Doublet Group distance statistics: 52957

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 3, 4, 2, 2, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.016, 0.024, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.011, 0.020, 0.030, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.020 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.011, 0.023, 0.034, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.022, 0.036, 0.049, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.036 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.020, 0.035, 0.049, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.035 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.009, 0.025, 0.040, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.025 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.019, 0.038, 0.056, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.038 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.048, 0.076, 0.104, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.076 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.045, 0.075, 0.106, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.075 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.046, 0.078, 0.110, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.078 std_dev=0.032
N2	B	0, 0.105, 0.255, 0.404, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.255 std_dev=0.150
N3	B	0, 0.103, 0.272, 0.441, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.272 std_dev=0.169
C2	B	0, 0.077, 0.279, 0.481, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.279 std_dev=0.202
O4'	A	0, 0.097, 0.299, 0.502, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.299 std_dev=0.202
C2'	A	0, 0.122, 0.334, 0.546, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.334 std_dev=0.212
C4	B	0, 0.080, 0.332, 0.584, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.332 std_dev=0.252
N9	B	0, 0.064, 0.366, 0.667, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.366 std_dev=0.301
C2'	B	0, 0.020, 0.337, 0.654, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.337 std_dev=0.317
C4'	A	0, 0.155, 0.473, 0.791, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.473 std_dev=0.318
N1	B	0, 0.050, 0.406, 0.762, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.406 std_dev=0.356
O5'	A	0, 0.317, 0.676, 1.035, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.676 std_dev=0.359
C5	B	0, 0.071, 0.439, 0.806, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.439 std_dev=0.368
C1'	B	0, 0.001, 0.370, 0.739, 1.730 max_d=1.730 avg_d=0.370 std_dev=0.369
C8	B	0, 0.081, 0.459, 0.836, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.459 std_dev=0.377
C3'	A	0, 0.143, 0.532, 0.920, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.532 std_dev=0.389
O2'	A	0, 0.113, 0.520, 0.927, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.520 std_dev=0.407
N7	B	0, 0.077, 0.514, 0.950, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.514 std_dev=0.437
C6	B	0, 0.040, 0.487, 0.934, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.487 std_dev=0.447
C3'	B	0, -0.062, 0.402, 0.866, 2.151 max_d=2.151 avg_d=0.402 std_dev=0.464
O3'	B	0, -0.074, 0.430, 0.934, 2.346 max_d=2.346 avg_d=0.430 std_dev=0.504
O4'	B	0, -0.056, 0.465, 0.985, 2.449 max_d=2.449 avg_d=0.465 std_dev=0.521
P	A	0, 0.071, 0.594, 1.116, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.594 std_dev=0.522
C5'	A	0, 0.282, 0.813, 1.344, 1.852 max_d=1.852 avg_d=0.813 std_dev=0.531
C4'	B	0, -0.129, 0.454, 1.038, 2.696 max_d=2.696 avg_d=0.454 std_dev=0.584
O6	B	0, -0.003, 0.597, 1.196, 2.289 max_d=2.289 avg_d=0.597 std_dev=0.600
O3'	A	0, 0.174, 0.841, 1.508, 2.692 max_d=2.692 avg_d=0.841 std_dev=0.667
O2'	B	0, -0.243, 0.433, 1.109, 3.096 max_d=3.096 avg_d=0.433 std_dev=0.676
O5'	B	0, -0.089, 0.598, 1.285, 3.204 max_d=3.204 avg_d=0.598 std_dev=0.687
C5'	B	0, -0.189, 0.527, 1.244, 3.281 max_d=3.281 avg_d=0.527 std_dev=0.716
OP1	A	0, 0.406, 1.166, 1.926, 2.377 max_d=2.377 avg_d=1.166 std_dev=0.760
OP2	A	0, 0.304, 1.147, 1.990, 2.781 max_d=2.781 avg_d=1.147 std_dev=0.843
OP2	B	0, -0.152, 0.709, 1.570, 4.009 max_d=4.009 avg_d=0.709 std_dev=0.861
P	B	0, -0.235, 0.638, 1.512, 4.015 max_d=4.015 avg_d=0.638 std_dev=0.873
OP1	B	0, -0.328, 0.660, 1.648, 4.526 max_d=4.526 avg_d=0.660 std_dev=0.988

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.18	0.01	0.25	0.25	0.25	0.12
C2	0.04	0.00	0.15	0.07	0.01	0.06	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.32	0.11	0.30	0.43	0.29	0.15
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.09	0.01	0.06	0.10	0.09	0.07	0.12	0.14	0.07	0.05	0.02	0.01	0.03	0.02	0.12	0.31	0.26	0.11
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.01	0.16	0.02	0.14	0.24	0.09	0.07	0.18	0.24	0.12	0.01	0.01	0.02	0.25	0.43	0.26	0.15
C4	0.02	0.01	0.09	0.08	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.21	0.17	0.06	0.28	0.42	0.29	0.17
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.10	0.15	0.07	0.05	0.12	0.15	0.08	0.15	0.02	0.01	0.02	0.34	0.24	0.08
C5	0.02	0.01	0.06	0.16	0.01	0.11	0.00	0.22	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.24	0.08	0.05	0.29	0.52	0.33	0.22
C5'	0.04	0.17	0.10	0.02	0.16	0.01	0.22	0.00	0.23	0.20	0.21	0.14	0.26	0.24	0.13	0.06	0.11	0.03	0.01	0.43	0.30	0.02
C6	0.03	0.01	0.09	0.14	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.26	0.12	0.06	0.30	0.55	0.34	0.22
C8	0.02	0.01	0.07	0.24	0.02	0.15	0.02	0.20	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.18	0.15	0.05	0.26	0.47	0.32	0.23
N1	0.03	0.00	0.12	0.09	0.01	0.07	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.23	0.09	0.30	0.51	0.32	0.20
N3	0.03	0.01	0.14	0.07	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.33	0.10	0.29	0.38	0.27	0.13
N6	0.03	0.01	0.07	0.18	0.02	0.12	0.02	0.26	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.27	0.08	0.06	0.30	0.62	0.37	0.26
N7	0.03	0.01	0.05	0.24	0.01	0.15	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.22	0.13	0.04	0.28	0.55	0.35	0.26
N9	0.01	0.01	0.02	0.12	0.00	0.08	0.01	0.13	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.14	0.08	0.03	0.26	0.37	0.28	0.16
O2'	0.02	0.27	0.01	0.01	0.21	0.15	0.24	0.06	0.26	0.18	0.28	0.24	0.27	0.22	0.14	0.00	0.05	0.12	0.14	0.47	0.46	0.24
O3'	0.18	0.32	0.03	0.01	0.17	0.02	0.08	0.11	0.12	0.15	0.23	0.33	0.08	0.13	0.08	0.05	0.00	0.11	0.51	0.64	0.49	0.38
O4'	0.01	0.11	0.02	0.02	0.06	0.01	0.05	0.03	0.06	0.05	0.09	0.10	0.06	0.04	0.03	0.12	0.11	0.00	0.37	0.29	0.28	0.15
O5'	0.25	0.30	0.12	0.25	0.28	0.02	0.29	0.01	0.30	0.26	0.30	0.29	0.30	0.28	0.26	0.14	0.51	0.37	0.00	0.04	0.03	0.01
OP1	0.25	0.43	0.31	0.43	0.42	0.34	0.52	0.43	0.55	0.47	0.51	0.38	0.62	0.55	0.37	0.47	0.64	0.29	0.04	0.00	0.02	0.01
OP2	0.25	0.29	0.26	0.26	0.29	0.24	0.33	0.30	0.34	0.32	0.32	0.27	0.37	0.35	0.28	0.46	0.49	0.28	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.15	0.11	0.15	0.17	0.08	0.22	0.02	0.22	0.23	0.20	0.13	0.26	0.26	0.16	0.24	0.38	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.13	0.16	0.30	0.16	0.53	0.17	0.60	0.16	0.21	0.14	0.14	0.13	0.20	0.19	0.52	0.46	0.51	0.53	0.17	0.64	0.51	0.60
C2	0.14	0.11	0.27	0.12	0.12	0.32	0.13	0.35	0.13	0.14	0.12	0.12	0.11	0.13	0.13	0.45	0.33	0.39	0.31	0.13	0.36	0.30	0.35
C2'	0.21	0.18	0.29	0.31	0.18	0.51	0.20	0.60	0.20	0.21	0.18	0.19	0.17	0.21	0.20	0.66	0.43	0.47	0.53	0.21	0.67	0.54	0.62
C3'	0.35	0.14	0.13	0.55	0.25	0.78	0.27	0.91	0.22	0.36	0.16	0.11	0.19	0.33	0.32	0.41	0.66	0.70	0.82	0.23	1.01	0.80	0.92
C4	0.17	0.11	0.21	0.20	0.13	0.43	0.13	0.47	0.12	0.16	0.11	0.12	0.11	0.14	0.15	0.46	0.42	0.46	0.40	0.13	0.47	0.37	0.45
C4'	0.34	0.15	0.09	0.52	0.24	0.73	0.24	0.83	0.20	0.33	0.16	0.14	0.19	0.30	0.30	0.37	0.64	0.66	0.74	0.20	0.89	0.71	0.82
C5	0.16	0.11	0.23	0.17	0.12	0.39	0.11	0.41	0.11	0.13	0.11	0.13	0.11	0.12	0.13	0.40	0.41	0.42	0.34	0.11	0.40	0.30	0.38
C5'	0.32	0.20	0.19	0.48	0.24	0.69	0.23	0.78	0.21	0.30	0.19	0.21	0.21	0.27	0.29	0.41	0.62	0.62	0.70	0.20	0.85	0.66	0.77
C6	0.15	0.12	0.26	0.14	0.12	0.31	0.12	0.33	0.12	0.12	0.12	0.13	0.12	0.12	0.13	0.35	0.36	0.37	0.26	0.11	0.31	0.22	0.29
C8	0.18	0.10	0.19	0.25	0.12	0.47	0.12	0.51	0.11	0.15	0.11	0.12	0.11	0.13	0.15	0.43	0.47	0.47	0.43	0.11	0.52	0.38	0.48
N1	0.14	0.10	0.28	0.13	0.11	0.28	0.11	0.29	0.10	0.12	0.10	0.12	0.11	0.11	0.12	0.37	0.32	0.34	0.24	0.10	0.28	0.22	0.27
N3	0.16	0.12	0.22	0.18	0.14	0.41	0.15	0.45	0.14	0.17	0.13	0.12	0.12	0.16	0.16	0.51	0.38	0.45	0.40	0.15	0.47	0.39	0.45
N6	0.15	0.15	0.27	0.15	0.14	0.28	0.15	0.28	0.16	0.14	0.16	0.16	0.14	0.14	0.14	0.30	0.35	0.33	0.22	0.16	0.25	0.17	0.24
N7	0.17	0.11	0.21	0.20	0.12	0.42	0.11	0.45	0.11	0.13	0.12	0.13	0.11	0.12	0.14	0.39	0.45	0.44	0.37	0.11	0.43	0.31	0.41
N9	0.19	0.11	0.18	0.26	0.13	0.49	0.14	0.53	0.13	0.17	0.11	0.12	0.12	0.16	0.16	0.47	0.46	0.49	0.46	0.13	0.55	0.43	0.52
O2'	0.32	0.39	0.36	0.38	0.36	0.53	0.40	0.63	0.44	0.37	0.43	0.39	0.35	0.40	0.34	0.73	0.42	0.54	0.60	0.47	0.71	0.65	0.70
O3'	0.74	0.48	0.50	0.98	0.64	1.21	0.66	1.36	0.60	0.78	0.51	0.37	0.55	0.74	0.72	0.25	1.05	1.10	1.27	0.61	1.48	1.27	1.39
O4'	0.30	0.17	0.17	0.41	0.22	0.61	0.22	0.67	0.19	0.28	0.17	0.17	0.20	0.25	0.27	0.44	0.56	0.58	0.60	0.18	0.70	0.57	0.66
O5'	0.52	0.35	0.32	0.68	0.43	0.83	0.43	0.89	0.39	0.50	0.36	0.30	0.40	0.47	0.48	0.32	0.82	0.77	0.83	0.39	0.93	0.78	0.87
OP1	0.45	0.52	0.36	0.52	0.47	0.61	0.46	0.63	0.48	0.44	0.51	0.56	0.49	0.44	0.45	0.42	0.63	0.60	0.61	0.48	0.65	0.60	0.63
OP2	0.31	0.35	0.28	0.43	0.33	0.54	0.35	0.60	0.37	0.34	0.37	0.35	0.33	0.35	0.32	0.47	0.51	0.49	0.56	0.39	0.66	0.54	0.61
P	0.35	0.23	0.09	0.47	0.28	0.63	0.27	0.68	0.25	0.33	0.22	0.21	0.26	0.30	0.32	0.28	0.60	0.60	0.63	0.24	0.71	0.58	0.67

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.17	0.01	0.11	0.03	0.12	0.16	0.13
C2	0.04	0.00	0.21	0.16	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.13	0.16	0.06	0.02	0.08	0.12	0.09
C2'	0.00	0.21	0.00	0.01	0.11	0.02	0.07	0.13	0.11	0.12	0.17	0.26	0.21	0.07	0.02	0.01	0.03	0.02	0.29	0.10	0.29	0.35	0.30
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.16	0.00	0.21	0.01	0.22	0.17	0.20	0.15	0.13	0.21	0.12	0.03	0.01	0.01	0.10	0.25	0.08	0.10	0.06
C4	0.02	0.01	0.11	0.16	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.08	0.06	0.02	0.07	0.12	0.08
C4'	0.00	0.06	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.06	0.14	0.04	0.10	0.07	0.13	0.06	0.15	0.01	0.00	0.02	0.09	0.06	0.06	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.21	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.08	0.03	0.11	0.01	0.10	0.14	0.09
C5'	0.04	0.07	0.13	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.07	0.13	0.05	0.11	0.08	0.14	0.04	0.06	0.11	0.01	0.01	0.11	0.06	0.05	0.02
C6	0.03	0.01	0.11	0.22	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.13	0.09	0.06	0.11	0.01	0.12	0.16	0.10
C8	0.01	0.01	0.12	0.17	0.01	0.14	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.09	0.10	0.12	0.02	0.09	0.13	0.09
N1	0.04	0.01	0.17	0.20	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.10	0.09	0.12	0.07	0.02	0.08	0.13	0.08
N2	0.05	0.01	0.26	0.15	0.01	0.10	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.21	0.18	0.20	0.08	0.04	0.10	0.12	0.11
N3	0.04	0.01	0.21	0.13	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.13	0.15	0.16	0.08	0.02	0.10	0.12	0.11
N7	0.01	0.01	0.07	0.21	0.01	0.13	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.11	0.06	0.16	0.02	0.14	0.16	0.13
N9	0.01	0.02	0.02	0.12	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.12	0.06	0.01	0.06	0.02	0.07	0.13	0.08
O2'	0.01	0.13	0.01	0.03	0.08	0.15	0.15	0.06	0.13	0.24	0.10	0.21	0.13	0.24	0.12	0.00	0.07	0.11	0.22	0.17	0.23	0.38	0.26
O3'	0.17	0.13	0.03	0.01	0.08	0.01	0.08	0.11	0.09	0.09	0.09	0.18	0.15	0.11	0.06	0.07	0.00	0.11	0.13	0.12	0.19	0.17	0.13
O4'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.10	0.12	0.20	0.16	0.06	0.01	0.11	0.11	0.00	0.07	0.04	0.06	0.07	0.05
O5'	0.11	0.06	0.29	0.10	0.06	0.02	0.11	0.01	0.11	0.12	0.07	0.08	0.08	0.16	0.06	0.22	0.13	0.07	0.00	0.16	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.10	0.25	0.02	0.09	0.01	0.11	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.17	0.12	0.04	0.16	0.00	0.17	0.21	0.15
OP1	0.12	0.08	0.29	0.08	0.07	0.06	0.10	0.06	0.12	0.09	0.08	0.10	0.10	0.14	0.07	0.23	0.19	0.06	0.02	0.17	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.12	0.35	0.10	0.12	0.06	0.14	0.05	0.16	0.13	0.13	0.12	0.12	0.16	0.13	0.38	0.17	0.07	0.02	0.21	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.09	0.30	0.06	0.08	0.02	0.09	0.02	0.10	0.09	0.08	0.11	0.11	0.13	0.08	0.26	0.13	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00