Doublet Group distance statistics: 52925

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.012, 0.024, 0.037, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.010, 0.022, 0.035, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.022 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.012, 0.027, 0.042, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.027 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.012, 0.028, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.028 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.016, 0.034, 0.051, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.034 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.014, 0.031, 0.049, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.031 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.010, 0.034, 0.057, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.034 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.027, 0.060, 0.093, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.060 std_dev=0.033
N6	A	0, 0.029, 0.066, 0.102, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.066 std_dev=0.037
C8	A	0, 0.032, 0.070, 0.107, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.070 std_dev=0.038
O4'	A	0, -0.012, 0.051, 0.114, 0.174 max_d=0.174 avg_d=0.051 std_dev=0.063
C2'	A	0, 0.018, 0.118, 0.218, 0.297 max_d=0.297 avg_d=0.118 std_dev=0.100
C4'	A	0, 0.033, 0.135, 0.236, 0.265 max_d=0.265 avg_d=0.135 std_dev=0.102
O2'	A	0, 0.078, 0.180, 0.282, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.180 std_dev=0.102
C5'	A	0, 0.121, 0.271, 0.421, 0.420 max_d=0.420 avg_d=0.271 std_dev=0.150
C3'	A	0, 0.009, 0.179, 0.350, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.179 std_dev=0.170
O3'	A	0, 0.036, 0.261, 0.486, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.261 std_dev=0.225
O2	B	0, 0.197, 0.460, 0.722, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.460 std_dev=0.262
N3	B	0, 0.256, 0.524, 0.793, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.524 std_dev=0.268
O2'	B	0, 0.265, 0.537, 0.809, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.537 std_dev=0.272
C2	B	0, 0.234, 0.510, 0.785, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.510 std_dev=0.275
C2'	B	0, 0.317, 0.649, 0.981, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.649 std_dev=0.332
N1	B	0, 0.301, 0.638, 0.974, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.638 std_dev=0.337
C1'	B	0, 0.302, 0.639, 0.975, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.639 std_dev=0.337
O4'	B	0, 0.323, 0.662, 1.001, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.662 std_dev=0.339
C4	B	0, 0.328, 0.671, 1.013, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.671 std_dev=0.342
C3'	B	0, 0.343, 0.692, 1.042, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.692 std_dev=0.350
C4'	B	0, 0.342, 0.695, 1.049, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.695 std_dev=0.353
C5'	B	0, 0.357, 0.715, 1.073, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.715 std_dev=0.358
O4	B	0, 0.321, 0.682, 1.044, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.682 std_dev=0.362
O3'	B	0, 0.354, 0.723, 1.092, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.723 std_dev=0.369
C6	B	0, 0.396, 0.803, 1.211, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.803 std_dev=0.408
C5	B	0, 0.412, 0.835, 1.257, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.835 std_dev=0.422
O5'	B	0, 0.435, 0.909, 1.383, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.909 std_dev=0.474
P	B	0, 0.538, 1.118, 1.699, 1.543 max_d=1.543 avg_d=1.118 std_dev=0.581
OP2	B	0, 0.588, 1.189, 1.790, 1.591 max_d=1.591 avg_d=1.189 std_dev=0.601
OP1	B	0, 0.616, 1.283, 1.949, 1.800 max_d=1.800 avg_d=1.283 std_dev=0.667
O5'	A	0, 0.432, 1.311, 2.189, 2.242 max_d=2.242 avg_d=1.311 std_dev=0.879
P	A	0, 0.416, 1.359, 2.302, 2.207 max_d=2.207 avg_d=1.359 std_dev=0.943
OP2	A	0, 0.556, 1.553, 2.551, 2.634 max_d=2.634 avg_d=1.553 std_dev=0.997
OP1	A	0, 0.349, 1.537, 2.725, 2.598 max_d=2.598 avg_d=1.537 std_dev=1.188

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.04	0.00	0.23	0.26	0.14	0.15
C2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.02	0.08	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.11	0.09	0.02	0.30	0.25	0.17	0.18
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.04	0.06	0.09	0.05	0.06	0.08	0.08	0.05	0.00	0.02	0.00	0.13	0.48	0.23	0.17
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.10	0.04	0.06	0.08	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.32	0.52	0.30	0.25
C4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.01	0.11	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.06	0.04	0.02	0.33	0.24	0.15	0.20
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.02	0.03	0.09	0.09	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.21	0.20	0.03
C5	0.02	0.02	0.06	0.06	0.01	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.05	0.05	0.03	0.39	0.23	0.16	0.23
C5'	0.04	0.08	0.04	0.01	0.11	0.01	0.15	0.00	0.16	0.17	0.11	0.07	0.20	0.19	0.10	0.04	0.02	0.02	0.01	0.14	0.30	0.02
C6	0.02	0.03	0.06	0.06	0.02	0.06	0.01	0.16	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.04	0.38	0.24	0.18	0.23
C8	0.03	0.02	0.09	0.10	0.02	0.09	0.01	0.17	0.03	0.00	0.02	0.03	0.06	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.43	0.23	0.14	0.25
N1	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.07	0.02	0.35	0.24	0.18	0.22
N3	0.02	0.00	0.06	0.06	0.02	0.03	0.03	0.07	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.11	0.08	0.02	0.27	0.25	0.16	0.16
N6	0.05	0.02	0.08	0.08	0.03	0.09	0.03	0.20	0.01	0.06	0.01	0.03	0.00	0.06	0.05	0.04	0.04	0.06	0.40	0.27	0.23	0.26
N7	0.03	0.02	0.08	0.09	0.01	0.09	0.01	0.19	0.03	0.00	0.02	0.03	0.06	0.00	0.01	0.05	0.07	0.03	0.44	0.23	0.17	0.26
N9	0.01	0.02	0.05	0.05	0.01	0.04	0.02	0.10	0.03	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.35	0.23	0.14	0.21
O2'	0.04	0.11	0.00	0.02	0.06	0.03	0.05	0.04	0.05	0.06	0.09	0.11	0.04	0.05	0.05	0.00	0.06	0.03	0.18	0.59	0.25	0.24
O3'	0.04	0.09	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.02	0.04	0.08	0.07	0.08	0.04	0.07	0.05	0.06	0.00	0.04	0.33	0.49	0.26	0.22
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.06	0.03	0.01	0.03	0.04	0.00	0.37	0.22	0.24	0.29
O5'	0.23	0.30	0.13	0.32	0.33	0.03	0.39	0.01	0.38	0.43	0.35	0.27	0.40	0.44	0.35	0.18	0.33	0.37	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.26	0.25	0.48	0.52	0.24	0.21	0.23	0.14	0.24	0.23	0.24	0.25	0.27	0.23	0.23	0.59	0.49	0.22	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.17	0.23	0.30	0.15	0.20	0.16	0.30	0.18	0.14	0.18	0.16	0.23	0.17	0.14	0.25	0.26	0.24	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.18	0.17	0.25	0.20	0.03	0.23	0.02	0.23	0.25	0.22	0.16	0.26	0.26	0.21	0.24	0.22	0.29	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.05	0.11	0.21	0.03	0.20	0.04	0.22	0.05	0.05	0.04	0.07	0.19	0.39	0.02	0.10	0.22	0.25	0.22	0.22
C2	0.08	0.06	0.12	0.22	0.05	0.20	0.05	0.20	0.06	0.06	0.06	0.09	0.22	0.38	0.04	0.11	0.21	0.24	0.21	0.20
C2'	0.06	0.02	0.09	0.18	0.03	0.19	0.02	0.22	0.02	0.03	0.02	0.04	0.18	0.36	0.05	0.10	0.21	0.23	0.21	0.22
C3'	0.07	0.02	0.11	0.22	0.03	0.22	0.02	0.26	0.02	0.03	0.02	0.04	0.19	0.41	0.06	0.11	0.24	0.27	0.25	0.26
C4	0.09	0.05	0.12	0.20	0.04	0.19	0.05	0.19	0.06	0.06	0.05	0.07	0.22	0.36	0.02	0.11	0.20	0.23	0.19	0.20
C4'	0.07	0.05	0.11	0.21	0.05	0.20	0.04	0.23	0.04	0.05	0.05	0.06	0.19	0.40	0.06	0.10	0.22	0.26	0.22	0.23
C5	0.10	0.06	0.13	0.17	0.05	0.17	0.06	0.17	0.08	0.08	0.05	0.07	0.24	0.31	0.03	0.12	0.18	0.22	0.16	0.17
C5'	0.12	0.16	0.14	0.18	0.16	0.17	0.14	0.18	0.13	0.14	0.17	0.16	0.20	0.33	0.18	0.11	0.18	0.23	0.15	0.18
C6	0.11	0.06	0.12	0.15	0.05	0.14	0.06	0.14	0.08	0.08	0.05	0.06	0.23	0.27	0.04	0.12	0.15	0.20	0.14	0.15
C8	0.11	0.08	0.13	0.18	0.06	0.18	0.07	0.18	0.09	0.09	0.07	0.09	0.23	0.32	0.05	0.12	0.19	0.23	0.17	0.19
N1	0.09	0.05	0.12	0.18	0.05	0.16	0.06	0.15	0.07	0.07	0.06	0.07	0.24	0.31	0.04	0.12	0.17	0.21	0.16	0.16
N3	0.08	0.06	0.12	0.23	0.04	0.21	0.05	0.22	0.05	0.06	0.05	0.08	0.21	0.40	0.03	0.11	0.23	0.25	0.22	0.22
N6	0.13	0.09	0.11	0.11	0.06	0.12	0.08	0.12	0.10	0.11	0.06	0.09	0.21	0.18	0.05	0.13	0.13	0.18	0.09	0.12
N7	0.12	0.09	0.14	0.17	0.07	0.17	0.08	0.17	0.10	0.10	0.07	0.09	0.24	0.29	0.05	0.13	0.18	0.23	0.16	0.18
N9	0.09	0.06	0.12	0.20	0.04	0.18	0.05	0.19	0.06	0.07	0.05	0.07	0.21	0.36	0.03	0.11	0.20	0.23	0.19	0.20
O2'	0.10	0.06	0.12	0.20	0.03	0.22	0.05	0.24	0.06	0.07	0.04	0.08	0.18	0.36	0.03	0.13	0.23	0.23	0.25	0.24
O3'	0.12	0.06	0.16	0.28	0.03	0.28	0.05	0.33	0.07	0.08	0.03	0.08	0.22	0.47	0.03	0.16	0.31	0.33	0.32	0.32
O4'	0.09	0.06	0.12	0.22	0.04	0.20	0.05	0.22	0.06	0.06	0.05	0.07	0.20	0.39	0.03	0.11	0.22	0.26	0.21	0.22
O5'	0.30	0.29	0.39	0.45	0.25	0.39	0.24	0.38	0.25	0.27	0.28	0.33	0.47	0.68	0.24	0.28	0.36	0.33	0.37	0.35
OP1	0.37	0.36	0.36	0.41	0.38	0.42	0.39	0.42	0.39	0.37	0.37	0.35	0.46	0.56	0.38	0.39	0.47	0.52	0.42	0.47
OP2	0.23	0.26	0.30	0.39	0.28	0.34	0.24	0.35	0.23	0.23	0.29	0.28	0.40	0.62	0.29	0.24	0.34	0.35	0.32	0.33
P	0.21	0.20	0.31	0.39	0.18	0.35	0.16	0.34	0.17	0.19	0.20	0.24	0.43	0.63	0.17	0.21	0.34	0.35	0.31	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.09	0.11	0.12	0.09
C2	0.03	0.00	0.05	0.09	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.08	0.01	0.03	0.06	0.08	0.08	0.06
C2'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.05	0.04	0.01	0.03	0.09	0.08	0.04
C3'	0.03	0.09	0.02	0.00	0.15	0.01	0.16	0.04	0.15	0.11	0.12	0.06	0.05	0.01	0.15	0.01	0.03	0.10	0.02	0.03
C4	0.02	0.01	0.04	0.15	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.17	0.01	0.02	0.13	0.11	0.04	0.08
C4'	0.01	0.03	0.03	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.05	0.04	0.07	0.01	0.09	0.00	0.02	0.10	0.04	0.02
C5	0.02	0.02	0.03	0.16	0.01	0.10	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.20	0.01	0.03	0.14	0.11	0.03	0.09
C5'	0.01	0.03	0.01	0.04	0.12	0.01	0.15	0.00	0.12	0.05	0.07	0.01	0.07	0.06	0.14	0.02	0.01	0.10	0.02	0.02
C6	0.01	0.02	0.02	0.15	0.01	0.09	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.01	0.02	0.11	0.09	0.06	0.06
N1	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.02	0.07	0.09	0.09	0.06
N3	0.03	0.01	0.06	0.12	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.12	0.12	0.01	0.03	0.08	0.08	0.05	0.05
O2	0.04	0.01	0.06	0.06	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.16	0.08	0.02	0.05	0.06	0.08	0.09	0.07
O2'	0.02	0.12	0.01	0.05	0.08	0.07	0.04	0.07	0.02	0.05	0.12	0.16	0.00	0.12	0.09	0.06	0.05	0.13	0.05	0.05
O3'	0.02	0.08	0.05	0.01	0.17	0.01	0.20	0.06	0.17	0.09	0.12	0.08	0.12	0.00	0.19	0.01	0.17	0.23	0.18	0.18
O4	0.02	0.01	0.04	0.15	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.19	0.00	0.03	0.15	0.13	0.06	0.11
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.06	0.01	0.03	0.00	0.12	0.13	0.14	0.12
O5'	0.09	0.06	0.03	0.03	0.13	0.02	0.14	0.01	0.11	0.07	0.08	0.06	0.05	0.17	0.15	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.08	0.09	0.10	0.11	0.10	0.11	0.10	0.09	0.09	0.08	0.08	0.13	0.23	0.13	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.08	0.08	0.02	0.04	0.04	0.03	0.02	0.06	0.09	0.05	0.09	0.05	0.18	0.06	0.14	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.06	0.04	0.03	0.08	0.02	0.09	0.02	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.18	0.11	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00