Doublet Group distance statistics: 52919

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 5, 17, 14, 9, 8, 3, 4, 0, 2, 2, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.015, 0.020, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.010, 0.027, 0.044, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.027 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.006, 0.025, 0.043, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C2	A	0, -0.002, 0.016, 0.035, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.016 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.002, 0.021, 0.040, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.021 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.010, 0.035, 0.059, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.035 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.013, 0.040, 0.067, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.040 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.011, 0.039, 0.066, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.039 std_dev=0.027
C2'	A	0, 0.040, 0.212, 0.384, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.212 std_dev=0.172
N1	B	0, 0.310, 0.509, 0.709, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.509 std_dev=0.199
O4'	A	0, -0.054, 0.180, 0.414, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.180 std_dev=0.234
C6	B	0, 0.307, 0.547, 0.787, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.547 std_dev=0.240
C1'	B	0, 0.301, 0.547, 0.793, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.547 std_dev=0.246
C5	B	0, 0.285, 0.547, 0.808, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.547 std_dev=0.262
C3'	A	0, -0.017, 0.251, 0.519, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.251 std_dev=0.268
C4'	A	0, 0.029, 0.313, 0.596, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.313 std_dev=0.283
O2'	A	0, 0.223, 0.517, 0.812, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.517 std_dev=0.295
C2	B	0, 0.239, 0.536, 0.834, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.536 std_dev=0.297
O2	B	0, 0.239, 0.593, 0.947, 1.819 max_d=1.819 avg_d=0.593 std_dev=0.354
O4'	B	0, 0.236, 0.615, 0.994, 2.105 max_d=2.105 avg_d=0.615 std_dev=0.379
C4	B	0, 0.150, 0.559, 0.968, 1.946 max_d=1.946 avg_d=0.559 std_dev=0.409
N3	B	0, 0.126, 0.573, 1.020, 2.142 max_d=2.142 avg_d=0.573 std_dev=0.447
O3'	A	0, -0.110, 0.359, 0.829, 2.733 max_d=2.733 avg_d=0.359 std_dev=0.469
C5'	A	0, 0.051, 0.530, 1.009, 2.401 max_d=2.401 avg_d=0.530 std_dev=0.479
C2'	B	0, 0.097, 0.580, 1.064, 2.404 max_d=2.404 avg_d=0.580 std_dev=0.484
O2'	B	0, 0.165, 0.749, 1.333, 2.988 max_d=2.988 avg_d=0.749 std_dev=0.584
O4	B	0, 0.017, 0.603, 1.189, 2.679 max_d=2.679 avg_d=0.603 std_dev=0.586
C4'	B	0, -0.014, 0.615, 1.244, 3.149 max_d=3.149 avg_d=0.615 std_dev=0.629
C3'	B	0, -0.086, 0.565, 1.217, 3.161 max_d=3.161 avg_d=0.565 std_dev=0.652
OP2	B	0, 0.314, 0.973, 1.631, 3.794 max_d=3.794 avg_d=0.973 std_dev=0.658
O5'	A	0, 1.221, 1.885, 2.550, 2.550 max_d=2.550 avg_d=1.885 std_dev=0.664
O5'	B	0, 0.102, 0.772, 1.442, 3.498 max_d=3.498 avg_d=0.772 std_dev=0.670
OP2	A	0, 1.324, 2.012, 2.699, 3.133 max_d=3.133 avg_d=2.012 std_dev=0.687
P	A	0, 1.239, 1.970, 2.701, 3.320 max_d=3.320 avg_d=1.970 std_dev=0.731
C5'	B	0, -0.041, 0.726, 1.493, 3.853 max_d=3.853 avg_d=0.726 std_dev=0.767
P	B	0, 0.142, 0.924, 1.706, 4.186 max_d=4.186 avg_d=0.924 std_dev=0.782
OP1	A	0, 1.443, 2.266, 3.088, 4.183 max_d=4.183 avg_d=2.266 std_dev=0.822
O3'	B	0, -0.287, 0.658, 1.602, 4.400 max_d=4.400 avg_d=0.658 std_dev=0.945
OP1	B	0, -0.012, 0.977, 1.966, 4.992 max_d=4.992 avg_d=0.977 std_dev=0.989

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02	0.01	0.00	0.03	0.18	0.01	0.21	0.11	0.33	0.19
C2	0.05	0.00	0.14	0.11	0.01	0.10	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.24	0.28	0.13	0.24	0.12	0.37	0.26
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.02	0.06	0.11	0.08	0.06	0.12	0.14	0.08	0.05	0.03	0.01	0.04	0.02	0.36	0.23	0.55	0.32
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.10	0.00	0.13	0.02	0.13	0.16	0.12	0.10	0.14	0.17	0.10	0.02	0.01	0.01	0.38	0.27	0.49	0.30
C4	0.02	0.01	0.08	0.10	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.19	0.07	0.25	0.13	0.40	0.26
C4'	0.01	0.10	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.07	0.12	0.08	0.09	0.08	0.12	0.06	0.11	0.03	0.01	0.02	0.15	0.29	0.08
C5	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.15	0.03	0.27	0.18	0.46	0.28
C5'	0.04	0.12	0.11	0.02	0.11	0.01	0.15	0.00	0.14	0.18	0.13	0.12	0.16	0.19	0.11	0.06	0.08	0.02	0.01	0.18	0.35	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.18	0.06	0.27	0.17	0.46	0.29
C8	0.01	0.02	0.06	0.16	0.01	0.12	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.14	0.12	0.09	0.28	0.20	0.48	0.28
N1	0.04	0.00	0.12	0.12	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.24	0.23	0.10	0.26	0.14	0.41	0.27
N3	0.05	0.00	0.14	0.10	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.28	0.13	0.24	0.12	0.36	0.24
N6	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.24	0.17	0.04	0.28	0.21	0.50	0.30
N7	0.01	0.01	0.05	0.17	0.00	0.12	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.18	0.13	0.06	0.29	0.23	0.51	0.30
N9	0.00	0.02	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.14	0.02	0.26	0.13	0.40	0.25
O2'	0.03	0.24	0.01	0.02	0.17	0.11	0.19	0.06	0.22	0.14	0.24	0.22	0.24	0.18	0.11	0.00	0.05	0.10	0.41	0.29	0.71	0.40
O3'	0.18	0.28	0.04	0.01	0.19	0.03	0.15	0.08	0.18	0.12	0.23	0.28	0.17	0.13	0.14	0.05	0.00	0.13	0.38	0.37	0.56	0.37
O4'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.07	0.01	0.03	0.02	0.06	0.09	0.10	0.13	0.04	0.06	0.02	0.10	0.13	0.00	0.24	0.24	0.16	0.15
O5'	0.21	0.24	0.36	0.38	0.25	0.02	0.27	0.01	0.27	0.28	0.26	0.24	0.28	0.29	0.26	0.41	0.38	0.24	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.12	0.23	0.27	0.13	0.15	0.18	0.18	0.17	0.20	0.14	0.12	0.21	0.23	0.13	0.29	0.37	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.37	0.55	0.49	0.40	0.29	0.46	0.35	0.46	0.48	0.41	0.36	0.50	0.51	0.40	0.71	0.56	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.26	0.32	0.30	0.26	0.08	0.28	0.02	0.29	0.28	0.27	0.24	0.30	0.30	0.25	0.40	0.37	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.12	0.14	0.14	0.12	0.13	0.12	0.13	0.14	0.13	0.13	0.14	0.14	0.17	0.13	0.21	0.13	0.12	0.14	0.09
C2	0.11	0.18	0.15	0.11	0.16	0.12	0.13	0.17	0.12	0.13	0.19	0.22	0.16	0.18	0.17	0.16	0.11	0.18	0.10	0.13
C2'	0.15	0.13	0.15	0.19	0.14	0.21	0.12	0.22	0.13	0.12	0.16	0.17	0.18	0.25	0.16	0.23	0.21	0.23	0.19	0.19
C3'	0.19	0.16	0.19	0.21	0.16	0.21	0.17	0.21	0.18	0.17	0.16	0.16	0.21	0.25	0.17	0.26	0.23	0.22	0.21	0.20
C4	0.13	0.13	0.09	0.09	0.13	0.11	0.13	0.13	0.13	0.13	0.14	0.15	0.09	0.14	0.14	0.19	0.12	0.13	0.14	0.09
C4'	0.18	0.14	0.19	0.19	0.13	0.17	0.15	0.16	0.17	0.16	0.13	0.15	0.20	0.23	0.13	0.24	0.18	0.13	0.18	0.13
C5	0.16	0.13	0.09	0.10	0.15	0.13	0.15	0.15	0.15	0.14	0.15	0.13	0.12	0.16	0.16	0.22	0.14	0.14	0.18	0.12
C5'	0.22	0.18	0.20	0.19	0.18	0.19	0.20	0.19	0.21	0.20	0.18	0.17	0.19	0.21	0.18	0.28	0.21	0.17	0.22	0.17
C6	0.16	0.15	0.11	0.13	0.17	0.16	0.16	0.17	0.15	0.14	0.17	0.16	0.18	0.20	0.18	0.22	0.14	0.16	0.18	0.13
C8	0.16	0.12	0.09	0.09	0.14	0.13	0.15	0.15	0.16	0.14	0.13	0.12	0.10	0.13	0.14	0.23	0.16	0.14	0.20	0.13
N1	0.12	0.18	0.08	0.09	0.17	0.16	0.14	0.19	0.13	0.13	0.20	0.22	0.12	0.16	0.19	0.19	0.12	0.17	0.13	0.12
N3	0.12	0.16	0.15	0.12	0.14	0.10	0.12	0.13	0.12	0.12	0.17	0.19	0.16	0.19	0.15	0.16	0.10	0.16	0.11	0.11
N6	0.21	0.17	0.21	0.21	0.20	0.21	0.20	0.20	0.19	0.18	0.20	0.15	0.30	0.29	0.22	0.25	0.19	0.19	0.24	0.18
N7	0.18	0.13	0.12	0.12	0.15	0.14	0.17	0.16	0.18	0.16	0.14	0.12	0.15	0.18	0.16	0.24	0.17	0.15	0.22	0.15
N9	0.14	0.12	0.09	0.09	0.12	0.12	0.13	0.13	0.14	0.13	0.13	0.13	0.09	0.13	0.13	0.20	0.13	0.12	0.16	0.10
O2'	0.22	0.35	0.15	0.15	0.38	0.18	0.32	0.21	0.28	0.28	0.39	0.38	0.15	0.20	0.40	0.24	0.19	0.22	0.22	0.23
O3'	0.17	0.19	0.17	0.17	0.18	0.19	0.17	0.21	0.17	0.17	0.20	0.21	0.19	0.20	0.19	0.22	0.20	0.29	0.21	0.25
O4'	0.20	0.16	0.19	0.18	0.15	0.16	0.16	0.14	0.18	0.17	0.16	0.17	0.19	0.20	0.15	0.24	0.16	0.11	0.19	0.12
O5'	0.31	0.30	0.27	0.26	0.31	0.26	0.32	0.25	0.33	0.31	0.31	0.31	0.28	0.29	0.31	0.37	0.30	0.21	0.34	0.26
OP1	0.17	0.18	0.12	0.12	0.22	0.15	0.22	0.19	0.21	0.17	0.22	0.19	0.16	0.20	0.25	0.26	0.18	0.16	0.20	0.17
OP2	0.56	0.59	0.41	0.40	0.65	0.47	0.66	0.48	0.64	0.60	0.63	0.56	0.35	0.32	0.67	0.63	0.54	0.44	0.62	0.52
P	0.34	0.33	0.27	0.26	0.35	0.28	0.36	0.29	0.36	0.34	0.34	0.33	0.26	0.27	0.36	0.41	0.33	0.24	0.38	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.07	0.14	0.09
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.02	0.13	0.14	0.24	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.06	0.10	0.01	0.02	0.05	0.01	0.07	0.09	0.14	0.08
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.10	0.01	0.12	0.02	0.12	0.07	0.09	0.10	0.02	0.01	0.11	0.02	0.09	0.12	0.13	0.10
C4	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.13	0.00	0.04	0.22	0.26	0.35	0.27
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.09	0.00	0.12	0.00	0.11	0.05	0.06	0.06	0.05	0.03	0.09	0.00	0.02	0.03	0.05	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.12	0.01	0.12	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.15	0.01	0.04	0.23	0.27	0.34	0.27
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.19	0.00	0.22	0.00	0.19	0.11	0.13	0.07	0.05	0.04	0.20	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.11	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.13	0.01	0.03	0.19	0.20	0.25	0.20
N1	0.00	0.01	0.02	0.07	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.01	0.12	0.12	0.20	0.13
N3	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.11	0.01	0.03	0.17	0.20	0.30	0.21
O2	0.05	0.01	0.10	0.10	0.02	0.06	0.01	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.13	0.13	0.03	0.04	0.09	0.10	0.20	0.11
O2'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.05	0.05	0.03	0.05	0.03	0.03	0.08	0.13	0.00	0.05	0.07	0.05	0.06	0.09	0.11	0.06
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.13	0.03	0.15	0.04	0.13	0.07	0.11	0.13	0.05	0.00	0.14	0.02	0.15	0.22	0.22	0.19
O4	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.09	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.14	0.00	0.04	0.23	0.30	0.39	0.30
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.05	0.02	0.04	0.00	0.11	0.12	0.16	0.14
O5'	0.08	0.13	0.07	0.09	0.22	0.02	0.23	0.01	0.19	0.12	0.17	0.09	0.06	0.15	0.23	0.11	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.07	0.14	0.09	0.12	0.26	0.03	0.27	0.07	0.20	0.12	0.20	0.10	0.09	0.22	0.30	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.24	0.14	0.13	0.35	0.05	0.34	0.03	0.25	0.20	0.30	0.20	0.11	0.22	0.39	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.15	0.08	0.10	0.27	0.02	0.27	0.01	0.20	0.13	0.21	0.11	0.06	0.19	0.30	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00