Doublet Group distance statistics: 52983

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.006, 0.030, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.030 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.005, 0.034, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.034 std_dev=0.030
N3	A	0, 0.008, 0.047, 0.087, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.047 std_dev=0.040
N1	A	0, 0.005, 0.044, 0.084, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.044 std_dev=0.040
N2	A	0, 0.012, 0.054, 0.097, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.054 std_dev=0.043
C5	A	0, 0.001, 0.048, 0.096, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.048 std_dev=0.047
C4	A	0, 0.003, 0.069, 0.134, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.069 std_dev=0.065
N9	A	0, 0.004, 0.081, 0.158, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.081 std_dev=0.077
O6	A	0, 0.014, 0.093, 0.171, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.093 std_dev=0.079
N7	A	0, 0.002, 0.100, 0.197, 0.199 max_d=0.199 avg_d=0.100 std_dev=0.097
C8	A	0, 0.005, 0.137, 0.268, 0.269 max_d=0.269 avg_d=0.137 std_dev=0.131
C4	B	0, 0.024, 0.545, 1.067, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.545 std_dev=0.522
C1'	B	0, 0.031, 0.578, 1.124, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.578 std_dev=0.547
C6	B	0, 0.026, 0.591, 1.157, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.591 std_dev=0.566
N3	B	0, 0.036, 0.607, 1.178, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.607 std_dev=0.571
C5	B	0, 0.003, 0.574, 1.146, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.574 std_dev=0.571
N6	B	0, 0.045, 0.618, 1.190, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.618 std_dev=0.572
N9	B	0, 0.023, 0.603, 1.182, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.603 std_dev=0.579
O2'	B	0, 0.073, 0.689, 1.305, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.689 std_dev=0.616
O4'	B	0, 0.025, 0.660, 1.295, 1.520 max_d=1.520 avg_d=0.660 std_dev=0.635
N1	B	0, 0.042, 0.705, 1.367, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.705 std_dev=0.663
O4'	A	0, 0.040, 0.714, 1.387, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.714 std_dev=0.673
C2'	B	0, 0.036, 0.723, 1.410, 1.591 max_d=1.591 avg_d=0.723 std_dev=0.687
C2	B	0, 0.037, 0.726, 1.414, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.726 std_dev=0.689
N7	B	0, 0.002, 0.724, 1.446, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.724 std_dev=0.722
C8	B	0, 0.018, 0.763, 1.508, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.763 std_dev=0.745
C4'	B	0, 0.044, 0.798, 1.552, 1.795 max_d=1.795 avg_d=0.798 std_dev=0.754
C3'	B	0, 0.042, 0.861, 1.679, 1.919 max_d=1.919 avg_d=0.861 std_dev=0.818
C2'	A	0, 0.036, 0.921, 1.806, 1.861 max_d=1.861 avg_d=0.921 std_dev=0.885
O3'	A	0, 0.049, 0.939, 1.828, 1.920 max_d=1.920 avg_d=0.939 std_dev=0.890
C5'	B	0, 0.037, 0.941, 1.845, 2.147 max_d=2.147 avg_d=0.941 std_dev=0.904
C3'	A	0, 0.038, 0.963, 1.888, 1.888 max_d=1.888 avg_d=0.963 std_dev=0.925
O3'	B	0, 0.073, 1.012, 1.952, 2.193 max_d=2.193 avg_d=1.012 std_dev=0.939
O5'	B	0, 0.033, 0.979, 1.925, 2.263 max_d=2.263 avg_d=0.979 std_dev=0.946
C4'	A	0, 0.041, 1.056, 2.072, 2.081 max_d=2.081 avg_d=1.056 std_dev=1.016
OP2	B	0, 0.035, 1.186, 2.338, 2.778 max_d=2.778 avg_d=1.186 std_dev=1.151
P	B	0, 0.017, 1.227, 2.436, 2.863 max_d=2.863 avg_d=1.227 std_dev=1.209
OP1	B	0, 0.003, 1.472, 2.940, 3.417 max_d=3.417 avg_d=1.472 std_dev=1.468
O2'	A	0, 0.087, 1.564, 3.040, 3.130 max_d=3.130 avg_d=1.564 std_dev=1.477
C5'	A	0, 0.076, 1.775, 3.475, 3.512 max_d=3.512 avg_d=1.775 std_dev=1.699
O5'	A	0, 0.115, 1.854, 3.593, 3.664 max_d=3.664 avg_d=1.854 std_dev=1.739
P	A	0, 0.081, 2.525, 4.969, 5.124 max_d=5.124 avg_d=2.525 std_dev=2.444
OP2	A	0, 0.049, 2.559, 5.070, 5.186 max_d=5.186 avg_d=2.559 std_dev=2.511
OP1	A	0, 0.104, 3.244, 6.385, 6.580 max_d=6.580 avg_d=3.244 std_dev=3.141

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.29	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03
C2	0.02	0.00	0.46	0.41	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.05	0.19	0.34	0.00	0.36	0.66	0.39
C2'	0.00	0.46	0.00	0.00	0.21	0.01	0.03	0.16	0.12	0.30	0.31	0.58	0.47	0.21	0.02	0.00	0.03	0.03	0.35	0.03	0.28	0.47	0.37
C3'	0.01	0.41	0.00	0.00	0.34	0.01	0.36	0.01	0.40	0.21	0.43	0.43	0.37	0.29	0.23	0.02	0.01	0.03	0.02	0.40	0.04	0.06	0.03
C4	0.00	0.00	0.21	0.34	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.03	0.10	0.33	0.00	0.35	0.56	0.37
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.00	0.16	0.01	0.15	0.22	0.09	0.02	0.01	0.23	0.11	0.31	0.02	0.01	0.01	0.18	0.03	0.01	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.36	0.00	0.16	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.43	0.09	0.01	0.47	0.01	0.54	0.78	0.55
C5'	0.02	0.06	0.16	0.01	0.12	0.01	0.24	0.00	0.24	0.30	0.15	0.01	0.02	0.34	0.14	0.13	0.22	0.01	0.01	0.30	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.12	0.40	0.00	0.15	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.39	0.12	0.05	0.51	0.00	0.61	0.90	0.62
C8	0.02	0.00	0.30	0.21	0.00	0.22	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.60	0.07	0.16	0.42	0.01	0.45	0.54	0.46
N1	0.00	0.00	0.31	0.43	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.09	0.13	0.44	0.00	0.52	0.82	0.53
N2	0.03	0.01	0.58	0.43	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.36	0.06	0.23	0.30	0.01	0.32	0.63	0.34
N3	0.02	0.01	0.47	0.37	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.02	0.21	0.26	0.00	0.26	0.51	0.29
N7	0.02	0.00	0.21	0.29	0.00	0.23	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.66	0.11	0.11	0.53	0.01	0.61	0.81	0.62
N9	0.01	0.00	0.02	0.23	0.00	0.11	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.27	0.07	0.01	0.26	0.01	0.26	0.38	0.28
O2'	0.03	0.15	0.00	0.02	0.15	0.31	0.43	0.13	0.39	0.60	0.14	0.36	0.22	0.66	0.27	0.00	0.03	0.23	0.25	0.53	0.16	0.58	0.31
O3'	0.29	0.05	0.03	0.01	0.03	0.02	0.09	0.22	0.12	0.07	0.09	0.06	0.02	0.11	0.07	0.03	0.00	0.15	0.21	0.14	0.38	0.20	0.27
O4'	0.01	0.19	0.03	0.03	0.10	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.13	0.23	0.21	0.11	0.01	0.23	0.15	0.00	0.08	0.01	0.03	0.12	0.08
O5'	0.02	0.34	0.35	0.02	0.33	0.01	0.47	0.01	0.51	0.42	0.44	0.30	0.26	0.53	0.26	0.25	0.21	0.08	0.00	0.57	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.00	0.03	0.40	0.00	0.18	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.53	0.14	0.01	0.57	0.00	0.73	1.03	0.72
OP1	0.03	0.36	0.28	0.04	0.35	0.03	0.54	0.04	0.61	0.45	0.52	0.32	0.26	0.61	0.26	0.16	0.38	0.03	0.01	0.73	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.66	0.47	0.06	0.56	0.01	0.78	0.01	0.90	0.54	0.82	0.63	0.51	0.81	0.38	0.58	0.20	0.12	0.01	1.03	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.39	0.37	0.03	0.37	0.01	0.55	0.01	0.62	0.46	0.53	0.34	0.29	0.62	0.28	0.31	0.27	0.08	0.00	0.72	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.37	0.47	0.51	0.49	0.38	0.40	0.33	0.33	0.31	0.31	0.38	0.46	0.25	0.29	0.36	0.55	0.57	0.31	0.23	0.22	0.11	0.16
C2	0.21	0.09	0.34	0.34	0.12	0.29	0.08	0.23	0.07	0.11	0.07	0.15	0.09	0.08	0.15	0.43	0.43	0.19	0.12	0.14	0.04	0.08
C2'	1.08	1.11	1.27	1.27	1.09	1.13	1.04	1.08	0.98	1.06	1.01	1.13	0.88	1.03	1.09	1.26	1.36	1.01	1.01	1.04	0.90	0.95
C3'	0.73	0.56	0.99	0.97	0.59	0.82	0.46	0.72	0.35	0.56	0.38	0.66	0.22	0.46	0.64	1.08	1.14	0.66	0.58	0.61	0.37	0.48
C4	0.25	0.28	0.41	0.39	0.22	0.30	0.15	0.23	0.13	0.15	0.18	0.30	0.10	0.13	0.21	0.49	0.49	0.19	0.12	0.13	0.04	0.06
C4'	0.19	0.21	0.45	0.40	0.13	0.25	0.11	0.12	0.14	0.10	0.11	0.24	0.24	0.14	0.12	0.56	0.57	0.10	0.06	0.07	0.25	0.16
C5	0.20	0.23	0.35	0.35	0.17	0.26	0.12	0.19	0.11	0.10	0.16	0.25	0.08	0.09	0.15	0.44	0.46	0.14	0.08	0.10	0.05	0.04
C5'	0.14	0.16	0.45	0.39	0.09	0.19	0.20	0.06	0.25	0.18	0.13	0.19	0.41	0.27	0.09	0.60	0.61	0.06	0.17	0.17	0.42	0.31
C6	0.14	0.14	0.28	0.29	0.11	0.22	0.07	0.17	0.07	0.06	0.09	0.17	0.08	0.06	0.10	0.37	0.40	0.10	0.06	0.09	0.05	0.03
C8	0.25	0.36	0.42	0.40	0.25	0.29	0.19	0.21	0.19	0.16	0.27	0.35	0.14	0.15	0.22	0.49	0.52	0.17	0.10	0.11	0.05	0.04
N1	0.14	0.08	0.27	0.28	0.08	0.24	0.06	0.19	0.07	0.06	0.06	0.11	0.09	0.06	0.09	0.36	0.38	0.12	0.08	0.10	0.04	0.05
N2	0.21	0.09	0.32	0.32	0.07	0.30	0.06	0.26	0.10	0.10	0.12	0.05	0.13	0.06	0.12	0.41	0.39	0.21	0.14	0.16	0.05	0.11
N3	0.27	0.21	0.42	0.40	0.21	0.33	0.14	0.26	0.10	0.16	0.12	0.28	0.09	0.13	0.22	0.49	0.49	0.23	0.14	0.15	0.04	0.09
N7	0.20	0.29	0.37	0.36	0.20	0.25	0.14	0.18	0.15	0.11	0.21	0.29	0.11	0.10	0.17	0.45	0.48	0.13	0.07	0.09	0.06	0.03
N9	0.29	0.37	0.45	0.42	0.28	0.33	0.21	0.25	0.20	0.20	0.27	0.37	0.15	0.18	0.26	0.51	0.53	0.22	0.14	0.15	0.04	0.07
O2'	1.14	1.42	1.21	1.25	1.37	1.15	1.48	1.17	1.53	1.39	1.53	1.30	1.55	1.48	1.30	1.04	1.25	1.10	1.21	1.24	1.26	1.22
O3'	0.38	0.10	0.64	0.65	0.21	0.50	0.12	0.41	0.07	0.24	0.07	0.23	0.15	0.15	0.28	0.73	0.83	0.33	0.28	0.34	0.08	0.19
O4'	0.07	0.16	0.19	0.15	0.12	0.06	0.19	0.13	0.20	0.21	0.14	0.13	0.27	0.25	0.13	0.28	0.28	0.14	0.25	0.27	0.42	0.35
O5'	0.44	0.37	0.76	0.72	0.29	0.53	0.14	0.37	0.12	0.17	0.17	0.44	0.22	0.12	0.30	0.93	0.95	0.33	0.19	0.21	0.10	0.06
O6	0.10	0.12	0.23	0.25	0.08	0.19	0.06	0.15	0.06	0.05	0.08	0.13	0.08	0.06	0.07	0.31	0.36	0.06	0.04	0.07	0.06	0.03
OP1	0.37	0.24	0.79	0.74	0.15	0.49	0.14	0.29	0.23	0.08	0.10	0.34	0.47	0.21	0.18	1.01	1.04	0.23	0.07	0.09	0.30	0.14
OP2	0.75	0.53	1.10	1.08	0.50	0.89	0.29	0.73	0.18	0.39	0.28	0.65	0.14	0.25	0.55	1.32	1.35	0.65	0.50	0.54	0.19	0.35
P	0.43	0.35	0.80	0.75	0.26	0.54	0.12	0.36	0.14	0.13	0.14	0.42	0.31	0.13	0.27	1.00	1.02	0.31	0.15	0.17	0.18	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.10	0.08	0.07
C2	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.18	0.22	0.27	0.22
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.05	0.03
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.08	0.03	0.09	0.09	0.07	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.00
C4	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.17	0.20	0.23	0.20
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.05	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.01	0.00
C5	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.20	0.24	0.28	0.25
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.11	0.11	0.10	0.08	0.12	0.13	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.20	0.26	0.31	0.27
C8	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.18	0.21	0.20	0.21
N1	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.00	0.20	0.25	0.31	0.25
N3	0.02	0.00	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.16	0.19	0.23	0.19
N6	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.21	0.28	0.34	0.29
N7	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.21	0.25	0.28	0.27
N9	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.14	0.17	0.17	0.16
O2'	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.05	0.04	0.01
O3'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.08	0.03	0.10	0.09	0.07	0.04	0.04	0.03	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.04
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.09	0.03	0.04
O5'	0.07	0.18	0.03	0.01	0.17	0.00	0.20	0.01	0.20	0.18	0.20	0.16	0.21	0.21	0.14	0.02	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.10	0.22	0.05	0.05	0.20	0.06	0.24	0.07	0.26	0.21	0.25	0.19	0.28	0.25	0.17	0.05	0.05	0.09	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.27	0.05	0.03	0.23	0.01	0.28	0.01	0.31	0.20	0.31	0.23	0.34	0.28	0.17	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.22	0.03	0.00	0.20	0.00	0.25	0.01	0.27	0.21	0.25	0.19	0.29	0.27	0.16	0.01	0.04	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00