Doublet Group distance statistics: 52953

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 2, 4, 2, 2, 5, 5, 15, 4, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.017, 0.026, 0.034, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.026 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.026, 0.036, 0.046, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.036 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.032, 0.043, 0.054, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.043 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.041, 0.054, 0.066, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.054 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.032, 0.045, 0.058, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.045 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.047, 0.063, 0.079, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.063 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.033, 0.048, 0.064, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.048 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.041, 0.058, 0.075, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.058 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.041, 0.060, 0.080, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.060 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.028, 0.054, 0.080, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.054 std_dev=0.026
N3	B	0, 0.548, 0.720, 0.892, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.720 std_dev=0.172
N2	B	0, 0.294, 0.501, 0.709, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.501 std_dev=0.207
C3'	B	0, 0.506, 0.714, 0.922, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.714 std_dev=0.208
C2	B	0, 0.568, 0.782, 0.996, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.782 std_dev=0.214
C1'	B	0, 0.960, 1.184, 1.409, 1.534 max_d=1.534 avg_d=1.184 std_dev=0.224
C4'	B	0, 0.972, 1.217, 1.462, 1.498 max_d=1.498 avg_d=1.217 std_dev=0.245
C2'	B	0, 0.826, 1.094, 1.363, 1.583 max_d=1.583 avg_d=1.094 std_dev=0.269
N9	B	0, 0.817, 1.111, 1.404, 1.469 max_d=1.469 avg_d=1.111 std_dev=0.294
C4	B	0, 0.795, 1.093, 1.392, 1.410 max_d=1.410 avg_d=1.093 std_dev=0.299
O3'	B	0, 1.255, 1.574, 1.894, 2.031 max_d=2.031 avg_d=1.574 std_dev=0.320
C5'	B	0, 1.182, 1.528, 1.874, 1.999 max_d=1.999 avg_d=1.528 std_dev=0.346
O4'	A	0, 1.900, 2.254, 2.607, 2.398 max_d=2.398 avg_d=2.254 std_dev=0.353
O4'	B	0, 1.298, 1.668, 2.039, 2.093 max_d=2.093 avg_d=1.668 std_dev=0.371
C2'	A	0, 2.068, 2.456, 2.843, 2.651 max_d=2.651 avg_d=2.456 std_dev=0.388
O2'	B	0, 1.867, 2.268, 2.669, 2.793 max_d=2.793 avg_d=2.268 std_dev=0.401
N1	B	0, 1.116, 1.569, 2.023, 2.020 max_d=2.020 avg_d=1.569 std_dev=0.454
C4'	A	0, 2.382, 2.836, 3.291, 3.154 max_d=3.154 avg_d=2.836 std_dev=0.454
C8	B	0, 1.287, 1.748, 2.208, 2.274 max_d=2.274 avg_d=1.748 std_dev=0.461
O5'	B	0, 1.443, 1.935, 2.426, 2.543 max_d=2.543 avg_d=1.935 std_dev=0.491
C5	B	0, 1.351, 1.867, 2.382, 2.351 max_d=2.351 avg_d=1.867 std_dev=0.515
C3'	A	0, 2.762, 3.281, 3.800, 3.629 max_d=3.629 avg_d=3.281 std_dev=0.519
O2'	A	0, 3.154, 3.744, 4.335, 4.070 max_d=4.070 avg_d=3.744 std_dev=0.591
O3'	A	0, 3.169, 3.774, 4.378, 4.401 max_d=4.401 avg_d=3.774 std_dev=0.605
N7	B	0, 1.701, 2.307, 2.913, 2.912 max_d=2.912 avg_d=2.307 std_dev=0.606
C6	B	0, 1.578, 2.202, 2.826, 2.754 max_d=2.754 avg_d=2.202 std_dev=0.624
OP1	B	0, 2.371, 3.064, 3.757, 3.764 max_d=3.764 avg_d=3.064 std_dev=0.693
P	B	0, 2.526, 3.308, 4.090, 4.111 max_d=4.111 avg_d=3.308 std_dev=0.782
O6	B	0, 2.136, 2.978, 3.821, 3.659 max_d=3.659 avg_d=2.978 std_dev=0.843
C5'	A	0, 4.791, 5.687, 6.584, 6.060 max_d=6.060 avg_d=5.687 std_dev=0.897
OP2	B	0, 3.249, 4.258, 5.266, 5.214 max_d=5.214 avg_d=4.258 std_dev=1.009
O5'	A	0, 6.151, 7.296, 8.440, 7.817 max_d=7.817 avg_d=7.296 std_dev=1.144
P	A	0, 8.700, 10.314, 11.928, 10.873 max_d=10.873 avg_d=10.314 std_dev=1.614
OP2	A	0, 9.556, 11.333, 13.110, 12.029 max_d=12.029 avg_d=11.333 std_dev=1.777
OP1	A	0, 9.690, 11.498, 13.306, 12.303 max_d=12.303 avg_d=11.498 std_dev=1.808

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.08	0.11	0.18	0.07
C2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.10	0.01	0.23	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.07	0.06	0.14	0.16	0.30	0.17
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.04	0.02	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.15	0.24	0.13
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.06	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.13	0.18	0.10
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.03	0.09	0.10	0.23	0.10
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.03	0.09	0.09	0.06	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.12	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.08	0.10	0.25	0.10
C5'	0.04	0.23	0.07	0.01	0.15	0.01	0.15	0.00	0.18	0.08	0.21	0.20	0.18	0.11	0.09	0.06	0.04	0.01	0.01	0.13	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.06	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.04	0.10	0.12	0.27	0.13
C8	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.06	0.04	0.10	0.12	0.22	0.10
N1	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.09	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.05	0.12	0.15	0.30	0.16
N3	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.09	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.06	0.12	0.13	0.26	0.14
N6	0.03	0.01	0.04	0.04	0.01	0.06	0.02	0.18	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.07	0.06	0.05	0.10	0.13	0.29	0.13
N7	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.06	0.04	0.09	0.11	0.23	0.10
N9	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.08	0.10	0.20	0.08
O2'	0.02	0.08	0.00	0.01	0.04	0.02	0.05	0.06	0.06	0.05	0.08	0.07	0.07	0.05	0.02	0.00	0.03	0.02	0.12	0.18	0.27	0.15
O3'	0.06	0.07	0.02	0.01	0.06	0.02	0.05	0.04	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.06	0.03	0.00	0.07	0.07	0.12	0.16	0.09
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.06	0.05	0.04	0.01	0.02	0.07	0.00	0.08	0.14	0.10	0.08
O5'	0.08	0.14	0.11	0.09	0.09	0.01	0.08	0.01	0.10	0.10	0.12	0.12	0.10	0.09	0.08	0.12	0.07	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.11	0.16	0.15	0.13	0.10	0.07	0.10	0.13	0.12	0.12	0.15	0.13	0.13	0.11	0.10	0.18	0.12	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.30	0.24	0.18	0.23	0.12	0.25	0.12	0.27	0.22	0.30	0.26	0.29	0.23	0.20	0.27	0.16	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.17	0.13	0.10	0.10	0.02	0.10	0.02	0.13	0.10	0.16	0.14	0.13	0.10	0.08	0.15	0.09	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.11	0.22	0.05	0.13	0.17	0.17	0.16	0.19	0.15	0.16	0.11	0.11	0.19	0.13	0.29	0.12	0.20	0.09	0.23	0.13	0.20	0.10
C2	0.11	0.11	0.28	0.13	0.13	0.09	0.15	0.08	0.15	0.14	0.13	0.11	0.11	0.16	0.13	0.30	0.15	0.13	0.07	0.16	0.12	0.13	0.08
C2'	0.15	0.17	0.23	0.08	0.18	0.13	0.26	0.11	0.29	0.23	0.24	0.14	0.14	0.28	0.18	0.23	0.10	0.17	0.13	0.35	0.22	0.32	0.18
C3'	0.13	0.14	0.20	0.06	0.16	0.11	0.24	0.09	0.27	0.22	0.21	0.12	0.11	0.27	0.15	0.20	0.09	0.14	0.13	0.33	0.25	0.34	0.20
C4	0.10	0.11	0.27	0.08	0.13	0.13	0.15	0.13	0.16	0.14	0.14	0.11	0.11	0.16	0.12	0.34	0.14	0.17	0.06	0.18	0.10	0.14	0.08
C4'	0.11	0.12	0.24	0.09	0.15	0.12	0.21	0.11	0.22	0.20	0.18	0.10	0.11	0.23	0.15	0.31	0.11	0.13	0.10	0.26	0.20	0.25	0.14
C5	0.10	0.13	0.30	0.10	0.14	0.12	0.14	0.13	0.15	0.13	0.14	0.13	0.13	0.14	0.13	0.38	0.14	0.16	0.07	0.16	0.09	0.11	0.09
C5'	0.15	0.22	0.30	0.16	0.24	0.13	0.29	0.13	0.31	0.27	0.28	0.19	0.19	0.31	0.22	0.36	0.16	0.12	0.16	0.35	0.22	0.28	0.19
C6	0.11	0.15	0.31	0.13	0.15	0.09	0.15	0.10	0.16	0.14	0.16	0.14	0.14	0.15	0.14	0.38	0.14	0.13	0.08	0.16	0.09	0.11	0.10
C8	0.11	0.12	0.27	0.07	0.13	0.16	0.14	0.18	0.16	0.13	0.15	0.12	0.12	0.15	0.13	0.37	0.14	0.19	0.09	0.18	0.11	0.14	0.11
N1	0.11	0.12	0.31	0.15	0.14	0.08	0.15	0.08	0.15	0.14	0.13	0.11	0.13	0.15	0.13	0.34	0.14	0.12	0.08	0.15	0.11	0.12	0.09
N3	0.11	0.11	0.26	0.09	0.13	0.12	0.16	0.10	0.17	0.15	0.14	0.12	0.11	0.17	0.12	0.29	0.15	0.16	0.06	0.19	0.11	0.15	0.07
N6	0.13	0.20	0.33	0.15	0.18	0.09	0.19	0.11	0.21	0.16	0.21	0.21	0.18	0.18	0.16	0.40	0.14	0.13	0.10	0.21	0.11	0.13	0.12
N7	0.11	0.14	0.29	0.09	0.14	0.14	0.14	0.16	0.16	0.13	0.15	0.14	0.14	0.14	0.13	0.40	0.14	0.18	0.09	0.17	0.10	0.12	0.11
N9	0.12	0.11	0.25	0.06	0.12	0.16	0.15	0.16	0.17	0.14	0.15	0.11	0.11	0.16	0.12	0.34	0.14	0.19	0.08	0.20	0.11	0.15	0.09
O2'	0.18	0.21	0.24	0.11	0.22	0.16	0.31	0.14	0.35	0.27	0.30	0.18	0.18	0.33	0.21	0.22	0.12	0.19	0.17	0.42	0.26	0.37	0.23
O3'	0.13	0.14	0.19	0.05	0.16	0.12	0.24	0.10	0.27	0.21	0.22	0.12	0.12	0.27	0.15	0.21	0.06	0.14	0.13	0.33	0.25	0.34	0.20
O4'	0.15	0.10	0.20	0.11	0.12	0.21	0.13	0.21	0.14	0.14	0.11	0.11	0.12	0.15	0.13	0.31	0.17	0.23	0.14	0.16	0.14	0.18	0.14
O5'	0.14	0.10	0.18	0.16	0.13	0.13	0.19	0.14	0.19	0.21	0.14	0.12	0.11	0.24	0.14	0.16	0.18	0.12	0.21	0.23	0.35	0.36	0.27
OP1	0.18	0.15	0.19	0.23	0.18	0.22	0.26	0.27	0.28	0.26	0.21	0.14	0.15	0.31	0.18	0.19	0.23	0.19	0.30	0.34	0.44	0.48	0.38
OP2	0.18	0.26	0.23	0.24	0.28	0.20	0.36	0.26	0.38	0.33	0.33	0.22	0.23	0.39	0.26	0.28	0.24	0.17	0.33	0.43	0.46	0.47	0.40
P	0.17	0.15	0.19	0.22	0.19	0.18	0.25	0.22	0.26	0.27	0.20	0.13	0.14	0.30	0.19	0.18	0.24	0.16	0.28	0.31	0.40	0.42	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.01	0.00	0.01	0.11	0.01	0.08	0.03	0.08	0.16	0.11
C2	0.04	0.00	0.14	0.10	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.12	0.07	0.10	0.01	0.13	0.18	0.13
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.06	0.07	0.06	0.11	0.17	0.13	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.06	0.13	0.22	0.16
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.10	0.01	0.14	0.01	0.14	0.15	0.12	0.11	0.09	0.17	0.09	0.02	0.01	0.02	0.07	0.16	0.12	0.13	0.08
C4	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.03	0.10	0.02	0.13	0.18	0.13
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.11	0.03	0.08	0.05	0.11	0.05	0.12	0.02	0.00	0.01	0.08	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.05	0.03	0.14	0.02	0.16	0.19	0.14
C5'	0.02	0.05	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.09	0.13	0.05	0.08	0.05	0.14	0.06	0.07	0.07	0.01	0.01	0.12	0.06	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.05	0.04	0.14	0.01	0.17	0.20	0.15
C8	0.02	0.01	0.06	0.15	0.01	0.11	0.01	0.13	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.15	0.11	0.07	0.15	0.04	0.15	0.18	0.14
N1	0.03	0.00	0.11	0.12	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.06	0.05	0.12	0.01	0.15	0.19	0.14
N2	0.06	0.01	0.17	0.11	0.02	0.08	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.17	0.17	0.10	0.11	0.02	0.13	0.18	0.14
N3	0.04	0.01	0.13	0.09	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.13	0.07	0.10	0.01	0.12	0.18	0.13
N7	0.01	0.01	0.04	0.17	0.01	0.11	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.12	0.06	0.17	0.04	0.18	0.21	0.16
N9	0.00	0.02	0.01	0.09	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.04	0.01	0.10	0.04	0.11	0.17	0.12
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.09	0.12	0.12	0.07	0.13	0.15	0.12	0.17	0.11	0.16	0.09	0.00	0.03	0.08	0.10	0.14	0.10	0.22	0.12
O3'	0.11	0.12	0.01	0.01	0.05	0.02	0.05	0.07	0.05	0.11	0.06	0.17	0.13	0.12	0.04	0.03	0.00	0.06	0.14	0.08	0.28	0.25	0.20
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.07	0.05	0.10	0.07	0.06	0.01	0.08	0.06	0.00	0.08	0.06	0.08	0.14	0.11
O5'	0.08	0.10	0.15	0.07	0.10	0.01	0.14	0.01	0.14	0.15	0.12	0.11	0.10	0.17	0.10	0.10	0.14	0.08	0.00	0.17	0.01	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.06	0.16	0.02	0.08	0.02	0.12	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.14	0.08	0.06	0.17	0.00	0.19	0.21	0.17
OP1	0.08	0.13	0.13	0.12	0.13	0.06	0.16	0.06	0.17	0.15	0.15	0.13	0.12	0.18	0.11	0.10	0.28	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.18	0.22	0.13	0.18	0.04	0.19	0.03	0.20	0.18	0.19	0.18	0.18	0.21	0.17	0.22	0.25	0.14	0.02	0.21	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.13	0.16	0.08	0.13	0.02	0.14	0.02	0.15	0.14	0.14	0.14	0.13	0.16	0.12	0.12	0.20	0.11	0.01	0.17	0.01	0.00	0.00