Doublet Group distance statistics: 53013

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.001, 0.012, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.013
C5	A	0, -0.001, 0.017, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.017 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.001, 0.020, 0.039, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.020 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.001, 0.020, 0.039, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.019
C4	A	0, -0.001, 0.027, 0.055, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.027 std_dev=0.028
N9	A	0, -0.002, 0.028, 0.058, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.028 std_dev=0.030
N7	A	0, -0.004, 0.031, 0.065, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.031 std_dev=0.035
C8	A	0, -0.007, 0.038, 0.082, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.038 std_dev=0.045
N6	A	0, -0.008, 0.039, 0.085, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.039 std_dev=0.046
O4'	A	0, 0.070, 0.243, 0.416, 0.388 max_d=0.388 avg_d=0.243 std_dev=0.173
C4'	A	0, 0.081, 0.295, 0.509, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.295 std_dev=0.214
C3'	A	0, 0.094, 0.322, 0.549, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.322 std_dev=0.228
C2'	A	0, 0.054, 0.330, 0.606, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.330 std_dev=0.276
OP2	B	0, 0.162, 0.553, 0.944, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.553 std_dev=0.391
C5'	A	0, 0.121, 0.521, 0.920, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.521 std_dev=0.400
O5'	A	0, 0.122, 0.548, 0.975, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.548 std_dev=0.427
P	B	0, 0.180, 0.617, 1.054, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.617 std_dev=0.437
O3'	A	0, 0.075, 0.530, 0.985, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.530 std_dev=0.455
O5'	B	0, 0.211, 0.734, 1.256, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.734 std_dev=0.523
P	A	0, 0.216, 0.819, 1.422, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.819 std_dev=0.603
O2'	A	0, -0.004, 0.649, 1.302, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.649 std_dev=0.653
OP1	A	0, 0.272, 0.931, 1.590, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.931 std_dev=0.659
C5'	B	0, 0.208, 0.925, 1.641, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.925 std_dev=0.716
OP1	B	0, 0.293, 1.032, 1.772, 1.693 max_d=1.693 avg_d=1.032 std_dev=0.739
OP2	A	0, 0.303, 1.149, 1.995, 2.013 max_d=2.013 avg_d=1.149 std_dev=0.846
O4'	B	0, 0.244, 1.202, 2.160, 2.344 max_d=2.344 avg_d=1.202 std_dev=0.958
C4'	B	0, 0.278, 1.264, 2.251, 2.406 max_d=2.406 avg_d=1.264 std_dev=0.986
C3'	B	0, 0.388, 1.562, 2.736, 2.831 max_d=2.831 avg_d=1.562 std_dev=1.174
C6	B	0, 0.488, 1.742, 2.996, 2.899 max_d=2.899 avg_d=1.742 std_dev=1.254
C1'	B	0, 0.445, 1.782, 3.119, 3.220 max_d=3.220 avg_d=1.782 std_dev=1.337
N1	B	0, 0.525, 1.910, 3.295, 3.239 max_d=3.239 avg_d=1.910 std_dev=1.385
C2'	B	0, 0.537, 2.048, 3.558, 3.597 max_d=3.597 avg_d=2.048 std_dev=1.510
O3'	B	0, 0.522, 2.044, 3.565, 3.649 max_d=3.649 avg_d=2.044 std_dev=1.522
C5	B	0, 0.638, 2.211, 3.784, 3.526 max_d=3.526 avg_d=2.211 std_dev=1.573
C2	B	0, 0.705, 2.490, 4.274, 4.089 max_d=4.089 avg_d=2.490 std_dev=1.784
O2'	B	0, 0.656, 2.500, 4.343, 4.392 max_d=4.392 avg_d=2.500 std_dev=1.844
C4	B	0, 0.801, 2.764, 4.728, 4.377 max_d=4.377 avg_d=2.764 std_dev=1.964
N3	B	0, 0.815, 2.831, 4.846, 4.532 max_d=4.532 avg_d=2.831 std_dev=2.015
O2	B	0, 0.792, 2.810, 4.828, 4.647 max_d=4.647 avg_d=2.810 std_dev=2.018
O4	B	0, 0.948, 3.269, 5.590, 5.161 max_d=5.161 avg_d=3.269 std_dev=2.321

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.20	0.01	0.13	0.20	0.03	0.06
C2	0.00	0.00	0.21	0.09	0.01	0.03	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.20	0.18	0.12	0.14	0.20	0.07	0.08
C2'	0.00	0.21	0.00	0.01	0.10	0.02	0.03	0.20	0.07	0.15	0.15	0.22	0.03	0.10	0.02	0.00	0.03	0.01	0.39	0.26	0.38	0.38
C3'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.08	0.04	0.09	0.08	0.07	0.06	0.04	0.01	0.01	0.00	0.07	0.12	0.14	0.08
C4	0.00	0.01	0.10	0.07	0.00	0.02	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.15	0.07	0.14	0.18	0.06	0.07
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.01	0.13	0.03	0.01	0.01	0.16	0.05	0.03
C5	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.13	0.04	0.16	0.15	0.08	0.08
C5'	0.07	0.13	0.20	0.01	0.13	0.01	0.16	0.00	0.17	0.16	0.15	0.11	0.19	0.17	0.12	0.09	0.11	0.02	0.01	0.05	0.07	0.02
C6	0.00	0.01	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.08	0.14	0.06	0.15	0.16	0.09	0.09
C8	0.01	0.00	0.15	0.04	0.01	0.02	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.27	0.09	0.06	0.16	0.11	0.06	0.07
N1	0.00	0.01	0.15	0.09	0.00	0.03	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.16	0.10	0.15	0.19	0.09	0.09
N3	0.00	0.00	0.22	0.08	0.00	0.02	0.01	0.11	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.22	0.19	0.12	0.13	0.21	0.06	0.07
N6	0.01	0.02	0.03	0.07	0.00	0.04	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.14	0.13	0.05	0.16	0.15	0.11	0.10
N7	0.00	0.01	0.10	0.06	0.01	0.03	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.25	0.09	0.03	0.16	0.11	0.08	0.08
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.14	0.01	0.14	0.18	0.04	0.06
O2'	0.03	0.20	0.00	0.01	0.03	0.13	0.12	0.09	0.08	0.27	0.10	0.22	0.14	0.25	0.11	0.00	0.10	0.08	0.39	0.31	0.40	0.44
O3'	0.20	0.18	0.03	0.01	0.15	0.03	0.13	0.11	0.14	0.09	0.16	0.19	0.13	0.09	0.14	0.10	0.00	0.16	0.02	0.13	0.08	0.02
O4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.06	0.10	0.12	0.05	0.03	0.01	0.08	0.16	0.00	0.09	0.34	0.17	0.20
O5'	0.13	0.14	0.39	0.07	0.14	0.01	0.16	0.01	0.15	0.16	0.15	0.13	0.16	0.16	0.14	0.39	0.02	0.09	0.00	0.00	0.02	0.01
OP1	0.20	0.20	0.26	0.12	0.18	0.16	0.15	0.05	0.16	0.11	0.19	0.21	0.15	0.11	0.18	0.31	0.13	0.34	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.03	0.07	0.38	0.14	0.06	0.05	0.08	0.07	0.09	0.06	0.09	0.06	0.11	0.08	0.04	0.40	0.08	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.08	0.38	0.08	0.07	0.03	0.08	0.02	0.09	0.07	0.09	0.07	0.10	0.08	0.06	0.44	0.02	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.45	0.72	0.60	0.45	0.30	0.31	0.10	0.20	0.12	0.43	0.71	0.93	0.67	0.50	0.19	0.26	0.22	0.15	0.11	0.14
C2	0.14	0.35	0.26	0.20	0.21	0.07	0.04	0.04	0.07	0.17	0.37	0.43	0.26	0.20	0.21	0.00	0.19	0.13	0.09	0.13
C2'	0.52	0.81	0.59	0.46	0.61	0.38	0.36	0.33	0.35	0.55	0.86	0.97	0.65	0.47	0.64	0.39	0.44	0.39	0.37	0.39
C3'	0.47	0.72	0.60	0.44	0.37	0.31	0.09	0.20	0.16	0.45	0.71	0.93	0.69	0.49	0.33	0.27	0.23	0.20	0.17	0.18
C4	0.23	0.43	0.40	0.32	0.12	0.17	0.27	0.10	0.11	0.19	0.39	0.60	0.45	0.38	0.17	0.08	0.18	0.13	0.09	0.11
C4'	0.47	0.66	0.65	0.47	0.18	0.30	0.10	0.16	0.08	0.39	0.59	0.92	0.76	0.56	0.07	0.24	0.10	0.07	0.09	0.08
C5	0.08	0.17	0.27	0.24	0.34	0.10	0.49	0.07	0.32	0.04	0.18	0.36	0.35	0.34	0.45	0.04	0.18	0.14	0.07	0.10
C5'	0.44	0.53	0.66	0.51	0.09	0.34	0.26	0.21	0.14	0.32	0.38	0.80	0.80	0.63	0.24	0.25	0.07	0.04	0.09	0.07
C6	0.13	0.11	0.17	0.14	0.37	0.08	0.50	0.05	0.40	0.18	0.21	0.17	0.22	0.24	0.42	0.16	0.18	0.14	0.06	0.10
C8	0.21	0.31	0.41	0.34	0.33	0.20	0.45	0.13	0.23	0.10	0.23	0.56	0.52	0.45	0.52	0.07	0.18	0.14	0.08	0.11
N1	0.11	0.10	0.15	0.12	0.14	0.07	0.29	0.04	0.28	0.08	0.13	0.20	0.18	0.17	0.17	0.15	0.19	0.12	0.06	0.10
N3	0.29	0.55	0.41	0.31	0.35	0.17	0.02	0.11	0.07	0.32	0.57	0.65	0.43	0.32	0.30	0.12	0.19	0.13	0.10	0.13
N6	0.28	0.29	0.23	0.16	0.53	0.14	0.60	0.08	0.52	0.36	0.40	0.19	0.24	0.23	0.57	0.26	0.19	0.16	0.04	0.09
N7	0.08	0.15	0.29	0.26	0.48	0.13	0.57	0.09	0.36	0.08	0.23	0.36	0.40	0.39	0.65	0.03	0.17	0.14	0.07	0.10
N9	0.31	0.51	0.49	0.38	0.14	0.23	0.27	0.14	0.09	0.25	0.45	0.73	0.56	0.45	0.22	0.15	0.19	0.13	0.09	0.11
O2'	0.70	1.01	0.67	0.53	1.00	0.53	0.69	0.48	0.64	0.78	1.14	1.11	0.70	0.47	1.14	0.61	0.59	0.47	0.46	0.52
O3'	0.63	0.91	0.74	0.55	0.66	0.41	0.35	0.26	0.38	0.64	0.95	1.10	0.82	0.57	0.70	0.40	0.17	0.06	0.09	0.08
O4'	0.43	0.61	0.63	0.47	0.15	0.30	0.27	0.17	0.15	0.35	0.51	0.87	0.73	0.56	0.23	0.22	0.05	0.03	0.13	0.08
O5'	0.36	0.41	0.59	0.48	0.15	0.32	0.30	0.22	0.13	0.23	0.25	0.68	0.72	0.61	0.36	0.20	0.10	0.10	0.06	0.03
OP1	0.09	0.27	0.22	0.16	0.86	0.04	0.86	0.09	0.59	0.30	0.51	0.32	0.39	0.37	1.16	0.20	0.28	0.19	0.28	0.27
OP2	0.07	0.12	0.32	0.25	0.56	0.09	0.60	0.02	0.38	0.12	0.25	0.34	0.46	0.42	0.80	0.07	0.15	0.09	0.14	0.14
P	0.09	0.13	0.34	0.27	0.55	0.11	0.60	0.04	0.37	0.09	0.23	0.38	0.48	0.44	0.81	0.04	0.14	0.07	0.14	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.10	0.09	0.17	0.10
C2	0.01	0.00	0.07	0.11	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.15	0.02	0.02	0.18	0.20	0.33	0.22
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.05	0.13	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.03	0.14	0.06
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.07	0.00	0.03	0.03	0.02	0.05	0.11	0.15	0.02	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.09	0.02
C4	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.02	0.23	0.30	0.44	0.32
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.05	0.04	0.07	0.05	0.01	0.01	0.07	0.01	0.02	0.04	0.07	0.02
C5	0.02	0.00	0.02	0.03	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.04	0.21	0.28	0.40	0.31
C5'	0.03	0.10	0.02	0.03	0.15	0.01	0.14	0.00	0.12	0.08	0.13	0.08	0.01	0.03	0.15	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.18	0.22	0.31	0.25
N1	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.01	0.15	0.17	0.27	0.19
N3	0.00	0.00	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.14	0.02	0.01	0.21	0.26	0.40	0.28
O2	0.01	0.00	0.13	0.15	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.22	0.02	0.03	0.16	0.17	0.31	0.19
O2'	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.00	0.06	0.03	0.01	0.02	0.02	0.11	0.03
O3'	0.04	0.15	0.05	0.01	0.08	0.01	0.04	0.03	0.04	0.06	0.14	0.22	0.06	0.00	0.08	0.02	0.10	0.08	0.09	0.07
O4	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.08	0.00	0.02	0.24	0.33	0.47	0.35
O4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.11	0.09	0.11	0.08
O5'	0.10	0.18	0.04	0.07	0.23	0.02	0.21	0.01	0.18	0.15	0.21	0.16	0.02	0.10	0.24	0.11	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.09	0.20	0.03	0.02	0.30	0.04	0.28	0.04	0.22	0.17	0.26	0.17	0.02	0.08	0.33	0.09	0.01	0.00	0.04	0.00
OP2	0.17	0.33	0.14	0.09	0.44	0.07	0.40	0.05	0.31	0.27	0.40	0.31	0.11	0.09	0.47	0.11	0.03	0.04	0.00	0.01
P	0.10	0.22	0.06	0.02	0.32	0.02	0.31	0.02	0.25	0.19	0.28	0.19	0.03	0.07	0.35	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00