Doublet Group distance statistics: 52946

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 5, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.001, 0.018, 0.035, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.018 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.001, 0.024, 0.046, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.024 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.004, 0.027, 0.051, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.027 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.004, 0.032, 0.060, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.032 std_dev=0.028
N1	A	0, -0.002, 0.027, 0.056, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.027 std_dev=0.029
C4	A	0, -0.005, 0.033, 0.071, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.033 std_dev=0.038
N9	A	0, -0.001, 0.041, 0.083, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.041 std_dev=0.042
N7	A	0, 0.000, 0.046, 0.093, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.046 std_dev=0.047
N6	A	0, 0.010, 0.057, 0.104, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.057 std_dev=0.047
C8	A	0, -0.010, 0.059, 0.128, 0.221 max_d=0.221 avg_d=0.059 std_dev=0.069
O2'	A	0, 0.069, 0.310, 0.550, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.310 std_dev=0.241
C4	B	0, 0.302, 0.569, 0.837, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.569 std_dev=0.268
C2'	A	0, 0.014, 0.285, 0.557, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.285 std_dev=0.271
O4'	A	0, 0.010, 0.320, 0.629, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.320 std_dev=0.309
N3	B	0, 0.239, 0.566, 0.894, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.566 std_dev=0.328
C2	B	0, 0.457, 0.812, 1.166, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.812 std_dev=0.355
N9	B	0, 0.172, 0.596, 1.020, 1.592 max_d=1.592 avg_d=0.596 std_dev=0.424
C3'	A	0, 0.012, 0.490, 0.968, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.490 std_dev=0.478
C4'	A	0, -0.011, 0.495, 1.002, 1.588 max_d=1.588 avg_d=0.495 std_dev=0.506
C5	B	0, 0.534, 1.062, 1.590, 2.004 max_d=2.004 avg_d=1.062 std_dev=0.528
C1'	B	0, 0.490, 1.020, 1.549, 2.368 max_d=2.368 avg_d=1.020 std_dev=0.530
C2'	B	0, 0.859, 1.418, 1.976, 2.668 max_d=2.668 avg_d=1.418 std_dev=0.559
N1	B	0, 0.612, 1.233, 1.854, 2.047 max_d=2.047 avg_d=1.233 std_dev=0.621
O3'	A	0, 0.034, 0.671, 1.308, 2.205 max_d=2.205 avg_d=0.671 std_dev=0.637
C8	B	0, 0.208, 0.852, 1.495, 2.212 max_d=2.212 avg_d=0.852 std_dev=0.644
O4'	B	0, 0.521, 1.184, 1.847, 2.912 max_d=2.912 avg_d=1.184 std_dev=0.663
C3'	B	0, 0.695, 1.376, 2.056, 3.046 max_d=3.046 avg_d=1.376 std_dev=0.681
C6	B	0, 0.753, 1.446, 2.139, 2.127 max_d=2.127 avg_d=1.446 std_dev=0.693
O2'	B	0, 1.293, 2.016, 2.739, 3.198 max_d=3.198 avg_d=2.016 std_dev=0.723
O5'	A	0, 0.978, 1.720, 2.462, 2.815 max_d=2.815 avg_d=1.720 std_dev=0.742
N7	B	0, 0.399, 1.205, 2.010, 2.888 max_d=2.888 avg_d=1.205 std_dev=0.805
C5'	A	0, 0.065, 0.872, 1.680, 2.492 max_d=2.492 avg_d=0.872 std_dev=0.807
O5'	B	0, 0.371, 1.183, 1.996, 2.820 max_d=2.820 avg_d=1.183 std_dev=0.813
C4'	B	0, 0.435, 1.267, 2.099, 3.357 max_d=3.357 avg_d=1.267 std_dev=0.832
O3'	B	0, 1.079, 1.943, 2.807, 3.597 max_d=3.597 avg_d=1.943 std_dev=0.864
C5'	B	0, 0.318, 1.208, 2.097, 3.624 max_d=3.624 avg_d=1.208 std_dev=0.889
P	B	0, 0.466, 1.439, 2.413, 3.141 max_d=3.141 avg_d=1.439 std_dev=0.974
OP1	B	0, 0.698, 1.692, 2.685, 3.662 max_d=3.662 avg_d=1.692 std_dev=0.993
N6	B	0, 1.079, 2.089, 3.100, 3.236 max_d=3.236 avg_d=2.089 std_dev=1.010
OP1	A	0, 2.669, 3.766, 4.863, 4.355 max_d=4.355 avg_d=3.766 std_dev=1.097
P	A	0, 2.518, 3.662, 4.806, 4.688 max_d=4.688 avg_d=3.662 std_dev=1.144
OP2	B	0, 0.177, 1.419, 2.661, 4.174 max_d=4.174 avg_d=1.419 std_dev=1.242
OP2	A	0, 3.697, 5.285, 6.874, 6.447 max_d=6.447 avg_d=5.285 std_dev=1.588

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.15	0.41	0.51	0.21
C2	0.04	0.00	0.22	0.22	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.21	0.28	0.09	0.31	0.45	0.52	0.29
C2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.13	0.01	0.10	0.02	0.14	0.05	0.20	0.20	0.13	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.53	0.57	0.29
C3'	0.02	0.22	0.01	0.00	0.15	0.01	0.15	0.03	0.19	0.10	0.22	0.20	0.18	0.11	0.08	0.02	0.01	0.02	0.15	0.54	0.49	0.29
C4	0.02	0.01	0.13	0.15	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.17	0.05	0.32	0.46	0.52	0.28
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.12	0.05	0.05	0.11	0.12	0.05	0.07	0.02	0.01	0.03	0.35	0.36	0.14
C5	0.01	0.01	0.10	0.15	0.01	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.18	0.06	0.43	0.49	0.53	0.35
C5'	0.02	0.07	0.02	0.03	0.10	0.01	0.18	0.00	0.18	0.20	0.13	0.04	0.24	0.23	0.10	0.07	0.07	0.02	0.01	0.28	0.17	0.01
C6	0.02	0.01	0.14	0.19	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.24	0.08	0.45	0.49	0.54	0.38
C8	0.02	0.02	0.05	0.10	0.01	0.12	0.01	0.20	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.10	0.07	0.43	0.50	0.52	0.32
N1	0.03	0.01	0.20	0.22	0.02	0.05	0.02	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.19	0.29	0.09	0.40	0.47	0.53	0.34
N3	0.04	0.01	0.20	0.20	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.18	0.23	0.08	0.25	0.43	0.52	0.25
N6	0.02	0.02	0.13	0.18	0.01	0.11	0.01	0.24	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.14	0.25	0.09	0.52	0.51	0.57	0.44
N7	0.02	0.02	0.03	0.11	0.01	0.12	0.00	0.23	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.13	0.06	0.49	0.51	0.55	0.40
N9	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.02	0.29	0.45	0.52	0.25
O2'	0.02	0.21	0.01	0.02	0.11	0.07	0.10	0.07	0.15	0.05	0.19	0.18	0.14	0.05	0.03	0.00	0.04	0.06	0.06	0.47	0.50	0.22
O3'	0.02	0.28	0.02	0.01	0.17	0.02	0.18	0.07	0.24	0.10	0.29	0.23	0.25	0.13	0.08	0.04	0.00	0.02	0.26	0.50	0.41	0.25
O4'	0.00	0.09	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.02	0.08	0.07	0.09	0.08	0.09	0.06	0.02	0.06	0.02	0.00	0.16	0.26	0.43	0.14
O5'	0.15	0.31	0.08	0.15	0.32	0.03	0.43	0.01	0.45	0.43	0.40	0.25	0.52	0.49	0.29	0.06	0.26	0.16	0.00	0.07	0.05	0.01
OP1	0.41	0.45	0.53	0.54	0.46	0.35	0.49	0.28	0.49	0.50	0.47	0.43	0.51	0.51	0.45	0.47	0.50	0.26	0.07	0.00	0.02	0.01
OP2	0.51	0.52	0.57	0.49	0.52	0.36	0.53	0.17	0.54	0.52	0.53	0.52	0.57	0.55	0.52	0.50	0.41	0.43	0.05	0.02	0.00	0.02
P	0.21	0.29	0.29	0.29	0.28	0.14	0.35	0.01	0.38	0.32	0.34	0.25	0.44	0.40	0.25	0.22	0.25	0.14	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.19	0.18	0.21	0.10	0.16	0.12	0.17	0.13	0.21	0.17	0.14	0.16	0.20	0.15	0.12	0.33	0.20	0.24	0.30	0.33	0.24
C2	0.22	0.22	0.23	0.26	0.17	0.21	0.20	0.22	0.18	0.29	0.19	0.19	0.20	0.27	0.22	0.18	0.33	0.22	0.28	0.34	0.36	0.29
C2'	0.25	0.24	0.12	0.12	0.19	0.21	0.14	0.21	0.13	0.17	0.19	0.24	0.11	0.14	0.20	0.15	0.23	0.30	0.15	0.22	0.21	0.17
C3'	0.28	0.20	0.18	0.19	0.20	0.28	0.16	0.29	0.14	0.20	0.16	0.23	0.12	0.17	0.23	0.22	0.28	0.36	0.21	0.27	0.23	0.24
C4	0.14	0.17	0.16	0.19	0.09	0.12	0.11	0.12	0.12	0.18	0.15	0.13	0.13	0.17	0.13	0.10	0.30	0.16	0.18	0.23	0.26	0.17
C4'	0.15	0.12	0.14	0.17	0.09	0.13	0.12	0.14	0.14	0.17	0.14	0.10	0.19	0.18	0.12	0.08	0.29	0.21	0.16	0.22	0.27	0.16
C5	0.15	0.14	0.14	0.16	0.11	0.11	0.09	0.10	0.09	0.13	0.11	0.13	0.10	0.12	0.13	0.12	0.25	0.19	0.10	0.13	0.18	0.10
C5'	0.15	0.16	0.21	0.24	0.16	0.15	0.23	0.16	0.25	0.23	0.22	0.12	0.32	0.26	0.17	0.14	0.35	0.21	0.20	0.25	0.31	0.20
C6	0.14	0.11	0.14	0.16	0.10	0.10	0.09	0.10	0.09	0.13	0.09	0.11	0.10	0.12	0.12	0.15	0.24	0.17	0.09	0.13	0.16	0.09
C8	0.17	0.17	0.15	0.16	0.13	0.14	0.11	0.14	0.12	0.14	0.15	0.16	0.12	0.12	0.15	0.12	0.27	0.22	0.12	0.14	0.19	0.12
N1	0.14	0.17	0.15	0.17	0.14	0.08	0.16	0.07	0.15	0.21	0.15	0.16	0.17	0.21	0.16	0.08	0.26	0.13	0.14	0.19	0.23	0.14
N3	0.20	0.21	0.22	0.26	0.14	0.21	0.17	0.22	0.16	0.26	0.18	0.16	0.19	0.25	0.19	0.18	0.36	0.21	0.29	0.36	0.37	0.30
N6	0.25	0.11	0.23	0.23	0.16	0.24	0.12	0.25	0.09	0.18	0.10	0.15	0.09	0.14	0.20	0.27	0.27	0.28	0.22	0.23	0.21	0.23
N7	0.20	0.17	0.16	0.17	0.15	0.17	0.12	0.17	0.12	0.15	0.14	0.18	0.12	0.13	0.17	0.16	0.25	0.26	0.14	0.14	0.18	0.15
N9	0.15	0.18	0.16	0.19	0.10	0.12	0.10	0.12	0.11	0.16	0.15	0.14	0.13	0.15	0.13	0.10	0.30	0.18	0.17	0.22	0.25	0.16
O2'	0.28	0.26	0.15	0.11	0.20	0.25	0.16	0.25	0.15	0.23	0.21	0.25	0.13	0.20	0.23	0.19	0.17	0.33	0.24	0.29	0.30	0.24
O3'	0.39	0.25	0.26	0.27	0.29	0.40	0.25	0.42	0.21	0.31	0.21	0.30	0.18	0.26	0.33	0.31	0.32	0.48	0.33	0.38	0.33	0.37
O4'	0.18	0.16	0.25	0.30	0.15	0.20	0.21	0.21	0.21	0.28	0.18	0.11	0.27	0.29	0.20	0.16	0.41	0.20	0.31	0.36	0.42	0.31
O5'	0.31	0.44	0.41	0.42	0.41	0.29	0.47	0.29	0.51	0.42	0.50	0.39	0.56	0.47	0.38	0.34	0.50	0.29	0.36	0.40	0.45	0.35
OP1	0.40	0.47	0.53	0.54	0.45	0.40	0.47	0.40	0.49	0.44	0.49	0.45	0.51	0.47	0.43	0.49	0.63	0.37	0.43	0.42	0.46	0.39
OP2	0.52	0.60	0.60	0.60	0.56	0.52	0.56	0.51	0.59	0.53	0.61	0.58	0.59	0.54	0.53	0.57	0.64	0.50	0.50	0.49	0.51	0.48
P	0.30	0.41	0.40	0.41	0.37	0.28	0.41	0.29	0.45	0.37	0.45	0.37	0.48	0.41	0.35	0.34	0.48	0.28	0.32	0.33	0.38	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.06	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.16	0.11	0.10
C2	0.07	0.00	0.19	0.18	0.03	0.08	0.03	0.09	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.22	0.24	0.07	0.13	0.21	0.19	0.11
C2'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.09	0.02	0.04	0.01	0.09	0.11	0.15	0.19	0.08	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.20	0.21	0.12
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.06	0.21	0.12	0.17	0.07	0.16	0.06	0.02	0.01	0.01	0.20	0.26	0.27	0.21
C4	0.04	0.03	0.09	0.06	0.00	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.10	0.08	0.03	0.10	0.14	0.14	0.08
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.09	0.05	0.07	0.06	0.08	0.03	0.07	0.01	0.01	0.02	0.15	0.06	0.04
C5	0.02	0.03	0.04	0.05	0.01	0.03	0.00	0.07	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.08	0.10	0.14	0.08
C5'	0.03	0.09	0.01	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.08	0.11	0.09	0.09	0.10	0.11	0.06	0.07	0.04	0.02	0.01	0.12	0.05	0.01
C6	0.04	0.02	0.09	0.06	0.02	0.03	0.02	0.08	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.12	0.08	0.03	0.09	0.14	0.17	0.09
C8	0.02	0.03	0.11	0.21	0.01	0.09	0.02	0.11	0.03	0.00	0.04	0.02	0.06	0.01	0.01	0.07	0.23	0.05	0.11	0.09	0.15	0.11
N1	0.06	0.01	0.15	0.12	0.03	0.05	0.03	0.09	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.05	0.03	0.19	0.17	0.06	0.11	0.19	0.19	0.10
N3	0.07	0.01	0.19	0.17	0.01	0.07	0.02	0.09	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.21	0.23	0.08	0.13	0.20	0.17	0.10
N6	0.04	0.03	0.08	0.07	0.03	0.06	0.03	0.10	0.01	0.06	0.02	0.03	0.00	0.07	0.04	0.11	0.09	0.05	0.11	0.16	0.19	0.12
N7	0.02	0.04	0.07	0.16	0.02	0.08	0.01	0.11	0.04	0.01	0.05	0.03	0.07	0.00	0.02	0.05	0.20	0.04	0.09	0.08	0.15	0.10
N9	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.06	0.01	0.10	0.11	0.13	0.09
O2'	0.01	0.22	0.00	0.02	0.10	0.07	0.07	0.07	0.12	0.07	0.19	0.21	0.11	0.05	0.02	0.00	0.04	0.05	0.07	0.19	0.17	0.08
O3'	0.01	0.24	0.01	0.01	0.08	0.01	0.07	0.04	0.08	0.23	0.17	0.23	0.09	0.20	0.06	0.04	0.00	0.01	0.30	0.36	0.37	0.30
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.06	0.08	0.05	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.19	0.21	0.14	0.16
O5'	0.11	0.13	0.08	0.20	0.10	0.02	0.08	0.01	0.09	0.11	0.11	0.13	0.11	0.09	0.10	0.07	0.30	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.16	0.21	0.20	0.26	0.14	0.15	0.10	0.12	0.14	0.09	0.19	0.20	0.16	0.08	0.11	0.19	0.36	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.19	0.21	0.27	0.14	0.06	0.14	0.05	0.17	0.15	0.19	0.17	0.19	0.15	0.13	0.17	0.37	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.11	0.12	0.21	0.08	0.04	0.08	0.01	0.09	0.11	0.10	0.10	0.12	0.10	0.09	0.08	0.30	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00