Doublet Group distance statistics: 52955

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 1, 2, 2, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 5, 2, 5, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.009, 0.016, 0.023, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.008, 0.016, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.010, 0.019, 0.027, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.021 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.016, 0.028, 0.040, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.028 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.016, 0.033, 0.051, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.033 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.019, 0.040, 0.061, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.040 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.020, 0.043, 0.065, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.043 std_dev=0.022
O4'	A	0, 0.044, 0.149, 0.254, 0.321 max_d=0.321 avg_d=0.149 std_dev=0.105
C2'	A	0, 0.061, 0.185, 0.308, 0.396 max_d=0.396 avg_d=0.185 std_dev=0.123
C4'	A	0, 0.126, 0.255, 0.384, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.255 std_dev=0.129
O2'	A	0, 0.176, 0.352, 0.528, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.352 std_dev=0.176
C3'	A	0, 0.119, 0.305, 0.491, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.305 std_dev=0.186
C5'	A	0, 0.191, 0.444, 0.697, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.444 std_dev=0.253
O3'	A	0, 0.206, 0.479, 0.751, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.479 std_dev=0.273
C2'	B	0, 0.386, 0.697, 1.009, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.697 std_dev=0.312
O5'	A	0, 0.312, 0.661, 1.009, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.661 std_dev=0.348
C1'	B	0, 0.406, 0.768, 1.130, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.768 std_dev=0.362
N9	B	0, 0.439, 0.819, 1.199, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.819 std_dev=0.380
C3'	B	0, 0.431, 0.820, 1.209, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.820 std_dev=0.389
C4	B	0, 0.429, 0.855, 1.281, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.855 std_dev=0.426
O2'	B	0, 0.374, 0.803, 1.232, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.803 std_dev=0.429
C5	B	0, 0.463, 0.894, 1.325, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.894 std_dev=0.431
C4'	B	0, 0.416, 0.856, 1.297, 1.578 max_d=1.578 avg_d=0.856 std_dev=0.440
C8	B	0, 0.479, 0.934, 1.388, 1.601 max_d=1.601 avg_d=0.934 std_dev=0.455
N7	B	0, 0.490, 0.966, 1.442, 1.656 max_d=1.656 avg_d=0.966 std_dev=0.476
O4'	B	0, 0.442, 0.927, 1.412, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.927 std_dev=0.485
C6	B	0, 0.472, 0.961, 1.451, 1.588 max_d=1.588 avg_d=0.961 std_dev=0.490
O6	B	0, 0.510, 1.010, 1.510, 1.684 max_d=1.684 avg_d=1.010 std_dev=0.500
N3	B	0, 0.412, 0.958, 1.504, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.958 std_dev=0.546
O3'	B	0, 0.497, 1.099, 1.700, 1.911 max_d=1.911 avg_d=1.099 std_dev=0.601
P	A	0, 0.279, 0.891, 1.502, 1.991 max_d=1.991 avg_d=0.891 std_dev=0.611
N1	B	0, 0.450, 1.063, 1.677, 1.879 max_d=1.879 avg_d=1.063 std_dev=0.613
OP1	A	0, 0.336, 0.973, 1.610, 3.011 max_d=3.011 avg_d=0.973 std_dev=0.637
C2	B	0, 0.428, 1.089, 1.750, 1.974 max_d=1.974 avg_d=1.089 std_dev=0.661
C5'	B	0, 0.531, 1.227, 1.923, 2.305 max_d=2.305 avg_d=1.227 std_dev=0.696
O5'	B	0, 0.536, 1.380, 2.224, 3.279 max_d=3.279 avg_d=1.380 std_dev=0.844
N2	B	0, 0.458, 1.315, 2.173, 2.488 max_d=2.488 avg_d=1.315 std_dev=0.857
P	B	0, 0.771, 1.952, 3.134, 3.700 max_d=3.700 avg_d=1.952 std_dev=1.182
OP2	B	0, 0.850, 2.106, 3.361, 3.619 max_d=3.619 avg_d=2.106 std_dev=1.255
OP1	B	0, 0.842, 2.179, 3.515, 4.099 max_d=4.099 avg_d=2.179 std_dev=1.336
OP2	A	0, 0.495, 1.940, 3.385, 3.704 max_d=3.704 avg_d=1.940 std_dev=1.445

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.10	0.25	0.40	0.09
C2	0.03	0.00	0.12	0.08	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.12	0.02	0.15	0.28	0.75	0.15
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.03	0.07	0.05	0.10	0.12	0.06	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.38	0.54	0.16
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.09	0.04	0.07	0.17	0.05	0.09	0.10	0.16	0.08	0.02	0.01	0.01	0.09	0.53	0.58	0.20
C4	0.02	0.01	0.06	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.04	0.01	0.16	0.31	0.69	0.11
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.12	0.03	0.06	0.07	0.11	0.05	0.06	0.03	0.00	0.03	0.33	0.40	0.11
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.09	0.01	0.21	0.40	0.88	0.17
C5'	0.03	0.06	0.03	0.04	0.07	0.01	0.12	0.00	0.11	0.18	0.08	0.06	0.15	0.19	0.08	0.05	0.05	0.01	0.01	0.24	0.37	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.07	0.01	0.21	0.39	0.95	0.17
C8	0.02	0.02	0.05	0.17	0.01	0.12	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.18	0.03	0.25	0.48	0.77	0.22
N1	0.03	0.00	0.10	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.20	0.08	0.02	0.18	0.32	0.86	0.15
N3	0.03	0.00	0.12	0.09	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.12	0.03	0.14	0.27	0.66	0.14
N6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.13	0.11	0.02	0.25	0.45	1.10	0.23
N7	0.01	0.01	0.04	0.16	0.01	0.11	0.00	0.19	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.17	0.03	0.27	0.52	0.99	0.26
N9	0.01	0.01	0.01	0.08	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.16	0.33	0.58	0.10
O2'	0.02	0.22	0.00	0.02	0.12	0.06	0.10	0.05	0.15	0.02	0.20	0.21	0.13	0.04	0.04	0.00	0.05	0.06	0.07	0.48	0.56	0.18
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.04	0.03	0.09	0.05	0.07	0.18	0.08	0.12	0.11	0.17	0.07	0.05	0.00	0.02	0.14	0.82	0.69	0.26
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.11	0.24	0.26	0.09
O5'	0.10	0.15	0.09	0.09	0.16	0.03	0.21	0.01	0.21	0.25	0.18	0.14	0.25	0.27	0.16	0.07	0.14	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.25	0.28	0.38	0.53	0.31	0.33	0.40	0.24	0.39	0.48	0.32	0.27	0.45	0.52	0.33	0.48	0.82	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.40	0.75	0.54	0.58	0.69	0.40	0.88	0.37	0.95	0.77	0.86	0.66	1.10	0.99	0.58	0.56	0.69	0.26	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.15	0.16	0.20	0.11	0.11	0.17	0.01	0.17	0.22	0.15	0.14	0.23	0.26	0.10	0.18	0.26	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.41	0.48	0.19	0.18	0.49	0.27	0.54	0.29	0.56	0.51	0.53	0.45	0.46	0.55	0.47	0.19	0.27	0.48	0.31	0.59	0.16	0.34	0.34
C2	0.43	0.51	0.21	0.18	0.50	0.23	0.52	0.22	0.53	0.47	0.52	0.48	0.50	0.50	0.48	0.18	0.23	0.44	0.25	0.53	0.15	0.27	0.25
C2'	0.48	0.42	0.27	0.28	0.49	0.42	0.54	0.46	0.53	0.56	0.47	0.36	0.43	0.58	0.51	0.24	0.23	0.59	0.46	0.56	0.32	0.51	0.51
C3'	0.40	0.25	0.16	0.21	0.38	0.40	0.45	0.49	0.42	0.52	0.32	0.16	0.27	0.53	0.43	0.16	0.17	0.57	0.47	0.47	0.39	0.55	0.57
C4	0.39	0.49	0.16	0.16	0.49	0.22	0.54	0.24	0.56	0.49	0.54	0.46	0.47	0.53	0.46	0.20	0.30	0.45	0.26	0.58	0.13	0.31	0.30
C4'	0.39	0.32	0.15	0.17	0.41	0.34	0.48	0.40	0.47	0.51	0.39	0.24	0.32	0.54	0.44	0.18	0.22	0.53	0.40	0.52	0.28	0.46	0.48
C5	0.35	0.48	0.17	0.18	0.48	0.18	0.54	0.21	0.56	0.48	0.53	0.42	0.45	0.54	0.44	0.29	0.36	0.41	0.25	0.59	0.14	0.32	0.30
C5'	0.32	0.18	0.15	0.16	0.32	0.31	0.40	0.40	0.39	0.47	0.28	0.12	0.20	0.49	0.37	0.25	0.29	0.50	0.38	0.44	0.30	0.47	0.49
C6	0.35	0.49	0.17	0.18	0.49	0.16	0.53	0.19	0.55	0.47	0.53	0.43	0.47	0.52	0.45	0.32	0.36	0.38	0.23	0.57	0.14	0.30	0.27
C8	0.34	0.44	0.17	0.18	0.46	0.19	0.53	0.23	0.56	0.49	0.52	0.39	0.40	0.55	0.43	0.28	0.37	0.43	0.27	0.61	0.15	0.35	0.33
N1	0.40	0.50	0.16	0.15	0.50	0.18	0.52	0.18	0.53	0.47	0.52	0.46	0.50	0.50	0.47	0.22	0.28	0.39	0.22	0.54	0.13	0.26	0.24
N3	0.43	0.51	0.20	0.18	0.50	0.25	0.53	0.25	0.54	0.49	0.53	0.48	0.49	0.52	0.48	0.18	0.24	0.46	0.27	0.56	0.15	0.29	0.28
N6	0.29	0.47	0.25	0.24	0.48	0.17	0.54	0.20	0.56	0.46	0.53	0.37	0.45	0.53	0.42	0.44	0.42	0.33	0.24	0.58	0.18	0.33	0.29
N7	0.32	0.44	0.20	0.20	0.45	0.17	0.53	0.22	0.56	0.48	0.52	0.37	0.39	0.54	0.42	0.33	0.40	0.40	0.26	0.61	0.16	0.35	0.33
N9	0.38	0.48	0.16	0.17	0.48	0.23	0.54	0.25	0.56	0.50	0.53	0.44	0.45	0.54	0.46	0.21	0.31	0.46	0.28	0.59	0.14	0.33	0.32
O2'	0.57	0.52	0.41	0.42	0.57	0.52	0.60	0.53	0.59	0.61	0.55	0.48	0.53	0.62	0.58	0.39	0.36	0.65	0.53	0.61	0.39	0.54	0.56
O3'	0.41	0.20	0.21	0.29	0.35	0.48	0.42	0.58	0.38	0.52	0.27	0.13	0.23	0.52	0.43	0.17	0.21	0.60	0.55	0.42	0.51	0.64	0.66
O4'	0.39	0.45	0.17	0.17	0.47	0.26	0.53	0.30	0.56	0.51	0.51	0.40	0.42	0.55	0.46	0.20	0.31	0.49	0.31	0.60	0.16	0.36	0.36
O5'	0.28	0.17	0.24	0.21	0.27	0.29	0.36	0.39	0.34	0.43	0.23	0.24	0.18	0.46	0.32	0.36	0.37	0.47	0.36	0.41	0.30	0.47	0.49
OP1	0.41	0.58	0.37	0.32	0.51	0.37	0.58	0.47	0.62	0.57	0.60	0.67	0.52	0.63	0.49	0.43	0.37	0.52	0.52	0.67	0.49	0.70	0.65
OP2	0.83	1.18	0.96	0.86	0.95	0.76	0.95	0.79	1.01	0.89	1.12	1.39	1.06	0.91	0.88	0.97	0.91	0.80	0.79	1.00	0.84	0.80	0.85
P	0.29	0.17	0.15	0.11	0.23	0.36	0.34	0.52	0.28	0.50	0.14	0.39	0.12	0.50	0.34	0.28	0.23	0.55	0.50	0.35	0.52	0.64	0.67

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.02	0.10	0.13	0.07
C2	0.02	0.00	0.08	0.08	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.12	0.03	0.06	0.01	0.08	0.16	0.10
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.03	0.07	0.09	0.08	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.05	0.11	0.13	0.06
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.06	0.05	0.07	0.09	0.07	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.09	0.06	0.13	0.14	0.05
C4	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.08	0.17	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.12	0.09	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.10	0.19	0.12
C5'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.06	0.04	0.03	0.03	0.06	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.12	0.05	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.07	0.00	0.10	0.18	0.12
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.07	0.01	0.10	0.20	0.13
N1	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.07	0.01	0.09	0.17	0.11
N2	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.14	0.04	0.06	0.02	0.09	0.16	0.10
N3	0.02	0.00	0.08	0.07	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.03	0.06	0.01	0.09	0.16	0.10
N7	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.02	0.07	0.02	0.13	0.22	0.14
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.08	0.16	0.10
O2'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.02	0.08	0.11	0.09	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.04	0.06	0.14	0.12	0.04
O3'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.09	0.06	0.11	0.14	0.10	0.06	0.04	0.03	0.00	0.01	0.12	0.09	0.16	0.18	0.08
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.11	0.02	0.12	0.12	0.07
O5'	0.06	0.06	0.06	0.09	0.06	0.02	0.07	0.01	0.07	0.07	0.07	0.06	0.06	0.07	0.06	0.04	0.12	0.11	0.00	0.07	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.09	0.02	0.07	0.00	0.11	0.19	0.13
OP1	0.10	0.08	0.11	0.13	0.08	0.12	0.10	0.12	0.10	0.10	0.09	0.09	0.09	0.13	0.08	0.14	0.16	0.12	0.02	0.11	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.16	0.13	0.14	0.17	0.09	0.19	0.05	0.18	0.20	0.17	0.16	0.16	0.22	0.16	0.12	0.18	0.12	0.02	0.19	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.10	0.06	0.05	0.10	0.03	0.12	0.01	0.12	0.13	0.11	0.10	0.10	0.14	0.10	0.04	0.08	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00