Doublet Group distance statistics: 52961

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.021, 0.038, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.010, 0.026, 0.043, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.026 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.014, 0.032, 0.049, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.032 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.016, 0.035, 0.055, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.035 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.015, 0.036, 0.057, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.036 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.006, 0.031, 0.055, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.031 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.020, 0.044, 0.069, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.044 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.029, 0.061, 0.093, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.061 std_dev=0.032
C2	A	0, 0.021, 0.053, 0.086, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.053 std_dev=0.032
C1'	A	0, 0.036, 0.075, 0.114, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.075 std_dev=0.039
N6	A	0, 0.024, 0.071, 0.119, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.071 std_dev=0.048
N3	B	0, 0.214, 0.439, 0.664, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.439 std_dev=0.225
N2	B	0, 0.233, 0.479, 0.726, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.479 std_dev=0.246
C1'	B	0, 0.201, 0.453, 0.706, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.453 std_dev=0.253
N9	B	0, 0.228, 0.530, 0.833, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.530 std_dev=0.303
O4'	B	0, 0.222, 0.551, 0.879, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.551 std_dev=0.329
C2	B	0, 0.227, 0.591, 0.956, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.591 std_dev=0.365
C4	B	0, 0.226, 0.625, 1.024, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.625 std_dev=0.399
OP1	A	0, 0.477, 1.069, 1.662, 1.711 max_d=1.711 avg_d=1.069 std_dev=0.592
C8	B	0, 0.223, 0.838, 1.453, 1.601 max_d=1.601 avg_d=0.838 std_dev=0.615
O5'	B	0, 0.278, 0.904, 1.530, 1.674 max_d=1.674 avg_d=0.904 std_dev=0.626
O4'	A	0, 0.121, 0.828, 1.536, 1.677 max_d=1.677 avg_d=0.828 std_dev=0.707
C2'	B	0, 0.129, 0.864, 1.598, 1.905 max_d=1.905 avg_d=0.864 std_dev=0.735
C4'	B	0, 0.186, 0.931, 1.677, 1.955 max_d=1.955 avg_d=0.931 std_dev=0.746
P	B	0, 0.414, 1.182, 1.951, 2.082 max_d=2.082 avg_d=1.182 std_dev=0.769
C5'	B	0, 0.221, 0.995, 1.769, 2.021 max_d=2.021 avg_d=0.995 std_dev=0.774
N1	B	0, 0.172, 0.959, 1.746, 1.907 max_d=1.907 avg_d=0.959 std_dev=0.787
OP2	B	0, 0.590, 1.405, 2.220, 2.276 max_d=2.276 avg_d=1.405 std_dev=0.815
C5	B	0, 0.182, 1.007, 1.832, 2.019 max_d=2.019 avg_d=1.007 std_dev=0.825
O3'	A	0, 0.533, 1.367, 2.201, 2.279 max_d=2.279 avg_d=1.367 std_dev=0.834
C2'	A	0, 0.190, 1.027, 1.864, 2.042 max_d=2.042 avg_d=1.027 std_dev=0.837
C3'	A	0, 0.314, 1.247, 2.179, 2.343 max_d=2.343 avg_d=1.247 std_dev=0.932
OP1	B	0, 0.402, 1.346, 2.290, 2.448 max_d=2.448 avg_d=1.346 std_dev=0.944
C3'	B	0, 0.164, 1.110, 2.056, 2.396 max_d=2.396 avg_d=1.110 std_dev=0.946
N7	B	0, 0.186, 1.153, 2.120, 2.330 max_d=2.330 avg_d=1.153 std_dev=0.967
C4'	A	0, 0.257, 1.303, 2.350, 2.573 max_d=2.573 avg_d=1.303 std_dev=1.046
O2'	B	0, -0.027, 1.039, 2.105, 2.607 max_d=2.607 avg_d=1.039 std_dev=1.066
C6	B	0, 0.136, 1.205, 2.274, 2.505 max_d=2.505 avg_d=1.205 std_dev=1.069
P	A	0, 0.316, 1.400, 2.485, 2.691 max_d=2.691 avg_d=1.400 std_dev=1.084
O5'	A	0, 0.343, 1.540, 2.737, 3.012 max_d=3.012 avg_d=1.540 std_dev=1.197
O2'	A	0, 0.260, 1.533, 2.806, 3.087 max_d=3.087 avg_d=1.533 std_dev=1.273
O3'	B	0, 0.092, 1.494, 2.896, 3.386 max_d=3.386 avg_d=1.494 std_dev=1.402
O6	B	0, 0.085, 1.560, 3.036, 3.400 max_d=3.400 avg_d=1.560 std_dev=1.475
OP2	A	0, 0.589, 2.076, 3.563, 3.900 max_d=3.900 avg_d=2.076 std_dev=1.487
C5'	A	0, 0.433, 2.165, 3.896, 4.249 max_d=4.249 avg_d=2.165 std_dev=1.732

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.31	0.01	0.47	0.10	0.58	0.38
C2	0.04	0.00	0.34	0.12	0.03	0.32	0.04	0.32	0.03	0.04	0.00	0.01	0.04	0.05	0.03	0.29	0.33	0.37	0.82	0.10	0.84	0.60
C2'	0.00	0.34	0.00	0.01	0.19	0.01	0.12	0.14	0.19	0.13	0.29	0.32	0.15	0.04	0.03	0.01	0.02	0.04	0.60	0.70	0.96	0.77
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.20	0.01	0.34	0.02	0.32	0.44	0.22	0.08	0.38	0.45	0.24	0.03	0.02	0.01	0.19	0.66	0.45	0.43
C4	0.02	0.03	0.19	0.20	0.00	0.07	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.18	0.20	0.61	0.10	0.86	0.49
C4'	0.02	0.32	0.01	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.43	0.18	0.32	0.10	0.35	0.13	0.27	0.05	0.01	0.03	0.13	0.20	0.05
C5	0.02	0.04	0.12	0.34	0.01	0.10	0.00	0.26	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.27	0.03	0.08	0.49	0.22	0.97	0.43
C5'	0.01	0.32	0.14	0.02	0.03	0.01	0.26	0.00	0.14	0.66	0.13	0.32	0.28	0.61	0.23	0.11	0.11	0.01	0.01	0.18	0.14	0.01
C6	0.02	0.03	0.19	0.32	0.01	0.01	0.01	0.14	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.06	0.16	0.58	0.20	1.01	0.49
C8	0.01	0.04	0.13	0.44	0.01	0.43	0.01	0.66	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.62	0.17	0.23	0.18	0.32	0.91	0.25
N1	0.03	0.00	0.29	0.22	0.01	0.18	0.02	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.12	0.20	0.29	0.74	0.11	0.95	0.57
N3	0.03	0.01	0.32	0.08	0.01	0.32	0.02	0.32	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.30	0.37	0.37	0.78	0.10	0.77	0.57
N6	0.02	0.04	0.15	0.38	0.02	0.10	0.02	0.28	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.28	0.06	0.11	0.50	0.29	1.09	0.46
N7	0.01	0.05	0.04	0.45	0.02	0.35	0.01	0.61	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.56	0.18	0.12	0.24	0.36	1.00	0.29
N9	0.01	0.03	0.03	0.24	0.01	0.13	0.02	0.23	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.27	0.09	0.01	0.44	0.13	0.80	0.39
O2'	0.01	0.29	0.01	0.03	0.08	0.27	0.27	0.11	0.17	0.62	0.12	0.30	0.28	0.56	0.27	0.00	0.03	0.20	0.23	0.41	0.55	0.40
O3'	0.31	0.33	0.02	0.02	0.18	0.05	0.03	0.11	0.06	0.17	0.20	0.37	0.06	0.18	0.09	0.03	0.00	0.17	0.38	0.43	0.28	0.12
O4'	0.01	0.37	0.04	0.01	0.20	0.01	0.08	0.01	0.16	0.23	0.29	0.37	0.11	0.12	0.01	0.20	0.17	0.00	0.41	0.24	0.26	0.16
O5'	0.47	0.82	0.60	0.19	0.61	0.03	0.49	0.01	0.58	0.18	0.74	0.78	0.50	0.24	0.44	0.23	0.38	0.41	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.10	0.70	0.66	0.10	0.13	0.22	0.18	0.20	0.32	0.11	0.10	0.29	0.36	0.13	0.41	0.43	0.24	0.02	0.00	0.04	0.01
OP2	0.58	0.84	0.96	0.45	0.86	0.20	0.97	0.14	1.01	0.91	0.95	0.77	1.09	1.00	0.80	0.55	0.28	0.26	0.02	0.04	0.00	0.01
P	0.38	0.60	0.77	0.43	0.49	0.05	0.43	0.01	0.49	0.25	0.57	0.57	0.46	0.29	0.39	0.40	0.12	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.14	0.32	0.47	0.16	0.18	0.25	0.25	0.29	0.19	0.22	0.08	0.10	0.27	0.12	0.15	0.68	0.08	0.38	0.35	0.39	0.46	0.38
C2	0.08	0.12	0.25	0.30	0.13	0.16	0.16	0.16	0.17	0.12	0.14	0.10	0.11	0.16	0.10	0.14	0.40	0.08	0.22	0.19	0.21	0.31	0.24
C2'	0.38	0.17	0.13	0.27	0.21	0.16	0.13	0.11	0.09	0.21	0.10	0.19	0.24	0.13	0.27	0.24	0.57	0.44	0.15	0.08	0.17	0.26	0.16
C3'	0.27	0.13	0.70	0.97	0.29	0.64	0.38	0.76	0.34	0.44	0.21	0.06	0.16	0.47	0.33	0.47	1.32	0.29	0.87	0.40	0.99	0.93	0.89
C4	0.05	0.13	0.26	0.35	0.14	0.16	0.20	0.19	0.23	0.15	0.19	0.09	0.10	0.21	0.11	0.12	0.49	0.05	0.28	0.27	0.28	0.37	0.29
C4'	0.76	0.64	1.12	1.40	0.85	1.07	0.98	1.21	0.96	1.04	0.78	0.44	0.67	1.10	0.89	0.79	1.68	0.76	1.39	1.04	1.48	1.47	1.41
C5	0.05	0.13	0.19	0.26	0.12	0.12	0.18	0.14	0.21	0.13	0.17	0.08	0.10	0.18	0.09	0.09	0.36	0.05	0.22	0.24	0.22	0.32	0.24
C5'	0.95	0.75	1.28	1.63	1.04	1.31	1.22	1.51	1.17	1.32	0.93	0.47	0.79	1.39	1.11	0.89	1.91	0.98	1.73	1.29	1.89	1.85	1.78
C6	0.07	0.11	0.14	0.19	0.10	0.11	0.13	0.11	0.15	0.10	0.13	0.08	0.09	0.13	0.08	0.09	0.25	0.07	0.16	0.17	0.16	0.27	0.19
C8	0.04	0.14	0.23	0.33	0.15	0.14	0.22	0.18	0.26	0.17	0.22	0.09	0.10	0.24	0.11	0.10	0.47	0.05	0.30	0.32	0.30	0.38	0.31
N1	0.08	0.10	0.15	0.19	0.09	0.12	0.11	0.12	0.12	0.09	0.10	0.08	0.09	0.11	0.08	0.10	0.25	0.08	0.15	0.13	0.15	0.26	0.19
N3	0.06	0.14	0.31	0.40	0.15	0.18	0.20	0.21	0.22	0.16	0.18	0.10	0.11	0.21	0.11	0.15	0.54	0.06	0.30	0.26	0.29	0.38	0.30
N6	0.08	0.08	0.09	0.12	0.08	0.09	0.09	0.09	0.09	0.08	0.08	0.06	0.08	0.09	0.08	0.09	0.15	0.08	0.10	0.10	0.13	0.24	0.15
N7	0.05	0.14	0.19	0.27	0.14	0.13	0.20	0.15	0.23	0.15	0.20	0.09	0.10	0.21	0.10	0.09	0.38	0.05	0.25	0.28	0.24	0.34	0.26
N9	0.05	0.14	0.27	0.39	0.15	0.16	0.22	0.21	0.26	0.17	0.21	0.08	0.10	0.24	0.11	0.12	0.55	0.06	0.32	0.31	0.32	0.41	0.33
O2'	0.70	0.22	0.31	0.24	0.42	0.60	0.36	0.58	0.24	0.56	0.18	0.12	0.36	0.44	0.57	0.51	0.13	0.84	0.46	0.19	0.48	0.42	0.48
O3'	0.76	0.52	1.22	1.49	0.71	1.17	0.77	1.28	0.70	0.86	0.57	0.36	0.59	0.86	0.78	1.04	1.86	0.78	1.35	0.74	1.47	1.38	1.36
O4'	0.57	0.65	0.86	1.04	0.76	0.74	0.89	0.84	0.91	0.86	0.78	0.49	0.62	0.96	0.74	0.52	1.23	0.52	1.04	1.00	1.05	1.13	1.05
O5'	1.13	1.27	1.44	1.70	1.41	1.33	1.61	1.49	1.66	1.57	1.47	1.05	1.22	1.71	1.37	1.00	1.89	1.08	1.78	1.79	1.86	1.97	1.82
OP1	0.34	0.36	0.56	0.82	0.53	0.56	0.73	0.74	0.75	0.74	0.55	0.20	0.33	0.86	0.54	0.24	0.99	0.33	1.00	0.89	1.11	1.11	1.04
OP2	0.63	1.23	0.87	0.97	1.12	0.58	1.35	0.67	1.53	1.09	1.45	1.17	1.04	1.33	0.94	0.48	1.05	0.47	1.02	1.70	0.97	1.26	1.03
P	0.77	1.02	1.03	1.25	1.10	0.90	1.33	1.06	1.41	1.23	1.24	0.85	0.93	1.41	1.04	0.61	1.40	0.70	1.37	1.57	1.43	1.57	1.42

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.16	0.08
C2	0.02	0.00	0.10	0.07	0.02	0.06	0.01	0.08	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.13	0.07	0.03	0.07	0.02	0.08	0.14	0.07
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.10	0.11	0.08	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.05	0.12	0.04
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.07	0.07	0.09	0.05	0.06	0.04	0.01	0.01	0.02	0.10	0.05	0.04	0.13	0.05
C4	0.01	0.02	0.05	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02	0.04	0.02	0.06	0.16	0.07
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.07	0.06	0.04	0.03	0.02	0.08	0.03	0.01	0.04	0.04	0.07	0.09	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.03	0.06	0.02	0.07	0.16	0.08
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.07	0.03	0.09	0.09	0.06	0.04	0.03	0.07	0.04	0.01	0.02	0.07	0.08	0.07	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.05	0.03	0.07	0.01	0.08	0.15	0.09
C8	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.08	0.06	0.03	0.02	0.09	0.23	0.10
N1	0.02	0.01	0.10	0.07	0.03	0.07	0.02	0.09	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.12	0.06	0.04	0.09	0.02	0.09	0.15	0.09
N2	0.03	0.01	0.11	0.09	0.02	0.06	0.01	0.09	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.16	0.10	0.03	0.07	0.03	0.09	0.15	0.07
N3	0.01	0.01	0.08	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.05	0.02	0.05	0.02	0.07	0.14	0.06
N7	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.04	0.05	0.02	0.09	0.20	0.08
N9	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.02	0.02	0.06	0.18	0.09
O2'	0.02	0.13	0.01	0.01	0.06	0.08	0.05	0.07	0.08	0.02	0.12	0.16	0.11	0.02	0.03	0.00	0.04	0.07	0.09	0.06	0.04	0.13	0.09
O3'	0.02	0.07	0.03	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.05	0.08	0.06	0.10	0.05	0.08	0.04	0.04	0.00	0.02	0.10	0.06	0.07	0.16	0.05
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.06	0.04	0.03	0.02	0.04	0.02	0.07	0.02	0.00	0.07	0.02	0.07	0.15	0.09
O5'	0.03	0.07	0.04	0.10	0.04	0.04	0.06	0.02	0.07	0.03	0.09	0.07	0.05	0.05	0.02	0.09	0.10	0.07	0.00	0.07	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.02	0.05	0.05	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.06	0.06	0.02	0.07	0.00	0.09	0.15	0.09
OP1	0.04	0.08	0.05	0.04	0.06	0.07	0.07	0.08	0.08	0.09	0.09	0.09	0.07	0.09	0.06	0.04	0.07	0.07	0.02	0.09	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.14	0.12	0.13	0.16	0.09	0.16	0.07	0.15	0.23	0.15	0.15	0.14	0.20	0.18	0.13	0.16	0.15	0.01	0.15	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.07	0.04	0.05	0.07	0.04	0.08	0.02	0.09	0.10	0.09	0.07	0.06	0.08	0.09	0.09	0.05	0.09	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00