Doublet Group distance statistics: 52969

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 10, 11, 13, 12, 12, 3, 4, 5, 4, 7, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.011, 0.018, 0.025, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.018 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.010, 0.019, 0.029, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.002, 0.012, 0.023, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.011, 0.023, 0.034, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.022 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.026, 0.058, 0.089, 0.175 max_d=0.175 avg_d=0.058 std_dev=0.031
O4	A	0, 0.026, 0.069, 0.111, 0.241 max_d=0.241 avg_d=0.069 std_dev=0.043
O4'	A	0, 0.057, 0.133, 0.209, 0.313 max_d=0.313 avg_d=0.133 std_dev=0.076
C2'	A	0, 0.083, 0.182, 0.281, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.182 std_dev=0.099
C4'	A	0, 0.110, 0.225, 0.341, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.225 std_dev=0.115
O2'	A	0, 0.125, 0.254, 0.382, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.254 std_dev=0.129
C3'	A	0, 0.111, 0.251, 0.392, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.251 std_dev=0.140
C5'	A	0, 0.202, 0.404, 0.606, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.404 std_dev=0.202
N3	B	0, 0.193, 0.400, 0.607, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.400 std_dev=0.207
O3'	A	0, 0.172, 0.384, 0.595, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.384 std_dev=0.211
N2	B	0, 0.172, 0.385, 0.597, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.385 std_dev=0.213
O5'	A	0, 0.235, 0.473, 0.710, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.473 std_dev=0.238
C2	B	0, 0.206, 0.460, 0.714, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.460 std_dev=0.254
C1'	B	0, 0.164, 0.434, 0.704, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.434 std_dev=0.270
C2'	B	0, 0.255, 0.531, 0.807, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.531 std_dev=0.276
C3'	B	0, 0.176, 0.455, 0.734, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.455 std_dev=0.279
C4	B	0, 0.228, 0.515, 0.803, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.515 std_dev=0.287
O4'	B	0, 0.149, 0.449, 0.749, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.449 std_dev=0.300
N9	B	0, 0.216, 0.518, 0.819, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.518 std_dev=0.301
C4'	B	0, 0.144, 0.454, 0.763, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.454 std_dev=0.309
O5'	B	0, 0.175, 0.524, 0.872, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.524 std_dev=0.348
N1	B	0, 0.292, 0.656, 1.020, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.656 std_dev=0.364
OP2	B	0, 0.271, 0.636, 1.001, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.636 std_dev=0.365
C5'	B	0, 0.133, 0.519, 0.905, 1.802 max_d=1.802 avg_d=0.519 std_dev=0.386
P	A	0, 0.230, 0.618, 1.006, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.618 std_dev=0.388
P	B	0, 0.187, 0.578, 0.969, 1.907 max_d=1.907 avg_d=0.578 std_dev=0.391
O3'	B	0, 0.106, 0.504, 0.903, 2.026 max_d=2.026 avg_d=0.504 std_dev=0.399
C5	B	0, 0.290, 0.699, 1.109, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.699 std_dev=0.409
C8	B	0, 0.265, 0.675, 1.086, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.675 std_dev=0.411
OP1	A	0, 0.371, 0.795, 1.219, 1.879 max_d=1.879 avg_d=0.795 std_dev=0.424
C6	B	0, 0.339, 0.797, 1.254, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.797 std_dev=0.457
OP1	B	0, 0.167, 0.626, 1.086, 2.307 max_d=2.307 avg_d=0.626 std_dev=0.459
N7	B	0, 0.320, 0.796, 1.273, 1.798 max_d=1.798 avg_d=0.796 std_dev=0.476
O2'	B	0, 0.255, 0.768, 1.281, 2.964 max_d=2.964 avg_d=0.768 std_dev=0.513
O6	B	0, 0.423, 1.006, 1.589, 2.117 max_d=2.117 avg_d=1.006 std_dev=0.583
OP2	A	0, 0.136, 1.188, 2.240, 3.681 max_d=3.681 avg_d=1.188 std_dev=1.052

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.00	0.07	0.19	0.16	0.17
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.02	0.02	0.14	0.32	0.54	0.30
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.06	0.03	0.06	0.09	0.00	0.02	0.06	0.01	0.08	0.12	0.16	0.10
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.02	0.08	0.03	0.05	0.10	0.02	0.01	0.06	0.01	0.11	0.13	0.20	0.07
C4	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.07	0.01	0.03	0.17	0.48	0.87	0.41
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.06	0.05	0.02	0.03	0.00	0.02	0.16	0.26	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.09	0.01	0.04	0.17	0.49	0.82	0.40
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.10	0.00	0.11	0.00	0.09	0.06	0.08	0.06	0.05	0.02	0.11	0.01	0.01	0.25	0.39	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.02	0.04	0.15	0.40	0.58	0.33
N1	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.12	0.30	0.43	0.27
N3	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.07	0.02	0.02	0.16	0.40	0.74	0.37
O2	0.05	0.01	0.09	0.10	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.09	0.12	0.03	0.05	0.13	0.27	0.45	0.26
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.04	0.03	0.06	0.09	0.00	0.05	0.07	0.04	0.05	0.11	0.20	0.04
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.07	0.02	0.09	0.02	0.09	0.04	0.07	0.12	0.05	0.00	0.08	0.02	0.14	0.24	0.36	0.11
O4	0.03	0.02	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.11	0.02	0.02	0.02	0.03	0.07	0.08	0.00	0.04	0.18	0.52	0.99	0.44
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.04	0.02	0.04	0.00	0.07	0.18	0.09	0.14
O5'	0.07	0.14	0.08	0.11	0.17	0.02	0.17	0.01	0.15	0.12	0.16	0.13	0.05	0.14	0.18	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.19	0.32	0.12	0.13	0.48	0.16	0.49	0.25	0.40	0.30	0.40	0.27	0.11	0.24	0.52	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.54	0.16	0.20	0.87	0.26	0.82	0.39	0.58	0.43	0.74	0.45	0.20	0.36	0.99	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.30	0.10	0.07	0.41	0.03	0.40	0.02	0.33	0.27	0.37	0.26	0.04	0.11	0.44	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.19	0.24	0.14	0.16	0.26	0.17	0.28	0.18	0.15	0.20	0.21	0.17	0.16	0.15	0.36	0.36	0.29	0.22	0.19	0.22	0.19	0.20
C2	0.15	0.16	0.24	0.14	0.14	0.26	0.14	0.30	0.15	0.14	0.16	0.18	0.15	0.13	0.14	0.40	0.36	0.30	0.23	0.16	0.24	0.19	0.21
C2'	0.12	0.16	0.23	0.14	0.12	0.26	0.13	0.30	0.16	0.12	0.17	0.18	0.13	0.12	0.12	0.39	0.37	0.28	0.22	0.18	0.24	0.20	0.21
C3'	0.11	0.14	0.23	0.12	0.10	0.24	0.11	0.29	0.14	0.09	0.15	0.16	0.12	0.10	0.10	0.36	0.35	0.27	0.19	0.17	0.20	0.18	0.18
C4	0.15	0.17	0.24	0.12	0.15	0.23	0.15	0.26	0.16	0.15	0.16	0.18	0.16	0.15	0.15	0.33	0.32	0.28	0.20	0.16	0.19	0.18	0.18
C4'	0.15	0.20	0.23	0.12	0.17	0.25	0.17	0.28	0.20	0.15	0.21	0.22	0.17	0.16	0.15	0.32	0.34	0.29	0.20	0.21	0.19	0.18	0.18
C5	0.16	0.20	0.24	0.12	0.18	0.22	0.18	0.24	0.20	0.17	0.20	0.20	0.18	0.18	0.17	0.29	0.31	0.27	0.19	0.20	0.17	0.20	0.18
C5'	0.21	0.26	0.25	0.16	0.23	0.29	0.24	0.32	0.26	0.22	0.27	0.27	0.24	0.23	0.22	0.29	0.32	0.34	0.23	0.28	0.21	0.19	0.21
C6	0.16	0.20	0.24	0.12	0.18	0.23	0.19	0.25	0.20	0.17	0.21	0.21	0.18	0.18	0.17	0.31	0.33	0.28	0.20	0.21	0.18	0.19	0.18
N1	0.15	0.18	0.24	0.13	0.16	0.25	0.16	0.28	0.18	0.15	0.19	0.20	0.17	0.16	0.15	0.35	0.35	0.29	0.21	0.19	0.21	0.19	0.20
N3	0.15	0.15	0.24	0.13	0.14	0.25	0.14	0.29	0.14	0.14	0.15	0.17	0.15	0.13	0.14	0.40	0.34	0.30	0.22	0.15	0.22	0.18	0.21
O2	0.15	0.15	0.25	0.17	0.13	0.29	0.13	0.32	0.14	0.13	0.15	0.17	0.14	0.12	0.14	0.44	0.37	0.31	0.24	0.14	0.27	0.20	0.24
O2'	0.14	0.16	0.24	0.17	0.13	0.28	0.14	0.32	0.16	0.13	0.17	0.18	0.14	0.13	0.13	0.40	0.40	0.29	0.24	0.18	0.27	0.21	0.24
O3'	0.10	0.12	0.23	0.12	0.09	0.24	0.10	0.29	0.14	0.08	0.15	0.15	0.10	0.10	0.08	0.38	0.35	0.25	0.19	0.17	0.21	0.18	0.18
O4	0.15	0.15	0.24	0.12	0.15	0.22	0.15	0.25	0.15	0.15	0.15	0.16	0.15	0.15	0.15	0.32	0.30	0.28	0.20	0.15	0.18	0.18	0.18
O4'	0.17	0.23	0.24	0.13	0.20	0.25	0.21	0.27	0.24	0.19	0.24	0.24	0.20	0.20	0.18	0.32	0.34	0.29	0.21	0.25	0.20	0.19	0.20
O5'	0.25	0.27	0.27	0.20	0.26	0.34	0.26	0.38	0.27	0.25	0.27	0.28	0.26	0.25	0.25	0.28	0.33	0.39	0.27	0.28	0.25	0.22	0.25
OP1	0.53	0.51	0.52	0.55	0.51	0.56	0.49	0.55	0.47	0.51	0.47	0.51	0.52	0.49	0.52	0.58	0.73	0.57	0.55	0.44	0.54	0.53	0.52
OP2	1.22	1.32	1.18	1.10	1.31	1.22	1.34	1.29	1.36	1.31	1.35	1.30	1.28	1.34	1.28	1.06	0.92	1.29	1.22	1.36	1.21	1.22	1.24
P	0.54	0.56	0.49	0.47	0.55	0.59	0.55	0.62	0.54	0.54	0.55	0.56	0.55	0.54	0.55	0.44	0.49	0.64	0.51	0.53	0.48	0.45	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.15	0.00	0.12	0.02	0.12	0.21	0.11
C2	0.02	0.00	0.16	0.12	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.16	0.12	0.13	0.02	0.12	0.20	0.12
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.11	0.07	0.09	0.12	0.19	0.16	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.27	0.06	0.26	0.30	0.25
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.12	0.01	0.16	0.02	0.16	0.15	0.14	0.11	0.10	0.17	0.10	0.01	0.01	0.01	0.12	0.18	0.13	0.10	0.06
C4	0.01	0.01	0.08	0.12	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.07	0.14	0.01	0.13	0.20	0.12
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.10	0.05	0.08	0.06	0.09	0.04	0.14	0.02	0.00	0.02	0.06	0.08	0.14	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.16	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.08	0.03	0.18	0.01	0.16	0.21	0.16
C5'	0.04	0.09	0.11	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.08	0.09	0.08	0.11	0.09	0.10	0.05	0.05	0.11	0.01	0.01	0.09	0.10	0.11	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.10	0.05	0.18	0.00	0.17	0.22	0.17
C8	0.01	0.01	0.09	0.15	0.01	0.10	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.09	0.08	0.19	0.02	0.16	0.21	0.16
N1	0.02	0.01	0.12	0.14	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.12	0.09	0.16	0.01	0.15	0.21	0.14
N2	0.03	0.00	0.19	0.11	0.01	0.08	0.01	0.11	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.20	0.15	0.12	0.02	0.11	0.20	0.11
N3	0.02	0.01	0.16	0.10	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.17	0.12	0.12	0.01	0.11	0.20	0.11
N7	0.01	0.01	0.06	0.17	0.01	0.09	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.11	0.05	0.20	0.02	0.18	0.21	0.18
N9	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.07	0.01	0.14	0.01	0.12	0.21	0.12
O2'	0.02	0.15	0.01	0.01	0.10	0.14	0.15	0.05	0.15	0.20	0.13	0.20	0.15	0.21	0.10	0.00	0.04	0.10	0.24	0.18	0.24	0.36	0.24
O3'	0.15	0.16	0.02	0.01	0.10	0.02	0.08	0.11	0.10	0.09	0.12	0.20	0.17	0.11	0.07	0.04	0.00	0.11	0.12	0.11	0.22	0.17	0.14
O4'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.08	0.09	0.15	0.12	0.05	0.01	0.10	0.11	0.00	0.09	0.05	0.12	0.21	0.12
O5'	0.12	0.13	0.27	0.12	0.14	0.02	0.18	0.01	0.18	0.19	0.16	0.12	0.12	0.20	0.14	0.24	0.12	0.09	0.00	0.20	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.18	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.18	0.11	0.05	0.20	0.00	0.20	0.23	0.19
OP1	0.12	0.12	0.26	0.13	0.13	0.08	0.16	0.10	0.17	0.16	0.15	0.11	0.11	0.18	0.12	0.24	0.22	0.12	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.20	0.30	0.10	0.20	0.14	0.21	0.11	0.22	0.21	0.21	0.20	0.20	0.21	0.21	0.36	0.17	0.21	0.02	0.23	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.12	0.25	0.06	0.12	0.03	0.16	0.02	0.17	0.16	0.14	0.11	0.11	0.18	0.12	0.24	0.14	0.12	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00