Doublet Group distance statistics: 52890

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 4, 6, 4, 3, 4, 3, 4, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.015, 0.027, 0.039, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.027 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.023, 0.037, 0.052, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.037 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.019 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.020, 0.036, 0.051, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.036 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.019, 0.035, 0.051, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.035 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.004, 0.025, 0.045, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.025 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.002, 0.023, 0.044, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.023 std_dev=0.021
N6	A	0, -0.004, 0.033, 0.071, 0.230 max_d=0.230 avg_d=0.033 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.089, 0.163, 0.236, 0.305 max_d=0.305 avg_d=0.163 std_dev=0.073
C2'	A	0, 0.097, 0.181, 0.265, 0.330 max_d=0.330 avg_d=0.181 std_dev=0.084
O2'	A	0, 0.124, 0.216, 0.309, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.216 std_dev=0.093
C4'	A	0, 0.170, 0.272, 0.374, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.272 std_dev=0.102
C3'	A	0, 0.160, 0.273, 0.387, 0.504 max_d=0.504 avg_d=0.273 std_dev=0.113
O5'	A	0, 0.131, 0.266, 0.401, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.266 std_dev=0.135
O3'	A	0, 0.250, 0.411, 0.573, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.411 std_dev=0.161
C5'	A	0, 0.262, 0.437, 0.611, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.437 std_dev=0.174
N3	B	0, 0.275, 0.486, 0.697, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.486 std_dev=0.211
C4	B	0, 0.333, 0.558, 0.782, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.558 std_dev=0.225
O4	B	0, 0.372, 0.609, 0.847, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.609 std_dev=0.238
P	A	0, 0.267, 0.505, 0.743, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.505 std_dev=0.238
C2	B	0, 0.276, 0.526, 0.777, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.526 std_dev=0.250
C5	B	0, 0.382, 0.638, 0.894, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.638 std_dev=0.256
OP2	A	0, 0.365, 0.641, 0.917, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.641 std_dev=0.276
C6	B	0, 0.380, 0.659, 0.938, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.659 std_dev=0.279
N1	B	0, 0.312, 0.591, 0.870, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.591 std_dev=0.279
O2	B	0, 0.265, 0.555, 0.846, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.555 std_dev=0.290
OP1	A	0, 0.528, 0.881, 1.233, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.881 std_dev=0.352
C1'	B	0, 0.342, 0.721, 1.099, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.721 std_dev=0.379
O2'	B	0, 0.293, 0.677, 1.062, 1.815 max_d=1.815 avg_d=0.677 std_dev=0.385
C2'	B	0, 0.305, 0.707, 1.108, 1.854 max_d=1.854 avg_d=0.707 std_dev=0.402
O5'	B	0, 0.352, 0.765, 1.178, 1.879 max_d=1.879 avg_d=0.765 std_dev=0.413
O4'	B	0, 0.467, 0.930, 1.392, 1.990 max_d=1.990 avg_d=0.930 std_dev=0.463
OP1	B	0, 0.448, 0.941, 1.434, 2.030 max_d=2.030 avg_d=0.941 std_dev=0.493
P	B	0, 0.443, 0.941, 1.438, 2.042 max_d=2.042 avg_d=0.941 std_dev=0.498
C3'	B	0, 0.406, 0.926, 1.446, 2.318 max_d=2.318 avg_d=0.926 std_dev=0.520
C4'	B	0, 0.457, 1.000, 1.542, 2.373 max_d=2.373 avg_d=1.000 std_dev=0.543
C5'	B	0, 0.445, 1.017, 1.589, 2.499 max_d=2.499 avg_d=1.017 std_dev=0.572
O3'	B	0, 0.431, 1.015, 1.598, 2.533 max_d=2.533 avg_d=1.015 std_dev=0.583
OP2	B	0, 0.703, 1.310, 1.918, 2.519 max_d=2.519 avg_d=1.310 std_dev=0.607

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.12	0.07	0.09
C2	0.06	0.00	0.11	0.10	0.02	0.07	0.02	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.13	0.12	0.05	0.12	0.12	0.14	0.12
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.09	0.10	0.06	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.08	0.05
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.09	0.09	0.07	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.06	0.08	0.04
C4	0.02	0.02	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.10	0.11	0.12	0.10
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.06	0.07	0.06	0.06	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.06	0.03	0.05
C5	0.02	0.02	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.13	0.12	0.15	0.12
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.09	0.09	0.09	0.07	0.12	0.11	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01
C6	0.03	0.01	0.06	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.07	0.02	0.14	0.13	0.18	0.13
C8	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.02	0.06	0.03	0.12	0.11	0.12	0.10
N1	0.05	0.00	0.09	0.09	0.02	0.06	0.02	0.09	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.11	0.10	0.04	0.13	0.12	0.17	0.13
N3	0.06	0.01	0.10	0.09	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.12	0.12	0.05	0.10	0.12	0.11	0.11
N6	0.03	0.01	0.06	0.07	0.02	0.06	0.02	0.12	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.07	0.07	0.04	0.16	0.15	0.21	0.16
N7	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.03	0.06	0.03	0.15	0.12	0.16	0.13
N9	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.09	0.11	0.09	0.10
O2'	0.01	0.13	0.01	0.02	0.06	0.03	0.05	0.04	0.08	0.02	0.11	0.12	0.07	0.03	0.02	0.00	0.05	0.04	0.04	0.06	0.07	0.06
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.07	0.06	0.10	0.12	0.07	0.06	0.03	0.05	0.00	0.02	0.06	0.13	0.10	0.06
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.16	0.07	0.12
O5'	0.04	0.12	0.04	0.04	0.10	0.02	0.13	0.01	0.14	0.12	0.13	0.10	0.16	0.15	0.09	0.04	0.06	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.12	0.04	0.06	0.11	0.06	0.12	0.04	0.13	0.11	0.12	0.12	0.15	0.12	0.11	0.06	0.13	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.14	0.08	0.08	0.12	0.03	0.15	0.02	0.18	0.12	0.17	0.11	0.21	0.16	0.09	0.07	0.10	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.12	0.05	0.04	0.10	0.05	0.12	0.01	0.13	0.10	0.13	0.11	0.16	0.13	0.10	0.06	0.06	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.10	0.09	0.10	0.12	0.09	0.12	0.07	0.10	0.08	0.12	0.12	0.14	0.09	0.18	0.10	0.07	0.10	0.08	0.06
C2	0.18	0.16	0.20	0.20	0.12	0.18	0.14	0.16	0.17	0.16	0.14	0.19	0.22	0.18	0.16	0.17	0.17	0.16	0.15	0.13
C2'	0.10	0.12	0.11	0.11	0.13	0.10	0.14	0.09	0.13	0.10	0.13	0.14	0.17	0.12	0.18	0.10	0.09	0.11	0.10	0.09
C3'	0.08	0.10	0.10	0.09	0.10	0.08	0.11	0.07	0.11	0.08	0.11	0.12	0.17	0.11	0.15	0.10	0.07	0.09	0.08	0.07
C4	0.12	0.10	0.13	0.13	0.07	0.12	0.12	0.10	0.14	0.11	0.09	0.13	0.15	0.12	0.14	0.11	0.11	0.11	0.09	0.08
C4'	0.08	0.10	0.08	0.09	0.11	0.09	0.11	0.07	0.10	0.08	0.11	0.11	0.15	0.08	0.15	0.12	0.07	0.09	0.08	0.07
C5	0.13	0.12	0.13	0.13	0.11	0.12	0.15	0.11	0.16	0.13	0.11	0.13	0.15	0.12	0.13	0.13	0.12	0.13	0.10	0.10
C5'	0.10	0.12	0.09	0.10	0.12	0.12	0.12	0.09	0.12	0.11	0.13	0.13	0.14	0.08	0.15	0.15	0.09	0.11	0.12	0.10
C6	0.14	0.14	0.15	0.14	0.13	0.13	0.15	0.11	0.16	0.14	0.12	0.15	0.18	0.14	0.15	0.13	0.13	0.14	0.10	0.09
C8	0.13	0.12	0.13	0.13	0.11	0.14	0.16	0.13	0.16	0.14	0.11	0.13	0.14	0.12	0.12	0.15	0.14	0.16	0.14	0.14
N1	0.16	0.15	0.18	0.18	0.12	0.16	0.14	0.14	0.16	0.15	0.13	0.17	0.21	0.17	0.15	0.15	0.15	0.14	0.12	0.11
N3	0.15	0.13	0.17	0.17	0.12	0.16	0.15	0.14	0.16	0.14	0.13	0.16	0.19	0.15	0.17	0.15	0.15	0.14	0.14	0.12
N6	0.14	0.15	0.15	0.14	0.16	0.13	0.17	0.12	0.17	0.15	0.15	0.16	0.18	0.14	0.19	0.14	0.13	0.16	0.11	0.11
N7	0.14	0.14	0.14	0.14	0.15	0.15	0.18	0.14	0.18	0.15	0.13	0.14	0.14	0.13	0.14	0.16	0.14	0.17	0.14	0.14
N9	0.10	0.09	0.12	0.11	0.08	0.11	0.11	0.09	0.12	0.10	0.09	0.11	0.14	0.10	0.15	0.11	0.10	0.11	0.09	0.08
O2'	0.15	0.15	0.15	0.15	0.18	0.15	0.20	0.16	0.19	0.15	0.17	0.16	0.22	0.16	0.22	0.15	0.15	0.16	0.16	0.15
O3'	0.10	0.12	0.13	0.13	0.11	0.10	0.12	0.11	0.12	0.09	0.12	0.14	0.21	0.15	0.15	0.10	0.10	0.11	0.10	0.09
O4'	0.11	0.10	0.11	0.12	0.11	0.12	0.11	0.09	0.11	0.10	0.11	0.11	0.14	0.10	0.15	0.14	0.09	0.10	0.10	0.09
O5'	0.14	0.16	0.13	0.12	0.16	0.14	0.16	0.12	0.16	0.15	0.17	0.18	0.15	0.11	0.18	0.18	0.11	0.13	0.12	0.11
OP1	0.16	0.18	0.16	0.15	0.19	0.16	0.17	0.18	0.16	0.16	0.19	0.18	0.20	0.16	0.21	0.18	0.18	0.26	0.21	0.20
OP2	0.17	0.21	0.14	0.14	0.21	0.16	0.19	0.11	0.19	0.19	0.21	0.22	0.15	0.13	0.22	0.20	0.10	0.12	0.13	0.10
P	0.11	0.14	0.09	0.08	0.14	0.09	0.12	0.06	0.11	0.12	0.15	0.15	0.13	0.09	0.17	0.13	0.06	0.11	0.11	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.03	0.01	0.08	0.16	0.07	0.06
C2	0.02	0.00	0.04	0.03	0.02	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.05	0.14	0.14	0.08	0.07
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.06	0.06	0.02	0.04	0.06	0.00	0.02	0.06	0.01	0.10	0.10	0.15	0.08
C3'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.03	0.05	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.10	0.14	0.05
C4	0.02	0.02	0.05	0.04	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.07	0.01	0.02	0.16	0.14	0.09	0.09
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.13	0.07	0.04
C5	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.06	0.01	0.04	0.16	0.16	0.10	0.10
C5'	0.04	0.09	0.06	0.02	0.10	0.01	0.10	0.00	0.10	0.08	0.10	0.10	0.06	0.03	0.11	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.06	0.01	0.05	0.15	0.17	0.09	0.10
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.13	0.15	0.08	0.07
N3	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.08	0.02	0.04	0.16	0.13	0.08	0.08
O2	0.03	0.01	0.06	0.05	0.02	0.06	0.02	0.10	0.01	0.02	0.02	0.00	0.12	0.09	0.03	0.09	0.14	0.15	0.09	0.08
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.08	0.01	0.10	0.06	0.09	0.02	0.07	0.12	0.00	0.04	0.09	0.01	0.11	0.11	0.20	0.11
O3'	0.05	0.08	0.02	0.01	0.07	0.01	0.06	0.03	0.06	0.05	0.08	0.09	0.04	0.00	0.08	0.04	0.04	0.11	0.13	0.05
O4	0.03	0.03	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.03	0.02	0.03	0.09	0.08	0.00	0.03	0.17	0.13	0.10	0.10
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.09	0.01	0.04	0.03	0.00	0.05	0.22	0.06	0.11
O5'	0.08	0.14	0.10	0.04	0.16	0.01	0.16	0.01	0.15	0.13	0.16	0.14	0.11	0.04	0.17	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.16	0.14	0.10	0.10	0.14	0.13	0.16	0.07	0.17	0.15	0.13	0.15	0.11	0.11	0.13	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.08	0.15	0.14	0.09	0.07	0.10	0.06	0.09	0.08	0.08	0.09	0.20	0.13	0.10	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.07	0.08	0.05	0.09	0.04	0.10	0.02	0.10	0.07	0.08	0.08	0.11	0.05	0.10	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00