Doublet Group distance statistics: 52899

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 2, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.010, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.010, 0.017, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.012, 0.021, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.021 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.023 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.016, 0.034, 0.051, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.034 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.018, 0.035, 0.053, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.035 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.023, 0.041, 0.060, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.041 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.023, 0.042, 0.061, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.042 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.020, 0.040, 0.060, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.040 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.021, 0.045, 0.068, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.045 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.031, 0.064, 0.097, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.064 std_dev=0.033
C2'	A	0, 0.065, 0.241, 0.418, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.241 std_dev=0.176
O4'	A	0, -0.029, 0.166, 0.361, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.166 std_dev=0.195
O4'	B	0, 0.440, 0.690, 0.939, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.690 std_dev=0.250
C2'	B	0, 0.410, 0.676, 0.943, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.676 std_dev=0.266
C1'	B	0, 0.452, 0.722, 0.992, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.722 std_dev=0.270
N1	B	0, 0.378, 0.674, 0.970, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.674 std_dev=0.296
C3'	B	0, 0.255, 0.554, 0.853, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.554 std_dev=0.299
C6	B	0, 0.270, 0.580, 0.891, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.580 std_dev=0.311
C4'	B	0, 0.300, 0.618, 0.935, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.618 std_dev=0.318
O3'	B	0, 0.526, 0.855, 1.185, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.855 std_dev=0.329
C5	B	0, 0.308, 0.637, 0.967, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.637 std_dev=0.330
P	A	0, 0.478, 0.808, 1.138, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.808 std_dev=0.330
OP2	A	0, 0.533, 0.863, 1.193, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.863 std_dev=0.330
O2'	B	0, 0.640, 0.978, 1.317, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.978 std_dev=0.338
O5'	A	0, 0.182, 0.522, 0.862, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.522 std_dev=0.340
C2	B	0, 0.453, 0.807, 1.162, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.807 std_dev=0.355
C4'	A	0, -0.031, 0.325, 0.682, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.325 std_dev=0.356
O2'	A	0, 0.061, 0.419, 0.778, 1.503 max_d=1.503 avg_d=0.419 std_dev=0.359
C5'	A	0, 0.114, 0.484, 0.854, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.484 std_dev=0.370
C4	B	0, 0.382, 0.765, 1.149, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.765 std_dev=0.383
C5'	B	0, 0.161, 0.546, 0.931, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.546 std_dev=0.385
P	B	0, 0.196, 0.587, 0.979, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.587 std_dev=0.391
O2	B	0, 0.544, 0.939, 1.333, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.939 std_dev=0.394
O5'	B	0, 0.062, 0.458, 0.854, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.458 std_dev=0.396
N3	B	0, 0.430, 0.830, 1.230, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.830 std_dev=0.400
OP1	A	0, 0.788, 1.205, 1.622, 1.623 max_d=1.623 avg_d=1.205 std_dev=0.417
O4	B	0, 0.457, 0.878, 1.299, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.878 std_dev=0.421
C3'	A	0, 0.014, 0.449, 0.884, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.449 std_dev=0.435
OP1	B	0, 0.294, 0.741, 1.188, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.741 std_dev=0.447
OP2	B	0, 0.249, 0.744, 1.240, 2.100 max_d=2.100 avg_d=0.744 std_dev=0.495
O3'	A	0, 0.030, 0.798, 1.566, 3.141 max_d=3.141 avg_d=0.798 std_dev=0.768

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.21	0.00	0.14	0.16	0.22	0.13
C2	0.01	0.00	0.15	0.10	0.00	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.28	0.13	0.18	0.17	0.31	0.15
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.14	0.09	0.07	0.12	0.14	0.08	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.29	0.43	0.47	0.37
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.13	0.00	0.21	0.02	0.21	0.23	0.16	0.07	0.25	0.25	0.14	0.01	0.01	0.02	0.09	0.22	0.12	0.12
C4	0.01	0.00	0.08	0.13	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.15	0.07	0.18	0.18	0.29	0.17
C4'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.05	0.14	0.04	0.07	0.08	0.12	0.05	0.19	0.02	0.00	0.02	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.21	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.09	0.04	0.21	0.24	0.36	0.23
C5'	0.06	0.11	0.14	0.02	0.10	0.00	0.14	0.00	0.13	0.18	0.12	0.11	0.15	0.19	0.10	0.05	0.14	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.09	0.21	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.13	0.06	0.21	0.25	0.38	0.23
C8	0.01	0.01	0.07	0.23	0.00	0.14	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.24	0.12	0.06	0.22	0.24	0.30	0.23
N1	0.01	0.00	0.12	0.16	0.00	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.20	0.10	0.20	0.21	0.35	0.19
N3	0.01	0.00	0.14	0.07	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.29	0.12	0.17	0.16	0.27	0.14
N6	0.01	0.01	0.08	0.25	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.20	0.14	0.04	0.23	0.30	0.43	0.27
N7	0.01	0.01	0.04	0.25	0.01	0.12	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.26	0.13	0.03	0.24	0.30	0.38	0.28
N9	0.00	0.01	0.01	0.14	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.08	0.01	0.16	0.17	0.25	0.15
O2'	0.02	0.02	0.00	0.01	0.09	0.19	0.18	0.05	0.16	0.24	0.08	0.03	0.20	0.26	0.14	0.00	0.03	0.13	0.20	0.34	0.52	0.32
O3'	0.21	0.28	0.02	0.01	0.15	0.02	0.09	0.14	0.13	0.12	0.20	0.29	0.14	0.13	0.08	0.03	0.00	0.14	0.20	0.22	0.20	0.20
O4'	0.00	0.13	0.01	0.02	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.06	0.10	0.12	0.04	0.03	0.01	0.13	0.14	0.00	0.05	0.07	0.06	0.07
O5'	0.14	0.18	0.29	0.09	0.18	0.02	0.21	0.01	0.21	0.22	0.20	0.17	0.23	0.24	0.16	0.20	0.20	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.16	0.17	0.43	0.22	0.18	0.06	0.24	0.04	0.25	0.24	0.21	0.16	0.30	0.30	0.17	0.34	0.22	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.31	0.47	0.12	0.29	0.04	0.36	0.02	0.38	0.30	0.35	0.27	0.43	0.38	0.25	0.52	0.20	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.15	0.37	0.12	0.17	0.02	0.23	0.01	0.23	0.23	0.19	0.14	0.27	0.28	0.15	0.32	0.20	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.20	0.18	0.08	0.24	0.11	0.19	0.05	0.14	0.15	0.24	0.21	0.38	0.10	0.28	0.15	0.05	0.13	0.24	0.11
C2	0.26	0.18	0.26	0.13	0.18	0.17	0.15	0.10	0.09	0.15	0.11	0.30	0.44	0.13	0.28	0.20	0.09	0.15	0.20	0.13
C2'	0.12	0.20	0.10	0.16	0.25	0.15	0.22	0.21	0.18	0.17	0.24	0.20	0.22	0.18	0.28	0.14	0.24	0.31	0.48	0.35
C3'	0.18	0.21	0.17	0.11	0.21	0.12	0.20	0.09	0.20	0.18	0.22	0.22	0.24	0.09	0.22	0.15	0.12	0.20	0.12	0.09
C4	0.21	0.13	0.23	0.11	0.20	0.13	0.16	0.08	0.09	0.12	0.14	0.19	0.40	0.11	0.27	0.14	0.09	0.14	0.20	0.13
C4'	0.17	0.29	0.14	0.07	0.27	0.10	0.21	0.07	0.18	0.21	0.31	0.33	0.22	0.09	0.29	0.15	0.08	0.19	0.13	0.07
C5	0.23	0.18	0.25	0.13	0.12	0.13	0.11	0.09	0.08	0.15	0.08	0.26	0.39	0.14	0.20	0.14	0.12	0.19	0.21	0.17
C5'	0.27	0.38	0.26	0.14	0.35	0.16	0.29	0.09	0.28	0.31	0.39	0.42	0.29	0.07	0.36	0.23	0.11	0.16	0.14	0.06
C6	0.27	0.27	0.27	0.14	0.05	0.14	0.07	0.09	0.09	0.20	0.17	0.37	0.41	0.14	0.15	0.18	0.12	0.22	0.24	0.18
C8	0.24	0.19	0.27	0.17	0.19	0.17	0.17	0.14	0.16	0.19	0.17	0.19	0.38	0.18	0.21	0.17	0.14	0.15	0.22	0.16
N1	0.28	0.26	0.27	0.14	0.11	0.17	0.11	0.10	0.09	0.20	0.15	0.38	0.44	0.13	0.21	0.21	0.11	0.19	0.24	0.16
N3	0.22	0.13	0.23	0.12	0.22	0.15	0.17	0.09	0.10	0.12	0.15	0.21	0.42	0.13	0.30	0.17	0.08	0.13	0.19	0.11
N6	0.30	0.36	0.28	0.16	0.14	0.15	0.07	0.11	0.14	0.26	0.32	0.44	0.39	0.16	0.11	0.20	0.14	0.27	0.29	0.22
N7	0.23	0.18	0.27	0.18	0.13	0.16	0.14	0.14	0.14	0.18	0.12	0.21	0.36	0.20	0.17	0.14	0.17	0.21	0.22	0.19
N9	0.21	0.17	0.22	0.11	0.22	0.13	0.18	0.08	0.13	0.15	0.19	0.19	0.39	0.11	0.26	0.15	0.09	0.12	0.21	0.12
O2'	0.13	0.18	0.11	0.10	0.32	0.07	0.30	0.18	0.21	0.14	0.25	0.21	0.36	0.10	0.38	0.09	0.27	0.37	0.64	0.44
O3'	0.17	0.27	0.16	0.16	0.25	0.17	0.19	0.17	0.18	0.19	0.30	0.33	0.23	0.20	0.28	0.16	0.20	0.33	0.13	0.18
O4'	0.16	0.25	0.15	0.13	0.28	0.15	0.19	0.12	0.14	0.16	0.30	0.27	0.34	0.20	0.32	0.15	0.09	0.20	0.14	0.08
O5'	0.19	0.31	0.18	0.08	0.31	0.07	0.26	0.03	0.22	0.25	0.33	0.33	0.19	0.02	0.32	0.13	0.05	0.21	0.17	0.10
OP1	0.03	0.16	0.07	0.01	0.23	0.08	0.23	0.13	0.18	0.11	0.20	0.19	0.08	0.02	0.26	0.04	0.12	0.27	0.14	0.13
OP2	0.09	0.21	0.11	0.04	0.32	0.08	0.31	0.15	0.25	0.18	0.27	0.17	0.09	0.01	0.35	0.04	0.13	0.32	0.20	0.19
P	0.06	0.17	0.08	0.01	0.24	0.04	0.23	0.09	0.19	0.14	0.21	0.17	0.07	0.00	0.26	0.01	0.08	0.23	0.15	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.11	0.07
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.01	0.03	0.07	0.09	0.21	0.14
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.10	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.08	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.10	0.00	0.12	0.01	0.11	0.06	0.08	0.08	0.02	0.00	0.11	0.01	0.05	0.07	0.07	0.02
C4	0.02	0.01	0.03	0.10	0.00	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.00	0.04	0.13	0.23	0.35	0.24
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.04	0.05	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.06	0.04	0.01
C5	0.02	0.03	0.05	0.12	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.02	0.03	0.04	0.02	0.15	0.00	0.06	0.15	0.25	0.36	0.24
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.09	0.05	0.07	0.03	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01
C6	0.02	0.02	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.13	0.00	0.07	0.12	0.17	0.27	0.19
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.03	0.07	0.09	0.19	0.13
N3	0.02	0.00	0.04	0.08	0.01	0.04	0.03	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.01	0.03	0.10	0.16	0.29	0.19
O2	0.04	0.01	0.10	0.08	0.02	0.05	0.04	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.11	0.10	0.01	0.04	0.04	0.05	0.17	0.10
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.05	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.11	0.00	0.04	0.02	0.03	0.02	0.09	0.07	0.03
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.13	0.01	0.15	0.01	0.13	0.06	0.09	0.10	0.04	0.00	0.14	0.01	0.06	0.11	0.13	0.06
O4	0.02	0.01	0.04	0.11	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.00	0.04	0.15	0.27	0.39	0.26
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.06	0.05	0.04
O5'	0.04	0.07	0.04	0.05	0.13	0.01	0.15	0.01	0.12	0.07	0.10	0.04	0.02	0.06	0.15	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.03	0.09	0.05	0.07	0.23	0.06	0.25	0.07	0.17	0.09	0.16	0.05	0.09	0.11	0.27	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.21	0.08	0.07	0.35	0.04	0.36	0.03	0.27	0.19	0.29	0.17	0.07	0.13	0.39	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.14	0.04	0.02	0.24	0.01	0.24	0.01	0.19	0.13	0.19	0.10	0.03	0.06	0.26	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00