Doublet Group distance statistics: 52895

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 5, 1, 5, 3, 3, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.018, 0.028, 0.038, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.028 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.024, 0.037, 0.051, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.037 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.024 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.026, 0.041, 0.057, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.041 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.029, 0.045, 0.060, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.045 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.027, 0.043, 0.060, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.043 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.037, 0.059, 0.080, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.059 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.064, 0.094, 0.124, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.094 std_dev=0.030
N9	A	0, 0.036, 0.069, 0.101, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.069 std_dev=0.032
N6	A	0, 0.051, 0.086, 0.122, 0.207 max_d=0.207 avg_d=0.086 std_dev=0.035
C8	A	0, 0.083, 0.123, 0.163, 0.193 max_d=0.193 avg_d=0.123 std_dev=0.040
O4'	A	0, 0.102, 0.181, 0.259, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.181 std_dev=0.078
C2'	A	0, 0.162, 0.262, 0.363, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.262 std_dev=0.100
C4'	A	0, 0.220, 0.347, 0.475, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.347 std_dev=0.128
C3'	A	0, 0.150, 0.330, 0.510, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.330 std_dev=0.180
C5'	A	0, 0.355, 0.551, 0.747, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.551 std_dev=0.196
O2'	A	0, 0.261, 0.464, 0.668, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.464 std_dev=0.204
C3'	B	0, 0.359, 0.598, 0.837, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.598 std_dev=0.239
C4'	B	0, 0.365, 0.612, 0.858, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.612 std_dev=0.247
C2'	B	0, 0.246, 0.496, 0.746, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.496 std_dev=0.250
C1'	B	0, 0.212, 0.463, 0.713, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.463 std_dev=0.251
O3'	B	0, 0.462, 0.728, 0.993, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.728 std_dev=0.265
O4'	B	0, 0.271, 0.540, 0.810, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.540 std_dev=0.269
O2'	B	0, 0.373, 0.645, 0.918, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.645 std_dev=0.273
N1	B	0, 0.156, 0.430, 0.704, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.430 std_dev=0.274
C6	B	0, 0.181, 0.464, 0.748, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.464 std_dev=0.283
C2	B	0, 0.205, 0.504, 0.804, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.504 std_dev=0.299
C5	B	0, 0.210, 0.511, 0.812, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.511 std_dev=0.301
O3'	A	0, 0.285, 0.595, 0.905, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.595 std_dev=0.310
O5'	A	0, 0.344, 0.662, 0.980, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.662 std_dev=0.318
P	A	0, 0.438, 0.761, 1.083, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.761 std_dev=0.322
N3	B	0, 0.216, 0.540, 0.864, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.540 std_dev=0.324
O2	B	0, 0.276, 0.611, 0.946, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.611 std_dev=0.335
C4	B	0, 0.172, 0.516, 0.859, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.516 std_dev=0.344
C5'	B	0, 0.402, 0.755, 1.109, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.755 std_dev=0.353
O5'	B	0, 0.283, 0.643, 1.002, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.643 std_dev=0.360
OP2	A	0, 0.461, 0.833, 1.205, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.833 std_dev=0.372
O4	B	0, 0.203, 0.588, 0.972, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.588 std_dev=0.384
OP1	A	0, 0.472, 0.892, 1.311, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.892 std_dev=0.420
P	B	0, 0.455, 0.877, 1.300, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.877 std_dev=0.423
OP1	B	0, 0.942, 1.893, 2.844, 3.607 max_d=3.607 avg_d=1.893 std_dev=0.951
OP2	B	0, 0.599, 1.572, 2.545, 3.925 max_d=3.925 avg_d=1.572 std_dev=0.973

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.14	0.14	0.21	0.14
C2	0.05	0.00	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.13	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.20	0.11	0.05	0.24	0.20	0.26	0.20
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.06	0.07	0.08	0.10	0.06	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.15	0.20	0.13
C3'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.11	0.01	0.16	0.03	0.16	0.18	0.13	0.10	0.19	0.20	0.10	0.03	0.01	0.01	0.15	0.17	0.17	0.12
C4	0.03	0.01	0.05	0.11	0.00	0.06	0.01	0.15	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.11	0.10	0.02	0.24	0.19	0.24	0.19
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.11	0.15	0.07	0.05	0.14	0.16	0.07	0.08	0.02	0.01	0.02	0.11	0.18	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.16	0.01	0.11	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.08	0.18	0.04	0.31	0.26	0.29	0.26
C5'	0.04	0.13	0.03	0.03	0.15	0.01	0.22	0.00	0.23	0.24	0.18	0.11	0.28	0.27	0.14	0.07	0.03	0.02	0.02	0.16	0.24	0.02
C6	0.02	0.02	0.06	0.16	0.02	0.11	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.18	0.04	0.32	0.29	0.33	0.28
C8	0.03	0.02	0.07	0.18	0.01	0.15	0.01	0.24	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.06	0.20	0.05	0.30	0.23	0.25	0.23
N1	0.04	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.17	0.14	0.04	0.28	0.25	0.30	0.25
N3	0.05	0.00	0.10	0.10	0.01	0.05	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.19	0.10	0.05	0.21	0.17	0.23	0.17
N6	0.03	0.03	0.06	0.19	0.02	0.14	0.02	0.28	0.01	0.04	0.02	0.03	0.00	0.04	0.03	0.10	0.23	0.07	0.38	0.37	0.40	0.36
N7	0.03	0.02	0.07	0.20	0.01	0.16	0.01	0.27	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.06	0.23	0.05	0.35	0.29	0.31	0.29
N9	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.07	0.02	0.14	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.09	0.01	0.22	0.18	0.22	0.18
O2'	0.02	0.20	0.00	0.03	0.11	0.08	0.08	0.07	0.11	0.06	0.17	0.19	0.10	0.06	0.04	0.00	0.06	0.09	0.05	0.10	0.18	0.07
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.10	0.02	0.18	0.03	0.18	0.20	0.14	0.10	0.23	0.23	0.09	0.06	0.00	0.02	0.15	0.21	0.23	0.15
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.07	0.05	0.01	0.09	0.02	0.00	0.12	0.15	0.21	0.15
O5'	0.14	0.24	0.13	0.15	0.24	0.02	0.31	0.02	0.32	0.30	0.28	0.21	0.38	0.35	0.22	0.05	0.15	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.14	0.20	0.15	0.17	0.19	0.11	0.26	0.16	0.29	0.23	0.25	0.17	0.37	0.29	0.18	0.10	0.21	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.21	0.26	0.20	0.17	0.24	0.18	0.29	0.24	0.33	0.25	0.30	0.23	0.40	0.31	0.22	0.18	0.23	0.21	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.20	0.13	0.12	0.19	0.04	0.26	0.02	0.28	0.23	0.25	0.17	0.36	0.29	0.18	0.07	0.15	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.23	0.26	0.22	0.23	0.22	0.25	0.25	0.23	0.23	0.19	0.32	0.34	0.24	0.26	0.23	0.33	0.65	0.70	0.35
C2	0.23	0.25	0.24	0.20	0.17	0.21	0.23	0.26	0.22	0.21	0.21	0.32	0.29	0.22	0.16	0.21	0.34	0.88	1.07	0.45
C2'	0.24	0.24	0.23	0.19	0.22	0.19	0.24	0.24	0.22	0.21	0.20	0.32	0.32	0.21	0.24	0.20	0.31	0.53	0.73	0.31
C3'	0.21	0.19	0.21	0.17	0.25	0.17	0.28	0.22	0.24	0.19	0.19	0.25	0.31	0.18	0.28	0.17	0.32	0.49	0.69	0.31
C4	0.24	0.23	0.25	0.22	0.12	0.23	0.20	0.27	0.21	0.21	0.17	0.32	0.29	0.22	0.16	0.22	0.34	0.75	0.95	0.42
C4'	0.20	0.16	0.20	0.13	0.25	0.13	0.29	0.16	0.25	0.18	0.18	0.20	0.31	0.16	0.28	0.15	0.30	0.44	0.57	0.28
C5	0.23	0.25	0.25	0.24	0.11	0.25	0.16	0.31	0.19	0.20	0.22	0.31	0.27	0.25	0.14	0.23	0.36	0.71	1.04	0.43
C5'	0.19	0.16	0.21	0.12	0.32	0.11	0.36	0.14	0.31	0.20	0.22	0.16	0.33	0.15	0.35	0.14	0.33	0.50	0.56	0.33
C6	0.23	0.26	0.24	0.24	0.16	0.25	0.18	0.32	0.21	0.21	0.26	0.31	0.26	0.26	0.17	0.23	0.36	0.76	1.15	0.46
C8	0.24	0.21	0.26	0.26	0.13	0.27	0.15	0.32	0.16	0.18	0.16	0.28	0.28	0.25	0.18	0.25	0.36	0.56	0.81	0.37
N1	0.22	0.25	0.23	0.22	0.15	0.22	0.21	0.29	0.21	0.21	0.23	0.32	0.26	0.23	0.12	0.21	0.35	0.84	1.14	0.47
N3	0.24	0.25	0.24	0.20	0.19	0.21	0.24	0.25	0.23	0.22	0.19	0.33	0.31	0.21	0.21	0.21	0.34	0.84	0.97	0.43
N6	0.25	0.28	0.27	0.28	0.24	0.30	0.21	0.37	0.24	0.24	0.30	0.32	0.27	0.31	0.28	0.28	0.39	0.72	1.23	0.49
N7	0.24	0.24	0.26	0.26	0.15	0.29	0.13	0.35	0.17	0.20	0.22	0.29	0.27	0.27	0.19	0.26	0.37	0.58	0.98	0.40
N9	0.26	0.22	0.27	0.24	0.15	0.25	0.21	0.28	0.21	0.21	0.15	0.31	0.31	0.24	0.20	0.24	0.35	0.67	0.81	0.38
O2'	0.28	0.29	0.25	0.18	0.25	0.19	0.26	0.21	0.25	0.26	0.26	0.38	0.34	0.19	0.25	0.23	0.33	0.59	0.70	0.33
O3'	0.19	0.18	0.19	0.14	0.24	0.14	0.28	0.22	0.24	0.18	0.18	0.25	0.29	0.15	0.27	0.15	0.34	0.54	0.71	0.34
O4'	0.24	0.17	0.25	0.21	0.24	0.21	0.26	0.22	0.23	0.19	0.18	0.22	0.34	0.25	0.28	0.20	0.31	0.55	0.56	0.31
O5'	0.21	0.18	0.25	0.11	0.24	0.07	0.26	0.07	0.25	0.20	0.20	0.16	0.28	0.02	0.26	0.13	0.31	0.51	0.43	0.24
OP1	0.05	0.08	0.10	0.04	0.18	0.14	0.19	0.27	0.15	0.08	0.13	0.08	0.16	0.02	0.21	0.10	0.16	0.73	0.55	0.31
OP2	0.13	0.24	0.07	0.09	0.30	0.18	0.28	0.27	0.23	0.20	0.29	0.23	0.06	0.02	0.33	0.18	0.21	0.75	0.44	0.29
P	0.04	0.12	0.09	0.02	0.19	0.08	0.19	0.17	0.15	0.09	0.16	0.11	0.13	0.01	0.22	0.05	0.19	0.60	0.39	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.08	0.78	0.18	0.22
C2	0.02	0.00	0.07	0.11	0.02	0.05	0.03	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.03	0.03	0.15	1.01	0.53	0.28
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.06	0.03	0.06	0.10	0.00	0.02	0.07	0.01	0.11	0.49	0.17	0.16
C3'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.11	0.01	0.10	0.02	0.09	0.07	0.11	0.12	0.03	0.01	0.12	0.02	0.18	0.32	0.15	0.14
C4	0.03	0.02	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.14	0.01	0.04	0.20	1.13	0.83	0.34
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.06	0.05	0.07	0.02	0.08	0.01	0.02	0.28	0.19	0.07
C5	0.03	0.03	0.06	0.10	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.13	0.01	0.05	0.19	1.13	0.80	0.34
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.07	0.10	0.07	0.07	0.04	0.14	0.01	0.02	0.22	0.36	0.03
C6	0.02	0.02	0.06	0.09	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.11	0.01	0.05	0.16	1.07	0.58	0.31
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.07	0.03	0.02	0.14	0.98	0.43	0.28
N3	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.06	0.01	0.10	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.14	0.03	0.02	0.18	1.09	0.70	0.32
O2	0.04	0.01	0.10	0.12	0.03	0.05	0.04	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.09	0.14	0.04	0.06	0.13	0.95	0.44	0.26
O2'	0.02	0.06	0.00	0.03	0.04	0.07	0.04	0.07	0.04	0.02	0.06	0.09	0.00	0.04	0.06	0.05	0.06	0.38	0.11	0.08
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.14	0.02	0.13	0.04	0.11	0.07	0.14	0.14	0.04	0.00	0.17	0.02	0.21	0.45	0.23	0.18
O4	0.04	0.03	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.03	0.03	0.04	0.06	0.17	0.00	0.05	0.21	1.13	0.93	0.35
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.06	0.05	0.02	0.05	0.00	0.14	0.73	0.16	0.21
O5'	0.08	0.15	0.11	0.18	0.20	0.02	0.19	0.02	0.16	0.14	0.18	0.13	0.06	0.21	0.21	0.14	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.78	1.01	0.49	0.32	1.13	0.28	1.13	0.22	1.07	0.98	1.09	0.95	0.38	0.45	1.13	0.73	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.53	0.17	0.15	0.83	0.19	0.80	0.36	0.58	0.43	0.70	0.44	0.11	0.23	0.93	0.16	0.02	0.02	0.00	0.02
P	0.22	0.28	0.16	0.14	0.34	0.07	0.34	0.03	0.31	0.28	0.32	0.26	0.08	0.18	0.35	0.21	0.01	0.01	0.02	0.00