Doublet Group distance statistics: 52889

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 9, 6, 4, 5, 4, 1, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.015, 0.024, 0.033, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.024 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.014, 0.025, 0.035, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.025 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.019, 0.033, 0.046, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.033 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.007, 0.020, 0.034, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.030, 0.050, 0.070, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.050 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.031, 0.054, 0.077, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.054 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.034, 0.057, 0.080, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.057 std_dev=0.023
N1	B	0, 0.203, 0.322, 0.441, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.322 std_dev=0.119
C1'	B	0, 0.308, 0.475, 0.642, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.475 std_dev=0.167
O4'	A	0, 0.342, 0.516, 0.690, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.516 std_dev=0.174
C2'	A	0, 0.376, 0.551, 0.726, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.551 std_dev=0.175
C2	B	0, 0.190, 0.407, 0.624, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.407 std_dev=0.217
C6	B	0, 0.279, 0.515, 0.752, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.515 std_dev=0.236
C2'	B	0, 0.204, 0.441, 0.678, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.441 std_dev=0.237
O5'	A	0, 0.532, 0.778, 1.024, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.778 std_dev=0.246
C3'	B	0, 0.209, 0.455, 0.702, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.455 std_dev=0.247
O2'	A	0, 0.988, 1.272, 1.555, 1.627 max_d=1.627 avg_d=1.272 std_dev=0.283
O2	B	0, 0.296, 0.603, 0.910, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.603 std_dev=0.307
O4'	B	0, 0.412, 0.725, 1.038, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.725 std_dev=0.313
C4'	A	0, 0.751, 1.067, 1.384, 1.490 max_d=1.490 avg_d=1.067 std_dev=0.316
P	A	0, 0.378, 0.695, 1.012, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.695 std_dev=0.317
C4'	B	0, 0.485, 0.824, 1.163, 1.651 max_d=1.651 avg_d=0.824 std_dev=0.339
N3	B	0, 0.168, 0.511, 0.853, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.511 std_dev=0.342
O3'	B	0, 0.155, 0.506, 0.857, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.506 std_dev=0.351
C5	B	0, 0.267, 0.638, 1.009, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.638 std_dev=0.371
OP2	A	0, 0.572, 0.949, 1.326, 2.426 max_d=2.426 avg_d=0.949 std_dev=0.377
C3'	A	0, 1.164, 1.543, 1.922, 1.928 max_d=1.928 avg_d=1.543 std_dev=0.379
C5'	A	0, 0.561, 0.945, 1.328, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.945 std_dev=0.384
C4	B	0, 0.192, 0.604, 1.016, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.604 std_dev=0.412
OP1	A	0, 0.317, 0.754, 1.191, 2.552 max_d=2.552 avg_d=0.754 std_dev=0.437
O2'	B	0, 0.428, 0.898, 1.369, 2.010 max_d=2.010 avg_d=0.898 std_dev=0.470
O4	B	0, 0.207, 0.784, 1.362, 2.048 max_d=2.048 avg_d=0.784 std_dev=0.578
C5'	B	0, 0.666, 1.255, 1.844, 2.355 max_d=2.355 avg_d=1.255 std_dev=0.589
O5'	B	0, 0.769, 1.420, 2.072, 2.345 max_d=2.345 avg_d=1.420 std_dev=0.652
O3'	A	0, 2.150, 2.870, 3.590, 3.526 max_d=3.526 avg_d=2.870 std_dev=0.720
P	B	0, 1.036, 2.048, 3.061, 3.568 max_d=3.568 avg_d=2.048 std_dev=1.012
OP1	B	0, 1.326, 2.423, 3.520, 4.183 max_d=4.183 avg_d=2.423 std_dev=1.097
OP2	B	0, 1.231, 2.335, 3.438, 3.907 max_d=3.907 avg_d=2.335 std_dev=1.103

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.11	0.01	0.09	0.10	0.16	0.12
C2	0.03	0.00	0.12	0.12	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.16	0.06	0.15	0.16	0.30	0.18
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.07	0.06	0.07	0.09	0.12	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.15	0.16	0.20	0.16
C3'	0.02	0.12	0.00	0.00	0.13	0.01	0.18	0.02	0.18	0.20	0.15	0.10	0.20	0.22	0.13	0.02	0.01	0.02	0.11	0.10	0.16	0.10
C4	0.02	0.01	0.06	0.13	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.15	0.09	0.04	0.16	0.16	0.28	0.19
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.12	0.04	0.03	0.09	0.12	0.06	0.14	0.04	0.00	0.02	0.07	0.06	0.05
C5	0.02	0.01	0.04	0.18	0.01	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.16	0.13	0.04	0.21	0.24	0.36	0.25
C5'	0.03	0.06	0.07	0.02	0.08	0.01	0.14	0.00	0.13	0.17	0.10	0.05	0.16	0.18	0.09	0.09	0.10	0.02	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.06	0.18	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.18	0.13	0.05	0.21	0.26	0.39	0.27
C8	0.01	0.02	0.07	0.20	0.01	0.12	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.12	0.18	0.05	0.21	0.23	0.30	0.24
N1	0.03	0.00	0.09	0.15	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.13	0.06	0.19	0.22	0.36	0.23
N3	0.03	0.00	0.12	0.10	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.16	0.06	0.13	0.13	0.26	0.16
N6	0.03	0.01	0.05	0.20	0.02	0.09	0.02	0.16	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.19	0.17	0.06	0.24	0.32	0.43	0.31
N7	0.02	0.01	0.05	0.22	0.01	0.12	0.01	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.15	0.19	0.04	0.24	0.30	0.38	0.30
N9	0.01	0.01	0.02	0.13	0.01	0.06	0.01	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.09	0.07	0.02	0.14	0.14	0.23	0.16
O2'	0.01	0.21	0.00	0.02	0.15	0.14	0.16	0.09	0.18	0.12	0.20	0.19	0.19	0.15	0.09	0.00	0.06	0.11	0.12	0.13	0.20	0.13
O3'	0.11	0.16	0.02	0.01	0.09	0.04	0.13	0.10	0.13	0.18	0.13	0.16	0.17	0.19	0.07	0.06	0.00	0.08	0.20	0.24	0.27	0.20
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.02	0.05	0.05	0.06	0.06	0.06	0.04	0.02	0.11	0.08	0.00	0.10	0.12	0.15	0.14
O5'	0.09	0.15	0.15	0.11	0.16	0.02	0.21	0.01	0.21	0.21	0.19	0.13	0.24	0.24	0.14	0.12	0.20	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.16	0.16	0.10	0.16	0.07	0.24	0.06	0.26	0.23	0.22	0.13	0.32	0.30	0.14	0.13	0.24	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.30	0.20	0.16	0.28	0.06	0.36	0.02	0.39	0.30	0.36	0.26	0.43	0.38	0.23	0.20	0.27	0.15	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.18	0.16	0.10	0.19	0.05	0.25	0.02	0.27	0.24	0.23	0.16	0.31	0.30	0.16	0.13	0.20	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.23	0.24	0.16	0.31	0.16	0.34	0.18	0.25	0.16	0.24	0.42	0.49	0.21	0.38	0.18	0.40	0.51	0.61	0.50
C2	0.18	0.23	0.22	0.16	0.36	0.17	0.46	0.33	0.30	0.13	0.15	0.49	0.41	0.17	0.52	0.14	0.48	0.77	0.79	0.69
C2'	0.20	0.23	0.20	0.14	0.29	0.12	0.33	0.21	0.25	0.14	0.23	0.42	0.46	0.18	0.36	0.14	0.47	0.58	0.69	0.58
C3'	0.18	0.21	0.17	0.13	0.28	0.10	0.35	0.21	0.29	0.17	0.23	0.36	0.38	0.12	0.32	0.12	0.45	0.55	0.68	0.54
C4	0.21	0.27	0.25	0.18	0.30	0.18	0.40	0.32	0.29	0.15	0.19	0.51	0.43	0.18	0.38	0.16	0.48	0.69	0.75	0.65
C4'	0.16	0.23	0.14	0.08	0.29	0.08	0.30	0.11	0.24	0.17	0.27	0.33	0.37	0.13	0.33	0.11	0.36	0.39	0.51	0.40
C5	0.21	0.32	0.26	0.22	0.18	0.26	0.37	0.43	0.29	0.17	0.25	0.52	0.38	0.21	0.24	0.21	0.53	0.79	0.82	0.74
C5'	0.21	0.28	0.21	0.13	0.30	0.11	0.31	0.11	0.29	0.24	0.30	0.34	0.31	0.08	0.31	0.16	0.34	0.34	0.41	0.34
C6	0.19	0.32	0.24	0.22	0.18	0.27	0.39	0.47	0.29	0.16	0.28	0.52	0.35	0.21	0.25	0.22	0.55	0.87	0.87	0.80
C8	0.25	0.30	0.31	0.24	0.15	0.25	0.28	0.36	0.25	0.19	0.22	0.46	0.42	0.23	0.19	0.22	0.51	0.64	0.72	0.64
N1	0.18	0.28	0.23	0.19	0.27	0.22	0.43	0.42	0.30	0.14	0.20	0.51	0.38	0.18	0.39	0.18	0.52	0.85	0.85	0.76
N3	0.20	0.21	0.23	0.15	0.38	0.15	0.44	0.27	0.30	0.13	0.18	0.48	0.44	0.18	0.51	0.14	0.45	0.69	0.74	0.63
N6	0.19	0.34	0.23	0.24	0.16	0.33	0.32	0.56	0.27	0.17	0.36	0.50	0.31	0.24	0.21	0.27	0.59	0.95	0.93	0.87
N7	0.24	0.34	0.29	0.27	0.13	0.31	0.28	0.48	0.26	0.20	0.29	0.48	0.37	0.26	0.17	0.26	0.56	0.76	0.82	0.75
N9	0.24	0.26	0.27	0.18	0.26	0.18	0.35	0.27	0.27	0.17	0.20	0.47	0.45	0.19	0.32	0.17	0.46	0.60	0.69	0.59
O2'	0.25	0.24	0.22	0.12	0.34	0.15	0.34	0.15	0.24	0.17	0.27	0.42	0.51	0.16	0.43	0.20	0.41	0.51	0.64	0.51
O3'	0.16	0.24	0.15	0.15	0.27	0.12	0.32	0.23	0.27	0.15	0.25	0.40	0.37	0.15	0.31	0.11	0.46	0.59	0.70	0.55
O4'	0.19	0.23	0.17	0.13	0.31	0.14	0.31	0.14	0.24	0.15	0.28	0.34	0.45	0.21	0.36	0.14	0.37	0.42	0.52	0.42
O5'	0.19	0.26	0.22	0.09	0.25	0.07	0.28	0.17	0.27	0.21	0.26	0.33	0.30	0.02	0.26	0.11	0.42	0.45	0.48	0.44
OP1	0.04	0.14	0.08	0.02	0.18	0.10	0.21	0.19	0.18	0.09	0.16	0.22	0.13	0.02	0.20	0.06	0.30	0.44	0.32	0.30
OP2	0.11	0.26	0.16	0.06	0.32	0.16	0.31	0.34	0.26	0.20	0.31	0.29	0.14	0.03	0.34	0.10	0.47	0.61	0.44	0.49
P	0.07	0.17	0.11	0.02	0.20	0.08	0.22	0.19	0.20	0.12	0.19	0.23	0.14	0.01	0.21	0.03	0.35	0.42	0.35	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.04	0.06	0.02	0.02	0.05	0.01	0.13	0.33	0.19	0.18
C2	0.04	0.00	0.10	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.10	0.02	0.04	0.25	0.50	0.37	0.34
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.08	0.16	0.00	0.02	0.07	0.01	0.17	0.24	0.18	0.18
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.08	0.01	0.11	0.02	0.12	0.05	0.08	0.14	0.02	0.01	0.08	0.01	0.23	0.20	0.18	0.20
C4	0.04	0.01	0.06	0.08	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.03	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.05	0.35	0.66	0.53	0.49
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.05	0.08	0.07	0.03	0.07	0.01	0.02	0.12	0.13	0.04
C5	0.03	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.06	0.37	0.67	0.53	0.49
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.13	0.08	0.11	0.08	0.06	0.05	0.14	0.02	0.01	0.08	0.21	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.06	0.33	0.58	0.41	0.41
N1	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.04	0.03	0.03	0.25	0.48	0.33	0.32
N3	0.04	0.00	0.08	0.08	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.09	0.01	0.04	0.30	0.59	0.46	0.42
O2	0.06	0.00	0.16	0.14	0.01	0.08	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.18	0.18	0.02	0.07	0.21	0.44	0.32	0.29
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.08	0.07	0.05	0.06	0.05	0.04	0.11	0.18	0.00	0.05	0.09	0.05	0.11	0.18	0.14	0.11
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.09	0.03	0.13	0.05	0.13	0.04	0.09	0.18	0.05	0.00	0.10	0.03	0.23	0.25	0.21	0.21
O4	0.05	0.02	0.07	0.08	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.03	0.01	0.02	0.09	0.10	0.00	0.06	0.37	0.70	0.58	0.53
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.04	0.07	0.05	0.03	0.06	0.00	0.11	0.30	0.19	0.14
O5'	0.13	0.25	0.17	0.23	0.35	0.02	0.37	0.01	0.33	0.25	0.30	0.21	0.11	0.23	0.37	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.33	0.50	0.24	0.20	0.66	0.12	0.67	0.08	0.58	0.48	0.59	0.44	0.18	0.25	0.70	0.30	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.19	0.37	0.18	0.18	0.53	0.13	0.53	0.21	0.41	0.33	0.46	0.32	0.14	0.21	0.58	0.19	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.18	0.34	0.18	0.20	0.49	0.04	0.49	0.01	0.41	0.32	0.42	0.29	0.11	0.21	0.53	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00