Doublet Group distance statistics: 52887

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 9, 2, 2, 2, 7, 4, 8, 3, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.010, 0.023, 0.037, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.002, 0.020, 0.038, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.020 std_dev=0.018
N3	A	0, -0.001, 0.019, 0.039, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.019 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.005, 0.027, 0.050, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.027 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.018, 0.043, 0.068, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.043 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.010, 0.036, 0.062, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.036 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.016, 0.045, 0.075, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.045 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.020, 0.053, 0.085, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.053 std_dev=0.033
C4	B	0, 0.229, 0.498, 0.767, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.498 std_dev=0.269
O4	B	0, 0.274, 0.546, 0.818, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.546 std_dev=0.272
C5	B	0, 0.239, 0.514, 0.788, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.514 std_dev=0.275
N3	B	0, 0.255, 0.551, 0.847, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.551 std_dev=0.296
C6	B	0, 0.244, 0.545, 0.845, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.545 std_dev=0.300
OP2	A	0, 0.303, 0.604, 0.905, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.604 std_dev=0.301
C2'	A	0, 0.111, 0.413, 0.715, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.413 std_dev=0.302
C2	B	0, 0.246, 0.548, 0.851, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.548 std_dev=0.302
C3'	B	0, 0.224, 0.529, 0.834, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.529 std_dev=0.305
O4'	A	0, 0.048, 0.355, 0.663, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.355 std_dev=0.308
C2'	B	0, 0.238, 0.548, 0.858, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.548 std_dev=0.310
N1	B	0, 0.204, 0.516, 0.828, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.516 std_dev=0.312
P	A	0, 0.279, 0.605, 0.930, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.605 std_dev=0.325
O3'	B	0, 0.262, 0.592, 0.921, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.592 std_dev=0.330
O2	B	0, 0.304, 0.637, 0.970, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.637 std_dev=0.333
C1'	B	0, 0.238, 0.583, 0.928, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.583 std_dev=0.345
C4'	B	0, 0.272, 0.638, 1.003, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.638 std_dev=0.365
O4'	B	0, 0.279, 0.646, 1.014, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.646 std_dev=0.367
O2'	B	0, 0.272, 0.644, 1.017, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.644 std_dev=0.373
O5'	A	0, 0.239, 0.612, 0.985, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.612 std_dev=0.373
OP1	A	0, 0.318, 0.705, 1.093, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.705 std_dev=0.387
C5'	B	0, 0.318, 0.713, 1.107, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.713 std_dev=0.394
O5'	B	0, 0.298, 0.727, 1.157, 2.088 max_d=2.088 avg_d=0.727 std_dev=0.430
O2'	A	0, 0.146, 0.661, 1.176, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.661 std_dev=0.515
C5'	A	0, 0.184, 0.714, 1.244, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.714 std_dev=0.530
P	B	0, 0.393, 0.937, 1.482, 2.298 max_d=2.298 avg_d=0.937 std_dev=0.544
C4'	A	0, 0.131, 0.697, 1.264, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.697 std_dev=0.566
C3'	A	0, 0.176, 0.917, 1.658, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.917 std_dev=0.741
OP2	B	0, 0.262, 1.220, 2.177, 5.033 max_d=5.033 avg_d=1.220 std_dev=0.957
O3'	A	0, 0.299, 1.630, 2.960, 3.320 max_d=3.320 avg_d=1.630 std_dev=1.330
OP1	B	0, 0.155, 1.536, 2.917, 4.986 max_d=4.986 avg_d=1.536 std_dev=1.381

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.37	0.01	0.21	0.20	0.35	0.23
C2	0.03	0.00	0.23	0.18	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.39	0.14	0.15	0.20	0.34	0.22
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.13	0.01	0.08	0.22	0.12	0.11	0.19	0.22	0.11	0.07	0.03	0.00	0.04	0.01	0.45	0.47	0.60	0.48
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.24	0.01	0.35	0.03	0.35	0.39	0.27	0.14	0.40	0.42	0.24	0.02	0.01	0.02	0.10	0.12	0.16	0.11
C4	0.02	0.01	0.13	0.24	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.22	0.08	0.15	0.20	0.35	0.22
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.08	0.18	0.04	0.05	0.11	0.17	0.08	0.31	0.03	0.01	0.02	0.10	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.35	0.01	0.10	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.30	0.12	0.05	0.13	0.20	0.33	0.21
C5'	0.08	0.10	0.22	0.03	0.07	0.01	0.08	0.00	0.08	0.11	0.08	0.10	0.10	0.12	0.06	0.09	0.26	0.02	0.01	0.11	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.12	0.35	0.01	0.08	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.15	0.07	0.13	0.20	0.32	0.21
C8	0.01	0.01	0.11	0.39	0.01	0.18	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.33	0.21	0.09	0.13	0.19	0.35	0.20
N1	0.02	0.01	0.19	0.27	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.25	0.11	0.14	0.20	0.33	0.21
N3	0.03	0.01	0.22	0.14	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.43	0.13	0.17	0.20	0.35	0.23
N6	0.02	0.01	0.11	0.40	0.01	0.11	0.02	0.10	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.34	0.17	0.06	0.15	0.21	0.29	0.20
N7	0.01	0.01	0.07	0.42	0.01	0.17	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.37	0.23	0.05	0.14	0.20	0.33	0.20
N9	0.01	0.01	0.03	0.24	0.01	0.08	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.20	0.13	0.02	0.15	0.20	0.36	0.22
O2'	0.03	0.12	0.00	0.02	0.19	0.31	0.30	0.09	0.28	0.33	0.20	0.09	0.34	0.37	0.20	0.00	0.07	0.22	0.31	0.32	0.63	0.37
O3'	0.37	0.39	0.04	0.01	0.22	0.03	0.12	0.26	0.15	0.21	0.25	0.43	0.17	0.23	0.13	0.07	0.00	0.27	0.31	0.54	0.38	0.38
O4'	0.01	0.14	0.01	0.02	0.08	0.01	0.05	0.02	0.07	0.09	0.11	0.13	0.06	0.05	0.02	0.22	0.27	0.00	0.09	0.10	0.17	0.10
O5'	0.21	0.15	0.45	0.10	0.15	0.02	0.13	0.01	0.13	0.13	0.14	0.17	0.15	0.14	0.15	0.31	0.31	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.20	0.20	0.47	0.12	0.20	0.10	0.20	0.11	0.20	0.19	0.20	0.20	0.21	0.20	0.20	0.32	0.54	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	0.34	0.60	0.16	0.35	0.05	0.33	0.03	0.32	0.35	0.33	0.35	0.29	0.33	0.36	0.63	0.38	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.22	0.48	0.11	0.22	0.03	0.21	0.02	0.21	0.20	0.21	0.23	0.20	0.20	0.22	0.37	0.38	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.18	0.14	0.12	0.17	0.11	0.21	0.12	0.19	0.11	0.18	0.31	0.20	0.15	0.22	0.10	0.26	0.31	0.73	0.27
C2	0.21	0.29	0.21	0.20	0.20	0.21	0.19	0.25	0.18	0.21	0.29	0.36	0.24	0.19	0.19	0.19	0.38	0.61	1.09	0.43
C2'	0.18	0.18	0.22	0.26	0.17	0.24	0.22	0.26	0.21	0.13	0.19	0.32	0.26	0.33	0.24	0.18	0.34	0.44	0.82	0.37
C3'	0.13	0.17	0.13	0.13	0.22	0.12	0.31	0.21	0.27	0.13	0.16	0.34	0.25	0.11	0.27	0.11	0.31	0.43	0.59	0.35
C4	0.14	0.21	0.17	0.16	0.14	0.15	0.19	0.19	0.17	0.13	0.19	0.31	0.21	0.17	0.18	0.12	0.33	0.43	0.99	0.37
C4'	0.22	0.25	0.20	0.09	0.17	0.11	0.21	0.09	0.21	0.19	0.21	0.38	0.29	0.09	0.18	0.15	0.19	0.30	0.44	0.20
C5	0.15	0.20	0.17	0.18	0.12	0.17	0.20	0.22	0.17	0.13	0.18	0.28	0.20	0.18	0.15	0.14	0.36	0.46	1.09	0.41
C5'	0.23	0.23	0.23	0.11	0.17	0.12	0.22	0.09	0.23	0.20	0.20	0.33	0.32	0.08	0.17	0.17	0.17	0.39	0.32	0.19
C6	0.19	0.24	0.20	0.20	0.17	0.21	0.20	0.26	0.18	0.19	0.24	0.29	0.21	0.19	0.14	0.18	0.40	0.58	1.20	0.47
C8	0.14	0.18	0.16	0.13	0.18	0.12	0.26	0.15	0.24	0.14	0.17	0.27	0.20	0.15	0.20	0.13	0.30	0.32	0.86	0.32
N1	0.22	0.29	0.21	0.21	0.22	0.22	0.20	0.27	0.20	0.22	0.29	0.34	0.23	0.20	0.19	0.20	0.40	0.65	1.18	0.47
N3	0.18	0.25	0.19	0.18	0.16	0.18	0.18	0.21	0.17	0.17	0.23	0.35	0.23	0.18	0.19	0.15	0.34	0.51	1.00	0.38
N6	0.20	0.24	0.21	0.21	0.21	0.24	0.22	0.30	0.21	0.21	0.24	0.27	0.21	0.20	0.18	0.21	0.43	0.61	1.28	0.51
N7	0.14	0.17	0.17	0.16	0.15	0.15	0.24	0.19	0.21	0.12	0.16	0.24	0.19	0.17	0.18	0.14	0.34	0.37	1.03	0.38
N9	0.12	0.18	0.15	0.13	0.16	0.12	0.22	0.14	0.19	0.11	0.17	0.30	0.20	0.16	0.20	0.10	0.29	0.33	0.86	0.31
O2'	0.16	0.24	0.16	0.14	0.16	0.12	0.22	0.20	0.18	0.13	0.22	0.42	0.30	0.17	0.20	0.12	0.36	0.51	0.92	0.45
O3'	0.34	0.56	0.25	0.11	0.37	0.10	0.30	0.21	0.29	0.36	0.53	0.77	0.34	0.22	0.36	0.19	0.28	0.54	0.58	0.35
O4'	0.15	0.21	0.14	0.12	0.17	0.11	0.21	0.12	0.20	0.15	0.19	0.33	0.20	0.14	0.19	0.11	0.23	0.28	0.54	0.23
O5'	0.12	0.18	0.14	0.07	0.15	0.07	0.20	0.15	0.20	0.12	0.17	0.28	0.21	0.03	0.16	0.08	0.23	0.44	0.38	0.25
OP1	0.04	0.12	0.07	0.02	0.11	0.06	0.17	0.15	0.16	0.07	0.12	0.21	0.12	0.02	0.12	0.03	0.19	0.78	0.25	0.28
OP2	0.06	0.18	0.09	0.05	0.20	0.14	0.23	0.25	0.20	0.12	0.19	0.23	0.09	0.03	0.20	0.13	0.28	0.73	0.37	0.32
P	0.04	0.13	0.08	0.02	0.12	0.06	0.18	0.15	0.17	0.08	0.13	0.21	0.12	0.01	0.12	0.04	0.20	0.61	0.27	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.11	0.59	0.25	0.19
C2	0.02	0.00	0.09	0.08	0.02	0.03	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.02	0.03	0.22	0.79	0.57	0.29
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.07	0.15	0.01	0.02	0.06	0.01	0.12	0.31	0.22	0.13
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.01	0.11	0.02	0.12	0.05	0.07	0.14	0.02	0.01	0.07	0.02	0.13	0.19	0.17	0.12
C4	0.03	0.02	0.05	0.07	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.08	0.01	0.04	0.31	0.92	0.90	0.39
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.07	0.02	0.06	0.00	0.02	0.16	0.21	0.07
C5	0.02	0.02	0.06	0.11	0.01	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.13	0.02	0.04	0.33	0.91	0.89	0.39
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.14	0.08	0.10	0.06	0.06	0.05	0.14	0.02	0.01	0.14	0.35	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.13	0.02	0.04	0.29	0.84	0.66	0.33
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.21	0.75	0.49	0.27
N3	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.04	0.02	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.01	0.03	0.27	0.87	0.76	0.34
O2	0.03	0.01	0.15	0.14	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.16	0.18	0.02	0.05	0.18	0.75	0.47	0.26
O2'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.07	0.07	0.05	0.06	0.05	0.03	0.09	0.16	0.00	0.04	0.08	0.06	0.06	0.24	0.12	0.07
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.08	0.02	0.13	0.05	0.13	0.04	0.09	0.18	0.04	0.00	0.08	0.02	0.11	0.41	0.15	0.15
O4	0.03	0.02	0.06	0.07	0.01	0.06	0.02	0.14	0.02	0.03	0.01	0.02	0.08	0.08	0.00	0.04	0.32	0.94	1.00	0.42
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.05	0.06	0.02	0.04	0.00	0.08	0.59	0.23	0.21
O5'	0.11	0.22	0.12	0.13	0.31	0.02	0.33	0.01	0.29	0.21	0.27	0.18	0.06	0.11	0.32	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.59	0.79	0.31	0.19	0.92	0.16	0.91	0.14	0.84	0.75	0.87	0.75	0.24	0.41	0.94	0.59	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.25	0.57	0.22	0.17	0.90	0.21	0.89	0.35	0.66	0.49	0.76	0.47	0.12	0.15	1.00	0.23	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.19	0.29	0.13	0.12	0.39	0.07	0.39	0.02	0.33	0.27	0.34	0.26	0.07	0.15	0.42	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00