Doublet Group distance statistics: 52920

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 16, 16, 11, 7, 3, 3, 4, 0, 1, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.015, 0.021, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.015, 0.025, 0.035, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.025 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.019, 0.029, 0.039, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.029 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.015, 0.026, 0.037, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.022, 0.034, 0.045, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.034 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.024, 0.038, 0.052, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.038 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.040, 0.059, 0.079, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.059 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.047, 0.069, 0.091, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.069 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.030, 0.055, 0.081, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.055 std_dev=0.025
C1'	B	0, 0.077, 0.268, 0.459, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.268 std_dev=0.191
O2'	B	0, 0.084, 0.279, 0.473, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.279 std_dev=0.195
C2'	B	0, 0.095, 0.295, 0.496, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.295 std_dev=0.201
O4'	B	0, 0.110, 0.328, 0.545, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.328 std_dev=0.218
N1	B	0, 0.125, 0.352, 0.579, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.352 std_dev=0.227
C3'	B	0, 0.120, 0.379, 0.638, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.379 std_dev=0.259
C2'	A	0, -0.093, 0.168, 0.428, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.168 std_dev=0.260
O4'	A	0, -0.099, 0.163, 0.425, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.163 std_dev=0.262
O3'	B	0, 0.156, 0.420, 0.683, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.420 std_dev=0.263
C2	B	0, 0.097, 0.363, 0.629, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.363 std_dev=0.266
O2	B	0, 0.053, 0.322, 0.591, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.322 std_dev=0.269
C4'	B	0, 0.121, 0.396, 0.671, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.396 std_dev=0.275
C6	B	0, 0.195, 0.487, 0.779, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.487 std_dev=0.292
O2'	A	0, -0.049, 0.260, 0.569, 1.619 max_d=1.619 avg_d=0.260 std_dev=0.309
C4'	A	0, -0.105, 0.236, 0.577, 1.882 max_d=1.882 avg_d=0.236 std_dev=0.341
N3	B	0, 0.157, 0.504, 0.850, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.504 std_dev=0.347
C5	B	0, 0.256, 0.607, 0.958, 1.946 max_d=1.946 avg_d=0.607 std_dev=0.351
C5'	B	0, 0.144, 0.519, 0.894, 1.865 max_d=1.865 avg_d=0.519 std_dev=0.375
C4	B	0, 0.243, 0.626, 1.009, 2.081 max_d=2.081 avg_d=0.626 std_dev=0.383
C3'	A	0, -0.163, 0.250, 0.663, 2.198 max_d=2.198 avg_d=0.250 std_dev=0.413
O4	B	0, 0.316, 0.795, 1.274, 2.600 max_d=2.600 avg_d=0.795 std_dev=0.479
O3'	A	0, -0.144, 0.409, 0.962, 3.029 max_d=3.029 avg_d=0.409 std_dev=0.553
C5'	A	0, -0.221, 0.417, 1.054, 3.454 max_d=3.454 avg_d=0.417 std_dev=0.638
O5'	B	0, -0.102, 0.643, 1.388, 4.569 max_d=4.569 avg_d=0.643 std_dev=0.745
OP1	B	0, -0.212, 0.667, 1.546, 4.615 max_d=4.615 avg_d=0.667 std_dev=0.879
P	B	0, -0.245, 0.707, 1.659, 5.803 max_d=5.803 avg_d=0.707 std_dev=0.952
O5'	A	0, -0.258, 0.708, 1.674, 4.343 max_d=4.343 avg_d=0.708 std_dev=0.966
OP2	B	0, -0.330, 0.835, 1.999, 7.244 max_d=7.244 avg_d=0.835 std_dev=1.165
P	A	0, -0.217, 1.082, 2.381, 6.219 max_d=6.219 avg_d=1.082 std_dev=1.299
OP2	A	0, 0.574, 2.135, 3.695, 7.132 max_d=7.132 avg_d=2.135 std_dev=1.561
OP1	A	0, 0.060, 1.693, 3.326, 7.209 max_d=7.209 avg_d=1.693 std_dev=1.633

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.20	0.31	0.24	0.15
C2	0.03	0.00	0.15	0.10	0.01	0.08	0.02	0.16	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.19	0.14	0.14	0.28	0.60	0.39	0.38
C2'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.07	0.02	0.03	0.02	0.06	0.11	0.10	0.15	0.04	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.14	0.40	0.28	0.18
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.06	0.15	0.07	0.09	0.06	0.13	0.06	0.02	0.01	0.01	0.23	0.40	0.39	0.21
C4	0.02	0.01	0.07	0.05	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.05	0.08	0.27	0.48	0.34	0.31
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.08	0.08	0.08	0.07	0.08	0.04	0.05	0.03	0.01	0.02	0.37	0.25	0.09
C5	0.01	0.02	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.07	0.04	0.30	0.57	0.41	0.37
C5'	0.02	0.16	0.02	0.02	0.10	0.01	0.12	0.00	0.13	0.15	0.16	0.14	0.14	0.15	0.08	0.05	0.04	0.01	0.01	0.28	0.31	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.06	0.07	0.31	0.63	0.44	0.40
C8	0.02	0.02	0.11	0.15	0.01	0.08	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.08	0.17	0.08	0.32	0.53	0.41	0.36
N1	0.03	0.00	0.10	0.07	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.10	0.11	0.29	0.62	0.42	0.40
N3	0.03	0.00	0.15	0.09	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.18	0.13	0.14	0.26	0.54	0.35	0.33
N6	0.03	0.01	0.04	0.06	0.02	0.07	0.02	0.14	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.08	0.07	0.06	0.34	0.72	0.50	0.46
N7	0.02	0.02	0.07	0.13	0.01	0.08	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.05	0.15	0.05	0.34	0.64	0.46	0.41
N9	0.00	0.02	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.26	0.39	0.31	0.26
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.10	0.05	0.06	0.05	0.10	0.08	0.14	0.18	0.08	0.05	0.03	0.00	0.04	0.05	0.10	0.51	0.31	0.20
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.05	0.03	0.07	0.04	0.06	0.17	0.10	0.13	0.07	0.15	0.05	0.04	0.00	0.02	0.36	0.49	0.59	0.32
O4'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.08	0.11	0.14	0.06	0.05	0.01	0.05	0.02	0.00	0.28	0.27	0.29	0.15
O5'	0.20	0.28	0.14	0.23	0.27	0.02	0.30	0.01	0.31	0.32	0.29	0.26	0.34	0.34	0.26	0.10	0.36	0.28	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.31	0.60	0.40	0.40	0.48	0.37	0.57	0.28	0.63	0.53	0.62	0.54	0.72	0.64	0.39	0.51	0.49	0.27	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.39	0.28	0.39	0.34	0.25	0.41	0.31	0.44	0.41	0.42	0.35	0.50	0.46	0.31	0.31	0.59	0.29	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.38	0.18	0.21	0.31	0.09	0.37	0.01	0.40	0.36	0.40	0.33	0.46	0.41	0.26	0.20	0.32	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.15	0.08	0.12	0.17	0.08	0.14	0.10	0.12	0.10	0.18	0.18	0.07	0.16	0.20	0.06	0.10	0.16	0.12	0.07
C2	0.09	0.17	0.10	0.12	0.17	0.08	0.14	0.10	0.12	0.13	0.19	0.21	0.07	0.15	0.18	0.08	0.12	0.16	0.15	0.11
C2'	0.14	0.17	0.13	0.14	0.18	0.16	0.15	0.17	0.14	0.14	0.19	0.20	0.15	0.16	0.20	0.15	0.21	0.20	0.27	0.22
C3'	0.08	0.16	0.08	0.11	0.18	0.12	0.14	0.14	0.11	0.11	0.20	0.20	0.09	0.15	0.22	0.10	0.16	0.22	0.23	0.18
C4	0.07	0.15	0.08	0.11	0.17	0.08	0.14	0.09	0.12	0.11	0.18	0.19	0.06	0.15	0.20	0.06	0.09	0.15	0.11	0.07
C4'	0.13	0.17	0.15	0.20	0.21	0.18	0.19	0.21	0.17	0.15	0.20	0.19	0.13	0.25	0.24	0.14	0.18	0.31	0.20	0.18
C5	0.08	0.16	0.10	0.13	0.19	0.09	0.16	0.10	0.13	0.12	0.20	0.17	0.08	0.17	0.22	0.07	0.11	0.17	0.12	0.10
C5'	0.23	0.24	0.27	0.34	0.29	0.30	0.30	0.34	0.28	0.24	0.28	0.25	0.23	0.40	0.32	0.25	0.32	0.46	0.36	0.33
C6	0.08	0.16	0.11	0.13	0.19	0.10	0.16	0.10	0.13	0.12	0.20	0.18	0.10	0.17	0.21	0.08	0.11	0.19	0.12	0.11
C8	0.08	0.15	0.10	0.13	0.21	0.09	0.18	0.11	0.15	0.12	0.20	0.16	0.07	0.17	0.24	0.08	0.13	0.17	0.13	0.12
N1	0.07	0.17	0.10	0.12	0.17	0.09	0.14	0.09	0.11	0.12	0.19	0.21	0.08	0.16	0.19	0.06	0.09	0.15	0.13	0.08
N3	0.09	0.16	0.09	0.11	0.17	0.08	0.14	0.10	0.12	0.12	0.18	0.20	0.07	0.15	0.18	0.07	0.11	0.16	0.14	0.10
N6	0.11	0.18	0.15	0.16	0.22	0.13	0.19	0.13	0.16	0.14	0.22	0.18	0.14	0.19	0.24	0.11	0.17	0.26	0.14	0.17
N7	0.10	0.16	0.11	0.14	0.22	0.11	0.20	0.12	0.16	0.13	0.21	0.16	0.09	0.18	0.26	0.10	0.15	0.20	0.15	0.15
N9	0.07	0.15	0.08	0.11	0.18	0.08	0.15	0.09	0.12	0.11	0.18	0.17	0.06	0.15	0.21	0.06	0.10	0.15	0.11	0.08
O2'	0.21	0.21	0.21	0.22	0.21	0.23	0.21	0.24	0.21	0.20	0.22	0.22	0.22	0.24	0.23	0.22	0.30	0.25	0.36	0.31
O3'	0.11	0.16	0.10	0.13	0.17	0.17	0.13	0.19	0.11	0.11	0.19	0.20	0.14	0.16	0.21	0.14	0.24	0.26	0.33	0.27
O4'	0.15	0.16	0.17	0.23	0.20	0.21	0.19	0.24	0.18	0.15	0.19	0.18	0.16	0.29	0.23	0.16	0.21	0.32	0.21	0.20
O5'	0.33	0.26	0.36	0.43	0.32	0.41	0.37	0.45	0.37	0.31	0.27	0.24	0.32	0.49	0.35	0.37	0.47	0.56	0.47	0.46
OP1	0.72	0.68	0.69	0.75	0.74	0.78	0.76	0.81	0.74	0.70	0.71	0.66	0.69	0.80	0.78	0.76	0.76	0.93	0.79	0.77
OP2	0.56	0.49	0.59	0.71	0.61	0.68	0.67	0.76	0.66	0.56	0.52	0.43	0.51	0.78	0.63	0.61	0.78	0.92	0.83	0.82
P	0.48	0.40	0.49	0.56	0.48	0.57	0.53	0.61	0.52	0.46	0.42	0.37	0.46	0.63	0.51	0.53	0.60	0.75	0.63	0.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.12	0.23	0.13	0.11
C2	0.03	0.00	0.08	0.08	0.02	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.03	0.22	0.32	0.27	0.23
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.07	0.13	0.01	0.01	0.07	0.01	0.10	0.14	0.15	0.10
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.09	0.01	0.09	0.01	0.08	0.05	0.09	0.12	0.02	0.01	0.11	0.01	0.13	0.11	0.21	0.11
C4	0.03	0.02	0.06	0.09	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.12	0.01	0.04	0.33	0.42	0.46	0.37
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.08	0.05	0.02	0.07	0.01	0.01	0.11	0.11	0.02
C5	0.03	0.02	0.05	0.09	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.11	0.02	0.05	0.35	0.43	0.47	0.39
C5'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.07	0.04	0.06	0.07	0.06	0.02	0.08	0.02	0.01	0.10	0.19	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.08	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.09	0.02	0.04	0.31	0.37	0.37	0.32
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.01	0.23	0.31	0.26	0.22
N3	0.03	0.01	0.07	0.09	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.00	0.02	0.07	0.11	0.01	0.03	0.28	0.38	0.37	0.30
O2	0.06	0.01	0.13	0.12	0.02	0.08	0.02	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.12	0.14	0.02	0.06	0.17	0.29	0.22	0.17
O2'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.05	0.05	0.04	0.06	0.03	0.03	0.07	0.12	0.00	0.03	0.06	0.04	0.05	0.13	0.12	0.06
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.12	0.02	0.11	0.02	0.09	0.05	0.11	0.14	0.03	0.00	0.14	0.02	0.08	0.16	0.24	0.08
O4	0.03	0.02	0.07	0.11	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.03	0.01	0.02	0.06	0.14	0.00	0.04	0.35	0.44	0.51	0.40
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.04	0.01	0.03	0.06	0.04	0.02	0.04	0.00	0.09	0.22	0.09	0.08
O5'	0.12	0.22	0.10	0.13	0.33	0.01	0.35	0.01	0.31	0.23	0.28	0.17	0.05	0.08	0.35	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.23	0.32	0.14	0.11	0.42	0.11	0.43	0.10	0.37	0.31	0.38	0.29	0.13	0.16	0.44	0.22	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.27	0.15	0.21	0.46	0.11	0.47	0.19	0.37	0.26	0.37	0.22	0.12	0.24	0.51	0.09	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.23	0.10	0.11	0.37	0.02	0.39	0.02	0.32	0.22	0.30	0.17	0.06	0.08	0.40	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00