Doublet Group distance statistics: 52970

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 11, 6, 4, 2, 1, 0, 0, 1, 1, 3, 3, 4, 1, 7, 1, 0, 1, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.006, 0.010, 0.013, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.005, 0.008, 0.012, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.009, 0.021, 0.032, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.009, 0.020, 0.032, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.009, 0.020, 0.032, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.021 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.024, 0.052, 0.079, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.052 std_dev=0.027
O4	A	0, 0.027, 0.088, 0.148, 0.240 max_d=0.240 avg_d=0.088 std_dev=0.060
C2'	A	0, 0.029, 0.125, 0.222, 0.552 max_d=0.552 avg_d=0.125 std_dev=0.096
O4'	A	0, 0.019, 0.117, 0.214, 0.468 max_d=0.468 avg_d=0.117 std_dev=0.097
O2'	A	0, 0.073, 0.179, 0.285, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.179 std_dev=0.106
C4'	A	0, 0.049, 0.203, 0.356, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.203 std_dev=0.153
C3'	A	0, 0.040, 0.202, 0.363, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.202 std_dev=0.161
N3	B	0, 0.163, 0.387, 0.611, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.387 std_dev=0.224
O5'	A	0, 0.103, 0.340, 0.577, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.340 std_dev=0.237
O3'	A	0, 0.082, 0.320, 0.558, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.320 std_dev=0.238
C5'	A	0, 0.045, 0.295, 0.544, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.295 std_dev=0.250
P	A	0, 0.104, 0.362, 0.620, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.362 std_dev=0.258
C2	B	0, 0.151, 0.427, 0.704, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.427 std_dev=0.276
N2	B	0, 0.210, 0.504, 0.798, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.504 std_dev=0.294
C4	B	0, 0.162, 0.462, 0.761, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.462 std_dev=0.299
C5	B	0, 0.150, 0.514, 0.878, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.514 std_dev=0.364
N7	B	0, 0.180, 0.603, 1.026, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.603 std_dev=0.423
C8	B	0, 0.237, 0.756, 1.275, 1.962 max_d=1.962 avg_d=0.756 std_dev=0.519
N1	B	0, 0.196, 0.740, 1.284, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.740 std_dev=0.544
N9	B	0, 0.200, 0.755, 1.310, 2.029 max_d=2.029 avg_d=0.755 std_dev=0.555
C6	B	0, 0.180, 0.764, 1.349, 1.975 max_d=1.975 avg_d=0.764 std_dev=0.585
O6	B	0, 0.205, 1.079, 1.953, 2.769 max_d=2.769 avg_d=1.079 std_dev=0.874
C1'	B	0, 0.172, 1.108, 2.044, 3.039 max_d=3.039 avg_d=1.108 std_dev=0.936
C2'	B	0, 0.202, 1.213, 2.224, 3.305 max_d=3.305 avg_d=1.213 std_dev=1.011
O4'	B	0, 0.238, 1.302, 2.367, 3.421 max_d=3.421 avg_d=1.302 std_dev=1.065
C3'	B	0, 0.279, 1.401, 2.523, 3.593 max_d=3.593 avg_d=1.401 std_dev=1.122
OP2	A	0, 0.164, 1.304, 2.443, 3.025 max_d=3.025 avg_d=1.304 std_dev=1.140
O5'	B	0, 0.268, 1.418, 2.568, 4.117 max_d=4.117 avg_d=1.418 std_dev=1.150
C4'	B	0, 0.283, 1.474, 2.665, 3.864 max_d=3.864 avg_d=1.474 std_dev=1.191
OP2	B	0, 0.203, 1.408, 2.613, 3.596 max_d=3.596 avg_d=1.408 std_dev=1.205
C5'	B	0, 0.333, 1.584, 2.835, 4.086 max_d=4.086 avg_d=1.584 std_dev=1.251
OP1	A	0, 0.240, 1.512, 2.784, 3.570 max_d=3.570 avg_d=1.512 std_dev=1.272
P	B	0, 0.256, 1.603, 2.951, 4.343 max_d=4.343 avg_d=1.603 std_dev=1.348
O3'	B	0, 0.235, 1.647, 3.059, 4.177 max_d=4.177 avg_d=1.647 std_dev=1.412
OP1	B	0, 0.311, 1.917, 3.524, 5.356 max_d=5.356 avg_d=1.917 std_dev=1.607
O2'	B	0, 0.041, 1.859, 3.677, 5.191 max_d=5.191 avg_d=1.859 std_dev=1.818

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.28	0.20	0.06
C2	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.02	0.09	0.56	0.59	0.12
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.09	0.00	0.02	0.06	0.00	0.04	0.16	0.14	0.06
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.02	0.06	0.03	0.08	0.10	0.01	0.01	0.08	0.01	0.05	0.34	0.10	0.08
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.02	0.12	0.85	0.93	0.16
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.05	0.05	0.01	0.05	0.00	0.02	0.18	0.26	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.02	0.12	0.89	0.91	0.16
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.07	0.04	0.07	0.05	0.05	0.02	0.09	0.02	0.01	0.27	0.46	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.02	0.11	0.71	0.67	0.13
N1	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.08	0.52	0.50	0.10
N3	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.01	0.02	0.11	0.71	0.78	0.15
O2	0.02	0.00	0.09	0.10	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.13	0.01	0.03	0.08	0.45	0.49	0.11
O2'	0.02	0.05	0.00	0.01	0.05	0.05	0.04	0.05	0.03	0.02	0.06	0.08	0.00	0.04	0.06	0.05	0.03	0.23	0.11	0.05
O3'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.08	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.09	0.13	0.04	0.00	0.10	0.01	0.07	0.66	0.27	0.11
O4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.02	0.12	0.92	1.04	0.18
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.02	0.00	0.06	0.27	0.11	0.07
O5'	0.05	0.09	0.04	0.05	0.12	0.02	0.12	0.01	0.11	0.08	0.11	0.08	0.03	0.07	0.12	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.28	0.56	0.16	0.34	0.85	0.18	0.89	0.27	0.71	0.52	0.71	0.45	0.23	0.66	0.92	0.27	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.59	0.14	0.10	0.93	0.26	0.91	0.46	0.67	0.50	0.78	0.49	0.11	0.27	1.04	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.12	0.06	0.08	0.16	0.02	0.16	0.02	0.13	0.10	0.15	0.11	0.05	0.11	0.18	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.15	0.43	0.43	0.16	0.59	0.15	0.61	0.15	0.19	0.16	0.16	0.16	0.16	0.20	0.60	1.03	0.58	0.53	0.16	0.60	0.33	0.44
C2	0.28	0.14	0.45	0.44	0.18	0.63	0.16	0.65	0.15	0.22	0.15	0.17	0.16	0.19	0.23	0.68	1.02	0.63	0.57	0.16	0.65	0.39	0.51
C2'	0.23	0.16	0.49	0.37	0.18	0.55	0.17	0.59	0.17	0.20	0.16	0.16	0.17	0.19	0.20	0.77	0.95	0.53	0.51	0.18	0.57	0.32	0.43
C3'	0.20	0.16	0.47	0.32	0.16	0.48	0.17	0.51	0.17	0.17	0.17	0.17	0.17	0.17	0.18	0.69	0.91	0.47	0.44	0.19	0.48	0.25	0.34
C4	0.27	0.14	0.40	0.36	0.17	0.53	0.15	0.53	0.14	0.20	0.15	0.17	0.16	0.16	0.21	0.49	0.94	0.57	0.50	0.15	0.52	0.31	0.40
C4'	0.22	0.14	0.42	0.36	0.15	0.51	0.14	0.52	0.14	0.16	0.15	0.15	0.16	0.14	0.17	0.54	0.99	0.49	0.46	0.16	0.49	0.25	0.34
C5	0.25	0.15	0.38	0.34	0.16	0.48	0.14	0.47	0.15	0.18	0.16	0.16	0.17	0.15	0.20	0.38	0.95	0.51	0.45	0.17	0.45	0.26	0.33
C5'	0.19	0.13	0.40	0.31	0.13	0.43	0.13	0.43	0.15	0.13	0.15	0.14	0.14	0.12	0.14	0.45	0.94	0.43	0.39	0.18	0.39	0.21	0.26
C6	0.25	0.15	0.39	0.37	0.16	0.51	0.14	0.51	0.15	0.18	0.16	0.16	0.17	0.15	0.20	0.43	0.99	0.52	0.47	0.18	0.49	0.27	0.36
N1	0.26	0.14	0.42	0.41	0.17	0.58	0.15	0.58	0.14	0.19	0.16	0.16	0.16	0.16	0.21	0.57	1.02	0.57	0.52	0.16	0.58	0.33	0.43
N3	0.28	0.15	0.44	0.41	0.18	0.61	0.17	0.63	0.15	0.23	0.16	0.18	0.16	0.19	0.23	0.65	0.99	0.63	0.57	0.16	0.62	0.38	0.49
O2	0.29	0.15	0.47	0.48	0.19	0.68	0.18	0.72	0.16	0.25	0.16	0.18	0.16	0.22	0.24	0.78	1.03	0.67	0.63	0.17	0.74	0.45	0.58
O2'	0.25	0.16	0.50	0.42	0.19	0.60	0.19	0.65	0.17	0.23	0.17	0.16	0.18	0.21	0.22	0.81	0.97	0.57	0.55	0.18	0.64	0.37	0.49
O3'	0.20	0.19	0.50	0.29	0.18	0.45	0.19	0.50	0.22	0.18	0.21	0.20	0.18	0.19	0.18	0.78	0.87	0.44	0.43	0.24	0.46	0.24	0.33
O4	0.27	0.14	0.40	0.31	0.17	0.49	0.15	0.50	0.14	0.20	0.16	0.19	0.16	0.17	0.21	0.46	0.87	0.56	0.49	0.16	0.49	0.30	0.39
O4'	0.26	0.15	0.40	0.42	0.15	0.56	0.14	0.56	0.16	0.17	0.17	0.16	0.16	0.14	0.19	0.48	1.04	0.55	0.50	0.19	0.54	0.29	0.39
O5'	0.17	0.13	0.40	0.25	0.13	0.37	0.13	0.37	0.15	0.13	0.15	0.15	0.14	0.13	0.14	0.42	0.88	0.38	0.35	0.18	0.32	0.21	0.21
OP1	0.95	1.02	0.85	1.08	0.96	1.07	0.92	1.04	0.91	0.90	0.96	1.09	1.01	0.89	0.94	0.91	1.71	1.04	1.08	0.86	1.04	0.86	0.92
OP2	1.20	1.22	1.42	1.05	1.27	0.98	1.32	1.03	1.33	1.32	1.28	1.15	1.21	1.35	1.26	1.32	0.46	1.03	1.10	1.35	1.14	1.41	1.25
P	0.18	0.16	0.36	0.23	0.15	0.32	0.16	0.31	0.17	0.15	0.16	0.18	0.16	0.16	0.16	0.31	0.85	0.34	0.34	0.20	0.28	0.24	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.35	0.00	0.25	0.01	0.24	0.27	0.18
C2	0.02	0.00	0.28	0.22	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.35	0.19	0.24	0.01	0.15	0.21	0.14
C2'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.13	0.02	0.05	0.24	0.10	0.18	0.20	0.35	0.28	0.12	0.02	0.01	0.05	0.02	0.57	0.07	0.67	0.65	0.59
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.24	0.00	0.32	0.03	0.33	0.31	0.28	0.19	0.18	0.35	0.21	0.02	0.01	0.01	0.21	0.36	0.31	0.11	0.15
C4	0.01	0.01	0.13	0.24	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.23	0.10	0.24	0.01	0.15	0.21	0.14
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.09	0.19	0.05	0.11	0.07	0.18	0.08	0.31	0.04	0.00	0.02	0.11	0.12	0.22	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.32	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.34	0.15	0.04	0.27	0.01	0.17	0.24	0.17
C5'	0.09	0.12	0.24	0.03	0.08	0.01	0.10	0.00	0.11	0.14	0.10	0.15	0.12	0.16	0.07	0.07	0.22	0.02	0.01	0.13	0.12	0.22	0.02
C6	0.01	0.01	0.10	0.33	0.01	0.09	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.33	0.17	0.07	0.28	0.00	0.19	0.27	0.19
C8	0.01	0.01	0.18	0.31	0.00	0.19	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.40	0.15	0.13	0.27	0.01	0.16	0.21	0.16
N1	0.02	0.01	0.20	0.28	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.25	0.14	0.26	0.01	0.16	0.24	0.16
N2	0.02	0.01	0.35	0.19	0.01	0.11	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.45	0.24	0.24	0.01	0.16	0.20	0.14
N3	0.02	0.00	0.28	0.18	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.38	0.19	0.24	0.01	0.17	0.21	0.14
N7	0.01	0.01	0.12	0.35	0.00	0.18	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.44	0.18	0.08	0.30	0.01	0.21	0.26	0.21
N9	0.00	0.01	0.02	0.21	0.01	0.08	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.23	0.17	0.01	0.24	0.01	0.16	0.21	0.13
O2'	0.03	0.14	0.01	0.02	0.20	0.31	0.34	0.07	0.33	0.40	0.22	0.18	0.12	0.44	0.23	0.00	0.05	0.22	0.40	0.39	0.57	0.75	0.50
O3'	0.35	0.35	0.05	0.01	0.23	0.04	0.15	0.22	0.17	0.15	0.25	0.45	0.38	0.18	0.17	0.05	0.00	0.25	0.22	0.17	0.33	0.24	0.24
O4'	0.00	0.19	0.02	0.01	0.10	0.00	0.04	0.02	0.07	0.13	0.14	0.24	0.19	0.08	0.01	0.22	0.25	0.00	0.06	0.05	0.08	0.29	0.14
O5'	0.25	0.24	0.57	0.21	0.24	0.02	0.27	0.01	0.28	0.27	0.26	0.24	0.24	0.30	0.24	0.40	0.22	0.06	0.00	0.30	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.07	0.36	0.01	0.11	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.39	0.17	0.05	0.30	0.00	0.25	0.32	0.23
OP1	0.24	0.15	0.67	0.31	0.15	0.12	0.17	0.12	0.19	0.16	0.16	0.16	0.17	0.21	0.16	0.57	0.33	0.08	0.02	0.25	0.00	0.02	0.00
OP2	0.27	0.21	0.65	0.11	0.21	0.22	0.24	0.22	0.27	0.21	0.24	0.20	0.21	0.26	0.21	0.75	0.24	0.29	0.02	0.32	0.02	0.00	0.02
P	0.18	0.14	0.59	0.15	0.14	0.05	0.17	0.02	0.19	0.16	0.16	0.14	0.14	0.21	0.13	0.50	0.24	0.14	0.00	0.23	0.00	0.02	0.00