Doublet Group distance statistics: 52888

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 3, 16, 11, 4, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.001, 0.015, 0.030, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.001, 0.018, 0.034, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.018 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.023 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.006, 0.026, 0.046, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.026 std_dev=0.020
C2	A	0, -0.009, 0.014, 0.037, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.014 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.002, 0.026, 0.051, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.026 std_dev=0.025
N3	A	0, -0.008, 0.017, 0.042, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.017 std_dev=0.025
C1'	A	0, -0.008, 0.018, 0.043, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.018 std_dev=0.025
C2'	A	0, 0.048, 0.135, 0.222, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.135 std_dev=0.087
O4'	A	0, 0.049, 0.138, 0.227, 0.381 max_d=0.381 avg_d=0.138 std_dev=0.089
C3'	A	0, 0.084, 0.179, 0.275, 0.431 max_d=0.431 avg_d=0.179 std_dev=0.096
O3'	A	0, 0.106, 0.212, 0.317, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.212 std_dev=0.105
C4'	A	0, 0.070, 0.206, 0.342, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.206 std_dev=0.136
O2'	A	0, 0.074, 0.218, 0.363, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.218 std_dev=0.144
N1	B	0, 0.129, 0.317, 0.504, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.317 std_dev=0.188
C6	B	0, 0.152, 0.341, 0.530, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.341 std_dev=0.189
C2	B	0, 0.128, 0.320, 0.513, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.320 std_dev=0.192
O2	B	0, 0.162, 0.369, 0.577, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.369 std_dev=0.207
C5	B	0, 0.133, 0.341, 0.549, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.341 std_dev=0.208
N3	B	0, 0.098, 0.310, 0.522, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.310 std_dev=0.212
C2'	B	0, 0.119, 0.333, 0.548, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.333 std_dev=0.215
C4	B	0, 0.087, 0.308, 0.530, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.308 std_dev=0.222
C1'	B	0, 0.129, 0.351, 0.573, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.351 std_dev=0.222
O4	B	0, 0.086, 0.342, 0.598, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.342 std_dev=0.256
O2'	B	0, 0.120, 0.380, 0.640, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.380 std_dev=0.260
C3'	B	0, 0.122, 0.397, 0.673, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.397 std_dev=0.276
P	A	0, 0.086, 0.370, 0.653, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.370 std_dev=0.283
OP1	A	0, 0.074, 0.376, 0.678, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.376 std_dev=0.302
O3'	B	0, 0.114, 0.418, 0.722, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.418 std_dev=0.304
O4'	B	0, 0.117, 0.424, 0.730, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.424 std_dev=0.306
OP2	A	0, 0.164, 0.474, 0.784, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.474 std_dev=0.310
C4'	B	0, 0.129, 0.461, 0.792, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.461 std_dev=0.332
C5'	A	0, 0.074, 0.422, 0.769, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.422 std_dev=0.348
O5'	B	0, 0.162, 0.523, 0.885, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.523 std_dev=0.361
O5'	A	0, 0.003, 0.384, 0.764, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.384 std_dev=0.381
C5'	B	0, 0.143, 0.550, 0.956, 1.857 max_d=1.857 avg_d=0.550 std_dev=0.406
OP2	B	0, 0.178, 0.585, 0.993, 1.896 max_d=1.896 avg_d=0.585 std_dev=0.407
P	B	0, 0.181, 0.608, 1.034, 1.926 max_d=1.926 avg_d=0.608 std_dev=0.427
OP1	B	0, 0.208, 0.676, 1.144, 2.097 max_d=2.097 avg_d=0.676 std_dev=0.468

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.12	0.14	0.17	0.05
C2	0.05	0.00	0.07	0.05	0.01	0.10	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.06	0.09	0.15	0.10	0.23	0.12
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.06	0.07	0.04	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.18	0.25	0.09	0.12
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.03	0.23	0.32	0.07	0.18
C4	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.04	0.16	0.11	0.19	0.07
C4'	0.02	0.10	0.02	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.07	0.09	0.03	0.05	0.01	0.10	0.03	0.00	0.01	0.15	0.25	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.03	0.19	0.12	0.18	0.08
C5'	0.02	0.14	0.03	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.08	0.18	0.10	0.13	0.09	0.17	0.08	0.10	0.06	0.02	0.01	0.25	0.35	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.03	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.03	0.04	0.18	0.10	0.19	0.09
C8	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.07	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.08	0.04	0.05	0.24	0.17	0.15	0.11
N1	0.04	0.00	0.06	0.03	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.07	0.16	0.09	0.22	0.10
N3	0.05	0.00	0.07	0.05	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.06	0.09	0.14	0.10	0.23	0.10
N6	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.03	0.04	0.20	0.11	0.18	0.10
N7	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.04	0.04	0.23	0.15	0.16	0.11
N9	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.18	0.14	0.17	0.07
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.05	0.10	0.05	0.10	0.06	0.08	0.08	0.09	0.06	0.07	0.04	0.00	0.04	0.05	0.11	0.24	0.10	0.09
O3'	0.03	0.06	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.06	0.03	0.04	0.05	0.06	0.03	0.04	0.03	0.04	0.00	0.02	0.14	0.32	0.09	0.14
O4'	0.00	0.09	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.07	0.09	0.04	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.13	0.14	0.21	0.05
O5'	0.12	0.15	0.18	0.23	0.16	0.01	0.19	0.01	0.18	0.24	0.16	0.14	0.20	0.23	0.18	0.11	0.14	0.13	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.14	0.10	0.25	0.32	0.11	0.15	0.12	0.25	0.10	0.17	0.09	0.10	0.11	0.15	0.14	0.24	0.32	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.23	0.09	0.07	0.19	0.25	0.18	0.35	0.19	0.15	0.22	0.23	0.18	0.16	0.17	0.10	0.09	0.21	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.12	0.12	0.18	0.07	0.04	0.08	0.01	0.09	0.11	0.10	0.10	0.10	0.11	0.07	0.09	0.14	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.09	0.07	0.12	0.12	0.09	0.14	0.10	0.13	0.06	0.10	0.13	0.09	0.15	0.15	0.05	0.10	0.16	0.13	0.08
C2	0.15	0.10	0.17	0.16	0.15	0.15	0.18	0.16	0.17	0.13	0.12	0.13	0.18	0.17	0.18	0.15	0.14	0.19	0.14	0.14
C2'	0.05	0.09	0.07	0.13	0.13	0.10	0.16	0.13	0.13	0.07	0.11	0.13	0.09	0.17	0.16	0.06	0.12	0.22	0.19	0.14
C3'	0.13	0.14	0.14	0.18	0.15	0.17	0.17	0.19	0.15	0.12	0.14	0.16	0.17	0.22	0.17	0.14	0.14	0.24	0.20	0.16
C4	0.08	0.08	0.11	0.12	0.11	0.10	0.15	0.11	0.13	0.06	0.09	0.13	0.12	0.14	0.15	0.08	0.09	0.16	0.13	0.09
C4'	0.11	0.13	0.12	0.12	0.14	0.12	0.16	0.14	0.14	0.11	0.13	0.18	0.19	0.16	0.16	0.10	0.13	0.13	0.12	0.10
C5	0.10	0.11	0.12	0.12	0.09	0.11	0.12	0.12	0.11	0.09	0.10	0.15	0.13	0.13	0.15	0.09	0.11	0.16	0.15	0.11
C5'	0.23	0.17	0.28	0.17	0.19	0.20	0.22	0.17	0.17	0.15	0.15	0.23	0.44	0.23	0.22	0.21	0.17	0.18	0.22	0.17
C6	0.12	0.11	0.13	0.12	0.09	0.12	0.13	0.14	0.12	0.11	0.09	0.16	0.14	0.13	0.15	0.11	0.11	0.16	0.15	0.12
C8	0.10	0.12	0.11	0.14	0.14	0.13	0.14	0.15	0.12	0.10	0.13	0.15	0.12	0.14	0.18	0.11	0.14	0.20	0.19	0.15
N1	0.14	0.10	0.15	0.14	0.14	0.14	0.16	0.16	0.15	0.12	0.10	0.14	0.17	0.15	0.18	0.14	0.13	0.17	0.14	0.13
N3	0.12	0.08	0.15	0.14	0.13	0.13	0.17	0.13	0.17	0.10	0.11	0.13	0.15	0.17	0.16	0.12	0.12	0.18	0.13	0.12
N6	0.13	0.14	0.13	0.12	0.09	0.13	0.12	0.16	0.12	0.13	0.12	0.18	0.14	0.13	0.13	0.12	0.13	0.17	0.17	0.14
N7	0.11	0.13	0.12	0.13	0.13	0.13	0.13	0.15	0.12	0.11	0.14	0.16	0.12	0.13	0.18	0.12	0.14	0.19	0.19	0.15
N9	0.07	0.09	0.09	0.12	0.12	0.10	0.14	0.11	0.12	0.06	0.11	0.13	0.11	0.13	0.16	0.07	0.10	0.17	0.14	0.10
O2'	0.07	0.09	0.07	0.12	0.11	0.09	0.14	0.11	0.13	0.07	0.10	0.15	0.10	0.16	0.15	0.07	0.10	0.20	0.17	0.12
O3'	0.10	0.12	0.11	0.16	0.14	0.15	0.16	0.18	0.14	0.10	0.13	0.16	0.14	0.21	0.16	0.11	0.13	0.23	0.19	0.15
O4'	0.08	0.12	0.08	0.12	0.13	0.10	0.14	0.11	0.13	0.09	0.13	0.15	0.11	0.15	0.14	0.07	0.11	0.14	0.11	0.08
O5'	0.20	0.21	0.21	0.10	0.26	0.07	0.27	0.09	0.24	0.20	0.23	0.21	0.28	0.02	0.27	0.13	0.11	0.27	0.29	0.20
OP1	0.06	0.07	0.11	0.02	0.12	0.08	0.13	0.17	0.11	0.07	0.09	0.08	0.16	0.02	0.13	0.04	0.15	0.12	0.10	0.10
OP2	0.09	0.12	0.10	0.08	0.14	0.14	0.14	0.23	0.13	0.12	0.13	0.12	0.12	0.02	0.15	0.12	0.19	0.21	0.12	0.12
P	0.05	0.06	0.09	0.01	0.11	0.05	0.13	0.13	0.10	0.06	0.08	0.06	0.13	0.01	0.13	0.02	0.09	0.17	0.13	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.15	0.11	0.08
C2	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01	0.06	0.02	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.06	0.11	0.15	0.15	0.12
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.20	0.13	0.09
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.07	0.04	0.05	0.06	0.01	0.01	0.07	0.01	0.05	0.20	0.14	0.11
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.00	0.03	0.08	0.17	0.19	0.14
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.05	0.11	0.04	0.02	0.04	0.00	0.01	0.12	0.05	0.04
C5	0.02	0.02	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.05	0.09	0.19	0.20	0.14
C5'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.09	0.05	0.10	0.16	0.04	0.04	0.09	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.08	0.01	0.06	0.09	0.17	0.16	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.05	0.15	0.12	0.08
N3	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.10	0.16	0.18	0.13
O2	0.04	0.01	0.04	0.06	0.02	0.11	0.02	0.16	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.05	0.02	0.11	0.15	0.17	0.16	0.15
O2'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.04	0.08	0.00	0.04	0.04	0.03	0.03	0.20	0.12	0.09
O3'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.07	0.02	0.09	0.04	0.08	0.04	0.05	0.05	0.04	0.00	0.08	0.02	0.08	0.25	0.17	0.15
O4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.08	0.00	0.04	0.10	0.20	0.23	0.17
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.04	0.11	0.03	0.02	0.04	0.00	0.10	0.14	0.12	0.09
O5'	0.05	0.11	0.03	0.05	0.08	0.01	0.09	0.01	0.09	0.05	0.10	0.15	0.03	0.08	0.10	0.10	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.15	0.15	0.20	0.20	0.17	0.12	0.19	0.09	0.17	0.15	0.16	0.17	0.20	0.25	0.20	0.14	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.15	0.13	0.14	0.19	0.05	0.20	0.02	0.16	0.12	0.18	0.16	0.12	0.17	0.23	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.12	0.09	0.11	0.14	0.04	0.14	0.01	0.12	0.08	0.13	0.15	0.09	0.15	0.17	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00