Doublet Group distance statistics: 52954

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 8, 8, 5, 3, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.005, 0.021, 0.036, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.001, 0.026, 0.051, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.026 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.007, 0.033, 0.059, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.033 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.012, 0.038, 0.064, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.038 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.009, 0.038, 0.067, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.038 std_dev=0.029
O4'	A	0, -0.108, 0.152, 0.412, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.152 std_dev=0.260
N2	B	0, 0.057, 0.337, 0.618, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.337 std_dev=0.280
C2	B	0, 0.061, 0.346, 0.631, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.346 std_dev=0.285
N1	B	0, 0.089, 0.386, 0.682, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.386 std_dev=0.297
N3	B	0, 0.050, 0.347, 0.644, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.347 std_dev=0.297
O2'	B	0, 0.071, 0.373, 0.675, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.373 std_dev=0.302
O5'	A	0, -0.019, 0.285, 0.588, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.285 std_dev=0.303
C2'	B	0, 0.028, 0.343, 0.658, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.343 std_dev=0.315
C4	B	0, 0.048, 0.369, 0.690, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.369 std_dev=0.321
C6	B	0, 0.093, 0.423, 0.753, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.423 std_dev=0.330
C2'	A	0, -0.147, 0.183, 0.514, 1.485 max_d=1.485 avg_d=0.183 std_dev=0.331
C5	B	0, 0.071, 0.406, 0.741, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.406 std_dev=0.335
OP2	A	0, 0.041, 0.376, 0.711, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.376 std_dev=0.335
P	A	0, -0.027, 0.317, 0.661, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.317 std_dev=0.344
N9	B	0, 0.031, 0.382, 0.733, 1.515 max_d=1.515 avg_d=0.382 std_dev=0.351
C1'	B	0, 0.030, 0.382, 0.735, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.382 std_dev=0.353
C4'	A	0, -0.139, 0.217, 0.573, 1.601 max_d=1.601 avg_d=0.217 std_dev=0.356
C3'	A	0, -0.110, 0.251, 0.613, 1.558 max_d=1.558 avg_d=0.251 std_dev=0.362
O3'	B	0, -0.026, 0.340, 0.706, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.340 std_dev=0.366
O6	B	0, 0.106, 0.477, 0.848, 1.734 max_d=1.734 avg_d=0.477 std_dev=0.371
N7	B	0, 0.072, 0.446, 0.819, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.446 std_dev=0.373
C3'	B	0, -0.026, 0.353, 0.731, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.353 std_dev=0.378
C8	B	0, 0.041, 0.421, 0.802, 1.654 max_d=1.654 avg_d=0.421 std_dev=0.381
O5'	B	0, 0.021, 0.452, 0.884, 1.906 max_d=1.906 avg_d=0.452 std_dev=0.431
O4'	B	0, -0.008, 0.430, 0.869, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.430 std_dev=0.439
OP1	A	0, -0.033, 0.408, 0.848, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.408 std_dev=0.441
C4'	B	0, -0.047, 0.420, 0.888, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.420 std_dev=0.468
OP2	B	0, 0.012, 0.537, 1.063, 2.160 max_d=2.160 avg_d=0.537 std_dev=0.526
C5'	A	0, -0.223, 0.307, 0.838, 2.389 max_d=2.389 avg_d=0.307 std_dev=0.530
P	B	0, -0.018, 0.514, 1.045, 2.114 max_d=2.114 avg_d=0.514 std_dev=0.532
O2'	A	0, -0.272, 0.285, 0.843, 2.457 max_d=2.457 avg_d=0.285 std_dev=0.557
O3'	A	0, -0.203, 0.391, 0.985, 2.083 max_d=2.083 avg_d=0.391 std_dev=0.594
OP1	B	0, -0.018, 0.613, 1.245, 2.161 max_d=2.161 avg_d=0.613 std_dev=0.631
C5'	B	0, -0.111, 0.524, 1.160, 2.613 max_d=2.613 avg_d=0.524 std_dev=0.636

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.00	0.08	0.09	0.22	0.08
C2	0.03	0.00	0.24	0.15	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.31	0.11	0.10	0.10	0.13	0.26	0.13
C2'	0.00	0.24	0.00	0.01	0.13	0.02	0.08	0.15	0.12	0.09	0.19	0.24	0.09	0.05	0.02	0.00	0.06	0.02	0.18	0.25	0.41	0.25
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.10	0.10	0.13	0.13	0.10	0.10	0.05	0.02	0.02	0.01	0.16	0.20	0.27	0.19
C4	0.02	0.01	0.13	0.08	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.21	0.11	0.05	0.10	0.11	0.26	0.11
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.06	0.04	0.03	0.01	0.11	0.05	0.00	0.02	0.05	0.12	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.08	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.11	0.03	0.09	0.11	0.27	0.11
C5'	0.06	0.14	0.15	0.02	0.10	0.01	0.11	0.00	0.13	0.08	0.14	0.12	0.13	0.10	0.08	0.08	0.14	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01
C6	0.01	0.01	0.12	0.10	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.24	0.07	0.04	0.09	0.12	0.27	0.12
C8	0.02	0.01	0.09	0.10	0.01	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.23	0.06	0.09	0.10	0.25	0.10
N1	0.02	0.01	0.19	0.13	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.29	0.07	0.07	0.10	0.13	0.26	0.13
N3	0.03	0.00	0.24	0.13	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.28	0.10	0.11	0.10	0.12	0.26	0.12
N6	0.01	0.02	0.09	0.10	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.22	0.08	0.04	0.09	0.12	0.27	0.13
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.10	0.19	0.06	0.09	0.10	0.27	0.11
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.01	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.19	0.01	0.09	0.10	0.25	0.10
O2'	0.01	0.31	0.00	0.02	0.21	0.11	0.18	0.08	0.24	0.06	0.29	0.28	0.22	0.10	0.09	0.00	0.08	0.07	0.10	0.21	0.42	0.20
O3'	0.26	0.11	0.06	0.02	0.11	0.05	0.11	0.14	0.07	0.23	0.07	0.10	0.08	0.19	0.19	0.08	0.00	0.20	0.18	0.22	0.34	0.24
O4'	0.00	0.10	0.02	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.07	0.11	0.04	0.06	0.01	0.07	0.20	0.00	0.17	0.18	0.19	0.16
O5'	0.08	0.10	0.18	0.16	0.10	0.02	0.09	0.01	0.09	0.09	0.10	0.10	0.09	0.09	0.09	0.10	0.18	0.17	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.13	0.25	0.20	0.11	0.05	0.11	0.05	0.12	0.10	0.13	0.12	0.12	0.10	0.10	0.21	0.22	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.26	0.41	0.27	0.26	0.12	0.27	0.12	0.27	0.25	0.26	0.26	0.27	0.27	0.25	0.42	0.34	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.13	0.25	0.19	0.11	0.03	0.11	0.01	0.12	0.10	0.13	0.12	0.13	0.11	0.10	0.20	0.24	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.08	0.10	0.08	0.10	0.07	0.12	0.12	0.13	0.14	0.11	0.10	0.09	0.14	0.12	0.20	0.12	0.10	0.13	0.16	0.17	0.13	0.12
C2	0.15	0.10	0.10	0.13	0.13	0.10	0.16	0.13	0.16	0.16	0.14	0.10	0.11	0.17	0.14	0.18	0.17	0.13	0.16	0.18	0.18	0.15	0.14
C2'	0.34	0.27	0.33	0.21	0.32	0.22	0.35	0.14	0.34	0.38	0.30	0.24	0.28	0.38	0.35	0.38	0.18	0.28	0.40	0.36	0.38	0.35	0.37
C3'	0.22	0.18	0.23	0.16	0.17	0.16	0.18	0.13	0.19	0.21	0.19	0.22	0.17	0.20	0.19	0.32	0.16	0.19	0.33	0.20	0.33	0.21	0.28
C4	0.15	0.10	0.09	0.10	0.13	0.07	0.14	0.11	0.15	0.15	0.13	0.10	0.11	0.16	0.14	0.17	0.15	0.12	0.14	0.17	0.17	0.14	0.12
C4'	0.17	0.08	0.17	0.07	0.07	0.09	0.07	0.09	0.08	0.12	0.08	0.12	0.07	0.10	0.11	0.31	0.09	0.13	0.19	0.10	0.22	0.12	0.16
C5	0.16	0.13	0.09	0.10	0.15	0.07	0.16	0.09	0.16	0.16	0.15	0.12	0.13	0.16	0.15	0.16	0.14	0.14	0.16	0.18	0.18	0.14	0.13
C5'	0.26	0.09	0.29	0.14	0.13	0.16	0.12	0.08	0.11	0.17	0.09	0.11	0.12	0.14	0.18	0.45	0.16	0.20	0.24	0.13	0.23	0.14	0.18
C6	0.16	0.15	0.09	0.11	0.16	0.09	0.17	0.09	0.18	0.17	0.16	0.13	0.15	0.17	0.17	0.14	0.15	0.15	0.17	0.19	0.19	0.15	0.14
C8	0.16	0.12	0.10	0.09	0.13	0.07	0.15	0.09	0.16	0.15	0.14	0.12	0.12	0.16	0.15	0.18	0.13	0.13	0.14	0.18	0.17	0.14	0.12
N1	0.16	0.14	0.10	0.12	0.16	0.10	0.17	0.11	0.18	0.17	0.16	0.11	0.15	0.18	0.16	0.14	0.16	0.15	0.18	0.19	0.19	0.16	0.15
N3	0.14	0.10	0.09	0.12	0.12	0.09	0.14	0.13	0.15	0.15	0.13	0.10	0.10	0.16	0.13	0.19	0.16	0.11	0.14	0.18	0.17	0.14	0.12
N6	0.17	0.18	0.10	0.11	0.17	0.10	0.18	0.10	0.19	0.18	0.19	0.17	0.17	0.18	0.17	0.13	0.14	0.17	0.19	0.21	0.19	0.16	0.15
N7	0.16	0.14	0.09	0.09	0.15	0.08	0.16	0.08	0.17	0.16	0.16	0.13	0.13	0.16	0.16	0.16	0.13	0.14	0.15	0.19	0.18	0.14	0.13
N9	0.15	0.10	0.09	0.09	0.12	0.07	0.14	0.11	0.15	0.15	0.12	0.10	0.10	0.15	0.14	0.18	0.14	0.11	0.13	0.17	0.17	0.14	0.11
O2'	0.32	0.41	0.28	0.16	0.40	0.14	0.46	0.07	0.50	0.42	0.47	0.39	0.37	0.47	0.37	0.30	0.09	0.23	0.32	0.54	0.30	0.34	0.31
O3'	0.20	0.21	0.21	0.20	0.20	0.18	0.24	0.25	0.27	0.23	0.25	0.21	0.18	0.25	0.19	0.32	0.19	0.18	0.32	0.30	0.32	0.26	0.29
O4'	0.14	0.14	0.12	0.17	0.13	0.13	0.14	0.20	0.15	0.13	0.15	0.16	0.14	0.14	0.13	0.20	0.21	0.13	0.09	0.17	0.15	0.17	0.10
O5'	0.08	0.11	0.11	0.03	0.07	0.04	0.08	0.13	0.09	0.10	0.10	0.15	0.10	0.10	0.07	0.18	0.02	0.03	0.15	0.10	0.21	0.14	0.15
OP1	0.05	0.18	0.07	0.04	0.14	0.16	0.18	0.27	0.21	0.15	0.20	0.20	0.16	0.19	0.10	0.05	0.01	0.12	0.16	0.24	0.20	0.20	0.15
OP2	0.11	0.23	0.17	0.05	0.16	0.13	0.15	0.30	0.18	0.10	0.22	0.26	0.21	0.12	0.11	0.21	0.03	0.07	0.22	0.18	0.33	0.21	0.24
P	0.05	0.15	0.10	0.02	0.10	0.09	0.12	0.20	0.14	0.11	0.15	0.17	0.13	0.13	0.08	0.12	0.01	0.04	0.16	0.16	0.22	0.15	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.02	0.08	0.14	0.07
C2	0.03	0.00	0.10	0.12	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.14	0.03	0.17	0.03	0.15	0.15	0.13
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.08	0.13	0.11	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.13	0.04	0.16	0.08	0.10
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.05	0.02	0.07	0.08	0.10	0.15	0.12	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.19	0.07	0.21	0.10	0.15
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.16	0.02	0.13	0.15	0.12
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.06	0.08	0.06	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.02	0.05	0.07	0.13	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.20	0.01	0.15	0.15	0.15
C5'	0.02	0.11	0.02	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.11	0.07	0.11	0.12	0.10	0.08	0.06	0.05	0.03	0.01	0.01	0.12	0.07	0.18	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.08	0.03	0.21	0.01	0.16	0.16	0.15
C8	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.09	0.03	0.20	0.02	0.13	0.15	0.13
N1	0.03	0.01	0.08	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.11	0.03	0.19	0.02	0.16	0.16	0.15
N2	0.04	0.01	0.13	0.15	0.02	0.08	0.02	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.12	0.19	0.04	0.16	0.03	0.15	0.16	0.14
N3	0.03	0.01	0.11	0.12	0.01	0.06	0.01	0.10	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.13	0.03	0.15	0.02	0.13	0.15	0.12
N7	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.03	0.22	0.03	0.15	0.16	0.15
N9	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.15	0.02	0.11	0.14	0.10
O2'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.04	0.04	0.05	0.05	0.03	0.08	0.12	0.09	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.06	0.05	0.13	0.08	0.05
O3'	0.01	0.14	0.02	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.08	0.09	0.11	0.19	0.13	0.08	0.03	0.03	0.00	0.01	0.18	0.08	0.26	0.16	0.19
O4'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.03	0.06	0.20	0.10
O5'	0.08	0.17	0.13	0.19	0.16	0.02	0.20	0.01	0.21	0.20	0.19	0.16	0.15	0.22	0.15	0.06	0.18	0.07	0.00	0.23	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.03	0.04	0.07	0.02	0.05	0.01	0.12	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.08	0.03	0.23	0.00	0.17	0.16	0.17
OP1	0.08	0.15	0.16	0.21	0.13	0.07	0.15	0.07	0.16	0.13	0.16	0.15	0.13	0.15	0.11	0.13	0.26	0.06	0.02	0.17	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.15	0.08	0.10	0.15	0.13	0.15	0.18	0.16	0.15	0.16	0.16	0.15	0.16	0.14	0.08	0.16	0.20	0.02	0.16	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.13	0.10	0.15	0.12	0.02	0.15	0.02	0.15	0.13	0.15	0.14	0.12	0.15	0.10	0.05	0.19	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00