Doublet Group distance statistics: 52936

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.008, 0.022, 0.035, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.005, 0.023, 0.041, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.023 std_dev=0.018
N3	A	0, -0.002, 0.018, 0.038, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.018 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.002, 0.022, 0.042, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.022 std_dev=0.020
C2	A	0, -0.004, 0.019, 0.041, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.019 std_dev=0.022
N1	A	0, -0.005, 0.019, 0.042, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.019 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.004, 0.030, 0.056, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.030 std_dev=0.026
C1'	A	0, -0.011, 0.023, 0.058, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.023 std_dev=0.034
C2	B	0, 0.126, 0.272, 0.417, 0.406 max_d=0.406 avg_d=0.272 std_dev=0.145
C2'	B	0, 0.124, 0.291, 0.457, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.291 std_dev=0.167
O2'	B	0, 0.110, 0.280, 0.451, 0.492 max_d=0.492 avg_d=0.280 std_dev=0.171
O2	B	0, 0.144, 0.316, 0.489, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.316 std_dev=0.172
N3	B	0, 0.116, 0.333, 0.549, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.333 std_dev=0.217
N1	B	0, 0.093, 0.315, 0.537, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.315 std_dev=0.222
C1'	B	0, 0.087, 0.324, 0.561, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.324 std_dev=0.237
C4	B	0, 0.018, 0.394, 0.771, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.394 std_dev=0.377
C3'	B	0, 0.029, 0.431, 0.833, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.431 std_dev=0.402
C6	B	0, -0.035, 0.392, 0.820, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.392 std_dev=0.428
O3'	B	0, 0.044, 0.472, 0.900, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.472 std_dev=0.428
C5	B	0, -0.067, 0.432, 0.932, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.432 std_dev=0.499
N4	B	0, -0.042, 0.466, 0.975, 1.731 max_d=1.731 avg_d=0.466 std_dev=0.508
O4'	B	0, -0.081, 0.456, 0.994, 1.828 max_d=1.828 avg_d=0.456 std_dev=0.537
C4'	B	0, -0.082, 0.482, 1.046, 1.920 max_d=1.920 avg_d=0.482 std_dev=0.564
O4'	A	0, -0.391, 0.359, 1.110, 2.335 max_d=2.335 avg_d=0.359 std_dev=0.751
C2'	A	0, -0.438, 0.381, 1.200, 2.542 max_d=2.542 avg_d=0.381 std_dev=0.819
O5'	B	0, -0.180, 0.734, 1.647, 3.071 max_d=3.071 avg_d=0.734 std_dev=0.913
C5'	B	0, -0.245, 0.692, 1.629, 3.120 max_d=3.120 avg_d=0.692 std_dev=0.937
C3'	A	0, -0.542, 0.511, 1.565, 3.289 max_d=3.289 avg_d=0.511 std_dev=1.053
C4'	A	0, -0.540, 0.528, 1.596, 3.344 max_d=3.344 avg_d=0.528 std_dev=1.068
O3'	A	0, -0.507, 0.585, 1.677, 3.454 max_d=3.454 avg_d=0.585 std_dev=1.092
O2'	A	0, -0.585, 0.538, 1.661, 3.503 max_d=3.503 avg_d=0.538 std_dev=1.123
P	B	0, -0.447, 0.866, 2.179, 4.295 max_d=4.295 avg_d=0.866 std_dev=1.313
OP2	B	0, -0.497, 0.868, 2.234, 4.445 max_d=4.445 avg_d=0.868 std_dev=1.366
O5'	A	0, -0.767, 0.825, 2.416, 5.022 max_d=5.022 avg_d=0.825 std_dev=1.592
OP1	B	0, -0.623, 0.975, 2.574, 5.167 max_d=5.167 avg_d=0.975 std_dev=1.598
C5'	A	0, -0.850, 0.886, 2.621, 5.456 max_d=5.456 avg_d=0.886 std_dev=1.735
OP2	A	0, -0.907, 1.311, 3.529, 6.799 max_d=6.799 avg_d=1.311 std_dev=2.218
P	A	0, -1.179, 1.093, 3.364, 7.079 max_d=7.079 avg_d=1.093 std_dev=2.271
OP1	A	0, -1.465, 1.677, 4.819, 9.655 max_d=9.655 avg_d=1.677 std_dev=3.142

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.07	0.05	0.01	0.07	0.06	0.05	0.02	0.01	0.01	0.21	0.01	0.13	0.35	0.48	0.18
C2	0.07	0.00	0.50	0.36	0.02	0.15	0.02	0.32	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.47	0.22	0.38	0.26	0.47	0.94	0.24
C2'	0.01	0.50	0.00	0.00	0.27	0.01	0.14	0.16	0.25	0.22	0.40	0.49	0.19	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.40	0.48	0.15	0.20
C3'	0.00	0.36	0.00	0.00	0.29	0.00	0.30	0.01	0.36	0.15	0.38	0.32	0.36	0.23	0.17	0.01	0.00	0.02	0.12	0.63	0.21	0.20
C4	0.04	0.02	0.27	0.29	0.00	0.04	0.01	0.17	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.13	0.11	0.20	0.16	0.41	0.94	0.27
C4'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.18	0.10	0.14	0.03	0.14	0.05	0.23	0.01	0.00	0.02	0.34	0.19	0.14
C5	0.03	0.02	0.14	0.30	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.08	0.16	0.09	0.11	0.40	1.12	0.34
C5'	0.07	0.32	0.16	0.01	0.17	0.01	0.10	0.00	0.17	0.15	0.27	0.29	0.12	0.10	0.06	0.07	0.16	0.02	0.00	0.15	0.18	0.01
C6	0.05	0.01	0.25	0.36	0.02	0.03	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.23	0.18	0.14	0.41	1.16	0.33
C8	0.01	0.02	0.22	0.15	0.01	0.18	0.01	0.15	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.45	0.04	0.21	0.15	0.39	1.00	0.38
N1	0.07	0.00	0.40	0.38	0.03	0.10	0.01	0.27	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.30	0.25	0.30	0.22	0.44	1.07	0.27
N3	0.06	0.00	0.49	0.32	0.00	0.14	0.01	0.29	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.47	0.14	0.37	0.24	0.45	0.84	0.22
N6	0.05	0.02	0.19	0.36	0.02	0.03	0.02	0.12	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.07	0.26	0.12	0.11	0.40	1.24	0.37
N7	0.02	0.02	0.10	0.23	0.01	0.14	0.00	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.36	0.11	0.10	0.13	0.40	1.17	0.41
N9	0.01	0.03	0.02	0.17	0.01	0.05	0.02	0.06	0.03	0.00	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.14	0.03	0.01	0.09	0.37	0.82	0.27
O2'	0.01	0.47	0.00	0.01	0.13	0.23	0.08	0.07	0.09	0.45	0.30	0.47	0.07	0.36	0.14	0.00	0.04	0.15	0.28	0.50	0.16	0.18
O3'	0.21	0.22	0.02	0.00	0.11	0.01	0.16	0.16	0.23	0.04	0.25	0.14	0.26	0.11	0.03	0.04	0.00	0.16	0.08	0.92	0.44	0.39
O4'	0.01	0.38	0.01	0.02	0.20	0.00	0.09	0.02	0.18	0.21	0.30	0.37	0.12	0.10	0.01	0.15	0.16	0.00	0.06	0.25	0.49	0.23
O5'	0.13	0.26	0.40	0.12	0.16	0.02	0.11	0.00	0.14	0.15	0.22	0.24	0.11	0.13	0.09	0.28	0.08	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.35	0.47	0.48	0.63	0.41	0.34	0.40	0.15	0.41	0.39	0.44	0.45	0.40	0.40	0.37	0.50	0.92	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.48	0.94	0.15	0.21	0.94	0.19	1.12	0.18	1.16	1.00	1.07	0.84	1.24	1.17	0.82	0.16	0.44	0.49	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.24	0.20	0.20	0.27	0.14	0.34	0.01	0.33	0.38	0.27	0.22	0.37	0.41	0.27	0.18	0.39	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.07	0.09	0.14	0.08	0.39	0.08	0.48	0.17	0.12	0.15	0.15	0.14	0.11	0.21	0.47	0.33	0.47	0.27	0.42
C2	0.22	0.10	0.04	0.11	0.07	0.37	0.12	0.43	0.18	0.13	0.13	0.10	0.18	0.06	0.14	0.41	0.31	0.41	0.26	0.36
C2'	0.15	0.26	0.37	0.36	0.23	0.11	0.17	0.08	0.15	0.18	0.28	0.26	0.31	0.42	0.50	0.10	0.11	0.10	0.10	0.07
C3'	0.27	0.49	0.38	0.34	0.51	0.12	0.41	0.08	0.35	0.37	0.55	0.57	0.52	0.38	0.40	0.15	0.17	0.10	0.22	0.10
C4	0.26	0.07	0.07	0.12	0.07	0.38	0.09	0.45	0.18	0.13	0.14	0.13	0.14	0.10	0.17	0.46	0.30	0.41	0.24	0.37
C4'	0.22	0.13	0.14	0.21	0.19	0.42	0.07	0.50	0.11	0.09	0.24	0.29	0.16	0.21	0.25	0.41	0.33	0.49	0.23	0.39
C5	0.27	0.07	0.09	0.13	0.08	0.36	0.08	0.40	0.16	0.14	0.14	0.15	0.13	0.13	0.17	0.45	0.25	0.33	0.17	0.30
C5'	0.33	0.05	0.32	0.38	0.14	0.53	0.08	0.58	0.17	0.16	0.16	0.25	0.04	0.40	0.44	0.48	0.41	0.55	0.27	0.43
C6	0.26	0.08	0.09	0.12	0.09	0.32	0.08	0.34	0.15	0.13	0.14	0.14	0.15	0.13	0.16	0.41	0.21	0.28	0.14	0.25
C8	0.28	0.06	0.10	0.13	0.09	0.38	0.08	0.44	0.17	0.15	0.15	0.18	0.11	0.13	0.18	0.48	0.28	0.38	0.20	0.35
N1	0.23	0.10	0.05	0.11	0.08	0.33	0.10	0.36	0.16	0.12	0.14	0.11	0.18	0.09	0.14	0.39	0.24	0.31	0.18	0.28
N3	0.24	0.09	0.04	0.11	0.07	0.39	0.12	0.47	0.19	0.14	0.13	0.11	0.16	0.07	0.14	0.45	0.34	0.46	0.28	0.40
N6	0.25	0.08	0.12	0.13	0.10	0.27	0.05	0.26	0.11	0.11	0.15	0.16	0.13	0.16	0.17	0.35	0.15	0.18	0.06	0.16
N7	0.28	0.07	0.10	0.13	0.10	0.35	0.06	0.39	0.15	0.14	0.15	0.18	0.11	0.14	0.18	0.45	0.24	0.32	0.15	0.29
N9	0.26	0.06	0.08	0.13	0.08	0.39	0.08	0.46	0.17	0.13	0.15	0.16	0.13	0.11	0.18	0.48	0.31	0.43	0.24	0.38
O2'	0.10	0.03	0.26	0.27	0.10	0.13	0.16	0.22	0.16	0.10	0.05	0.11	0.06	0.37	0.50	0.28	0.16	0.27	0.20	0.27
O3'	0.20	0.42	0.29	0.22	0.44	0.08	0.33	0.15	0.27	0.30	0.48	0.50	0.46	0.29	0.28	0.14	0.09	0.21	0.08	0.10
O4'	0.46	0.07	0.33	0.41	0.05	0.68	0.18	0.75	0.31	0.27	0.09	0.14	0.04	0.41	0.41	0.67	0.57	0.72	0.45	0.63
O5'	0.26	0.10	0.24	0.29	0.23	0.43	0.11	0.46	0.09	0.09	0.24	0.35	0.09	0.33	0.35	0.39	0.28	0.40	0.14	0.30
OP1	0.56	0.60	0.42	0.42	0.71	0.54	0.70	0.56	0.65	0.60	0.66	0.79	0.54	0.44	0.37	0.62	0.55	0.54	0.59	0.56
OP2	1.19	1.42	1.13	1.10	1.53	1.03	1.47	1.04	1.38	1.34	1.51	1.60	1.38	1.02	1.01	1.11	1.19	1.10	1.31	1.18
P	0.37	0.56	0.27	0.25	0.70	0.27	0.63	0.29	0.54	0.49	0.67	0.79	0.51	0.22	0.18	0.36	0.36	0.32	0.47	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.09	0.07
C2	0.02	0.00	0.04	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.04	0.02	0.09	0.10	0.12	0.08
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.02	0.06	0.00	0.06	0.01	0.03	0.03	0.10	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.04	0.03
C3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.13	0.05	0.04	0.09	0.08	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.09	0.07
C4	0.02	0.02	0.03	0.08	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.10	0.03	0.10	0.10	0.11	0.09
C4'	0.00	0.02	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.02	0.05	0.05	0.05	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01
C5	0.02	0.02	0.06	0.13	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.04	0.15	0.03	0.10	0.09	0.10	0.08
C5'	0.02	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.06	0.03	0.04	0.07	0.05	0.05	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.14	0.03	0.09	0.08	0.09	0.07
N1	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.08	0.08	0.10	0.07
N3	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02	0.09	0.11	0.12	0.08
N4	0.02	0.02	0.03	0.09	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.11	0.03	0.10	0.11	0.12	0.10
O2	0.04	0.01	0.10	0.08	0.02	0.05	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.11	0.10	0.04	0.10	0.11	0.13	0.09
O2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.01	0.05	0.03	0.11	0.00	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.04
O3'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.10	0.01	0.15	0.01	0.14	0.05	0.05	0.11	0.10	0.02	0.00	0.01	0.13	0.13	0.15	0.13
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.10	0.08	0.11	0.09
O5'	0.07	0.09	0.03	0.08	0.10	0.01	0.10	0.00	0.09	0.08	0.09	0.10	0.10	0.03	0.13	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.06	0.10	0.06	0.08	0.10	0.03	0.09	0.04	0.08	0.08	0.11	0.11	0.11	0.05	0.13	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.12	0.04	0.09	0.11	0.02	0.10	0.01	0.09	0.10	0.12	0.12	0.13	0.03	0.15	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.08	0.03	0.07	0.09	0.01	0.08	0.01	0.07	0.07	0.08	0.10	0.09	0.04	0.13	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00