Doublet Group distance statistics: 52982

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 5, 3, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.014 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.014, 0.027, 0.041, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.001, 0.017, 0.032, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.017 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.005, 0.021, 0.038, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.021 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.011, 0.034, 0.057, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.034 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.005, 0.033, 0.061, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.033 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.003, 0.037, 0.070, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.037 std_dev=0.034
N3	B	0, 0.133, 0.284, 0.435, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.284 std_dev=0.151
C4	B	0, 0.135, 0.302, 0.470, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.302 std_dev=0.168
C5	B	0, 0.145, 0.363, 0.581, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.363 std_dev=0.218
N9	B	0, 0.143, 0.362, 0.580, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.362 std_dev=0.219
C2	B	0, 0.098, 0.341, 0.584, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.341 std_dev=0.243
C1'	B	0, 0.145, 0.391, 0.637, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.391 std_dev=0.246
N7	B	0, 0.176, 0.447, 0.719, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.447 std_dev=0.272
C6	B	0, 0.114, 0.391, 0.668, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.391 std_dev=0.277
C8	B	0, 0.164, 0.450, 0.737, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.450 std_dev=0.287
N1	B	0, 0.072, 0.384, 0.697, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.384 std_dev=0.312
O2'	B	0, 0.146, 0.464, 0.782, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.464 std_dev=0.318
C2'	B	0, 0.128, 0.466, 0.803, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.466 std_dev=0.337
N6	B	0, 0.121, 0.474, 0.827, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.474 std_dev=0.353
O4'	A	0, -0.220, 0.173, 0.567, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.173 std_dev=0.393
C2'	A	0, -0.228, 0.198, 0.624, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.198 std_dev=0.426
O4'	B	0, 0.040, 0.521, 1.001, 1.949 max_d=1.949 avg_d=0.521 std_dev=0.481
O5'	A	0, -0.038, 0.557, 1.152, 2.346 max_d=2.346 avg_d=0.557 std_dev=0.595
C3'	B	0, 0.000, 0.601, 1.201, 2.354 max_d=2.354 avg_d=0.601 std_dev=0.601
C4'	A	0, -0.327, 0.278, 0.883, 2.276 max_d=2.276 avg_d=0.278 std_dev=0.605
C3'	A	0, -0.323, 0.285, 0.893, 2.292 max_d=2.292 avg_d=0.285 std_dev=0.608
O2'	A	0, -0.312, 0.299, 0.910, 2.305 max_d=2.305 avg_d=0.299 std_dev=0.611
C4'	B	0, -0.011, 0.622, 1.254, 2.508 max_d=2.508 avg_d=0.622 std_dev=0.632
P	A	0, 0.065, 0.717, 1.369, 2.623 max_d=2.623 avg_d=0.717 std_dev=0.652
OP1	A	0, 0.347, 1.076, 1.805, 2.979 max_d=2.979 avg_d=1.076 std_dev=0.729
OP2	A	0, 0.092, 0.823, 1.555, 2.931 max_d=2.931 avg_d=0.823 std_dev=0.732
O3'	B	0, -0.046, 0.695, 1.436, 2.926 max_d=2.926 avg_d=0.695 std_dev=0.741
O3'	A	0, -0.409, 0.375, 1.159, 2.953 max_d=2.953 avg_d=0.375 std_dev=0.784
C5'	A	0, -0.371, 0.446, 1.263, 3.125 max_d=3.125 avg_d=0.446 std_dev=0.817
O5'	B	0, -0.115, 0.762, 1.640, 3.493 max_d=3.493 avg_d=0.762 std_dev=0.877
C5'	B	0, -0.138, 0.775, 1.689, 3.646 max_d=3.646 avg_d=0.775 std_dev=0.914
P	B	0, -0.300, 0.968, 2.235, 5.029 max_d=5.029 avg_d=0.968 std_dev=1.267
OP1	B	0, -0.199, 1.070, 2.339, 5.121 max_d=5.121 avg_d=1.070 std_dev=1.269
OP2	B	0, -0.292, 1.016, 2.324, 5.199 max_d=5.199 avg_d=1.016 std_dev=1.308

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.17	0.00	0.10	0.01	0.12	0.43	0.21
C2	0.02	0.00	0.29	0.28	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.10	0.15	0.11	0.01	0.17	0.43	0.23
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.15	0.02	0.07	0.13	0.13	0.14	0.22	0.35	0.29	0.08	0.02	0.00	0.03	0.01	0.30	0.09	0.31	0.60	0.40
C3'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.24	0.01	0.27	0.02	0.31	0.17	0.31	0.28	0.24	0.23	0.17	0.03	0.01	0.02	0.07	0.32	0.03	0.15	0.09
C4	0.01	0.00	0.15	0.24	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.07	0.08	0.11	0.01	0.18	0.44	0.23
C4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.07	0.11	0.04	0.02	0.02	0.11	0.05	0.23	0.01	0.00	0.01	0.09	0.12	0.14	0.04
C5	0.01	0.00	0.07	0.27	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.15	0.04	0.16	0.01	0.22	0.43	0.23
C5'	0.06	0.07	0.13	0.02	0.07	0.00	0.08	0.00	0.08	0.10	0.07	0.07	0.07	0.11	0.06	0.10	0.15	0.01	0.01	0.09	0.16	0.05	0.01
C6	0.01	0.00	0.13	0.31	0.00	0.07	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.19	0.07	0.17	0.00	0.23	0.42	0.24
C8	0.01	0.01	0.14	0.17	0.00	0.11	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.28	0.10	0.09	0.16	0.01	0.22	0.47	0.23
N1	0.01	0.00	0.22	0.31	0.00	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.16	0.11	0.14	0.01	0.20	0.42	0.24
N2	0.03	0.01	0.35	0.28	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.08	0.17	0.10	0.01	0.15	0.42	0.23
N3	0.02	0.00	0.29	0.24	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.05	0.15	0.08	0.01	0.15	0.43	0.22
N7	0.01	0.00	0.08	0.23	0.00	0.11	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.28	0.16	0.05	0.19	0.01	0.25	0.43	0.23
N9	0.00	0.01	0.02	0.17	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.05	0.01	0.10	0.01	0.17	0.45	0.22
O2'	0.03	0.14	0.00	0.03	0.06	0.23	0.16	0.10	0.14	0.28	0.07	0.24	0.15	0.28	0.12	0.00	0.06	0.17	0.21	0.19	0.23	0.63	0.33
O3'	0.17	0.10	0.03	0.01	0.07	0.01	0.15	0.15	0.19	0.10	0.16	0.08	0.05	0.16	0.05	0.06	0.00	0.11	0.15	0.23	0.27	0.08	0.14
O4'	0.00	0.15	0.01	0.02	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.09	0.11	0.17	0.15	0.05	0.01	0.17	0.11	0.00	0.06	0.05	0.11	0.24	0.06
O5'	0.10	0.11	0.30	0.07	0.11	0.01	0.16	0.01	0.17	0.16	0.14	0.10	0.08	0.19	0.10	0.21	0.15	0.06	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.09	0.32	0.01	0.09	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.23	0.05	0.20	0.00	0.26	0.40	0.24
OP1	0.12	0.17	0.31	0.03	0.18	0.12	0.22	0.16	0.23	0.22	0.20	0.15	0.15	0.25	0.17	0.23	0.27	0.11	0.01	0.26	0.00	0.01	0.01
OP2	0.43	0.43	0.60	0.15	0.44	0.14	0.43	0.05	0.42	0.47	0.42	0.42	0.43	0.43	0.45	0.63	0.08	0.24	0.01	0.40	0.01	0.00	0.00
P	0.21	0.23	0.40	0.09	0.23	0.04	0.23	0.01	0.24	0.23	0.24	0.23	0.22	0.23	0.22	0.33	0.14	0.06	0.00	0.24	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.21	0.24	0.29	0.15	0.10	0.21	0.11	0.29	0.14	0.30	0.13	0.34	0.20	0.10	0.26	0.39	0.09	0.16	0.44	0.08	0.28
C2	0.09	0.11	0.24	0.21	0.09	0.09	0.10	0.08	0.12	0.08	0.12	0.09	0.13	0.09	0.08	0.29	0.29	0.12	0.10	0.16	0.11	0.13
C2'	0.39	0.56	0.18	0.11	0.48	0.25	0.52	0.20	0.56	0.45	0.59	0.48	0.58	0.49	0.43	0.19	0.13	0.40	0.14	0.15	0.25	0.04
C3'	0.15	0.21	0.08	0.17	0.15	0.05	0.15	0.08	0.18	0.12	0.21	0.18	0.19	0.13	0.13	0.09	0.23	0.16	0.18	0.53	0.12	0.37
C4	0.06	0.14	0.25	0.25	0.11	0.07	0.15	0.05	0.19	0.10	0.19	0.09	0.23	0.14	0.08	0.29	0.35	0.11	0.09	0.24	0.08	0.16
C4'	0.11	0.09	0.27	0.34	0.11	0.19	0.11	0.25	0.12	0.12	0.11	0.10	0.15	0.12	0.11	0.22	0.39	0.08	0.35	0.73	0.20	0.51
C5	0.08	0.12	0.25	0.24	0.10	0.09	0.14	0.08	0.18	0.11	0.17	0.09	0.22	0.14	0.08	0.31	0.35	0.14	0.08	0.16	0.09	0.11
C5'	0.14	0.14	0.30	0.35	0.15	0.21	0.16	0.26	0.16	0.16	0.15	0.15	0.17	0.16	0.16	0.24	0.39	0.12	0.37	0.75	0.21	0.52
C6	0.11	0.10	0.25	0.22	0.09	0.12	0.12	0.14	0.14	0.10	0.13	0.09	0.17	0.12	0.09	0.32	0.32	0.17	0.11	0.13	0.11	0.11
C8	0.06	0.16	0.26	0.27	0.12	0.07	0.19	0.05	0.24	0.13	0.23	0.10	0.30	0.19	0.09	0.30	0.39	0.12	0.09	0.27	0.08	0.17
N1	0.12	0.09	0.24	0.21	0.09	0.13	0.10	0.14	0.11	0.09	0.11	0.09	0.13	0.10	0.09	0.31	0.29	0.16	0.12	0.13	0.12	0.11
N2	0.11	0.11	0.23	0.20	0.10	0.10	0.10	0.09	0.10	0.10	0.11	0.11	0.11	0.10	0.10	0.27	0.24	0.12	0.12	0.15	0.13	0.14
N3	0.06	0.14	0.24	0.24	0.09	0.07	0.13	0.05	0.17	0.08	0.17	0.09	0.19	0.12	0.07	0.27	0.32	0.10	0.11	0.26	0.08	0.17
N7	0.08	0.14	0.25	0.25	0.11	0.08	0.17	0.07	0.21	0.13	0.20	0.09	0.26	0.17	0.09	0.32	0.38	0.15	0.08	0.19	0.08	0.12
N9	0.06	0.17	0.25	0.27	0.12	0.08	0.18	0.06	0.24	0.12	0.24	0.10	0.29	0.18	0.09	0.29	0.39	0.10	0.12	0.33	0.07	0.21
O2'	0.40	0.79	0.16	0.10	0.63	0.20	0.76	0.17	0.89	0.60	0.93	0.61	0.95	0.72	0.53	0.14	0.19	0.39	0.17	0.11	0.30	0.07
O3'	0.15	0.15	0.30	0.44	0.19	0.29	0.23	0.40	0.23	0.24	0.20	0.15	0.26	0.26	0.20	0.17	0.46	0.17	0.53	0.91	0.46	0.76
O4'	0.21	0.16	0.41	0.45	0.17	0.29	0.14	0.31	0.13	0.16	0.13	0.19	0.15	0.14	0.19	0.40	0.52	0.16	0.39	0.72	0.22	0.50
O5'	0.07	0.08	0.23	0.30	0.08	0.13	0.10	0.17	0.11	0.09	0.10	0.08	0.12	0.10	0.09	0.19	0.36	0.08	0.27	0.60	0.17	0.42
O6	0.12	0.09	0.25	0.22	0.09	0.15	0.11	0.18	0.12	0.10	0.11	0.08	0.15	0.11	0.10	0.33	0.32	0.19	0.14	0.17	0.13	0.13
OP1	0.14	0.12	0.30	0.34	0.13	0.19	0.12	0.22	0.11	0.13	0.11	0.13	0.12	0.12	0.14	0.28	0.41	0.11	0.30	0.62	0.16	0.42
OP2	0.40	0.37	0.59	0.63	0.39	0.46	0.36	0.47	0.34	0.38	0.34	0.39	0.32	0.37	0.40	0.58	0.70	0.36	0.56	0.78	0.47	0.66
P	0.22	0.20	0.40	0.44	0.21	0.27	0.19	0.30	0.18	0.21	0.18	0.22	0.17	0.19	0.22	0.38	0.50	0.18	0.39	0.68	0.26	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.13	0.08	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.16	0.52	0.11	0.25
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.06	0.04	0.07	0.04	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.04	0.07	0.10
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.09	0.08	0.08	0.09	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.12	0.08	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.14	0.47	0.13	0.21
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.06	0.06	0.05	0.02	0.08	0.07	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.17	0.17	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.02	0.17	0.63	0.19	0.24
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.12	0.10	0.10	0.06	0.14	0.12	0.06	0.03	0.03	0.01	0.01	0.25	0.27	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.02	0.19	0.71	0.20	0.28
C8	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.11	0.06	0.13	0.49	0.21	0.15
N1	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.18	0.64	0.16	0.28
N3	0.02	0.00	0.07	0.08	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.03	0.14	0.41	0.10	0.21
N6	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.10	0.03	0.21	0.82	0.24	0.31
N7	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.11	0.05	0.17	0.67	0.25	0.22
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.02	0.11	0.35	0.13	0.14
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.05	0.07	0.04	0.04	0.02	0.00	0.05	0.02	0.02	0.11	0.08	0.06
O3'	0.02	0.08	0.03	0.01	0.05	0.03	0.07	0.03	0.08	0.11	0.07	0.08	0.10	0.11	0.05	0.05	0.00	0.03	0.06	0.29	0.16	0.09
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02	0.03	0.03	0.05	0.02	0.02	0.03	0.00	0.06	0.03	0.09	0.04
O5'	0.07	0.16	0.04	0.03	0.14	0.01	0.17	0.01	0.19	0.13	0.18	0.14	0.21	0.17	0.11	0.02	0.06	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.13	0.52	0.04	0.12	0.47	0.17	0.63	0.25	0.71	0.49	0.64	0.41	0.82	0.67	0.35	0.11	0.29	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.11	0.07	0.08	0.13	0.17	0.19	0.27	0.20	0.21	0.16	0.10	0.24	0.25	0.13	0.08	0.16	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.25	0.10	0.08	0.21	0.03	0.24	0.01	0.28	0.15	0.28	0.21	0.31	0.22	0.14	0.06	0.09	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00