Doublet Group distance statistics: 52997

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.002, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N2	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.025 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.002, 0.018, 0.034, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.003, 0.019, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.002, 0.020, 0.038, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.001, 0.019, 0.038, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.004, 0.024, 0.045, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.024 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.003, 0.024, 0.045, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.024 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.009, 0.039, 0.069, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.039 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.005, 0.036, 0.068, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.036 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.004, 0.040, 0.076, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.040 std_dev=0.036
C2'	A	0, 0.016, 0.060, 0.103, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.060 std_dev=0.043
O4'	A	0, -0.008, 0.056, 0.121, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.056 std_dev=0.064
O2'	A	0, 0.019, 0.099, 0.178, 0.222 max_d=0.222 avg_d=0.099 std_dev=0.080
C3'	A	0, 0.025, 0.121, 0.217, 0.232 max_d=0.232 avg_d=0.121 std_dev=0.096
C4'	A	0, 0.025, 0.172, 0.319, 0.333 max_d=0.333 avg_d=0.172 std_dev=0.147
O3'	A	0, 0.011, 0.194, 0.378, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.194 std_dev=0.184
C4	B	0, 0.017, 0.246, 0.476, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.246 std_dev=0.230
O4	B	0, 0.026, 0.256, 0.487, 0.558 max_d=0.558 avg_d=0.256 std_dev=0.231
N3	B	0, -0.045, 0.224, 0.492, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.224 std_dev=0.268
C5'	A	0, 0.036, 0.334, 0.632, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.334 std_dev=0.298
N1	B	0, 0.011, 0.309, 0.608, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.309 std_dev=0.298
OP2	A	0, 0.015, 0.327, 0.640, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.327 std_dev=0.312
C2	B	0, -0.036, 0.285, 0.606, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.285 std_dev=0.321
C1'	B	0, 0.013, 0.369, 0.725, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.369 std_dev=0.356
C5	B	0, 0.043, 0.403, 0.763, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.403 std_dev=0.360
C6	B	0, 0.046, 0.408, 0.770, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.408 std_dev=0.362
P	A	0, -0.014, 0.374, 0.763, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.374 std_dev=0.389
O4'	B	0, -0.004, 0.409, 0.822, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.409 std_dev=0.413
OP1	A	0, -0.039, 0.397, 0.834, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.397 std_dev=0.436
O2	B	0, -0.017, 0.433, 0.884, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.433 std_dev=0.451
O5'	B	0, 0.015, 0.497, 0.979, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.497 std_dev=0.482
OP2	B	0, 0.077, 0.581, 1.086, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.581 std_dev=0.504
C2'	B	0, -0.013, 0.520, 1.054, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.520 std_dev=0.534
O3'	B	0, -0.012, 0.528, 1.067, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.528 std_dev=0.539
P	B	0, -0.005, 0.557, 1.120, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.557 std_dev=0.563
C4'	B	0, -0.038, 0.532, 1.102, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.532 std_dev=0.570
O5'	A	0, 0.023, 0.597, 1.171, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.597 std_dev=0.574
O2'	B	0, 0.010, 0.595, 1.179, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.595 std_dev=0.585
C3'	B	0, -0.033, 0.553, 1.139, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.553 std_dev=0.586
C5'	B	0, -0.084, 0.664, 1.413, 1.906 max_d=1.906 avg_d=0.664 std_dev=0.749
OP1	B	0, -0.150, 0.651, 1.452, 2.013 max_d=2.013 avg_d=0.651 std_dev=0.801

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.12	0.02	0.13	0.14	0.08
C2	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.05	0.02	0.28	0.01	0.20	0.13	0.16
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.05	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.17	0.01	0.18	0.11	0.11
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.07	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.23	0.06	0.23	0.09	0.15
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.02	0.00	0.27	0.02	0.18	0.13	0.15
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.06	0.04	0.04	0.03	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.08	0.11	0.23	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.06	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.00	0.31	0.02	0.18	0.13	0.16
C5'	0.04	0.12	0.02	0.02	0.13	0.01	0.18	0.00	0.19	0.17	0.16	0.11	0.10	0.20	0.12	0.05	0.02	0.02	0.01	0.22	0.19	0.32	0.01
C6	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.32	0.01	0.19	0.13	0.17
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.06	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.28	0.03	0.16	0.12	0.14
N1	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.04	0.01	0.16	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.31	0.01	0.20	0.13	0.17
N2	0.02	0.01	0.06	0.07	0.02	0.04	0.02	0.11	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.09	0.09	0.02	0.27	0.02	0.20	0.13	0.16
N3	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.01	0.25	0.02	0.19	0.14	0.15
N7	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.20	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.32	0.04	0.17	0.13	0.17
N9	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.23	0.03	0.16	0.13	0.13
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.05	0.09	0.07	0.03	0.03	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.13	0.13	0.05
O3'	0.03	0.05	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.07	0.01	0.09	0.07	0.07	0.02	0.07	0.00	0.02	0.16	0.07	0.21	0.13	0.12
O4'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.10	0.18	0.04
O5'	0.12	0.28	0.17	0.23	0.27	0.02	0.31	0.01	0.32	0.28	0.31	0.27	0.25	0.32	0.23	0.05	0.16	0.04	0.00	0.33	0.02	0.03	0.01
O6	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.08	0.02	0.22	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.07	0.03	0.33	0.00	0.17	0.12	0.17
OP1	0.13	0.20	0.18	0.23	0.18	0.11	0.18	0.19	0.19	0.16	0.20	0.20	0.19	0.17	0.16	0.13	0.21	0.10	0.02	0.17	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.13	0.11	0.09	0.13	0.23	0.13	0.32	0.13	0.12	0.13	0.13	0.14	0.13	0.13	0.13	0.13	0.18	0.03	0.12	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.16	0.11	0.15	0.15	0.01	0.16	0.01	0.17	0.14	0.17	0.16	0.15	0.17	0.13	0.05	0.12	0.04	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.08	0.08	0.07	0.10	0.06	0.16	0.10	0.12	0.04	0.08	0.18	0.04	0.08	0.15	0.04	0.25	0.07	0.17	0.05
C2	0.13	0.10	0.20	0.15	0.08	0.12	0.08	0.14	0.09	0.11	0.06	0.17	0.27	0.12	0.12	0.12	0.14	0.19	0.04	0.04
C2'	0.05	0.12	0.12	0.11	0.11	0.10	0.15	0.15	0.10	0.02	0.13	0.23	0.06	0.08	0.16	0.05	0.26	0.19	0.16	0.04
C3'	0.05	0.12	0.11	0.11	0.13	0.10	0.21	0.15	0.16	0.02	0.12	0.26	0.06	0.11	0.18	0.05	0.30	0.16	0.21	0.06
C4	0.08	0.10	0.15	0.11	0.06	0.09	0.05	0.12	0.01	0.06	0.07	0.20	0.18	0.07	0.11	0.08	0.19	0.12	0.09	0.01
C4'	0.10	0.04	0.04	0.04	0.18	0.03	0.31	0.03	0.26	0.11	0.06	0.18	0.08	0.11	0.21	0.06	0.36	0.11	0.30	0.17
C5	0.08	0.10	0.17	0.13	0.04	0.09	0.05	0.12	0.01	0.06	0.04	0.19	0.22	0.09	0.10	0.08	0.19	0.11	0.09	0.02
C5'	0.08	0.08	0.03	0.03	0.16	0.02	0.32	0.01	0.27	0.09	0.07	0.25	0.06	0.10	0.19	0.05	0.38	0.17	0.36	0.23
C6	0.11	0.10	0.21	0.16	0.04	0.11	0.03	0.13	0.04	0.08	0.03	0.18	0.28	0.13	0.09	0.10	0.15	0.14	0.08	0.01
C8	0.06	0.10	0.12	0.10	0.06	0.07	0.12	0.11	0.08	0.04	0.06	0.20	0.13	0.06	0.10	0.06	0.24	0.05	0.13	0.05
N1	0.13	0.10	0.22	0.17	0.05	0.12	0.06	0.14	0.07	0.10	0.03	0.16	0.30	0.13	0.10	0.12	0.14	0.18	0.06	0.03
N2	0.16	0.10	0.23	0.18	0.10	0.15	0.13	0.17	0.15	0.14	0.05	0.14	0.30	0.14	0.12	0.15	0.15	0.23	0.07	0.08
N3	0.09	0.11	0.16	0.12	0.09	0.10	0.06	0.13	0.04	0.08	0.09	0.19	0.20	0.08	0.14	0.09	0.16	0.17	0.06	0.02
N7	0.07	0.10	0.15	0.12	0.06	0.08	0.09	0.11	0.05	0.05	0.04	0.20	0.18	0.08	0.10	0.07	0.22	0.06	0.12	0.05
N9	0.06	0.10	0.12	0.10	0.06	0.08	0.10	0.11	0.06	0.04	0.07	0.20	0.12	0.07	0.11	0.06	0.23	0.08	0.12	0.03
O2'	0.08	0.06	0.06	0.07	0.12	0.06	0.19	0.12	0.16	0.07	0.10	0.14	0.09	0.13	0.16	0.03	0.29	0.19	0.17	0.04
O3'	0.12	0.08	0.10	0.12	0.11	0.11	0.24	0.16	0.22	0.10	0.07	0.22	0.10	0.15	0.14	0.08	0.42	0.13	0.15	0.06
O4'	0.06	0.06	0.05	0.05	0.13	0.04	0.23	0.07	0.18	0.07	0.06	0.17	0.04	0.09	0.17	0.04	0.29	0.03	0.23	0.10
O5'	0.12	0.05	0.06	0.06	0.07	0.05	0.15	0.11	0.15	0.10	0.01	0.09	0.13	0.17	0.08	0.06	0.30	0.12	0.22	0.03
O6	0.12	0.10	0.23	0.19	0.04	0.13	0.03	0.14	0.04	0.09	0.03	0.18	0.32	0.16	0.09	0.11	0.15	0.14	0.08	0.01
OP1	0.18	0.06	0.13	0.11	0.17	0.10	0.30	0.03	0.29	0.18	0.05	0.07	0.21	0.21	0.16	0.13	0.38	0.12	0.32	0.17
OP2	0.16	0.22	0.21	0.21	0.06	0.19	0.07	0.24	0.07	0.13	0.18	0.33	0.16	0.18	0.03	0.16	0.30	0.15	0.18	0.07
P	0.11	0.06	0.06	0.05	0.09	0.05	0.20	0.07	0.19	0.10	0.03	0.14	0.10	0.14	0.09	0.07	0.32	0.01	0.24	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.05	0.02	0.01	0.13	0.28	0.15	0.06
C2	0.03	0.00	0.11	0.05	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.17	0.04	0.01	0.07	0.13	0.19	0.14	0.05
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.02	0.00	0.09	0.02	0.12	0.01	0.08	0.19	0.00	0.02	0.02	0.00	0.38	0.27	0.24	0.16
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.03	0.07	0.01	0.04	0.10	0.02	0.02	0.01	0.01	0.28	0.31	0.25	0.08
C4	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.04	0.00	0.01	0.13	0.03	0.07	0.04
C4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.06	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.34	0.24	0.04
C5	0.01	0.02	0.09	0.06	0.02	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.07	0.02	0.07	0.15	0.08	0.07	0.06
C5'	0.03	0.05	0.02	0.03	0.09	0.01	0.10	0.00	0.09	0.06	0.07	0.04	0.02	0.04	0.09	0.00	0.01	0.31	0.32	0.00
C6	0.01	0.02	0.12	0.07	0.02	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.02	0.02	0.15	0.08	0.03	0.10	0.16	0.06	0.07	0.07
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.14	0.18	0.13	0.06
N3	0.03	0.01	0.08	0.04	0.01	0.02	0.02	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01	0.13	0.04	0.00	0.05	0.13	0.12	0.10	0.04
O2	0.06	0.00	0.19	0.10	0.00	0.06	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.32	0.09	0.01	0.14	0.13	0.25	0.18	0.08
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.06	0.02	0.13	0.02	0.15	0.01	0.13	0.32	0.00	0.06	0.07	0.02	0.41	0.28	0.25	0.19
O3'	0.05	0.04	0.02	0.02	0.04	0.03	0.07	0.04	0.08	0.05	0.04	0.09	0.06	0.00	0.04	0.06	0.21	0.29	0.26	0.06
O4	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.03	0.02	0.00	0.01	0.07	0.04	0.00	0.01	0.12	0.07	0.08	0.05
O4'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.05	0.14	0.02	0.06	0.01	0.00	0.12	0.36	0.12	0.13
O5'	0.13	0.13	0.38	0.28	0.13	0.01	0.15	0.01	0.16	0.14	0.13	0.13	0.41	0.21	0.12	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.28	0.19	0.27	0.31	0.03	0.34	0.08	0.31	0.06	0.18	0.12	0.25	0.28	0.29	0.07	0.36	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.14	0.24	0.25	0.07	0.24	0.07	0.32	0.07	0.13	0.10	0.18	0.25	0.26	0.08	0.12	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.05	0.16	0.08	0.04	0.04	0.06	0.00	0.07	0.06	0.04	0.08	0.19	0.06	0.05	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00