Doublet Group distance statistics: 52944

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 9, 13, 8, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 2, 1, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, -0.001, 0.008, 0.017, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.008 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.001, 0.014, 0.026, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.016, 0.036, 0.055, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.036 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.021, 0.043, 0.066, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.043 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.021, 0.046, 0.071, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.046 std_dev=0.025
O3'	A	0, 0.010, 0.187, 0.364, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.187 std_dev=0.177
O2'	B	0, 0.227, 0.528, 0.829, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.528 std_dev=0.301
C2'	B	0, 0.071, 0.419, 0.768, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.419 std_dev=0.349
C1'	B	0, 0.160, 0.512, 0.863, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.512 std_dev=0.352
N9	B	0, 0.132, 0.492, 0.852, 1.685 max_d=1.685 avg_d=0.492 std_dev=0.360
N7	B	0, 0.161, 0.526, 0.892, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.526 std_dev=0.365
C8	B	0, 0.164, 0.534, 0.904, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.534 std_dev=0.370
C3'	A	0, -0.107, 0.266, 0.638, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.266 std_dev=0.373
O4'	A	0, -0.144, 0.250, 0.643, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.250 std_dev=0.394
C5	B	0, 0.109, 0.510, 0.911, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.510 std_dev=0.401
O4'	B	0, 0.183, 0.585, 0.988, 1.839 max_d=1.839 avg_d=0.585 std_dev=0.402
C2'	A	0, -0.133, 0.275, 0.683, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.275 std_dev=0.408
OP1	B	0, 0.783, 1.191, 1.598, 2.164 max_d=2.164 avg_d=1.191 std_dev=0.408
C4	B	0, 0.072, 0.498, 0.925, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.498 std_dev=0.426
O5'	B	0, 0.596, 1.052, 1.508, 2.169 max_d=2.169 avg_d=1.052 std_dev=0.456
N6	B	0, 0.120, 0.581, 1.042, 1.774 max_d=1.774 avg_d=0.581 std_dev=0.461
C6	B	0, 0.079, 0.562, 1.045, 1.821 max_d=1.821 avg_d=0.562 std_dev=0.483
C5'	B	0, -0.014, 0.495, 1.003, 2.075 max_d=2.075 avg_d=0.495 std_dev=0.509
N3	B	0, -0.002, 0.554, 1.111, 1.999 max_d=1.999 avg_d=0.554 std_dev=0.556
C4'	B	0, -0.111, 0.465, 1.041, 2.211 max_d=2.211 avg_d=0.465 std_dev=0.576
P	A	0, -0.055, 0.538, 1.131, 2.153 max_d=2.153 avg_d=0.538 std_dev=0.593
C4'	A	0, -0.237, 0.381, 0.999, 1.890 max_d=1.890 avg_d=0.381 std_dev=0.618
N1	B	0, 0.017, 0.641, 1.265, 2.263 max_d=2.263 avg_d=0.641 std_dev=0.624
C2	B	0, -0.019, 0.638, 1.296, 2.355 max_d=2.355 avg_d=0.638 std_dev=0.658
O2'	A	0, -0.171, 0.499, 1.168, 2.211 max_d=2.211 avg_d=0.499 std_dev=0.669
P	B	0, -0.091, 0.671, 1.433, 2.882 max_d=2.882 avg_d=0.671 std_dev=0.762
C3'	B	0, -0.174, 0.609, 1.393, 2.834 max_d=2.834 avg_d=0.609 std_dev=0.784
O5'	A	0, -0.282, 0.545, 1.372, 2.572 max_d=2.572 avg_d=0.545 std_dev=0.827
OP1	A	0, -0.139, 0.707, 1.554, 2.820 max_d=2.820 avg_d=0.707 std_dev=0.847
O3'	B	0, -0.132, 0.901, 1.934, 3.588 max_d=3.588 avg_d=0.901 std_dev=1.033
C5'	A	0, -0.495, 0.721, 1.937, 3.667 max_d=3.667 avg_d=0.721 std_dev=1.216
OP2	B	0, 0.278, 1.548, 2.819, 4.985 max_d=4.985 avg_d=1.548 std_dev=1.270
OP2	A	0, -0.401, 0.942, 2.286, 4.470 max_d=4.470 avg_d=0.942 std_dev=1.343

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.07	0.31	0.12	0.17
C2	0.02	0.00	0.22	0.09	0.01	0.15	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.40	0.14	0.20	0.14	0.15	0.22	0.20
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.13	0.02	0.09	0.12	0.13	0.09	0.19	0.21	0.11	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.21	0.14	0.32	0.17
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.04	0.09	0.08	0.09	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.32	0.28	0.46	0.21
C4	0.01	0.01	0.13	0.06	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.10	0.10	0.22	0.16	0.31	0.26
C4'	0.01	0.15	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.03	0.20	0.09	0.16	0.06	0.17	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.54	0.14	0.18
C5	0.01	0.00	0.09	0.07	0.00	0.06	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.08	0.03	0.35	0.13	0.51	0.36
C5'	0.08	0.08	0.12	0.01	0.12	0.01	0.26	0.00	0.21	0.45	0.10	0.09	0.29	0.43	0.21	0.11	0.07	0.02	0.01	0.20	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.13	0.08	0.01	0.03	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.09	0.08	0.33	0.14	0.51	0.34
C8	0.01	0.01	0.09	0.04	0.00	0.20	0.00	0.45	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.04	0.14	0.46	0.17	0.59	0.42
N1	0.02	0.00	0.19	0.09	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.31	0.12	0.15	0.23	0.14	0.36	0.27
N3	0.02	0.00	0.21	0.08	0.00	0.16	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.38	0.14	0.20	0.11	0.17	0.18	0.18
N6	0.02	0.01	0.11	0.09	0.01	0.06	0.01	0.29	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.08	0.05	0.41	0.15	0.65	0.39
N7	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.17	0.00	0.43	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.05	0.09	0.49	0.13	0.69	0.44
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.06	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.25	0.20	0.32	0.28
O2'	0.01	0.40	0.00	0.02	0.18	0.01	0.09	0.11	0.17	0.21	0.31	0.38	0.13	0.14	0.03	0.00	0.04	0.01	0.24	0.17	0.39	0.21
O3'	0.07	0.14	0.02	0.00	0.10	0.01	0.08	0.07	0.09	0.04	0.12	0.14	0.08	0.05	0.07	0.04	0.00	0.10	0.27	0.53	0.49	0.12
O4'	0.00	0.20	0.02	0.01	0.10	0.00	0.03	0.02	0.08	0.14	0.15	0.20	0.05	0.09	0.01	0.01	0.10	0.00	0.15	0.44	0.14	0.32
O5'	0.07	0.14	0.21	0.32	0.22	0.01	0.35	0.01	0.33	0.46	0.23	0.11	0.41	0.49	0.25	0.24	0.27	0.15	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.31	0.15	0.14	0.28	0.16	0.54	0.13	0.20	0.14	0.17	0.14	0.17	0.15	0.13	0.20	0.17	0.53	0.44	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.22	0.32	0.46	0.31	0.14	0.51	0.23	0.51	0.59	0.36	0.18	0.65	0.69	0.32	0.39	0.49	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.20	0.17	0.21	0.26	0.18	0.36	0.02	0.34	0.42	0.27	0.18	0.39	0.44	0.28	0.21	0.12	0.32	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.37	0.13	0.52	0.30	0.29	0.32	0.30	0.36	0.26	0.38	0.32	0.37	0.29	0.25	0.10	0.94	0.23	0.47	0.67	0.44	0.55
C2	0.26	0.33	0.16	0.52	0.32	0.27	0.34	0.30	0.35	0.31	0.34	0.32	0.36	0.33	0.30	0.08	0.87	0.24	0.51	0.64	0.50	0.58
C2'	0.44	0.53	0.32	0.78	0.48	0.58	0.48	0.58	0.50	0.45	0.52	0.51	0.50	0.46	0.46	0.25	1.26	0.49	0.69	0.95	0.62	0.77
C3'	0.37	0.53	0.23	0.67	0.45	0.47	0.46	0.47	0.51	0.39	0.54	0.48	0.51	0.43	0.40	0.15	1.11	0.40	0.60	0.81	0.56	0.67
C4	0.20	0.33	0.11	0.43	0.28	0.22	0.31	0.26	0.34	0.26	0.35	0.29	0.36	0.30	0.25	0.10	0.83	0.20	0.43	0.68	0.38	0.54
C4'	0.19	0.49	0.10	0.38	0.35	0.20	0.40	0.20	0.48	0.28	0.53	0.39	0.51	0.35	0.27	0.10	0.75	0.20	0.37	0.57	0.36	0.45
C5	0.16	0.29	0.10	0.29	0.25	0.15	0.29	0.19	0.32	0.24	0.33	0.24	0.34	0.28	0.21	0.13	0.68	0.17	0.35	0.71	0.27	0.49
C5'	0.37	0.77	0.15	0.44	0.60	0.31	0.67	0.31	0.78	0.50	0.83	0.64	0.83	0.60	0.48	0.13	0.77	0.37	0.49	0.74	0.42	0.59
C6	0.16	0.26	0.11	0.23	0.25	0.13	0.29	0.17	0.32	0.25	0.31	0.22	0.34	0.29	0.21	0.14	0.57	0.16	0.34	0.71	0.25	0.49
C8	0.16	0.30	0.10	0.32	0.24	0.17	0.28	0.20	0.32	0.22	0.34	0.24	0.35	0.26	0.20	0.13	0.74	0.18	0.35	0.72	0.26	0.48
N1	0.21	0.29	0.10	0.35	0.29	0.17	0.32	0.22	0.33	0.29	0.32	0.27	0.35	0.32	0.27	0.11	0.67	0.19	0.42	0.68	0.38	0.55
N3	0.25	0.35	0.15	0.54	0.31	0.29	0.33	0.31	0.35	0.29	0.36	0.32	0.36	0.32	0.28	0.08	0.92	0.24	0.51	0.64	0.50	0.58
N6	0.15	0.18	0.19	0.12	0.19	0.15	0.26	0.14	0.29	0.23	0.25	0.13	0.32	0.27	0.18	0.17	0.36	0.17	0.26	0.73	0.16	0.43
N7	0.14	0.27	0.12	0.24	0.22	0.13	0.27	0.16	0.31	0.21	0.32	0.20	0.34	0.26	0.18	0.14	0.63	0.16	0.30	0.73	0.20	0.46
N9	0.19	0.34	0.10	0.43	0.28	0.23	0.31	0.26	0.34	0.25	0.36	0.29	0.36	0.29	0.23	0.11	0.85	0.20	0.42	0.69	0.36	0.53
O2'	0.55	0.51	0.48	1.00	0.51	0.78	0.48	0.77	0.46	0.50	0.47	0.53	0.44	0.48	0.52	0.36	1.54	0.62	0.85	1.09	0.79	0.90
O3'	0.36	0.48	0.28	0.76	0.41	0.50	0.41	0.50	0.45	0.36	0.48	0.45	0.44	0.38	0.37	0.16	1.21	0.38	0.64	0.77	0.64	0.68
O4'	0.14	0.34	0.13	0.31	0.24	0.13	0.28	0.15	0.35	0.19	0.38	0.26	0.38	0.25	0.18	0.13	0.66	0.15	0.31	0.50	0.31	0.40
O5'	0.44	0.73	0.26	0.55	0.63	0.40	0.69	0.43	0.78	0.58	0.80	0.63	0.83	0.66	0.54	0.31	0.88	0.43	0.62	0.89	0.53	0.75
OP1	0.21	0.20	0.19	0.32	0.20	0.24	0.21	0.25	0.22	0.22	0.22	0.19	0.24	0.22	0.21	0.15	0.64	0.25	0.39	0.58	0.28	0.46
OP2	0.57	0.97	0.40	0.64	0.83	0.48	0.94	0.52	1.06	0.77	1.08	0.83	1.15	0.90	0.72	0.48	0.91	0.53	0.74	0.99	0.68	0.90
P	0.43	0.61	0.29	0.59	0.55	0.43	0.62	0.47	0.67	0.55	0.67	0.54	0.72	0.61	0.51	0.39	0.91	0.43	0.66	0.90	0.57	0.80

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.00	0.16	0.75	0.08	0.32
C2	0.03	0.00	0.16	0.15	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.29	0.09	0.22	0.84	0.42	0.22
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.17	0.07	0.09	0.13	0.17	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.38	0.66	0.29	0.52
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.18	0.01	0.25	0.02	0.24	0.27	0.20	0.12	0.28	0.29	0.18	0.02	0.01	0.01	0.11	0.29	0.18	0.09
C4	0.01	0.00	0.09	0.18	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.16	0.05	0.25	0.87	0.37	0.23
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.08	0.16	0.04	0.03	0.10	0.15	0.08	0.25	0.02	0.00	0.01	0.34	0.15	0.09
C5	0.01	0.00	0.05	0.25	0.00	0.10	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.05	0.02	0.34	0.90	0.53	0.18
C5'	0.06	0.06	0.17	0.02	0.08	0.01	0.14	0.00	0.14	0.18	0.10	0.06	0.17	0.20	0.09	0.08	0.19	0.01	0.01	0.20	0.24	0.02
C6	0.01	0.00	0.07	0.24	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.31	0.09	0.04	0.35	0.89	0.60	0.16
C8	0.01	0.00	0.09	0.27	0.00	0.16	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.23	0.09	0.07	0.36	0.93	0.39	0.21
N1	0.02	0.00	0.13	0.20	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.19	0.07	0.29	0.87	0.54	0.18
N3	0.03	0.00	0.17	0.12	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.31	0.09	0.19	0.83	0.32	0.25
N6	0.01	0.00	0.05	0.28	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.33	0.05	0.04	0.40	0.89	0.71	0.15
N7	0.01	0.00	0.06	0.29	0.00	0.15	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.28	0.10	0.04	0.41	0.93	0.58	0.16
N9	0.00	0.01	0.02	0.18	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.10	0.01	0.23	0.87	0.25	0.26
O2'	0.01	0.24	0.00	0.02	0.23	0.25	0.28	0.08	0.31	0.23	0.28	0.20	0.33	0.28	0.18	0.00	0.04	0.18	0.30	0.53	0.31	0.46
O3'	0.26	0.29	0.02	0.01	0.16	0.02	0.05	0.19	0.09	0.09	0.19	0.31	0.05	0.10	0.10	0.04	0.00	0.18	0.19	0.52	0.32	0.25
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.07	0.09	0.04	0.04	0.01	0.18	0.18	0.00	0.12	0.67	0.09	0.20
O5'	0.16	0.22	0.38	0.11	0.25	0.01	0.34	0.01	0.35	0.36	0.29	0.19	0.40	0.41	0.23	0.30	0.19	0.12	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.75	0.84	0.66	0.29	0.87	0.34	0.90	0.20	0.89	0.93	0.87	0.83	0.89	0.93	0.87	0.53	0.52	0.67	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.42	0.29	0.18	0.37	0.15	0.53	0.24	0.60	0.39	0.54	0.32	0.71	0.58	0.25	0.31	0.32	0.09	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.32	0.22	0.52	0.09	0.23	0.09	0.18	0.02	0.16	0.21	0.18	0.25	0.15	0.16	0.26	0.46	0.25	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00