Doublet Group distance statistics: 52958

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.012, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.022 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.017, 0.030, 0.044, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.030 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.011, 0.027, 0.042, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.013, 0.030, 0.047, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.030 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C2	A	0, -0.001, 0.017, 0.035, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.017 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.013, 0.036, 0.059, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.036 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.022, 0.048, 0.074, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.048 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.014, 0.042, 0.070, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.042 std_dev=0.028
C2'	A	0, 0.079, 0.141, 0.203, 0.249 max_d=0.249 avg_d=0.141 std_dev=0.062
O4'	A	0, 0.051, 0.121, 0.191, 0.236 max_d=0.236 avg_d=0.121 std_dev=0.070
O2'	A	0, 0.136, 0.246, 0.357, 0.362 max_d=0.362 avg_d=0.246 std_dev=0.110
C3'	A	0, 0.092, 0.251, 0.410, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.251 std_dev=0.159
O3'	A	0, 0.152, 0.335, 0.518, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.335 std_dev=0.183
C4'	A	0, 0.031, 0.241, 0.450, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.241 std_dev=0.210
N2	B	0, 0.309, 0.558, 0.807, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.558 std_dev=0.249
N3	B	0, 0.228, 0.553, 0.879, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.553 std_dev=0.325
C1'	B	0, 0.405, 0.746, 1.086, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.746 std_dev=0.341
C2'	B	0, 0.484, 0.827, 1.170, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.827 std_dev=0.343
O2'	B	0, 0.471, 0.821, 1.170, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.821 std_dev=0.350
C5'	A	0, 0.056, 0.469, 0.882, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.469 std_dev=0.413
C2	B	0, 0.200, 0.617, 1.033, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.617 std_dev=0.416
C4'	B	0, 0.482, 0.907, 1.331, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.907 std_dev=0.425
O5'	A	0, 0.353, 0.786, 1.218, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.786 std_dev=0.432
O4'	B	0, 0.413, 0.901, 1.388, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.901 std_dev=0.487
C3'	B	0, 0.491, 0.983, 1.475, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.983 std_dev=0.492
O3'	B	0, 0.497, 1.091, 1.685, 2.070 max_d=2.070 avg_d=1.091 std_dev=0.594
C4	B	0, 0.202, 0.812, 1.422, 1.988 max_d=1.988 avg_d=0.812 std_dev=0.610
N9	B	0, 0.291, 0.906, 1.521, 2.066 max_d=2.066 avg_d=0.906 std_dev=0.615
P	A	0, 0.192, 0.828, 1.464, 2.049 max_d=2.049 avg_d=0.828 std_dev=0.636
C5'	B	0, 0.427, 1.116, 1.805, 2.266 max_d=2.266 avg_d=1.116 std_dev=0.689
N1	B	0, 0.096, 0.888, 1.681, 2.388 max_d=2.388 avg_d=0.888 std_dev=0.793
OP2	A	0, 1.259, 2.216, 3.172, 2.953 max_d=2.953 avg_d=2.216 std_dev=0.957
O5'	B	0, 0.340, 1.302, 2.264, 3.143 max_d=3.143 avg_d=1.302 std_dev=0.962
C8	B	0, 0.277, 1.274, 2.271, 3.228 max_d=3.228 avg_d=1.274 std_dev=0.997
C5	B	0, 0.136, 1.143, 2.150, 3.129 max_d=3.129 avg_d=1.143 std_dev=1.007
C6	B	0, 0.056, 1.184, 2.312, 3.390 max_d=3.390 avg_d=1.184 std_dev=1.128
OP1	A	0, 0.997, 2.156, 3.315, 3.712 max_d=3.712 avg_d=2.156 std_dev=1.159
N7	B	0, 0.195, 1.438, 2.681, 3.900 max_d=3.900 avg_d=1.438 std_dev=1.243
OP1	B	0, 0.713, 1.958, 3.204, 4.327 max_d=4.327 avg_d=1.958 std_dev=1.246
P	B	0, 0.466, 1.738, 3.010, 4.186 max_d=4.186 avg_d=1.738 std_dev=1.272
O6	B	0, 0.029, 1.493, 2.957, 4.362 max_d=4.362 avg_d=1.493 std_dev=1.464
OP2	B	0, 0.363, 1.902, 3.442, 4.859 max_d=4.859 avg_d=1.902 std_dev=1.540

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.09	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.21	0.27	0.56	0.21
C2	0.05	0.00	0.11	0.16	0.02	0.12	0.02	0.27	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.17	0.16	0.04	0.13	0.36	0.88	0.17
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.04	0.07	0.03	0.09	0.11	0.06	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.16	0.14	0.47	0.17
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.11	0.01	0.13	0.04	0.16	0.11	0.16	0.13	0.17	0.13	0.07	0.02	0.01	0.01	0.28	0.18	0.43	0.22
C4	0.02	0.02	0.06	0.11	0.00	0.10	0.01	0.27	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.02	0.12	0.41	0.86	0.21
C4'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.15	0.14	0.13	0.10	0.18	0.16	0.09	0.06	0.02	0.00	0.03	0.08	0.26	0.06
C5	0.02	0.02	0.05	0.13	0.01	0.14	0.00	0.35	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.02	0.12	0.52	0.99	0.22
C5'	0.09	0.27	0.04	0.04	0.27	0.01	0.35	0.00	0.36	0.33	0.32	0.23	0.41	0.38	0.24	0.05	0.08	0.03	0.02	0.11	0.12	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.16	0.01	0.15	0.01	0.36	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.10	0.14	0.02	0.11	0.52	1.01	0.17
C8	0.02	0.02	0.03	0.11	0.01	0.14	0.01	0.33	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.11	0.03	0.25	0.57	0.95	0.32
N1	0.04	0.01	0.09	0.16	0.01	0.13	0.01	0.32	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.14	0.15	0.03	0.11	0.44	0.95	0.16
N3	0.05	0.01	0.11	0.13	0.01	0.10	0.01	0.23	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.14	0.04	0.13	0.33	0.81	0.19
N6	0.03	0.01	0.06	0.17	0.01	0.18	0.01	0.41	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.16	0.03	0.13	0.58	1.07	0.15
N7	0.01	0.02	0.03	0.13	0.01	0.16	0.01	0.38	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02	0.13	0.02	0.18	0.63	1.08	0.29
N9	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.24	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.18	0.41	0.78	0.24
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.09	0.06	0.07	0.05	0.10	0.02	0.14	0.17	0.09	0.02	0.03	0.00	0.06	0.09	0.12	0.15	0.42	0.13
O3'	0.02	0.16	0.03	0.01	0.09	0.02	0.12	0.08	0.14	0.11	0.15	0.14	0.16	0.13	0.06	0.06	0.00	0.04	0.41	0.37	0.56	0.32
O4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.09	0.04	0.00	0.32	0.26	0.44	0.24
O5'	0.21	0.13	0.16	0.28	0.12	0.03	0.12	0.02	0.11	0.25	0.11	0.13	0.13	0.18	0.18	0.12	0.41	0.32	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.27	0.36	0.14	0.18	0.41	0.08	0.52	0.11	0.52	0.57	0.44	0.33	0.58	0.63	0.41	0.15	0.37	0.26	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.56	0.88	0.47	0.43	0.86	0.26	0.99	0.12	1.01	0.95	0.95	0.81	1.07	1.08	0.78	0.42	0.56	0.44	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.17	0.17	0.22	0.21	0.06	0.22	0.02	0.17	0.32	0.16	0.19	0.15	0.29	0.24	0.13	0.32	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.19	0.22	0.19	0.17	0.22	0.18	0.26	0.16	0.25	0.18	0.27	0.16	0.22	0.23	0.21	0.35	0.44	0.20	0.17	0.24	0.21	0.25
C2	0.26	0.27	0.23	0.18	0.20	0.23	0.20	0.26	0.22	0.23	0.26	0.33	0.22	0.21	0.22	0.23	0.30	0.43	0.19	0.22	0.23	0.19	0.22
C2'	0.26	0.23	0.26	0.20	0.21	0.22	0.23	0.28	0.22	0.30	0.22	0.31	0.20	0.28	0.25	0.29	0.39	0.46	0.23	0.22	0.27	0.25	0.29
C3'	0.31	0.27	0.21	0.16	0.30	0.27	0.35	0.36	0.33	0.41	0.29	0.32	0.26	0.41	0.34	0.28	0.34	0.51	0.32	0.36	0.37	0.36	0.39
C4	0.28	0.20	0.19	0.15	0.18	0.25	0.18	0.29	0.17	0.26	0.19	0.30	0.17	0.23	0.24	0.20	0.28	0.45	0.23	0.17	0.27	0.23	0.26
C4'	0.31	0.28	0.19	0.16	0.30	0.26	0.34	0.34	0.33	0.39	0.30	0.33	0.27	0.38	0.33	0.23	0.33	0.50	0.29	0.35	0.34	0.32	0.35
C5	0.30	0.20	0.17	0.14	0.21	0.28	0.23	0.32	0.20	0.31	0.19	0.29	0.18	0.28	0.28	0.21	0.23	0.45	0.28	0.20	0.31	0.28	0.31
C5'	0.48	0.52	0.35	0.33	0.53	0.42	0.58	0.49	0.58	0.59	0.55	0.53	0.50	0.61	0.53	0.35	0.40	0.62	0.47	0.61	0.49	0.50	0.51
C6	0.30	0.22	0.18	0.16	0.21	0.29	0.23	0.32	0.20	0.30	0.20	0.32	0.19	0.27	0.27	0.24	0.23	0.44	0.28	0.20	0.31	0.28	0.30
C8	0.30	0.20	0.16	0.14	0.23	0.27	0.25	0.32	0.23	0.33	0.20	0.27	0.18	0.31	0.28	0.20	0.26	0.46	0.28	0.24	0.32	0.29	0.32
N1	0.28	0.26	0.19	0.14	0.19	0.26	0.20	0.29	0.20	0.25	0.24	0.34	0.22	0.22	0.23	0.24	0.23	0.43	0.23	0.20	0.26	0.22	0.24
N3	0.26	0.23	0.23	0.19	0.18	0.23	0.18	0.26	0.19	0.23	0.23	0.31	0.19	0.20	0.22	0.22	0.33	0.44	0.19	0.19	0.23	0.19	0.23
N6	0.33	0.23	0.24	0.24	0.28	0.32	0.30	0.35	0.26	0.36	0.24	0.32	0.21	0.35	0.33	0.30	0.27	0.42	0.34	0.27	0.35	0.33	0.34
N7	0.32	0.21	0.17	0.15	0.26	0.30	0.29	0.35	0.26	0.36	0.23	0.28	0.20	0.35	0.31	0.22	0.23	0.46	0.32	0.28	0.34	0.33	0.35
N9	0.28	0.19	0.18	0.15	0.18	0.25	0.19	0.29	0.17	0.27	0.18	0.28	0.16	0.24	0.24	0.20	0.30	0.45	0.23	0.17	0.27	0.24	0.27
O2'	0.31	0.27	0.38	0.35	0.25	0.27	0.25	0.30	0.25	0.31	0.26	0.33	0.25	0.28	0.29	0.38	0.51	0.47	0.27	0.25	0.28	0.29	0.30
O3'	0.29	0.25	0.22	0.16	0.29	0.26	0.34	0.36	0.33	0.42	0.28	0.31	0.24	0.42	0.33	0.32	0.37	0.51	0.33	0.36	0.39	0.39	0.42
O4'	0.27	0.17	0.19	0.17	0.18	0.23	0.20	0.28	0.17	0.28	0.17	0.24	0.15	0.25	0.24	0.20	0.34	0.45	0.22	0.18	0.26	0.23	0.27
O5'	0.38	0.30	0.19	0.15	0.33	0.40	0.40	0.53	0.38	0.51	0.33	0.41	0.26	0.50	0.40	0.25	0.25	0.63	0.49	0.42	0.56	0.53	0.58
OP1	0.69	0.84	0.53	0.48	0.82	0.57	0.91	0.65	0.95	0.87	0.91	0.83	0.78	0.94	0.79	0.49	0.42	0.78	0.69	1.02	0.69	0.80	0.75
OP2	0.76	1.00	1.01	0.93	0.80	0.74	0.74	0.70	0.77	0.69	0.89	1.20	0.93	0.68	0.74	1.06	1.04	0.67	0.75	0.72	0.76	0.72	0.74
P	0.35	0.21	0.28	0.20	0.28	0.36	0.37	0.50	0.32	0.49	0.23	0.36	0.19	0.49	0.37	0.36	0.30	0.57	0.49	0.39	0.57	0.56	0.59

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.03	0.08	0.09	0.09
C2	0.05	0.00	0.20	0.20	0.01	0.08	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.20	0.28	0.04	0.11	0.02	0.13	0.16	0.13
C2'	0.00	0.20	0.00	0.01	0.12	0.02	0.11	0.02	0.14	0.03	0.18	0.21	0.18	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01	0.07	0.13	0.09	0.13	0.08
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.14	0.00	0.14	0.02	0.17	0.11	0.20	0.22	0.18	0.12	0.08	0.02	0.01	0.02	0.10	0.17	0.11	0.14	0.10
C4	0.03	0.01	0.12	0.14	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.18	0.03	0.11	0.02	0.12	0.14	0.12
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.08	0.10	0.08	0.09	0.05	0.08	0.03	0.00	0.02	0.08	0.06	0.05	0.04
C5	0.02	0.01	0.11	0.14	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.10	0.19	0.03	0.13	0.02	0.15	0.18	0.16
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.14	0.10	0.08	0.07	0.15	0.08	0.08	0.03	0.02	0.01	0.14	0.07	0.03	0.02
C6	0.03	0.01	0.14	0.17	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.14	0.24	0.03	0.14	0.01	0.16	0.20	0.17
C8	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.09	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.03	0.14	0.03	0.15	0.15	0.15
N1	0.04	0.01	0.18	0.20	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.18	0.28	0.03	0.13	0.02	0.15	0.18	0.15
N2	0.06	0.01	0.21	0.22	0.02	0.10	0.01	0.08	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.23	0.32	0.05	0.11	0.04	0.13	0.15	0.12
N3	0.05	0.01	0.18	0.18	0.01	0.08	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.18	0.24	0.04	0.11	0.02	0.12	0.14	0.11
N7	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.09	0.00	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.16	0.03	0.16	0.03	0.17	0.20	0.18
N9	0.01	0.02	0.04	0.08	0.01	0.05	0.02	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.08	0.02	0.10	0.03	0.11	0.12	0.11
O2'	0.02	0.20	0.00	0.02	0.11	0.08	0.10	0.08	0.14	0.02	0.18	0.23	0.18	0.05	0.03	0.00	0.04	0.07	0.05	0.13	0.05	0.09	0.06
O3'	0.02	0.28	0.02	0.01	0.18	0.03	0.19	0.03	0.24	0.12	0.28	0.32	0.24	0.16	0.08	0.04	0.00	0.01	0.14	0.25	0.17	0.16	0.14
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.02	0.07	0.01	0.00	0.11	0.04	0.13	0.11	0.13
O5'	0.06	0.11	0.07	0.10	0.11	0.02	0.13	0.01	0.14	0.14	0.13	0.11	0.11	0.16	0.10	0.05	0.14	0.11	0.00	0.15	0.02	0.03	0.01
O6	0.03	0.02	0.13	0.17	0.02	0.08	0.02	0.14	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.13	0.25	0.04	0.15	0.00	0.19	0.24	0.20
OP1	0.08	0.13	0.09	0.11	0.12	0.06	0.15	0.07	0.16	0.15	0.15	0.13	0.12	0.17	0.11	0.05	0.17	0.13	0.02	0.19	0.00	0.02	0.01
OP2	0.09	0.16	0.13	0.14	0.14	0.05	0.18	0.03	0.20	0.15	0.18	0.15	0.14	0.20	0.12	0.09	0.16	0.11	0.03	0.24	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.13	0.08	0.10	0.12	0.04	0.16	0.02	0.17	0.15	0.15	0.12	0.11	0.18	0.11	0.06	0.14	0.13	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00