Doublet Group distance statistics: 52913

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N1	A	0, 0.000, 0.027, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C2	A	0, 0.000, 0.028, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C4	A	0, 0.000, 0.034, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C1'	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N3	A	0, 0.000, 0.037, 0.075, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N6	A	0, 0.000, 0.046, 0.092, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.046 std_dev=0.046
N9	A	0, 0.000, 0.049, 0.098, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.049 std_dev=0.049
N7	A	0, 0.000, 0.052, 0.104, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.052 std_dev=0.052
C8	A	0, 0.000, 0.065, 0.131, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.065 std_dev=0.065
O2	B	0, 0.000, 0.152, 0.304, 0.304 max_d=0.304 avg_d=0.152 std_dev=0.152
C2	B	0, 0.000, 0.377, 0.755, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.377 std_dev=0.377
P	B	0, 0.000, 0.423, 0.845, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.423 std_dev=0.423
N1	B	0, 0.000, 0.558, 1.117, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.558 std_dev=0.558
C1'	B	0, 0.000, 0.580, 1.159, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.580 std_dev=0.580
N3	B	0, 0.000, 0.606, 1.213, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.606 std_dev=0.606
OP1	B	0, 0.000, 0.607, 1.215, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.607 std_dev=0.607
O2'	B	0, 0.000, 0.631, 1.261, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.631 std_dev=0.631
C6	B	0, 0.000, 0.793, 1.587, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.793 std_dev=0.793
C2'	A	0, 0.000, 0.828, 1.656, 1.656 max_d=1.656 avg_d=0.828 std_dev=0.828
C4	B	0, 0.000, 0.838, 1.677, 1.677 max_d=1.677 avg_d=0.838 std_dev=0.838
O4'	A	0, 0.000, 0.842, 1.685, 1.685 max_d=1.685 avg_d=0.842 std_dev=0.842
C2'	B	0, 0.000, 0.852, 1.704, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.852 std_dev=0.852
O4'	B	0, 0.000, 0.860, 1.719, 1.719 max_d=1.719 avg_d=0.860 std_dev=0.860
C5	B	0, 0.000, 0.917, 1.835, 1.835 max_d=1.835 avg_d=0.917 std_dev=0.917
O5'	B	0, 0.000, 0.942, 1.884, 1.884 max_d=1.884 avg_d=0.942 std_dev=0.942
O4	B	0, 0.000, 1.023, 2.046, 2.046 max_d=2.046 avg_d=1.023 std_dev=1.023
O2'	A	0, 0.000, 1.133, 2.265, 2.265 max_d=2.265 avg_d=1.133 std_dev=1.133
C4'	B	0, 0.000, 1.196, 2.393, 2.393 max_d=2.393 avg_d=1.196 std_dev=1.196
C3'	A	0, 0.000, 1.262, 2.523, 2.523 max_d=2.523 avg_d=1.262 std_dev=1.262
C3'	B	0, 0.000, 1.262, 2.524, 2.524 max_d=2.524 avg_d=1.262 std_dev=1.262
P	A	0, 0.000, 1.303, 2.606, 2.606 max_d=2.606 avg_d=1.303 std_dev=1.303
C4'	A	0, 0.000, 1.309, 2.618, 2.618 max_d=2.618 avg_d=1.309 std_dev=1.309
OP2	A	0, 0.000, 1.362, 2.723, 2.723 max_d=2.723 avg_d=1.362 std_dev=1.362
OP2	B	0, 0.000, 1.385, 2.769, 2.769 max_d=2.769 avg_d=1.385 std_dev=1.385
OP1	A	0, 0.000, 1.511, 3.022, 3.022 max_d=3.022 avg_d=1.511 std_dev=1.511
C5'	B	0, 0.000, 1.524, 3.048, 3.048 max_d=3.048 avg_d=1.524 std_dev=1.524
O5'	A	0, 0.000, 1.554, 3.108, 3.108 max_d=3.108 avg_d=1.554 std_dev=1.554
O3'	B	0, 0.000, 1.598, 3.195, 3.195 max_d=3.195 avg_d=1.598 std_dev=1.598
O3'	A	0, 0.000, 1.602, 3.204, 3.204 max_d=3.204 avg_d=1.602 std_dev=1.602
C5'	A	0, 0.000, 1.781, 3.561, 3.561 max_d=3.561 avg_d=1.781 std_dev=1.781

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.24	0.00	0.11	0.38	0.12	0.07
C2	0.04	0.00	0.29	0.16	0.01	0.20	0.01	0.27	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.23	0.13	0.35	0.14	0.15	0.20	0.12
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.16	0.01	0.10	0.18	0.17	0.13	0.25	0.27	0.14	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.33	0.96	0.56	0.55
C3'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.20	0.00	0.28	0.01	0.30	0.26	0.24	0.11	0.34	0.32	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.73	0.15	0.27
C4	0.02	0.01	0.16	0.20	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.19	0.06	0.10	0.17	0.16
C4'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.02	0.21	0.12	0.20	0.03	0.17	0.05	0.18	0.03	0.00	0.00	0.28	0.04	0.06
C5	0.01	0.01	0.10	0.28	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.08	0.10	0.06	0.10	0.35	0.33
C5'	0.06	0.27	0.18	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.07	0.19	0.19	0.26	0.02	0.16	0.00	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02
C6	0.02	0.00	0.17	0.30	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.17	0.04	0.13	0.41	0.34
C8	0.01	0.02	0.13	0.26	0.01	0.21	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.36	0.12	0.17	0.18	0.11	0.24	0.35
N1	0.03	0.00	0.25	0.24	0.01	0.12	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.01	0.28	0.05	0.01	0.33	0.25
N3	0.04	0.00	0.27	0.11	0.01	0.20	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.23	0.20	0.35	0.16	0.24	0.10	0.06
N6	0.02	0.00	0.14	0.34	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.11	0.17	0.13	0.10	0.27	0.53	0.44
N7	0.01	0.01	0.04	0.32	0.00	0.17	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.31	0.18	0.08	0.20	0.25	0.44	0.46
N9	0.00	0.02	0.01	0.17	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.05	0.01	0.01	0.14	0.07	0.13
O2'	0.00	0.23	0.00	0.01	0.02	0.18	0.12	0.00	0.04	0.36	0.12	0.23	0.11	0.31	0.14	0.00	0.02	0.13	0.27	1.03	0.72	0.59
O3'	0.24	0.13	0.01	0.00	0.06	0.03	0.08	0.13	0.09	0.12	0.01	0.20	0.17	0.18	0.05	0.02	0.00	0.19	0.17	0.57	0.01	0.13
O4'	0.00	0.35	0.01	0.01	0.19	0.00	0.10	0.01	0.17	0.17	0.28	0.35	0.13	0.08	0.01	0.13	0.19	0.00	0.01	0.04	0.09	0.16
O5'	0.11	0.14	0.33	0.02	0.06	0.00	0.06	0.01	0.04	0.18	0.05	0.16	0.10	0.20	0.01	0.27	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01
OP1	0.38	0.15	0.96	0.73	0.10	0.28	0.10	0.01	0.13	0.11	0.01	0.24	0.27	0.25	0.14	1.03	0.57	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.20	0.56	0.15	0.17	0.04	0.35	0.01	0.41	0.24	0.33	0.10	0.53	0.44	0.07	0.72	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.12	0.55	0.27	0.16	0.06	0.33	0.02	0.34	0.35	0.25	0.06	0.44	0.46	0.13	0.59	0.13	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.04	0.34	0.66	0.41	0.76	0.18	0.97	0.15	0.17	0.30	0.01	0.32	0.74	0.62	0.61	0.67	0.40	0.09	0.19
C2	0.40	0.08	0.58	0.86	0.06	0.73	0.19	0.81	0.33	0.29	0.10	0.02	0.43	0.97	0.19	0.54	0.55	0.35	0.55	0.29
C2'	0.17	0.19	0.07	0.41	0.43	0.64	0.17	0.95	0.08	0.03	0.40	0.20	0.02	0.46	0.58	0.52	0.68	0.58	0.09	0.29
C3'	0.65	0.14	0.54	0.91	0.28	1.22	0.03	1.57	0.42	0.42	0.18	0.16	0.54	0.96	0.56	1.06	1.31	1.13	0.62	0.88
C4	0.37	0.01	0.47	0.77	0.24	0.73	0.11	0.85	0.33	0.26	0.22	0.02	0.36	0.86	0.46	0.56	0.61	0.37	0.33	0.22
C4'	0.98	0.50	0.85	1.12	0.01	1.42	0.28	1.69	0.71	0.76	0.16	0.55	0.88	1.11	0.31	1.34	1.50	1.29	0.71	1.01
C5	0.40	0.08	0.51	0.77	0.02	0.69	0.34	0.80	0.45	0.32	0.10	0.00	0.39	0.87	0.26	0.53	0.61	0.39	0.35	0.23
C5'	1.17	0.70	0.99	1.20	0.24	1.52	0.56	1.73	0.97	0.98	0.37	0.73	1.02	1.15	0.11	1.51	1.65	1.62	0.90	1.24
C6	0.42	0.16	0.58	0.80	0.19	0.68	0.45	0.76	0.49	0.37	0.04	0.04	0.43	0.91	0.04	0.52	0.58	0.39	0.48	0.27
C8	0.35	0.00	0.41	0.67	0.22	0.67	0.14	0.81	0.34	0.25	0.22	0.04	0.33	0.75	0.49	0.53	0.62	0.38	0.12	0.16
N1	0.42	0.17	0.61	0.83	0.17	0.69	0.38	0.76	0.44	0.36	0.06	0.06	0.45	0.95	0.05	0.51	0.55	0.37	0.57	0.30
N3	0.37	0.01	0.50	0.83	0.27	0.77	0.01	0.88	0.25	0.22	0.25	0.02	0.38	0.93	0.42	0.57	0.58	0.35	0.43	0.26
N6	0.43	0.21	0.59	0.79	0.34	0.66	0.55	0.72	0.54	0.40	0.16	0.07	0.44	0.91	0.29	0.50	0.59	0.41	0.50	0.28
N7	0.38	0.06	0.47	0.71	0.05	0.66	0.31	0.77	0.43	0.31	0.12	0.01	0.37	0.81	0.30	0.52	0.61	0.39	0.23	0.19
N9	0.34	0.03	0.39	0.69	0.33	0.71	0.01	0.87	0.26	0.21	0.27	0.04	0.33	0.78	0.57	0.56	0.63	0.37	0.17	0.18
O2'	0.23	0.44	0.33	0.03	0.57	0.17	0.43	0.46	0.29	0.31	0.56	0.43	0.37	0.03	0.62	0.07	0.11	0.04	0.50	0.27
O3'	0.99	0.44	0.90	1.30	0.05	1.63	0.23	2.00	0.64	0.71	0.09	0.51	0.93	1.38	0.35	1.42	1.61	1.34	0.88	1.15
O4'	0.88	0.45	0.82	1.07	0.05	1.24	0.21	1.39	0.64	0.69	0.13	0.50	0.83	1.08	0.35	1.14	1.16	0.83	0.44	0.60
O5'	1.00	0.55	0.87	1.10	0.19	1.34	0.58	1.55	0.91	0.85	0.25	0.54	0.86	1.08	0.15	1.31	1.47	1.44	0.79	1.06
OP1	0.78	0.25	0.77	1.05	0.17	1.22	0.21	1.47	0.59	0.57	0.09	0.25	0.79	1.13	0.54	1.07	1.36	1.12	0.55	0.87
OP2	0.56	0.08	0.52	0.80	0.17	0.95	0.28	1.19	0.55	0.42	0.20	0.02	0.47	0.86	0.50	0.85	1.14	1.06	0.53	0.74
P	0.63	0.13	0.56	0.82	0.23	1.02	0.19	1.25	0.52	0.45	0.18	0.11	0.55	0.87	0.58	0.92	1.20	1.10	0.52	0.78

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.11	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.06	0.71	0.19
C2	0.07	0.00	0.19	0.18	0.01	0.08	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.23	0.01	0.01	0.04	0.01	0.55	0.05
C2'	0.00	0.19	0.00	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.08	0.03	0.18	0.30	0.00	0.03	0.12	0.01	0.14	0.09	0.45	0.00
C3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.10	0.00	0.02	0.01	0.05	0.06	0.16	0.27	0.02	0.01	0.11	0.01	0.25	0.24	0.16	0.15
C4	0.03	0.01	0.10	0.10	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.14	0.00	0.02	0.09	0.15	0.06	0.27
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.05	0.15	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.52	0.13
C5	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.13	0.17	0.08	0.34
C5'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.01	0.10	0.05	0.03	0.06	0.01	0.00	0.31	0.16	0.01
C6	0.04	0.01	0.08	0.05	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.08	0.05	0.01	0.01	0.06	0.06	0.12	0.17
N1	0.00	0.00	0.03	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.03	0.48	0.05
N3	0.05	0.00	0.18	0.16	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.14	0.22	0.00	0.02	0.03	0.09	0.33	0.11
O2	0.11	0.01	0.30	0.27	0.00	0.15	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.27	0.34	0.01	0.04	0.11	0.07	0.77	0.19
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.07	0.05	0.03	0.05	0.08	0.01	0.14	0.27	0.00	0.04	0.10	0.02	0.05	0.02	0.73	0.19
O3'	0.02	0.23	0.03	0.01	0.14	0.01	0.00	0.03	0.05	0.07	0.22	0.34	0.04	0.00	0.17	0.01	0.33	0.31	0.02	0.22
O4	0.04	0.01	0.12	0.11	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.10	0.17	0.00	0.03	0.11	0.21	0.06	0.35
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.18	0.06	0.80	0.32
O5'	0.05	0.04	0.14	0.25	0.09	0.01	0.13	0.00	0.06	0.03	0.03	0.11	0.05	0.33	0.11	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.06	0.01	0.09	0.24	0.15	0.14	0.17	0.31	0.06	0.03	0.09	0.07	0.02	0.31	0.21	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.71	0.55	0.45	0.16	0.06	0.52	0.08	0.16	0.12	0.48	0.33	0.77	0.73	0.02	0.06	0.80	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.05	0.00	0.15	0.27	0.13	0.34	0.01	0.17	0.05	0.11	0.19	0.19	0.22	0.35	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00