Doublet Group distance statistics: 52979

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 2, 6, 12, 8, 14, 5, 3, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.014, 0.021, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.003, 0.013, 0.024, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.013, 0.025, 0.037, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.025 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.012, 0.024, 0.037, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.016, 0.032, 0.049, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.014, 0.033, 0.052, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.033 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.017, 0.037, 0.056, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.037 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.024, 0.048, 0.071, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.048 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.025, 0.050, 0.074, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.050 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.032, 0.062, 0.092, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.062 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.051, 0.125, 0.200, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.125 std_dev=0.075
C2'	A	0, 0.083, 0.158, 0.233, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.158 std_dev=0.075
O2'	A	0, 0.094, 0.209, 0.323, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.209 std_dev=0.115
C3'	A	0, 0.190, 0.309, 0.428, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.309 std_dev=0.119
C4'	A	0, 0.156, 0.279, 0.403, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.279 std_dev=0.124
N3	B	0, 0.243, 0.417, 0.590, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.417 std_dev=0.173
O3'	A	0, 0.297, 0.483, 0.669, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.483 std_dev=0.186
C2	B	0, 0.244, 0.432, 0.620, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.432 std_dev=0.188
C5'	A	0, 0.235, 0.426, 0.618, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.426 std_dev=0.191
C4	B	0, 0.401, 0.611, 0.821, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.611 std_dev=0.210
C1'	B	0, 0.375, 0.610, 0.845, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.610 std_dev=0.235
N1	B	0, 0.338, 0.590, 0.842, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.590 std_dev=0.252
N9	B	0, 0.469, 0.730, 0.990, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.730 std_dev=0.261
C2'	B	0, 0.691, 1.026, 1.360, 1.567 max_d=1.567 avg_d=1.026 std_dev=0.334
O2'	B	0, 0.566, 0.935, 1.304, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.935 std_dev=0.369
C5	B	0, 0.480, 0.864, 1.249, 1.745 max_d=1.745 avg_d=0.864 std_dev=0.385
C6	B	0, 0.444, 0.838, 1.232, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.838 std_dev=0.394
O4'	B	0, 0.297, 0.698, 1.099, 2.318 max_d=2.318 avg_d=0.698 std_dev=0.401
C8	B	0, 0.585, 1.049, 1.513, 2.316 max_d=2.316 avg_d=1.049 std_dev=0.464
C3'	B	0, 0.872, 1.366, 1.861, 2.628 max_d=2.628 avg_d=1.366 std_dev=0.495
C4'	B	0, 0.677, 1.173, 1.668, 2.891 max_d=2.891 avg_d=1.173 std_dev=0.496
N7	B	0, 0.600, 1.151, 1.703, 2.605 max_d=2.605 avg_d=1.151 std_dev=0.551
N6	B	0, 0.532, 1.102, 1.673, 2.511 max_d=2.511 avg_d=1.102 std_dev=0.570
P	B	0, 1.152, 1.743, 2.334, 3.636 max_d=3.636 avg_d=1.743 std_dev=0.591
C5'	B	0, 1.002, 1.635, 2.268, 3.957 max_d=3.957 avg_d=1.635 std_dev=0.633
OP1	B	0, 1.221, 1.868, 2.515, 3.135 max_d=3.135 avg_d=1.868 std_dev=0.647
O5'	B	0, 1.119, 1.777, 2.434, 3.818 max_d=3.818 avg_d=1.777 std_dev=0.657
O3'	B	0, 1.155, 1.847, 2.538, 3.380 max_d=3.380 avg_d=1.847 std_dev=0.691
OP2	B	0, 1.114, 1.847, 2.579, 4.097 max_d=4.097 avg_d=1.847 std_dev=0.732
O5'	A	0, 0.596, 1.441, 2.285, 2.921 max_d=2.921 avg_d=1.441 std_dev=0.844
P	A	0, 0.972, 2.073, 3.175, 4.175 max_d=4.175 avg_d=2.073 std_dev=1.102
OP2	A	0, 1.124, 2.291, 3.458, 4.822 max_d=4.822 avg_d=2.291 std_dev=1.167
OP1	A	0, 1.453, 2.927, 4.402, 5.267 max_d=5.267 avg_d=2.927 std_dev=1.474

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.21	0.02	0.28	0.48	0.27
C2	0.03	0.00	0.10	0.16	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.19	0.03	0.45	0.02	0.19	0.59	0.19
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.07	0.04	0.09	0.11	0.09	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.31	0.08	0.39	0.33	0.13
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.13	0.00	0.15	0.02	0.17	0.10	0.17	0.17	0.14	0.13	0.08	0.02	0.01	0.01	0.43	0.18	0.54	0.36	0.21
C4	0.02	0.01	0.06	0.13	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.13	0.02	0.46	0.01	0.18	0.62	0.23
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.11	0.10	0.10	0.08	0.07	0.12	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.13	0.38	0.42	0.27
C5	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.11	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.16	0.02	0.57	0.01	0.34	0.81	0.41
C5'	0.03	0.15	0.01	0.02	0.15	0.01	0.20	0.00	0.21	0.18	0.19	0.13	0.12	0.22	0.12	0.04	0.04	0.01	0.01	0.24	0.35	0.41	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.17	0.01	0.11	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.20	0.02	0.59	0.01	0.38	0.87	0.45
C8	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.10	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.02	0.55	0.01	0.34	0.79	0.42
N1	0.03	0.00	0.09	0.17	0.01	0.10	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.21	0.03	0.53	0.01	0.26	0.74	0.32
N2	0.04	0.00	0.11	0.17	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.20	0.04	0.41	0.02	0.22	0.52	0.15
N3	0.03	0.00	0.09	0.14	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.15	0.03	0.39	0.01	0.19	0.52	0.15
N7	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.12	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.15	0.02	0.61	0.01	0.46	0.94	0.55
N9	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.42	0.01	0.15	0.58	0.21
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.07	0.10	0.07	0.03	0.02	0.00	0.05	0.05	0.08	0.05	0.57	0.40	0.40
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.13	0.02	0.16	0.04	0.20	0.11	0.21	0.20	0.15	0.15	0.07	0.05	0.00	0.02	0.37	0.22	0.74	0.33	0.32
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.10	0.02	0.35	0.61	0.43
O5'	0.21	0.45	0.31	0.43	0.46	0.01	0.57	0.01	0.59	0.55	0.53	0.41	0.39	0.61	0.42	0.08	0.37	0.10	0.00	0.63	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.08	0.18	0.01	0.13	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.22	0.02	0.63	0.00	0.49	1.01	0.57
OP1	0.28	0.19	0.39	0.54	0.18	0.38	0.34	0.35	0.38	0.34	0.26	0.22	0.19	0.46	0.15	0.57	0.74	0.35	0.02	0.49	0.00	0.01	0.00
OP2	0.48	0.59	0.33	0.36	0.62	0.42	0.81	0.41	0.87	0.79	0.74	0.52	0.52	0.94	0.58	0.40	0.33	0.61	0.02	1.01	0.01	0.00	0.01
P	0.27	0.19	0.13	0.21	0.23	0.27	0.41	0.02	0.45	0.42	0.32	0.15	0.15	0.55	0.21	0.40	0.32	0.43	0.01	0.57	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.17	0.31	0.32	0.23	0.16	0.39	0.22	0.48	0.33	0.38	0.13	0.62	0.43	0.22	0.28	0.38	0.18	0.54	0.55	0.54	0.52
C2	0.25	0.20	0.38	0.35	0.20	0.29	0.26	0.29	0.30	0.25	0.28	0.14	0.34	0.27	0.22	0.42	0.41	0.29	0.42	0.47	0.44	0.43
C2'	0.14	0.14	0.32	0.36	0.17	0.17	0.26	0.19	0.33	0.22	0.28	0.13	0.42	0.28	0.16	0.29	0.46	0.15	0.57	0.52	0.50	0.49
C3'	0.14	0.14	0.33	0.37	0.16	0.17	0.23	0.19	0.29	0.20	0.23	0.14	0.39	0.26	0.16	0.31	0.49	0.16	0.57	0.51	0.50	0.48
C4	0.20	0.20	0.34	0.31	0.22	0.22	0.35	0.23	0.42	0.31	0.36	0.13	0.52	0.39	0.22	0.36	0.37	0.23	0.46	0.51	0.46	0.47
C4'	0.14	0.12	0.30	0.32	0.16	0.16	0.28	0.23	0.35	0.25	0.25	0.12	0.49	0.33	0.17	0.27	0.42	0.19	0.54	0.51	0.56	0.49
C5	0.23	0.20	0.36	0.33	0.23	0.27	0.36	0.27	0.42	0.33	0.36	0.13	0.53	0.40	0.24	0.42	0.39	0.26	0.44	0.52	0.45	0.47
C5'	0.15	0.13	0.31	0.33	0.18	0.16	0.30	0.24	0.36	0.28	0.26	0.12	0.51	0.36	0.19	0.28	0.42	0.19	0.54	0.53	0.58	0.50
C6	0.27	0.20	0.40	0.37	0.22	0.33	0.32	0.32	0.37	0.31	0.33	0.14	0.46	0.36	0.24	0.48	0.45	0.31	0.42	0.51	0.43	0.45
C8	0.19	0.19	0.33	0.30	0.25	0.20	0.42	0.23	0.49	0.38	0.39	0.13	0.64	0.48	0.25	0.36	0.36	0.21	0.50	0.57	0.51	0.52
N1	0.28	0.20	0.41	0.39	0.20	0.35	0.27	0.34	0.31	0.28	0.30	0.14	0.38	0.30	0.24	0.49	0.47	0.32	0.42	0.49	0.44	0.44
N2	0.28	0.19	0.40	0.38	0.19	0.32	0.20	0.32	0.21	0.23	0.22	0.15	0.23	0.22	0.23	0.42	0.44	0.32	0.42	0.46	0.46	0.42
N3	0.20	0.20	0.33	0.31	0.20	0.22	0.30	0.23	0.36	0.26	0.33	0.13	0.41	0.31	0.20	0.34	0.37	0.23	0.45	0.48	0.45	0.44
N7	0.22	0.19	0.35	0.31	0.24	0.25	0.40	0.26	0.47	0.37	0.38	0.13	0.60	0.46	0.25	0.41	0.38	0.25	0.46	0.55	0.48	0.50
N9	0.18	0.18	0.32	0.30	0.24	0.18	0.39	0.22	0.47	0.34	0.39	0.12	0.60	0.44	0.23	0.32	0.36	0.20	0.50	0.54	0.50	0.50
O2'	0.13	0.13	0.28	0.34	0.12	0.15	0.17	0.20	0.23	0.14	0.16	0.14	0.34	0.19	0.12	0.25	0.46	0.17	0.56	0.49	0.52	0.46
O3'	0.14	0.14	0.33	0.38	0.13	0.19	0.16	0.19	0.19	0.15	0.15	0.15	0.28	0.18	0.13	0.32	0.53	0.16	0.58	0.48	0.49	0.46
O4'	0.16	0.16	0.31	0.32	0.23	0.17	0.40	0.26	0.49	0.35	0.36	0.13	0.67	0.46	0.23	0.27	0.38	0.20	0.54	0.56	0.59	0.54
O5'	0.18	0.15	0.21	0.23	0.17	0.17	0.40	0.21	0.49	0.37	0.29	0.17	0.77	0.53	0.19	0.28	0.28	0.22	0.60	0.67	0.72	0.67
O6	0.29	0.20	0.42	0.41	0.22	0.38	0.32	0.37	0.37	0.32	0.33	0.14	0.46	0.37	0.25	0.52	0.50	0.33	0.42	0.51	0.43	0.45
OP1	0.58	0.53	0.67	0.76	0.69	0.61	0.92	0.67	0.95	0.95	0.73	0.51	1.19	1.08	0.73	0.54	0.77	0.55	1.14	1.29	1.35	1.31
OP2	0.59	0.49	0.61	0.67	0.72	0.58	0.98	0.62	1.03	1.00	0.76	0.48	1.29	1.15	0.76	0.51	0.65	0.57	1.08	1.25	1.28	1.27
P	0.52	0.45	0.61	0.69	0.67	0.53	0.93	0.58	0.98	0.94	0.72	0.43	1.24	1.09	0.71	0.46	0.69	0.48	1.08	1.23	1.28	1.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.29	0.32	0.27	0.26
C2	0.03	0.00	0.25	0.29	0.01	0.10	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.38	0.10	0.50	0.44	0.44	0.42
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.14	0.02	0.09	0.02	0.14	0.11	0.20	0.25	0.12	0.08	0.04	0.00	0.01	0.01	0.13	0.13	0.36	0.10
C3'	0.01	0.29	0.00	0.00	0.16	0.00	0.13	0.02	0.18	0.15	0.25	0.26	0.17	0.11	0.06	0.02	0.01	0.02	0.09	0.19	0.42	0.17
C4	0.01	0.01	0.14	0.16	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.20	0.05	0.47	0.43	0.39	0.39
C4'	0.01	0.10	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.07	0.11	0.08	0.09	0.07	0.09	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.19	0.32	0.06
C5	0.01	0.01	0.09	0.13	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.17	0.03	0.53	0.48	0.46	0.44
C5'	0.06	0.15	0.02	0.02	0.14	0.00	0.18	0.00	0.18	0.22	0.16	0.13	0.20	0.22	0.14	0.05	0.06	0.02	0.01	0.35	0.34	0.01
C6	0.01	0.01	0.14	0.18	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.25	0.05	0.56	0.51	0.51	0.47
C8	0.01	0.01	0.11	0.15	0.01	0.11	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.16	0.06	0.50	0.45	0.38	0.39
N1	0.02	0.00	0.20	0.25	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.34	0.08	0.54	0.49	0.49	0.46
N3	0.03	0.00	0.25	0.26	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.33	0.10	0.45	0.40	0.39	0.38
N6	0.01	0.01	0.12	0.17	0.01	0.07	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.25	0.04	0.58	0.54	0.56	0.50
N7	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.15	0.04	0.54	0.50	0.47	0.45
N9	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.42	0.39	0.33	0.34
O2'	0.02	0.19	0.00	0.02	0.09	0.05	0.07	0.05	0.11	0.07	0.16	0.18	0.10	0.06	0.02	0.00	0.05	0.06	0.05	0.13	0.36	0.11
O3'	0.02	0.38	0.01	0.01	0.20	0.02	0.17	0.06	0.25	0.16	0.34	0.33	0.25	0.15	0.07	0.05	0.00	0.03	0.25	0.43	0.50	0.34
O4'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.02	0.05	0.06	0.08	0.10	0.04	0.04	0.01	0.06	0.03	0.00	0.31	0.47	0.20	0.34
O5'	0.29	0.50	0.13	0.09	0.47	0.01	0.53	0.01	0.56	0.50	0.54	0.45	0.58	0.54	0.42	0.05	0.25	0.31	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.32	0.44	0.13	0.19	0.43	0.19	0.48	0.35	0.51	0.45	0.49	0.40	0.54	0.50	0.39	0.13	0.43	0.47	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.44	0.36	0.42	0.39	0.32	0.46	0.34	0.51	0.38	0.49	0.39	0.56	0.47	0.33	0.36	0.50	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.26	0.42	0.10	0.17	0.39	0.06	0.44	0.01	0.47	0.39	0.46	0.38	0.50	0.45	0.34	0.11	0.34	0.34	0.01	0.01	0.01	0.00