	0.13	0.04
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.03
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.07	0.06	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.03	0.16	0.05
C4'	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.03	0.18	0.04
C5'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.04	0.04	0.06	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.03
C6	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.02	0.17	0.03
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.14	0.04
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.05	0.04	0.03	0.14	0.05
N4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.02	0.04	0.05	0.17	0.06
O2	0.01	0.01	0.11	0.08	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.08	0.03	0.01	0.10	0.03
O2'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.04	0.06	0.05	0.02	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.08	0.09	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.05	0.02
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.05	0.02	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.03	0.04
O5'	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.09	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.03	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.13	0.08	0.02	0.16	0.02	0.18	0.01	0.17	0.14	0.14	0.17	0.10	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.04	0.03	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.03	0.04	0.05	0.06	0.03	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00