Doublet Group distance statistics: 52897

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 7, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.008, 0.011, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.003
C2	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.005
N9	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N6	A	0, 0.010, 0.018, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C8	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.015 std_dev=0.011
O4'	A	0, -0.014, 0.120, 0.253, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.120 std_dev=0.133
C2'	A	0, 0.007, 0.158, 0.310, 0.452 max_d=0.452 avg_d=0.158 std_dev=0.152
O2'	A	0, 0.025, 0.206, 0.386, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.206 std_dev=0.180
C4'	A	0, -0.003, 0.196, 0.395, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.196 std_dev=0.199
C5	B	0, 0.117, 0.344, 0.571, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.344 std_dev=0.227
C3'	A	0, -0.005, 0.231, 0.466, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.231 std_dev=0.236
C6	B	0, 0.115, 0.370, 0.626, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.370 std_dev=0.255
C4	B	0, 0.012, 0.340, 0.668, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.340 std_dev=0.328
N1	B	0, 0.019, 0.365, 0.710, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.365 std_dev=0.346
C5'	A	0, -0.007, 0.339, 0.685, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.339 std_dev=0.346
O3'	A	0, 0.007, 0.368, 0.729, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.368 std_dev=0.361
O4	B	0, 0.021, 0.413, 0.806, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.413 std_dev=0.393
N3	B	0, -0.052, 0.403, 0.858, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.403 std_dev=0.455
C2	B	0, -0.066, 0.399, 0.865, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.399 std_dev=0.465
C1'	B	0, -0.042, 0.441, 0.924, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.441 std_dev=0.483
C2'	B	0, -0.077, 0.453, 0.984, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.453 std_dev=0.531
O2	B	0, -0.111, 0.512, 1.134, 1.819 max_d=1.819 avg_d=0.512 std_dev=0.622
O4'	B	0, -0.083, 0.553, 1.188, 2.220 max_d=2.220 avg_d=0.553 std_dev=0.635
O2'	B	0, -0.122, 0.636, 1.394, 2.243 max_d=2.243 avg_d=0.636 std_dev=0.758
C3'	B	0, -0.190, 0.612, 1.414, 2.743 max_d=2.743 avg_d=0.612 std_dev=0.802
C4'	B	0, -0.232, 0.684, 1.599, 3.215 max_d=3.215 avg_d=0.684 std_dev=0.915
O5'	B	0, -0.199, 0.793, 1.785, 3.816 max_d=3.816 avg_d=0.793 std_dev=0.992
C5'	B	0, -0.256, 0.807, 1.870, 3.900 max_d=3.900 avg_d=0.807 std_dev=1.063
O5'	A	0, -0.305, 0.794, 1.893, 3.017 max_d=3.017 avg_d=0.794 std_dev=1.099
OP1	B	0, -0.141, 0.999, 2.140, 4.623 max_d=4.623 avg_d=0.999 std_dev=1.140
O3'	B	0, -0.328, 0.814, 1.956, 3.691 max_d=3.691 avg_d=0.814 std_dev=1.142
P	B	0, -0.224, 0.925, 2.073, 4.577 max_d=4.577 avg_d=0.925 std_dev=1.149
P	A	0, -0.519, 1.171, 2.861, 4.641 max_d=4.641 avg_d=1.171 std_dev=1.690
OP2	A	0, -0.507, 1.242, 2.991, 4.626 max_d=4.626 avg_d=1.242 std_dev=1.749
OP2	B	0, -0.394, 1.422, 3.238, 6.208 max_d=6.208 avg_d=1.422 std_dev=1.816
OP1	A	0, -0.580, 1.310, 3.199, 5.264 max_d=5.264 avg_d=1.310 std_dev=1.889

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.24	0.34	0.64	0.22
C2	0.01	0.00	0.11	0.12	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.17	0.02	0.54	0.86	0.69	0.40
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.08	0.11	0.03	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.28	0.34	0.35	0.27
C3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.11	0.09	0.12	0.03	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00	0.33	0.32	0.23	0.38
C4	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.07	0.01	0.54	0.80	0.73	0.37
C4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.07	0.03	0.05	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.24	0.10
C5	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.66	1.01	0.76	0.46
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.08	0.03	0.05	0.04	0.08	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.11	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.68	1.10	0.74	0.51
C8	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.12	0.02	0.63	0.85	0.82	0.38
N1	0.01	0.00	0.08	0.09	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.12	0.02	0.63	1.02	0.71	0.48
N3	0.01	0.00	0.11	0.12	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.16	0.02	0.47	0.72	0.68	0.34
N6	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.74	1.23	0.74	0.56
N7	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.01	0.71	1.07	0.81	0.47
N9	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.49	0.66	0.74	0.31
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.02	0.05	0.04	0.09	0.11	0.04	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.05	0.08	0.32	0.12
O3'	0.02	0.17	0.03	0.00	0.07	0.01	0.03	0.03	0.05	0.12	0.12	0.16	0.04	0.10	0.03	0.05	0.00	0.01	0.18	0.18	0.40	0.41
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.18	0.66	0.31
O5'	0.24	0.54	0.28	0.33	0.54	0.01	0.66	0.01	0.68	0.63	0.63	0.47	0.74	0.71	0.49	0.05	0.18	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.34	0.86	0.34	0.32	0.80	0.06	1.01	0.11	1.10	0.85	1.02	0.72	1.23	1.07	0.66	0.08	0.18	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.64	0.69	0.35	0.23	0.73	0.24	0.76	0.02	0.74	0.82	0.71	0.68	0.74	0.81	0.74	0.32	0.40	0.66	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.40	0.27	0.38	0.37	0.10	0.46	0.01	0.51	0.38	0.48	0.34	0.56	0.47	0.31	0.12	0.41	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.43	0.24	0.24	0.29	0.24	0.24	0.27	0.23	0.31	0.39	0.54	0.26	0.26	0.26	0.28	0.20	0.62	0.27	0.21
C2	0.34	0.46	0.22	0.23	0.22	0.24	0.15	0.27	0.18	0.31	0.41	0.63	0.35	0.26	0.20	0.34	0.14	0.75	0.32	0.13
C2'	0.30	0.46	0.23	0.20	0.29	0.21	0.22	0.22	0.22	0.31	0.42	0.62	0.28	0.21	0.27	0.27	0.15	0.50	0.33	0.15
C3'	0.14	0.35	0.11	0.18	0.30	0.15	0.25	0.17	0.20	0.20	0.37	0.48	0.17	0.32	0.31	0.10	0.11	0.30	0.55	0.13
C4	0.28	0.48	0.20	0.28	0.29	0.23	0.17	0.30	0.17	0.29	0.48	0.61	0.24	0.35	0.27	0.26	0.11	0.68	0.44	0.13
C4'	0.09	0.24	0.13	0.17	0.29	0.17	0.28	0.15	0.23	0.16	0.29	0.30	0.24	0.33	0.30	0.09	0.11	0.29	0.46	0.11
C5	0.22	0.42	0.21	0.38	0.29	0.28	0.12	0.39	0.12	0.23	0.47	0.53	0.19	0.48	0.31	0.21	0.15	0.66	0.66	0.17
C5'	0.23	0.17	0.33	0.41	0.32	0.41	0.35	0.37	0.31	0.19	0.27	0.17	0.46	0.65	0.36	0.28	0.31	0.16	0.73	0.29
C6	0.22	0.39	0.19	0.35	0.22	0.26	0.11	0.38	0.11	0.22	0.42	0.52	0.20	0.45	0.24	0.21	0.13	0.68	0.66	0.15
C8	0.22	0.38	0.29	0.47	0.34	0.38	0.18	0.46	0.13	0.22	0.45	0.45	0.25	0.59	0.36	0.23	0.24	0.58	0.73	0.24
N1	0.27	0.41	0.18	0.27	0.20	0.22	0.12	0.30	0.13	0.25	0.39	0.56	0.27	0.34	0.19	0.27	0.08	0.73	0.48	0.08
N3	0.35	0.49	0.24	0.23	0.26	0.26	0.18	0.27	0.21	0.33	0.44	0.67	0.35	0.25	0.22	0.34	0.17	0.73	0.27	0.17
N6	0.18	0.33	0.21	0.42	0.19	0.31	0.10	0.46	0.11	0.18	0.37	0.45	0.17	0.54	0.22	0.18	0.22	0.64	0.83	0.25
N7	0.20	0.37	0.28	0.49	0.33	0.40	0.12	0.52	0.12	0.20	0.45	0.45	0.23	0.63	0.38	0.22	0.28	0.59	0.86	0.29
N9	0.25	0.45	0.22	0.31	0.32	0.26	0.21	0.32	0.18	0.28	0.46	0.56	0.22	0.39	0.30	0.24	0.14	0.64	0.46	0.16
O2'	0.39	0.47	0.34	0.28	0.28	0.32	0.23	0.31	0.26	0.36	0.40	0.64	0.42	0.24	0.23	0.37	0.27	0.55	0.15	0.26
O3'	0.16	0.37	0.11	0.13	0.29	0.11	0.25	0.13	0.20	0.21	0.38	0.52	0.17	0.25	0.30	0.11	0.12	0.22	0.54	0.14
O4'	0.12	0.25	0.14	0.20	0.28	0.17	0.26	0.19	0.22	0.18	0.29	0.29	0.22	0.31	0.29	0.12	0.13	0.50	0.33	0.15
O5'	0.60	0.15	0.87	1.06	0.51	1.06	0.36	0.96	0.25	0.23	0.41	0.11	1.17	1.54	0.65	0.76	0.74	0.33	0.97	0.61
OP1	0.89	0.11	1.16	1.60	0.59	1.72	0.28	1.73	0.24	0.35	0.45	0.16	1.51	2.30	0.87	1.21	1.46	1.05	1.65	1.32
OP2	1.65	1.22	1.67	1.99	1.09	2.04	1.34	2.08	1.56	1.48	1.06	1.13	1.61	2.10	0.95	1.84	2.02	1.50	2.49	1.92
P	1.35	0.57	1.55	1.95	0.17	2.00	0.48	1.97	0.86	0.91	0.25	0.58	1.72	2.47	0.11	1.62	1.75	1.21	1.97	1.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.19	0.41	0.22	0.20
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.08	0.01	0.04	0.20	0.69	0.12	0.21
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.09	0.02	0.04	0.13	0.00	0.02	0.06	0.01	0.09	0.21	0.05	0.08
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.15	0.00	0.17	0.01	0.16	0.09	0.12	0.10	0.01	0.00	0.17	0.01	0.04	0.07	0.13	0.05
C4	0.02	0.01	0.05	0.15	0.00	0.11	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.18	0.00	0.03	0.21	0.95	0.32	0.23
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.11	0.00	0.14	0.00	0.13	0.07	0.08	0.02	0.04	0.02	0.12	0.00	0.01	0.12	0.24	0.01
C5	0.01	0.01	0.08	0.17	0.00	0.14	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.23	0.00	0.05	0.21	0.96	0.35	0.23
C5'	0.03	0.13	0.02	0.01	0.23	0.00	0.26	0.00	0.23	0.14	0.18	0.08	0.04	0.01	0.24	0.01	0.01	0.28	0.31	0.01
C6	0.01	0.00	0.09	0.16	0.00	0.13	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.19	0.01	0.05	0.22	0.80	0.19	0.23
N1	0.01	0.00	0.02	0.09	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.01	0.21	0.65	0.12	0.22
N3	0.02	0.00	0.04	0.12	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.12	0.01	0.03	0.21	0.84	0.20	0.22
O2	0.02	0.00	0.13	0.10	0.00	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.13	0.01	0.06	0.19	0.60	0.13	0.20
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.04	0.04	0.05	0.04	0.06	0.03	0.08	0.19	0.00	0.04	0.04	0.05	0.02	0.05	0.10	0.02
O3'	0.02	0.08	0.02	0.00	0.18	0.02	0.23	0.01	0.19	0.07	0.12	0.13	0.04	0.00	0.21	0.02	0.21	0.39	0.29	0.23
O4	0.02	0.01	0.06	0.17	0.00	0.12	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.21	0.00	0.05	0.21	1.03	0.38	0.23
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.03	0.06	0.05	0.02	0.05	0.00	0.21	0.33	0.42	0.23
O5'	0.19	0.20	0.09	0.04	0.21	0.01	0.21	0.01	0.22	0.21	0.21	0.19	0.02	0.21	0.21	0.21	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.41	0.69	0.21	0.07	0.95	0.12	0.96	0.28	0.80	0.65	0.84	0.60	0.05	0.39	1.03	0.33	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.12	0.05	0.13	0.32	0.24	0.35	0.31	0.19	0.12	0.20	0.13	0.10	0.29	0.38	0.42	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.21	0.08	0.05	0.23	0.01	0.23	0.01	0.23	0.22	0.22	0.20	0.02	0.23	0.23	0.23	0.00	0.00	0.01	0.00