Doublet Group distance statistics: 52891

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 12, 9, 3, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.010, 0.017, 0.023, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.014, 0.021, 0.029, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.013, 0.022, 0.031, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.016, 0.036, 0.056, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.036 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.017, 0.038, 0.060, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.038 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.017, 0.040, 0.063, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.040 std_dev=0.023
O5'	A	0, 0.252, 0.392, 0.532, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.392 std_dev=0.140
C4'	A	0, 0.497, 0.689, 0.882, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.689 std_dev=0.192
P	A	0, 0.089, 0.282, 0.474, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.282 std_dev=0.192
OP1	A	0, 0.241, 0.442, 0.642, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.442 std_dev=0.201
C3'	A	0, 0.486, 0.704, 0.923, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.704 std_dev=0.219
O4'	A	0, 0.475, 0.699, 0.923, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.699 std_dev=0.224
O3'	A	0, 0.300, 0.529, 0.757, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.529 std_dev=0.229
OP2	A	0, 0.429, 0.659, 0.888, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.659 std_dev=0.229
N3	B	0, 0.498, 0.728, 0.957, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.728 std_dev=0.229
C2	B	0, 0.512, 0.741, 0.971, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.741 std_dev=0.229
O4	B	0, 0.496, 0.726, 0.957, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.726 std_dev=0.230
C4	B	0, 0.505, 0.737, 0.968, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.737 std_dev=0.232
C2'	A	0, 0.507, 0.743, 0.978, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.743 std_dev=0.235
O2	B	0, 0.566, 0.802, 1.037, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.802 std_dev=0.235
N1	B	0, 0.517, 0.759, 1.001, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.759 std_dev=0.242
O4'	B	0, 0.509, 0.756, 1.002, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.756 std_dev=0.246
C5	B	0, 0.572, 0.825, 1.078, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.825 std_dev=0.253
C1'	B	0, 0.526, 0.779, 1.032, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.779 std_dev=0.253
C4'	B	0, 0.435, 0.694, 0.953, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.694 std_dev=0.259
C6	B	0, 0.572, 0.835, 1.098, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.835 std_dev=0.263
C2'	B	0, 0.563, 0.848, 1.134, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.848 std_dev=0.286
O3'	B	0, 0.551, 0.847, 1.144, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.847 std_dev=0.296
O2'	B	0, 0.601, 0.901, 1.200, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.901 std_dev=0.300
C3'	B	0, 0.563, 0.864, 1.165, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.864 std_dev=0.301
C5'	B	0, 0.475, 0.785, 1.094, 1.639 max_d=1.639 avg_d=0.785 std_dev=0.310
OP1	B	0, 0.175, 0.496, 0.816, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.496 std_dev=0.321
P	B	0, 0.492, 0.840, 1.187, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.840 std_dev=0.348
C5'	A	0, 0.936, 1.285, 1.635, 1.674 max_d=1.674 avg_d=1.285 std_dev=0.350
O2'	A	0, 0.852, 1.250, 1.647, 1.683 max_d=1.683 avg_d=1.250 std_dev=0.397
OP2	B	0, 0.713, 1.113, 1.513, 1.935 max_d=1.935 avg_d=1.113 std_dev=0.400
O5'	B	0, 0.802, 1.258, 1.714, 2.177 max_d=2.177 avg_d=1.258 std_dev=0.456

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.13	0.00	0.08	0.13	0.10	0.06
C2	0.02	0.00	0.13	0.02	0.01	0.13	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.22	0.14	0.19	0.14	0.15	0.10	0.09
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.07	0.06	0.08	0.10	0.13	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.33	0.39	0.24	0.32
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.08	0.03	0.02	0.06	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.23	0.32	0.11	0.22
C4	0.01	0.01	0.07	0.03	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.10	0.13	0.12	0.11	0.07
C4'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.07	0.11	0.12	0.06	0.04	0.01	0.10	0.03	0.00	0.01	0.08	0.13	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.06	0.13	0.11	0.12	0.07
C5'	0.02	0.21	0.07	0.02	0.11	0.01	0.09	0.00	0.13	0.09	0.18	0.18	0.13	0.07	0.05	0.05	0.06	0.01	0.01	0.08	0.15	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.09	0.10	0.14	0.11	0.11	0.07
C8	0.01	0.01	0.08	0.08	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.21	0.06	0.09	0.12	0.10	0.14	0.07
N1	0.02	0.00	0.10	0.03	0.01	0.11	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.12	0.15	0.14	0.13	0.10	0.08
N3	0.02	0.00	0.13	0.02	0.00	0.12	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.22	0.15	0.19	0.13	0.15	0.10	0.09
N6	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.10	0.07	0.08	0.15	0.10	0.11	0.07
N7	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.17	0.05	0.04	0.13	0.09	0.14	0.07
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.09	0.01	0.11	0.11	0.11	0.06
O2'	0.02	0.22	0.00	0.02	0.09	0.10	0.08	0.05	0.09	0.21	0.16	0.22	0.10	0.17	0.07	0.00	0.05	0.05	0.28	0.41	0.28	0.31
O3'	0.13	0.14	0.02	0.01	0.10	0.03	0.07	0.06	0.09	0.06	0.12	0.15	0.07	0.05	0.09	0.05	0.00	0.11	0.13	0.24	0.09	0.15
O4'	0.00	0.19	0.01	0.01	0.10	0.00	0.06	0.01	0.10	0.09	0.15	0.19	0.08	0.04	0.01	0.05	0.11	0.00	0.11	0.09	0.26	0.14
O5'	0.08	0.14	0.33	0.23	0.13	0.01	0.13	0.01	0.14	0.12	0.14	0.13	0.15	0.13	0.11	0.28	0.13	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.13	0.15	0.39	0.32	0.12	0.08	0.11	0.08	0.11	0.10	0.13	0.15	0.10	0.09	0.11	0.41	0.24	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.10	0.24	0.11	0.11	0.13	0.12	0.15	0.11	0.14	0.10	0.10	0.11	0.14	0.11	0.28	0.09	0.26	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.09	0.32	0.22	0.07	0.02	0.07	0.02	0.07	0.07	0.08	0.09	0.07	0.07	0.06	0.31	0.15	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.14	0.10	0.10	0.12	0.09	0.14	0.07	0.12	0.11	0.13	0.17	0.12	0.13	0.14	0.11	0.13	0.13	0.08	0.09
C2	0.13	0.13	0.12	0.12	0.10	0.11	0.16	0.12	0.15	0.12	0.10	0.16	0.16	0.16	0.12	0.12	0.19	0.17	0.15	0.14
C2'	0.13	0.17	0.11	0.11	0.14	0.10	0.14	0.08	0.13	0.13	0.18	0.21	0.10	0.12	0.15	0.13	0.14	0.17	0.10	0.11
C3'	0.16	0.20	0.14	0.14	0.18	0.13	0.15	0.11	0.15	0.16	0.21	0.22	0.14	0.16	0.19	0.16	0.20	0.23	0.18	0.19
C4	0.10	0.12	0.09	0.09	0.11	0.08	0.16	0.08	0.13	0.10	0.10	0.16	0.12	0.13	0.14	0.10	0.13	0.15	0.10	0.09
C4'	0.24	0.24	0.25	0.25	0.23	0.23	0.23	0.22	0.23	0.24	0.24	0.25	0.24	0.25	0.22	0.24	0.29	0.32	0.30	0.30
C5	0.08	0.10	0.08	0.08	0.14	0.07	0.18	0.09	0.14	0.09	0.09	0.14	0.10	0.11	0.16	0.09	0.11	0.15	0.12	0.08
C5'	0.37	0.37	0.37	0.38	0.39	0.39	0.39	0.39	0.39	0.38	0.37	0.35	0.34	0.38	0.39	0.39	0.43	0.51	0.47	0.47
C6	0.08	0.09	0.09	0.08	0.14	0.08	0.19	0.11	0.17	0.10	0.09	0.13	0.10	0.11	0.15	0.08	0.11	0.15	0.16	0.10
C8	0.09	0.11	0.08	0.08	0.14	0.08	0.16	0.08	0.13	0.09	0.10	0.15	0.10	0.11	0.18	0.10	0.10	0.14	0.09	0.07
N1	0.10	0.10	0.10	0.10	0.11	0.09	0.18	0.13	0.16	0.10	0.08	0.14	0.12	0.13	0.13	0.10	0.15	0.16	0.17	0.12
N3	0.13	0.14	0.12	0.12	0.10	0.10	0.15	0.10	0.14	0.12	0.12	0.17	0.15	0.15	0.12	0.12	0.17	0.16	0.12	0.12
N6	0.10	0.10	0.13	0.11	0.16	0.10	0.20	0.13	0.19	0.14	0.12	0.12	0.14	0.11	0.16	0.10	0.11	0.16	0.19	0.11
N7	0.08	0.10	0.08	0.08	0.16	0.08	0.18	0.09	0.14	0.10	0.11	0.14	0.10	0.11	0.20	0.09	0.10	0.15	0.12	0.08
N9	0.10	0.12	0.09	0.09	0.12	0.08	0.15	0.07	0.12	0.10	0.11	0.16	0.11	0.12	0.15	0.10	0.12	0.13	0.08	0.07
O2'	0.13	0.13	0.16	0.16	0.14	0.17	0.24	0.22	0.23	0.14	0.14	0.19	0.13	0.13	0.15	0.15	0.22	0.22	0.28	0.23
O3'	0.20	0.23	0.21	0.21	0.20	0.19	0.18	0.19	0.18	0.20	0.23	0.25	0.21	0.22	0.20	0.20	0.30	0.28	0.28	0.28
O4'	0.22	0.21	0.25	0.25	0.17	0.21	0.18	0.19	0.21	0.21	0.19	0.21	0.27	0.26	0.14	0.21	0.26	0.27	0.26	0.26
O5'	0.20	0.23	0.20	0.19	0.18	0.17	0.15	0.13	0.16	0.20	0.22	0.25	0.22	0.22	0.17	0.18	0.16	0.16	0.12	0.12
OP1	0.16	0.17	0.18	0.17	0.15	0.14	0.15	0.11	0.16	0.16	0.16	0.18	0.19	0.18	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.13
OP2	0.10	0.10	0.09	0.10	0.11	0.11	0.12	0.12	0.11	0.10	0.10	0.11	0.08	0.10	0.12	0.12	0.15	0.14	0.08	0.08
P	0.13	0.14	0.13	0.13	0.12	0.12	0.12	0.09	0.12	0.13	0.14	0.15	0.14	0.14	0.12	0.13	0.13	0.13	0.10	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.25	0.10	0.07
C2	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.04	0.12	0.21	0.09	0.06
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.02	0.03	0.04	0.00	0.02	0.03	0.01	0.22	0.28	0.10	0.14
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.22	0.27	0.11	0.12
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.16	0.17	0.10	0.09
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.24	0.15	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.03	0.16	0.20	0.11	0.11
C5'	0.03	0.05	0.05	0.02	0.08	0.00	0.10	0.00	0.09	0.05	0.06	0.06	0.05	0.02	0.08	0.01	0.01	0.23	0.18	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.04	0.15	0.23	0.10	0.11
N1	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.11	0.23	0.09	0.07
N3	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.01	0.03	0.14	0.19	0.09	0.08
O2	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.06	0.02	0.06	0.11	0.22	0.10	0.06
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.04	0.01	0.05	0.05	0.06	0.03	0.05	0.08	0.00	0.04	0.04	0.01	0.25	0.28	0.13	0.17
O3'	0.04	0.05	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.06	0.04	0.00	0.04	0.04	0.16	0.26	0.12	0.10
O4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.00	0.03	0.17	0.16	0.11	0.10
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.03	0.00	0.11	0.24	0.13	0.06
O5'	0.08	0.12	0.22	0.22	0.16	0.02	0.16	0.01	0.15	0.11	0.14	0.11	0.25	0.16	0.17	0.11	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.25	0.21	0.28	0.27	0.17	0.24	0.20	0.23	0.23	0.23	0.19	0.22	0.28	0.26	0.16	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.09	0.10	0.11	0.10	0.15	0.11	0.18	0.10	0.09	0.09	0.10	0.13	0.12	0.11	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.06	0.14	0.12	0.09	0.03	0.11	0.02	0.11	0.07	0.08	0.06	0.17	0.10	0.10	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00