Doublet Group distance statistics: 52959

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.016, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.014, 0.026, 0.037, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.026 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.020, 0.041, 0.061, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.041 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.016, 0.038, 0.059, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.038 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.028, 0.052, 0.077, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.052 std_dev=0.025
C2	A	0, 0.026, 0.051, 0.076, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.051 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.019, 0.046, 0.073, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.046 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.018, 0.046, 0.074, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.046 std_dev=0.028
N6	A	0, 0.033, 0.065, 0.097, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.065 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.034, 0.068, 0.103, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.068 std_dev=0.035
C1'	A	0, 0.034, 0.070, 0.107, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.070 std_dev=0.037
C2'	A	0, 0.257, 0.462, 0.667, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.462 std_dev=0.205
O2'	A	0, 0.102, 0.352, 0.603, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.352 std_dev=0.251
O4'	A	0, 0.282, 0.554, 0.826, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.554 std_dev=0.272
C3'	A	0, 0.515, 0.931, 1.347, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.931 std_dev=0.416
N9	B	0, 0.658, 1.130, 1.601, 1.599 max_d=1.599 avg_d=1.130 std_dev=0.472
C8	B	0, 0.667, 1.146, 1.626, 1.617 max_d=1.617 avg_d=1.146 std_dev=0.479
C4'	A	0, 0.435, 0.925, 1.416, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.925 std_dev=0.491
C2'	B	0, 0.641, 1.149, 1.658, 1.827 max_d=1.827 avg_d=1.149 std_dev=0.509
C4	B	0, 0.451, 0.959, 1.468, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.959 std_dev=0.509
N7	B	0, 0.645, 1.157, 1.668, 1.615 max_d=1.615 avg_d=1.157 std_dev=0.511
N3	B	0, 0.400, 0.929, 1.458, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.929 std_dev=0.529
N2	B	0, 0.479, 1.033, 1.588, 1.619 max_d=1.619 avg_d=1.033 std_dev=0.554
C5	B	0, 0.525, 1.080, 1.635, 1.693 max_d=1.693 avg_d=1.080 std_dev=0.555
C1'	B	0, 0.861, 1.464, 2.067, 2.032 max_d=2.032 avg_d=1.464 std_dev=0.603
C2	B	0, 0.360, 0.966, 1.571, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.966 std_dev=0.605
O5'	A	0, 0.613, 1.231, 1.849, 2.403 max_d=2.403 avg_d=1.231 std_dev=0.618
O3'	A	0, 0.904, 1.538, 2.171, 2.117 max_d=2.117 avg_d=1.538 std_dev=0.634
C6	B	0, 0.601, 1.304, 2.007, 2.149 max_d=2.149 avg_d=1.304 std_dev=0.703
N1	B	0, 0.452, 1.202, 1.951, 2.061 max_d=2.061 avg_d=1.202 std_dev=0.749
C3'	B	0, 1.083, 1.838, 2.594, 2.385 max_d=2.385 avg_d=1.838 std_dev=0.756
C5'	A	0, 0.624, 1.384, 2.145, 2.079 max_d=2.079 avg_d=1.384 std_dev=0.761
O4'	B	0, 1.152, 1.938, 2.724, 2.559 max_d=2.559 avg_d=1.938 std_dev=0.786
P	A	0, 1.098, 1.912, 2.727, 3.107 max_d=3.107 avg_d=1.912 std_dev=0.815
O6	B	0, 0.824, 1.656, 2.489, 2.618 max_d=2.618 avg_d=1.656 std_dev=0.832
C4'	B	0, 1.220, 2.055, 2.889, 2.658 max_d=2.658 avg_d=2.055 std_dev=0.834
O5'	B	0, 1.184, 2.040, 2.896, 2.740 max_d=2.740 avg_d=2.040 std_dev=0.856
OP2	B	0, 1.298, 2.169, 3.040, 2.850 max_d=2.850 avg_d=2.169 std_dev=0.871
C5'	B	0, 1.319, 2.198, 3.076, 2.805 max_d=2.805 avg_d=2.198 std_dev=0.878
P	B	0, 1.255, 2.161, 3.066, 2.979 max_d=2.979 avg_d=2.161 std_dev=0.905
OP1	A	0, 1.548, 2.529, 3.510, 3.318 max_d=3.318 avg_d=2.529 std_dev=0.981
OP1	B	0, 1.331, 2.336, 3.340, 3.301 max_d=3.301 avg_d=2.336 std_dev=1.005
O3'	B	0, 1.601, 2.738, 3.875, 3.626 max_d=3.626 avg_d=2.738 std_dev=1.137
O2'	B	0, 1.589, 2.727, 3.864, 3.573 max_d=3.573 avg_d=2.727 std_dev=1.137
OP2	A	0, 1.943, 3.152, 4.361, 3.951 max_d=3.951 avg_d=3.152 std_dev=1.209

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.04	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.79	0.15	0.30
C2	0.04	0.00	0.10	0.04	0.00	0.12	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.03	0.14	0.59	0.53	0.13	0.11
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.08	0.08	0.11	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.12	0.67	0.19	0.24
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.06	0.11	0.04	0.04	0.09	0.11	0.04	0.01	0.01	0.02	0.12	0.45	0.31	0.15
C4	0.03	0.00	0.05	0.03	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.03	0.06	0.40	0.66	0.11	0.12
C4'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.08	0.17	0.09	0.12	0.10	0.15	0.07	0.02	0.02	0.00	0.03	0.49	0.12	0.24
C5	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.09	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.35	0.64	0.18	0.17
C5'	0.04	0.23	0.03	0.01	0.16	0.01	0.22	0.00	0.22	0.31	0.22	0.21	0.25	0.31	0.15	0.02	0.05	0.01	0.02	0.09	0.28	0.02
C6	0.03	0.01	0.05	0.06	0.01	0.08	0.01	0.22	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.07	0.05	0.43	0.57	0.20	0.14
C8	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.17	0.01	0.31	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.10	0.12	0.10	0.15	0.72	0.20	0.30
N1	0.04	0.00	0.08	0.04	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.14	0.03	0.09	0.54	0.52	0.17	0.13
N3	0.05	0.00	0.11	0.04	0.00	0.12	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.04	0.14	0.54	0.60	0.10	0.07
N6	0.03	0.01	0.05	0.09	0.02	0.10	0.01	0.25	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.10	0.04	0.39	0.56	0.24	0.18
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.15	0.01	0.31	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.08	0.13	0.08	0.21	0.67	0.23	0.26
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.24	0.73	0.12	0.23
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.09	0.02	0.06	0.02	0.09	0.10	0.14	0.18	0.08	0.08	0.03	0.00	0.06	0.05	0.05	0.78	0.15	0.34
O3'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.08	0.05	0.07	0.12	0.03	0.04	0.10	0.13	0.04	0.06	0.00	0.02	0.13	0.36	0.36	0.13
O4'	0.00	0.14	0.01	0.02	0.06	0.00	0.02	0.01	0.05	0.10	0.09	0.14	0.04	0.08	0.02	0.05	0.02	0.00	0.17	0.76	0.18	0.34
O5'	0.18	0.59	0.12	0.12	0.40	0.03	0.35	0.02	0.43	0.15	0.54	0.54	0.39	0.21	0.24	0.05	0.13	0.17	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.79	0.53	0.67	0.45	0.66	0.49	0.64	0.09	0.57	0.72	0.52	0.60	0.56	0.67	0.73	0.78	0.36	0.76	0.02	0.00	0.04	0.00
OP2	0.15	0.13	0.19	0.31	0.11	0.12	0.18	0.28	0.20	0.20	0.17	0.10	0.24	0.23	0.12	0.15	0.36	0.18	0.02	0.04	0.00	0.00
P	0.30	0.11	0.24	0.15	0.12	0.24	0.17	0.02	0.14	0.30	0.13	0.07	0.18	0.26	0.23	0.34	0.13	0.34	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.25	0.59	0.27	0.20	0.40	0.21	0.46	0.24	0.21	0.26	0.30	0.21	0.20	0.20	1.04	0.53	0.36	0.39	0.25	0.43	0.34	0.43
C2	0.25	0.08	0.60	0.18	0.13	0.36	0.13	0.46	0.11	0.19	0.09	0.10	0.09	0.16	0.18	1.24	0.40	0.30	0.35	0.11	0.43	0.35	0.43
C2'	0.24	0.26	0.62	0.27	0.22	0.42	0.23	0.48	0.26	0.23	0.27	0.29	0.22	0.23	0.22	1.05	0.51	0.39	0.39	0.28	0.44	0.36	0.45
C3'	0.25	0.24	0.69	0.26	0.21	0.30	0.22	0.33	0.24	0.26	0.25	0.30	0.19	0.25	0.23	1.05	0.40	0.30	0.28	0.26	0.31	0.29	0.31
C4	0.22	0.18	0.60	0.23	0.17	0.38	0.17	0.44	0.18	0.19	0.19	0.21	0.16	0.18	0.19	1.09	0.52	0.35	0.35	0.19	0.40	0.34	0.40
C4'	0.19	0.25	0.64	0.21	0.17	0.25	0.19	0.27	0.22	0.23	0.25	0.35	0.18	0.21	0.19	1.00	0.36	0.25	0.25	0.24	0.27	0.24	0.26
C5	0.22	0.20	0.56	0.23	0.19	0.38	0.20	0.43	0.21	0.20	0.21	0.21	0.18	0.20	0.20	0.93	0.56	0.37	0.33	0.22	0.38	0.34	0.38
C5'	0.21	0.29	0.64	0.25	0.16	0.21	0.17	0.22	0.20	0.25	0.26	0.43	0.21	0.23	0.20	0.92	0.30	0.23	0.21	0.21	0.29	0.29	0.21
C6	0.22	0.10	0.54	0.23	0.14	0.39	0.14	0.44	0.13	0.17	0.12	0.10	0.10	0.16	0.17	0.91	0.55	0.38	0.34	0.14	0.39	0.36	0.39
C8	0.23	0.31	0.56	0.25	0.25	0.39	0.27	0.42	0.30	0.23	0.32	0.35	0.26	0.25	0.23	0.86	0.59	0.38	0.34	0.32	0.37	0.33	0.38
N1	0.24	0.09	0.56	0.19	0.11	0.37	0.11	0.46	0.10	0.15	0.10	0.11	0.09	0.13	0.16	1.10	0.47	0.32	0.34	0.10	0.41	0.36	0.41
N3	0.24	0.12	0.62	0.21	0.14	0.36	0.14	0.45	0.12	0.20	0.12	0.15	0.11	0.17	0.19	1.22	0.44	0.32	0.36	0.13	0.43	0.34	0.42
N6	0.26	0.07	0.46	0.27	0.18	0.41	0.18	0.44	0.15	0.23	0.11	0.12	0.11	0.21	0.23	0.64	0.58	0.42	0.35	0.15	0.40	0.39	0.40
N7	0.23	0.30	0.53	0.24	0.26	0.38	0.27	0.41	0.30	0.24	0.31	0.32	0.26	0.26	0.24	0.78	0.60	0.39	0.33	0.31	0.36	0.34	0.37
N9	0.22	0.25	0.59	0.25	0.20	0.39	0.21	0.44	0.24	0.21	0.26	0.29	0.21	0.21	0.20	1.01	0.55	0.36	0.36	0.25	0.40	0.33	0.40
O2'	0.23	0.26	0.58	0.31	0.22	0.48	0.23	0.57	0.26	0.22	0.28	0.29	0.22	0.23	0.22	1.04	0.56	0.42	0.47	0.28	0.53	0.43	0.54
O3'	0.26	0.24	0.71	0.26	0.23	0.30	0.25	0.33	0.26	0.29	0.25	0.27	0.21	0.28	0.26	1.06	0.37	0.30	0.28	0.29	0.30	0.30	0.30
O4'	0.24	0.28	0.64	0.24	0.22	0.29	0.24	0.32	0.27	0.26	0.29	0.35	0.23	0.25	0.23	1.06	0.42	0.28	0.29	0.28	0.30	0.27	0.31
O5'	0.59	0.34	1.07	0.65	0.51	0.52	0.57	0.55	0.52	0.71	0.41	0.28	0.38	0.68	0.62	1.32	0.46	0.46	0.45	0.56	0.51	0.71	0.49
OP1	0.31	0.52	0.24	0.31	0.30	0.47	0.23	0.44	0.31	0.11	0.44	0.69	0.47	0.13	0.21	0.49	0.49	0.51	0.49	0.30	0.46	0.24	0.43
OP2	0.20	0.36	0.59	0.29	0.34	0.26	0.46	0.29	0.52	0.45	0.47	0.36	0.26	0.52	0.33	0.69	0.37	0.20	0.24	0.61	0.30	0.40	0.24
P	0.19	0.25	0.63	0.31	0.20	0.26	0.31	0.29	0.32	0.39	0.29	0.37	0.15	0.40	0.26	0.82	0.33	0.20	0.21	0.39	0.29	0.42	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.25	0.01	0.12	0.01	0.14	0.19	0.16
C2	0.03	0.00	0.25	0.16	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.30	0.14	0.12	0.03	0.11	0.17	0.12
C2'	0.01	0.25	0.00	0.01	0.15	0.03	0.09	0.21	0.13	0.10	0.20	0.29	0.24	0.06	0.05	0.00	0.03	0.02	0.51	0.10	0.50	0.50	0.52
C3'	0.02	0.16	0.01	0.00	0.23	0.01	0.33	0.01	0.32	0.38	0.25	0.11	0.13	0.40	0.24	0.02	0.01	0.04	0.21	0.36	0.23	0.08	0.15
C4	0.01	0.01	0.15	0.23	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.14	0.06	0.14	0.02	0.12	0.15	0.12
C4'	0.01	0.06	0.03	0.01	0.05	0.00	0.15	0.01	0.12	0.29	0.04	0.14	0.08	0.27	0.12	0.18	0.05	0.01	0.04	0.16	0.12	0.08	0.05
C5	0.01	0.01	0.09	0.33	0.00	0.15	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.25	0.07	0.04	0.28	0.01	0.26	0.25	0.27
C5'	0.06	0.06	0.21	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.19	0.32	0.09	0.12	0.07	0.33	0.11	0.04	0.21	0.01	0.01	0.24	0.13	0.14	0.03
C6	0.01	0.01	0.13	0.32	0.01	0.12	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.21	0.07	0.03	0.29	0.01	0.30	0.30	0.30
C8	0.01	0.01	0.10	0.38	0.01	0.29	0.01	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.35	0.21	0.16	0.30	0.02	0.25	0.18	0.23
N1	0.02	0.01	0.20	0.25	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.18	0.08	0.21	0.03	0.21	0.24	0.22
N2	0.03	0.00	0.29	0.11	0.01	0.14	0.01	0.12	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.42	0.19	0.08	0.04	0.08	0.16	0.10
N3	0.03	0.01	0.24	0.13	0.01	0.08	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.33	0.15	0.07	0.03	0.07	0.14	0.08
N7	0.01	0.01	0.06	0.40	0.00	0.27	0.00	0.33	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.36	0.21	0.13	0.37	0.03	0.35	0.30	0.35
N9	0.01	0.01	0.05	0.24	0.00	0.12	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.18	0.06	0.04	0.11	0.01	0.09	0.12	0.08
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.12	0.18	0.25	0.04	0.21	0.35	0.09	0.14	0.07	0.36	0.18	0.00	0.04	0.12	0.43	0.28	0.45	0.59	0.50
O3'	0.25	0.30	0.03	0.01	0.14	0.05	0.07	0.21	0.07	0.21	0.18	0.42	0.33	0.21	0.06	0.04	0.00	0.13	0.07	0.09	0.23	0.29	0.11
O4'	0.01	0.14	0.02	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.03	0.16	0.08	0.19	0.15	0.13	0.04	0.12	0.13	0.00	0.10	0.04	0.11	0.09	0.04
O5'	0.12	0.12	0.51	0.21	0.14	0.04	0.28	0.01	0.29	0.30	0.21	0.08	0.07	0.37	0.11	0.43	0.07	0.10	0.00	0.35	0.02	0.03	0.02
O6	0.01	0.03	0.10	0.36	0.02	0.16	0.01	0.24	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.28	0.09	0.04	0.35	0.00	0.37	0.36	0.38
OP1	0.14	0.11	0.50	0.23	0.12	0.12	0.26	0.13	0.30	0.25	0.21	0.08	0.07	0.35	0.09	0.45	0.23	0.11	0.02	0.37	0.00	0.05	0.00
OP2	0.19	0.17	0.50	0.08	0.15	0.08	0.25	0.14	0.30	0.18	0.24	0.16	0.14	0.30	0.12	0.59	0.29	0.09	0.03	0.36	0.05	0.00	0.01
P	0.16	0.12	0.52	0.15	0.12	0.05	0.27	0.03	0.30	0.23	0.22	0.10	0.08	0.35	0.08	0.50	0.11	0.04	0.02	0.38	0.00	0.01	0.00