Doublet Group distance statistics: 52878

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C6	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
N3	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C2	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N1	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C1'	A	0, 0.000, 0.039, 0.079, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.039 std_dev=0.039
N9	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.043 std_dev=0.043
N7	A	0, 0.000, 0.049, 0.098, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.049 std_dev=0.049
C8	A	0, 0.000, 0.058, 0.116, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.058 std_dev=0.058
N6	A	0, 0.000, 0.064, 0.127, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.064 std_dev=0.064
O2'	B	0, 0.000, 0.318, 0.636, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.318 std_dev=0.318
C2'	B	0, 0.000, 0.399, 0.798, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.399 std_dev=0.399
C1'	B	0, 0.000, 0.507, 1.013, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.507 std_dev=0.507
N1	B	0, 0.000, 0.564, 1.128, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.564 std_dev=0.564
C3'	B	0, 0.000, 0.567, 1.135, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.567 std_dev=0.567
OP1	B	0, 0.000, 0.575, 1.151, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.575 std_dev=0.575
O3'	B	0, 0.000, 0.590, 1.180, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.590 std_dev=0.590
C2	B	0, 0.000, 0.593, 1.186, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.593 std_dev=0.593
O2	B	0, 0.000, 0.607, 1.213, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.607 std_dev=0.607
C6	B	0, 0.000, 0.621, 1.242, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.621 std_dev=0.621
N3	B	0, 0.000, 0.639, 1.279, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.639 std_dev=0.639
O4'	B	0, 0.000, 0.655, 1.309, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.655 std_dev=0.655
C5	B	0, 0.000, 0.671, 1.342, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.671 std_dev=0.671
C4	B	0, 0.000, 0.673, 1.346, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.673 std_dev=0.673
C4'	B	0, 0.000, 0.676, 1.352, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.676 std_dev=0.676
N4	B	0, 0.000, 0.738, 1.476, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.738 std_dev=0.738
P	B	0, 0.000, 0.831, 1.663, 1.663 max_d=1.663 avg_d=0.831 std_dev=0.831
C5'	B	0, 0.000, 0.908, 1.815, 1.815 max_d=1.815 avg_d=0.908 std_dev=0.908
O5'	B	0, 0.000, 0.980, 1.960, 1.960 max_d=1.960 avg_d=0.980 std_dev=0.980
O3'	A	0, 0.000, 1.011, 2.021, 2.021 max_d=2.021 avg_d=1.011 std_dev=1.011
O4'	A	0, 0.000, 1.268, 2.537, 2.537 max_d=2.537 avg_d=1.268 std_dev=1.268
C2'	A	0, 0.000, 1.272, 2.543, 2.543 max_d=2.543 avg_d=1.272 std_dev=1.272
C3'	A	0, 0.000, 1.381, 2.763, 2.763 max_d=2.763 avg_d=1.381 std_dev=1.381
C4'	A	0, 0.000, 1.645, 3.290, 3.290 max_d=3.290 avg_d=1.645 std_dev=1.645
OP2	B	0, 0.000, 1.963, 3.925, 3.925 max_d=3.925 avg_d=1.963 std_dev=1.963
O2'	A	0, 0.000, 2.047, 4.094, 4.094 max_d=4.094 avg_d=2.047 std_dev=2.047
C5'	A	0, 0.000, 2.941, 5.883, 5.883 max_d=5.883 avg_d=2.941 std_dev=2.941
O5'	A	0, 0.000, 3.365, 6.730, 6.730 max_d=6.730 avg_d=3.365 std_dev=3.365
P	A	0, 0.000, 4.523, 9.046, 9.046 max_d=9.046 avg_d=4.523 std_dev=4.523
OP2	A	0, 0.000, 4.780, 9.560, 9.560 max_d=9.560 avg_d=4.780 std_dev=4.780
OP1	A	0, 0.000, 5.214, 10.428, 10.428 max_d=10.428 avg_d=5.214 std_dev=5.214

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.04	0.05	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.06	0.11	0.28	0.09
C2	0.04	0.00	0.34	0.47	0.02	0.52	0.00	0.93	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.09	0.31	0.30	1.25	1.45	1.16	1.39
C2'	0.00	0.34	0.00	0.01	0.17	0.02	0.06	0.06	0.14	0.19	0.26	0.34	0.10	0.12	0.00	0.00	0.02	0.01	0.11	0.20	0.45	0.17
C3'	0.02	0.47	0.01	0.00	0.19	0.00	0.05	0.01	0.16	0.27	0.35	0.46	0.10	0.19	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.37	0.48	0.03
C4	0.02	0.02	0.17	0.19	0.00	0.22	0.00	0.37	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.08	0.14	0.14	0.52	0.51	0.45	0.56
C4'	0.01	0.52	0.02	0.00	0.22	0.00	0.09	0.00	0.21	0.24	0.40	0.50	0.15	0.15	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.13	0.36	0.03
C5	0.02	0.00	0.06	0.05	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.08	0.07	0.07	0.21	0.24	0.03	0.23
C5'	0.02	0.93	0.06	0.01	0.37	0.00	0.14	0.00	0.35	0.40	0.70	0.87	0.23	0.27	0.01	0.04	0.04	0.01	0.00	0.07	0.20	0.00
C6	0.04	0.02	0.14	0.16	0.02	0.21	0.01	0.35	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.09	0.14	0.14	0.49	0.61	0.27	0.55
C8	0.01	0.01	0.19	0.27	0.01	0.24	0.01	0.40	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.10	0.14	0.52	0.60	0.61	0.54
N1	0.05	0.01	0.26	0.35	0.03	0.40	0.01	0.70	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.10	0.24	0.24	0.95	1.17	0.79	1.07
N3	0.04	0.01	0.34	0.46	0.00	0.50	0.01	0.87	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.29	0.30	1.17	1.21	1.10	1.24
N6	0.05	0.02	0.10	0.10	0.02	0.15	0.03	0.23	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.10	0.10	0.11	0.31	0.45	0.00	0.34
N7	0.00	0.00	0.12	0.19	0.01	0.15	0.00	0.27	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.06	0.07	0.35	0.39	0.58	0.39
N9	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01	0.02	0.07	0.06	0.04
O2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.02	0.08	0.04	0.09	0.07	0.10	0.08	0.10	0.07	0.06	0.00	0.07	0.01	0.12	0.29	0.57	0.20
O3'	0.06	0.31	0.02	0.00	0.14	0.00	0.07	0.04	0.14	0.10	0.24	0.29	0.10	0.06	0.03	0.07	0.00	0.04	0.08	0.56	0.56	0.05
O4'	0.00	0.30	0.01	0.00	0.14	0.00	0.07	0.01	0.14	0.14	0.24	0.30	0.11	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.04	0.21	0.03
O5'	0.06	1.25	0.11	0.03	0.52	0.00	0.21	0.00	0.49	0.52	0.95	1.17	0.31	0.35	0.02	0.12	0.08	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.11	1.45	0.20	0.37	0.51	0.13	0.24	0.07	0.61	0.60	1.17	1.21	0.45	0.39	0.07	0.29	0.56	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	1.16	0.45	0.48	0.45	0.36	0.03	0.20	0.27	0.61	0.79	1.10	0.00	0.58	0.06	0.57	0.56	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.09	1.39	0.17	0.03	0.56	0.03	0.23	0.00	0.55	0.54	1.07	1.24	0.34	0.39	0.04	0.20	0.05	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.30	0.02	0.12	0.36	0.08	0.24	0.14	0.14	0.18	0.38	0.42	0.31	0.04	0.21	0.07	0.13	0.29	0.93	0.19
C2	0.02	0.24	0.07	0.13	0.16	0.11	0.02	0.15	0.07	0.04	0.30	0.18	0.32	0.05	0.14	0.05	0.20	0.29	0.51	0.14
C2'	0.69	0.29	0.75	0.92	0.07	0.95	0.28	1.03	0.52	0.50	0.10	0.14	0.29	0.77	0.97	0.77	0.99	0.51	1.71	1.01
C3'	0.51	0.11	0.72	0.90	0.24	0.81	0.13	0.83	0.15	0.25	0.11	0.45	0.18	0.82	1.12	0.53	0.64	0.22	1.16	0.56
C4	0.03	0.23	0.09	0.19	0.24	0.16	0.03	0.23	0.05	0.05	0.32	0.29	0.27	0.08	0.21	0.06	0.28	0.33	0.83	0.25
C4'	0.03	0.30	0.33	0.42	0.64	0.14	0.68	0.02	0.47	0.27	0.47	0.77	0.18	0.47	0.75	0.17	0.23	0.81	0.15	0.44
C5	0.10	0.13	0.13	0.22	0.10	0.21	0.13	0.30	0.18	0.05	0.23	0.18	0.19	0.10	0.22	0.14	0.37	0.36	0.90	0.31
C5'	0.24	0.13	0.80	0.90	0.73	0.47	0.84	0.23	0.49	0.13	0.41	0.95	0.10	1.02	1.41	0.03	0.16	1.11	0.23	0.64
C6	0.13	0.06	0.14	0.21	0.03	0.21	0.22	0.28	0.24	0.12	0.14	0.03	0.16	0.09	0.19	0.16	0.36	0.36	0.76	0.28
C8	0.06	0.16	0.11	0.22	0.20	0.22	0.01	0.32	0.09	0.01	0.26	0.30	0.20	0.09	0.24	0.11	0.38	0.35	1.15	0.38
N1	0.10	0.11	0.12	0.17	0.01	0.16	0.16	0.22	0.19	0.08	0.17	0.04	0.22	0.08	0.15	0.12	0.29	0.33	0.58	0.20
N3	0.02	0.30	0.04	0.13	0.26	0.10	0.09	0.15	0.01	0.12	0.36	0.28	0.34	0.04	0.17	0.00	0.18	0.28	0.61	0.15
N6	0.17	0.04	0.15	0.22	0.17	0.23	0.31	0.31	0.30	0.18	0.00	0.15	0.07	0.10	0.18	0.21	0.40	0.37	0.79	0.32
N7	0.12	0.09	0.14	0.24	0.08	0.25	0.14	0.35	0.19	0.07	0.18	0.19	0.15	0.11	0.24	0.17	0.42	0.37	1.08	0.39
N9	0.01	0.24	0.07	0.18	0.29	0.16	0.11	0.24	0.01	0.09	0.33	0.35	0.26	0.07	0.22	0.04	0.28	0.33	0.99	0.29
O2'	0.77	0.43	0.64	0.79	0.40	1.00	0.68	1.18	0.83	0.67	0.31	0.24	0.35	0.61	0.70	0.94	1.26	1.06	2.40	1.54
O3'	0.35	0.02	0.48	0.62	0.20	0.59	0.09	0.63	0.10	0.15	0.14	0.35	0.06	0.57	0.80	0.37	0.47	0.41	1.19	0.56
O4'	0.40	0.57	0.10	0.04	0.77	0.27	0.82	0.32	0.69	0.57	0.67	0.80	0.48	0.01	0.22	0.51	0.47	1.01	0.09	0.55
O5'	1.05	0.47	1.62	1.80	0.34	1.39	0.36	1.14	0.16	0.57	0.05	0.72	0.72	1.83	2.29	0.91	0.70	0.40	0.45	0.14
OP1	1.46	0.81	2.07	2.16	0.15	1.79	0.22	1.39	0.33	0.86	0.33	0.58	1.18	2.52	2.92	1.26	0.72	0.29	0.23	0.06
OP2	1.63	0.71	2.13	2.54	0.26	2.40	0.11	2.36	0.57	0.97	0.15	0.82	0.99	2.41	3.16	1.71	1.75	0.87	1.28	1.22
P	1.55	0.80	2.15	2.40	0.16	2.05	0.17	1.75	0.44	0.93	0.29	0.64	1.12	2.48	3.12	1.45	1.13	0.02	0.60	0.46

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.04	0.38	0.31	0.14
C2	0.02	0.00	0.09	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.10	0.01	0.06	0.65	0.05	0.12
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.15	0.00	0.01	0.00	0.04	0.18	0.14	0.06
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.00	0.05	0.00	0.13	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.06	0.01
C4	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.11	0.84	0.24	0.08
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.38	0.07
C5	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.14	0.85	0.27	0.07
C5'	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.04	0.04	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.28	0.35	0.00
C6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.12	0.73	0.07	0.11
N1	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.60	0.10	0.13
N3	0.01	0.00	0.08	0.05	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.08	0.76	0.10	0.10
N4	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.12	0.90	0.35	0.06
O2	0.02	0.00	0.15	0.13	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.14	0.17	0.01	0.02	0.57	0.16	0.14
O2'	0.00	0.08	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.07	0.02	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.28	0.08
O3'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.17	0.02	0.00	0.00	0.02	0.28	0.04	0.07
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.32	0.48	0.19
O5'	0.04	0.06	0.04	0.03	0.11	0.01	0.14	0.01	0.12	0.07	0.08	0.12	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.38	0.65	0.18	0.03	0.84	0.04	0.85	0.28	0.73	0.60	0.76	0.90	0.57	0.09	0.28	0.32	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.05	0.14	0.06	0.24	0.38	0.27	0.35	0.07	0.10	0.10	0.35	0.16	0.28	0.04	0.48	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.12	0.06	0.01	0.08	0.07	0.07	0.00	0.11	0.13	0.10	0.06	0.14	0.08	0.07	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00