Doublet Group distance statistics: 52981

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 3, 3, 4, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.010, 0.026, 0.042, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.019, 0.036, 0.054, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.036 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.016, 0.035, 0.054, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.035 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.005, 0.030, 0.056, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.030 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.012, 0.041, 0.069, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.041 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.038, 0.173, 0.308, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.173 std_dev=0.135
C2'	A	0, 0.053, 0.202, 0.351, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.202 std_dev=0.149
C4'	A	0, 0.102, 0.304, 0.507, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.304 std_dev=0.202
O2'	A	0, 0.109, 0.342, 0.575, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.342 std_dev=0.233
C3'	A	0, 0.109, 0.344, 0.578, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.344 std_dev=0.234
O5'	A	0, 0.364, 0.639, 0.915, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.639 std_dev=0.275
C4	B	0, 0.468, 0.760, 1.051, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.760 std_dev=0.292
C6	B	0, 0.574, 0.894, 1.214, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.894 std_dev=0.320
N3	B	0, 0.452, 0.779, 1.106, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.779 std_dev=0.327
C5	B	0, 0.491, 0.823, 1.154, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.823 std_dev=0.332
C5'	A	0, 0.214, 0.552, 0.891, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.552 std_dev=0.339
O3'	A	0, 0.160, 0.543, 0.925, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.543 std_dev=0.383
N6	B	0, 0.612, 1.018, 1.425, 1.557 max_d=1.557 avg_d=1.018 std_dev=0.406
N9	B	0, 0.436, 0.890, 1.343, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.890 std_dev=0.454
N1	B	0, 0.506, 0.973, 1.440, 1.663 max_d=1.663 avg_d=0.973 std_dev=0.467
N7	B	0, 0.530, 1.022, 1.514, 1.835 max_d=1.835 avg_d=1.022 std_dev=0.492
C2	B	0, 0.389, 0.898, 1.408, 1.733 max_d=1.733 avg_d=0.898 std_dev=0.509
C2'	B	0, 0.358, 0.914, 1.470, 2.111 max_d=2.111 avg_d=0.914 std_dev=0.556
C8	B	0, 0.530, 1.091, 1.652, 2.016 max_d=2.016 avg_d=1.091 std_dev=0.561
C1'	B	0, 0.374, 0.947, 1.521, 2.178 max_d=2.178 avg_d=0.947 std_dev=0.574
C3'	B	0, 0.455, 1.085, 1.715, 2.224 max_d=2.224 avg_d=1.085 std_dev=0.630
O3'	B	0, 0.474, 1.155, 1.835, 2.414 max_d=2.414 avg_d=1.155 std_dev=0.681
O4'	B	0, 0.422, 1.142, 1.861, 2.643 max_d=2.643 avg_d=1.142 std_dev=0.720
O2'	B	0, 0.224, 1.005, 1.786, 2.999 max_d=2.999 avg_d=1.005 std_dev=0.781
P	A	0, 0.880, 1.705, 2.529, 2.879 max_d=2.879 avg_d=1.705 std_dev=0.825
C4'	B	0, 0.438, 1.280, 2.122, 3.010 max_d=3.010 avg_d=1.280 std_dev=0.842
O5'	B	0, 0.712, 1.710, 2.708, 3.828 max_d=3.828 avg_d=1.710 std_dev=0.998
OP1	A	0, 1.097, 2.186, 3.276, 3.901 max_d=3.901 avg_d=2.186 std_dev=1.090
C5'	B	0, 0.544, 1.640, 2.735, 3.877 max_d=3.877 avg_d=1.640 std_dev=1.095
OP2	A	0, 1.034, 2.135, 3.236, 4.161 max_d=4.161 avg_d=2.135 std_dev=1.101
P	B	0, 1.132, 2.529, 3.926, 5.023 max_d=5.023 avg_d=2.529 std_dev=1.397
OP1	B	0, 1.248, 2.806, 4.364, 5.022 max_d=5.022 avg_d=2.806 std_dev=1.558
OP2	B	0, 1.271, 2.889, 4.507, 6.036 max_d=6.036 avg_d=2.889 std_dev=1.618

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.12	0.03	0.23	0.18	0.16
C2	0.03	0.00	0.11	0.10	0.02	0.05	0.02	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.20	0.15	0.05	0.21	0.03	0.42	0.43	0.28
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.06	0.06	0.09	0.13	0.11	0.05	0.02	0.00	0.04	0.01	0.11	0.06	0.39	0.34	0.18
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.07	0.01	0.10	0.02	0.09	0.16	0.09	0.12	0.09	0.15	0.08	0.02	0.01	0.02	0.16	0.10	0.47	0.38	0.28
C4	0.02	0.02	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.08	0.03	0.23	0.01	0.40	0.37	0.28
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.12	0.04	0.06	0.04	0.11	0.05	0.07	0.03	0.01	0.02	0.07	0.15	0.12	0.08
C5	0.02	0.02	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.19	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.09	0.11	0.04	0.28	0.01	0.49	0.47	0.37
C5'	0.04	0.10	0.02	0.02	0.13	0.01	0.19	0.00	0.18	0.23	0.14	0.09	0.09	0.24	0.13	0.06	0.05	0.03	0.01	0.21	0.13	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.13	0.12	0.04	0.29	0.01	0.53	0.53	0.40
C8	0.02	0.02	0.06	0.16	0.01	0.12	0.01	0.23	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.17	0.05	0.30	0.02	0.42	0.37	0.34
N1	0.03	0.01	0.09	0.09	0.02	0.04	0.02	0.14	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.18	0.13	0.05	0.25	0.02	0.48	0.49	0.35
N2	0.05	0.00	0.13	0.12	0.02	0.06	0.02	0.09	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.23	0.20	0.06	0.20	0.04	0.41	0.43	0.27
N3	0.03	0.01	0.11	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.18	0.14	0.04	0.19	0.02	0.37	0.37	0.24
N7	0.02	0.02	0.05	0.15	0.01	0.11	0.00	0.24	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.17	0.05	0.33	0.03	0.52	0.50	0.42
N9	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.05	0.02	0.13	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.04	0.08	0.02	0.21	0.02	0.33	0.28	0.24
O2'	0.02	0.20	0.00	0.02	0.11	0.07	0.09	0.06	0.13	0.04	0.18	0.23	0.18	0.05	0.04	0.00	0.09	0.07	0.07	0.12	0.32	0.26	0.13
O3'	0.03	0.15	0.04	0.01	0.08	0.03	0.11	0.05	0.12	0.17	0.13	0.20	0.14	0.17	0.08	0.09	0.00	0.03	0.22	0.13	0.63	0.47	0.40
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.05	0.05	0.06	0.04	0.05	0.02	0.07	0.03	0.00	0.15	0.05	0.24	0.20	0.26
O5'	0.12	0.21	0.11	0.16	0.23	0.02	0.28	0.01	0.29	0.30	0.25	0.20	0.19	0.33	0.21	0.07	0.22	0.15	0.00	0.31	0.03	0.02	0.01
O6	0.03	0.03	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.21	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.12	0.13	0.05	0.31	0.00	0.58	0.58	0.46
OP1	0.23	0.42	0.39	0.47	0.40	0.15	0.49	0.13	0.53	0.42	0.48	0.41	0.37	0.52	0.33	0.32	0.63	0.24	0.03	0.58	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.43	0.34	0.38	0.37	0.12	0.47	0.06	0.53	0.37	0.49	0.43	0.37	0.50	0.28	0.26	0.47	0.20	0.02	0.58	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.28	0.18	0.28	0.28	0.08	0.37	0.02	0.40	0.34	0.35	0.27	0.24	0.42	0.24	0.13	0.40	0.26	0.01	0.46	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.35	0.34	0.34	0.23	0.28	0.25	0.37	0.25	0.33	0.33	0.25	0.25	0.30	0.28	0.29	0.32	0.28	0.33	0.35	0.55	0.39
C2	0.19	0.16	0.22	0.19	0.16	0.20	0.16	0.20	0.15	0.20	0.15	0.15	0.15	0.18	0.19	0.20	0.22	0.27	0.39	0.32	0.56	0.42
C2'	0.26	0.29	0.29	0.33	0.26	0.26	0.30	0.39	0.29	0.34	0.29	0.23	0.30	0.35	0.29	0.23	0.31	0.25	0.28	0.29	0.48	0.32
C3'	0.26	0.29	0.30	0.34	0.27	0.26	0.32	0.40	0.33	0.35	0.32	0.24	0.36	0.37	0.29	0.23	0.32	0.25	0.29	0.29	0.49	0.33
C4	0.20	0.24	0.28	0.25	0.18	0.18	0.19	0.22	0.19	0.22	0.22	0.20	0.20	0.21	0.20	0.23	0.26	0.22	0.36	0.36	0.56	0.43
C4'	0.28	0.32	0.30	0.32	0.22	0.27	0.24	0.40	0.25	0.32	0.33	0.23	0.26	0.30	0.27	0.25	0.30	0.27	0.30	0.31	0.52	0.35
C5	0.19	0.21	0.26	0.22	0.17	0.20	0.18	0.23	0.18	0.22	0.21	0.18	0.19	0.20	0.19	0.22	0.23	0.25	0.39	0.40	0.58	0.47
C5'	0.30	0.32	0.32	0.34	0.23	0.30	0.24	0.41	0.25	0.32	0.33	0.24	0.26	0.29	0.28	0.28	0.32	0.31	0.32	0.33	0.53	0.37
C6	0.22	0.16	0.23	0.19	0.16	0.26	0.16	0.28	0.15	0.22	0.16	0.15	0.16	0.19	0.20	0.22	0.22	0.31	0.42	0.41	0.59	0.49
C8	0.24	0.28	0.31	0.28	0.21	0.21	0.22	0.27	0.23	0.27	0.28	0.22	0.24	0.26	0.24	0.26	0.28	0.24	0.36	0.41	0.58	0.46
N1	0.24	0.15	0.21	0.18	0.17	0.27	0.16	0.28	0.14	0.22	0.15	0.14	0.15	0.19	0.21	0.22	0.21	0.33	0.42	0.36	0.57	0.46
N2	0.24	0.16	0.20	0.17	0.18	0.23	0.17	0.20	0.15	0.22	0.16	0.16	0.15	0.19	0.22	0.22	0.20	0.32	0.40	0.28	0.55	0.39
N3	0.18	0.22	0.27	0.25	0.17	0.16	0.18	0.20	0.18	0.20	0.20	0.19	0.18	0.19	0.19	0.22	0.26	0.20	0.36	0.32	0.55	0.40
N7	0.21	0.24	0.28	0.24	0.19	0.21	0.20	0.25	0.21	0.24	0.24	0.19	0.22	0.23	0.21	0.24	0.25	0.25	0.38	0.44	0.60	0.49
N9	0.24	0.30	0.31	0.30	0.21	0.22	0.22	0.28	0.23	0.27	0.28	0.23	0.23	0.26	0.24	0.27	0.29	0.24	0.35	0.37	0.56	0.42
O2'	0.28	0.39	0.28	0.33	0.28	0.30	0.31	0.44	0.30	0.36	0.39	0.28	0.30	0.36	0.30	0.26	0.31	0.28	0.35	0.34	0.53	0.37
O3'	0.33	0.33	0.36	0.42	0.38	0.36	0.45	0.51	0.46	0.46	0.40	0.31	0.52	0.50	0.39	0.31	0.41	0.32	0.35	0.35	0.51	0.37
O4'	0.34	0.37	0.36	0.37	0.25	0.34	0.27	0.43	0.26	0.37	0.36	0.26	0.27	0.34	0.32	0.32	0.34	0.35	0.37	0.40	0.59	0.43
O5'	0.39	0.34	0.42	0.42	0.30	0.38	0.30	0.47	0.29	0.40	0.34	0.29	0.29	0.36	0.36	0.37	0.41	0.39	0.34	0.45	0.55	0.45
O6	0.25	0.14	0.23	0.21	0.17	0.32	0.16	0.35	0.14	0.23	0.16	0.14	0.16	0.20	0.22	0.24	0.23	0.36	0.45	0.45	0.60	0.52
OP1	0.45	0.47	0.44	0.45	0.36	0.45	0.35	0.53	0.37	0.43	0.45	0.41	0.38	0.39	0.40	0.43	0.44	0.48	0.50	0.63	0.78	0.65
OP2	0.49	0.53	0.54	0.53	0.45	0.47	0.45	0.53	0.47	0.48	0.53	0.47	0.48	0.47	0.46	0.53	0.53	0.48	0.50	0.65	0.70	0.63
P	0.42	0.35	0.44	0.44	0.32	0.42	0.33	0.50	0.32	0.44	0.36	0.30	0.34	0.41	0.39	0.41	0.43	0.44	0.43	0.62	0.71	0.62

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.26	0.13	0.26	0.14
C2	0.04	0.00	0.21	0.28	0.01	0.11	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.18	0.33	0.11	0.32	0.27	0.60	0.37
C2'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.10	0.02	0.06	0.03	0.10	0.13	0.16	0.22	0.08	0.09	0.03	0.00	0.03	0.03	0.18	0.11	0.23	0.05
C3'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.17	0.01	0.14	0.02	0.18	0.11	0.25	0.25	0.17	0.08	0.07	0.03	0.01	0.02	0.14	0.16	0.20	0.09
C4	0.02	0.01	0.10	0.17	0.00	0.10	0.01	0.24	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.18	0.06	0.35	0.30	0.57	0.37
C4'	0.00	0.11	0.02	0.01	0.10	0.00	0.11	0.01	0.12	0.10	0.12	0.10	0.14	0.12	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.14	0.15	0.18
C5	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.11	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.14	0.04	0.40	0.45	0.73	0.51
C5'	0.07	0.25	0.03	0.02	0.24	0.01	0.29	0.00	0.30	0.26	0.28	0.21	0.33	0.30	0.20	0.06	0.04	0.02	0.01	0.23	0.17	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.18	0.01	0.12	0.01	0.30	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.11	0.21	0.06	0.39	0.48	0.79	0.55
C8	0.02	0.01	0.13	0.11	0.01	0.10	0.01	0.26	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.09	0.13	0.08	0.45	0.47	0.65	0.48
N1	0.03	0.01	0.16	0.25	0.02	0.12	0.01	0.28	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.15	0.29	0.09	0.36	0.38	0.72	0.48
N3	0.04	0.01	0.22	0.25	0.01	0.10	0.01	0.21	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.17	0.29	0.10	0.30	0.21	0.51	0.30
N6	0.02	0.02	0.08	0.17	0.01	0.14	0.02	0.33	0.00	0.04	0.02	0.02	0.00	0.04	0.03	0.10	0.19	0.06	0.42	0.58	0.89	0.64
N7	0.02	0.01	0.09	0.08	0.01	0.12	0.01	0.30	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.08	0.10	0.05	0.44	0.56	0.80	0.59
N9	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.07	0.01	0.20	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.04	0.06	0.02	0.36	0.28	0.49	0.32
O2'	0.03	0.18	0.00	0.03	0.09	0.06	0.08	0.06	0.11	0.09	0.15	0.17	0.10	0.08	0.04	0.00	0.06	0.10	0.05	0.35	0.09	0.24
O3'	0.02	0.33	0.03	0.01	0.18	0.02	0.14	0.04	0.21	0.13	0.29	0.29	0.19	0.10	0.06	0.06	0.00	0.03	0.15	0.35	0.18	0.22
O4'	0.01	0.11	0.03	0.02	0.06	0.00	0.04	0.02	0.06	0.08	0.09	0.10	0.06	0.05	0.02	0.10	0.03	0.00	0.22	0.19	0.21	0.17
O5'	0.26	0.32	0.18	0.14	0.35	0.02	0.40	0.01	0.39	0.45	0.36	0.30	0.42	0.44	0.36	0.05	0.15	0.22	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.27	0.11	0.16	0.30	0.14	0.45	0.23	0.48	0.47	0.38	0.21	0.58	0.56	0.28	0.35	0.35	0.19	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.26	0.60	0.23	0.20	0.57	0.15	0.73	0.17	0.79	0.65	0.72	0.51	0.89	0.80	0.49	0.09	0.18	0.21	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.37	0.05	0.09	0.37	0.18	0.51	0.02	0.55	0.48	0.48	0.30	0.64	0.59	0.32	0.24	0.22	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00