Doublet Group distance statistics: 53001

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 13, 13, 4, 6, 2, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.012, 0.018, 0.023, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.016, 0.027, 0.037, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.027 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.020, 0.031, 0.042, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.031 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.013, 0.025, 0.037, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.016, 0.032, 0.047, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.032 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.022, 0.038, 0.054, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.038 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.020, 0.039, 0.059, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.039 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.019, 0.044, 0.069, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.044 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.030, 0.059, 0.089, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.059 std_dev=0.030
C2'	A	0, 0.160, 0.232, 0.303, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.232 std_dev=0.071
O4'	A	0, 0.108, 0.183, 0.257, 0.423 max_d=0.423 avg_d=0.183 std_dev=0.075
O2'	A	0, 0.308, 0.411, 0.515, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.411 std_dev=0.103
C4'	A	0, 0.188, 0.303, 0.417, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.303 std_dev=0.114
C3'	A	0, 0.192, 0.317, 0.442, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.317 std_dev=0.125
OP2	B	0, 0.203, 0.384, 0.565, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.384 std_dev=0.181
O3'	A	0, 0.301, 0.488, 0.674, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.488 std_dev=0.186
C5'	B	0, 0.111, 0.298, 0.485, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.298 std_dev=0.187
C5'	A	0, 0.254, 0.451, 0.647, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.451 std_dev=0.197
O5'	A	0, 0.186, 0.387, 0.588, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.387 std_dev=0.201
P	B	0, 0.145, 0.361, 0.577, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.361 std_dev=0.216
C4'	B	0, 0.136, 0.354, 0.572, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.354 std_dev=0.218
O5'	B	0, 0.135, 0.360, 0.586, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.360 std_dev=0.226
O4'	B	0, 0.181, 0.410, 0.640, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.410 std_dev=0.229
P	A	0, 0.235, 0.482, 0.728, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.482 std_dev=0.246
OP1	B	0, 0.233, 0.480, 0.727, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.480 std_dev=0.247
O3'	B	0, 0.153, 0.408, 0.662, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.408 std_dev=0.254
C3'	B	0, 0.163, 0.425, 0.687, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.425 std_dev=0.262
C1'	B	0, 0.219, 0.487, 0.754, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.487 std_dev=0.268
C6	B	0, 0.235, 0.509, 0.784, 1.546 max_d=1.546 avg_d=0.509 std_dev=0.274
OP2	A	0, 0.230, 0.514, 0.797, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.514 std_dev=0.283
O2'	B	0, 0.240, 0.524, 0.808, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.524 std_dev=0.284
N1	B	0, 0.236, 0.525, 0.815, 1.535 max_d=1.535 avg_d=0.525 std_dev=0.290
C2'	B	0, 0.193, 0.485, 0.777, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.485 std_dev=0.292
C5	B	0, 0.257, 0.556, 0.855, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.556 std_dev=0.299
OP1	A	0, 0.316, 0.620, 0.923, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.620 std_dev=0.304
C2	B	0, 0.273, 0.604, 0.936, 1.688 max_d=1.688 avg_d=0.604 std_dev=0.331
C4	B	0, 0.274, 0.615, 0.955, 1.803 max_d=1.803 avg_d=0.615 std_dev=0.341
N3	B	0, 0.287, 0.638, 0.989, 1.803 max_d=1.803 avg_d=0.638 std_dev=0.351
O2	B	0, 0.295, 0.654, 1.014, 1.754 max_d=1.754 avg_d=0.654 std_dev=0.359
O4	B	0, 0.293, 0.664, 1.034, 1.927 max_d=1.927 avg_d=0.664 std_dev=0.370

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.05	0.10	0.04
C2	0.03	0.00	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.05	0.04	0.06	0.07	0.16	0.08
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.10	0.05
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.04	0.04	0.04	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.08	0.09	0.05
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.06	0.06	0.14	0.08
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.03	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.08	0.06	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.07	0.09	0.16	0.10
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.06	0.05	0.04	0.07	0.07	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.09	0.04	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.03	0.07	0.11	0.17	0.11
C8	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.03	0.08	0.08	0.14	0.08
N1	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.05	0.03	0.06	0.09	0.17	0.10
N3	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.05	0.04	0.05	0.05	0.14	0.07
N6	0.02	0.02	0.04	0.04	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.03	0.08	0.13	0.17	0.12
N7	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.03	0.08	0.11	0.16	0.10
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.06	0.05	0.13	0.06
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.04	0.08	0.09	0.05
O3'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.07	0.05	0.05	0.05	0.07	0.03	0.04	0.00	0.01	0.09	0.10	0.11	0.08
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.07	0.08	0.04
O5'	0.05	0.06	0.03	0.05	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.08	0.06	0.05	0.08	0.08	0.06	0.04	0.09	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.05	0.07	0.06	0.08	0.06	0.08	0.09	0.09	0.11	0.08	0.09	0.05	0.13	0.11	0.05	0.08	0.10	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.16	0.10	0.09	0.14	0.06	0.16	0.04	0.17	0.14	0.17	0.14	0.17	0.16	0.13	0.09	0.11	0.08	0.01	0.02	0.00	0.02
P	0.04	0.08	0.05	0.05	0.08	0.02	0.10	0.01	0.11	0.08	0.10	0.07	0.12	0.10	0.06	0.05	0.08	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.14	0.11	0.11	0.14	0.11	0.14	0.12	0.13	0.12	0.14	0.16	0.13	0.12	0.14	0.11	0.11	0.09	0.12	0.07
C2	0.11	0.14	0.11	0.12	0.14	0.12	0.14	0.15	0.13	0.12	0.15	0.16	0.13	0.12	0.14	0.11	0.16	0.12	0.14	0.09
C2'	0.10	0.13	0.10	0.11	0.13	0.11	0.13	0.12	0.12	0.11	0.13	0.14	0.13	0.12	0.14	0.10	0.12	0.13	0.12	0.08
C3'	0.10	0.13	0.10	0.11	0.13	0.11	0.13	0.12	0.12	0.11	0.14	0.16	0.13	0.13	0.14	0.11	0.12	0.13	0.12	0.08
C4	0.09	0.14	0.09	0.10	0.14	0.10	0.14	0.13	0.12	0.11	0.15	0.16	0.12	0.10	0.14	0.09	0.15	0.07	0.14	0.07
C4'	0.11	0.14	0.12	0.12	0.14	0.12	0.14	0.12	0.13	0.13	0.14	0.17	0.15	0.14	0.14	0.12	0.11	0.11	0.11	0.07
C5	0.09	0.15	0.09	0.10	0.15	0.11	0.14	0.14	0.12	0.11	0.16	0.18	0.13	0.11	0.15	0.10	0.16	0.09	0.14	0.08
C5'	0.12	0.15	0.12	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.12	0.15	0.18	0.15	0.15	0.14	0.12	0.11	0.10	0.12	0.08
C6	0.09	0.16	0.09	0.11	0.16	0.12	0.15	0.15	0.13	0.11	0.17	0.19	0.12	0.11	0.16	0.10	0.17	0.12	0.14	0.10
C8	0.10	0.15	0.10	0.11	0.15	0.11	0.14	0.13	0.13	0.12	0.16	0.19	0.15	0.11	0.15	0.11	0.15	0.07	0.13	0.07
N1	0.10	0.15	0.10	0.11	0.16	0.12	0.15	0.15	0.13	0.12	0.16	0.17	0.12	0.11	0.16	0.10	0.17	0.14	0.15	0.10
N3	0.10	0.13	0.10	0.11	0.14	0.11	0.14	0.14	0.13	0.12	0.14	0.15	0.12	0.12	0.14	0.10	0.14	0.08	0.14	0.07
N6	0.10	0.17	0.10	0.11	0.16	0.12	0.15	0.15	0.13	0.11	0.18	0.21	0.13	0.11	0.17	0.11	0.18	0.13	0.15	0.10
N7	0.10	0.16	0.10	0.11	0.15	0.11	0.14	0.13	0.13	0.12	0.17	0.20	0.15	0.11	0.16	0.11	0.16	0.08	0.14	0.08
N9	0.09	0.14	0.09	0.10	0.14	0.10	0.14	0.12	0.12	0.11	0.14	0.16	0.13	0.11	0.14	0.10	0.14	0.07	0.13	0.07
O2'	0.12	0.13	0.12	0.12	0.14	0.12	0.15	0.12	0.14	0.12	0.13	0.13	0.15	0.13	0.14	0.12	0.11	0.16	0.11	0.09
O3'	0.10	0.13	0.10	0.12	0.13	0.11	0.14	0.12	0.12	0.11	0.13	0.15	0.13	0.13	0.14	0.11	0.11	0.15	0.12	0.08
O4'	0.12	0.15	0.12	0.12	0.14	0.12	0.14	0.12	0.13	0.13	0.15	0.17	0.15	0.14	0.14	0.12	0.10	0.09	0.13	0.08
O5'	0.15	0.19	0.15	0.14	0.17	0.14	0.17	0.14	0.16	0.16	0.19	0.22	0.18	0.15	0.17	0.15	0.13	0.08	0.12	0.07
OP1	0.09	0.13	0.10	0.11	0.12	0.12	0.12	0.13	0.11	0.10	0.13	0.16	0.14	0.13	0.12	0.11	0.13	0.09	0.12	0.08
OP2	0.13	0.14	0.13	0.16	0.14	0.16	0.15	0.18	0.15	0.12	0.14	0.17	0.15	0.17	0.15	0.14	0.19	0.15	0.22	0.17
P	0.08	0.12	0.08	0.10	0.11	0.10	0.12	0.12	0.11	0.09	0.12	0.16	0.12	0.11	0.12	0.09	0.13	0.10	0.16	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.16	0.04	0.04
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.02	0.07	0.21	0.06	0.07
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.06	0.09	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.15	0.07	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.06	0.09	0.02	0.01	0.06	0.01	0.08	0.13	0.09	0.05
C4	0.02	0.02	0.05	0.05	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.06	0.01	0.03	0.11	0.26	0.12	0.14
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.01	0.04	0.00	0.01	0.10	0.06	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.02	0.13	0.26	0.14	0.15
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.04	0.05	0.04	0.05	0.03	0.08	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.02	0.02	0.12	0.22	0.10	0.11
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.08	0.20	0.06	0.07
N3	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.02	0.07	0.08	0.02	0.03	0.09	0.23	0.09	0.11
O2	0.03	0.01	0.09	0.09	0.02	0.05	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.09	0.12	0.04	0.04	0.05	0.19	0.05	0.05
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.06	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02	0.07	0.09	0.00	0.03	0.06	0.04	0.04	0.12	0.10	0.04
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.03	0.06	0.03	0.08	0.12	0.03	0.00	0.07	0.01	0.11	0.10	0.13	0.07
O4	0.03	0.03	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.07	0.00	0.03	0.12	0.27	0.15	0.17
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.03	0.00	0.08	0.13	0.06	0.05
O5'	0.05	0.07	0.05	0.08	0.11	0.01	0.13	0.01	0.12	0.08	0.09	0.05	0.04	0.11	0.12	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.16	0.21	0.15	0.13	0.26	0.10	0.26	0.07	0.22	0.20	0.23	0.19	0.12	0.10	0.27	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.06	0.07	0.09	0.12	0.06	0.14	0.05	0.10	0.06	0.09	0.05	0.10	0.13	0.15	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.07	0.04	0.05	0.14	0.01	0.15	0.01	0.11	0.07	0.11	0.05	0.04	0.07	0.17	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00