Doublet Group distance statistics: 53018

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C5	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C2	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C1'	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C4	A	0, 0.000, 0.036, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.036 std_dev=0.036
N3	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
N9	A	0, 0.000, 0.040, 0.079, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.040 std_dev=0.040
C8	A	0, 0.000, 0.042, 0.085, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.042 std_dev=0.042
P	B	0, 0.000, 0.309, 0.618, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.309 std_dev=0.309
OP1	B	0, 0.000, 0.337, 0.673, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.337 std_dev=0.337
O5'	B	0, 0.000, 0.536, 1.073, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.536 std_dev=0.536
OP2	B	0, 0.000, 0.563, 1.127, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.563 std_dev=0.563
C5'	B	0, 0.000, 0.575, 1.150, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.575 std_dev=0.575
C3'	B	0, 0.000, 0.777, 1.553, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.777 std_dev=0.777
O3'	A	0, 0.000, 0.785, 1.569, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.785 std_dev=0.785
C3'	A	0, 0.000, 0.875, 1.749, 1.749 max_d=1.749 avg_d=0.875 std_dev=0.875
C4'	B	0, 0.000, 1.067, 2.135, 2.135 max_d=2.135 avg_d=1.067 std_dev=1.067
O4'	A	0, 0.000, 1.110, 2.219, 2.219 max_d=2.219 avg_d=1.110 std_dev=1.110
C4'	A	0, 0.000, 1.161, 2.321, 2.321 max_d=2.321 avg_d=1.161 std_dev=1.161
C2'	A	0, 0.000, 1.170, 2.340, 2.340 max_d=2.340 avg_d=1.170 std_dev=1.170
C2'	B	0, 0.000, 1.177, 2.354, 2.354 max_d=2.354 avg_d=1.177 std_dev=1.177
O2'	B	0, 0.000, 1.311, 2.623, 2.623 max_d=2.623 avg_d=1.311 std_dev=1.311
O3'	B	0, 0.000, 1.333, 2.667, 2.667 max_d=2.667 avg_d=1.333 std_dev=1.333
O4'	B	0, 0.000, 1.988, 3.975, 3.975 max_d=3.975 avg_d=1.988 std_dev=1.988
O2'	A	0, 0.000, 2.069, 4.139, 4.139 max_d=4.139 avg_d=2.069 std_dev=2.069
C1'	B	0, 0.000, 2.308, 4.616, 4.616 max_d=4.616 avg_d=2.308 std_dev=2.308
C5'	A	0, 0.000, 2.424, 4.849, 4.849 max_d=4.849 avg_d=2.424 std_dev=2.424
O5'	A	0, 0.000, 2.860, 5.719, 5.719 max_d=5.719 avg_d=2.860 std_dev=2.860
N1	B	0, 0.000, 3.223, 6.446, 6.446 max_d=6.446 avg_d=3.223 std_dev=3.223
C6	B	0, 0.000, 3.442, 6.884, 6.884 max_d=6.884 avg_d=3.442 std_dev=3.442
OP1	A	0, 0.000, 3.714, 7.428, 7.428 max_d=7.428 avg_d=3.714 std_dev=3.714
P	A	0, 0.000, 3.903, 7.806, 7.806 max_d=7.806 avg_d=3.903 std_dev=3.903
C2	B	0, 0.000, 4.084, 8.167, 8.167 max_d=8.167 avg_d=4.084 std_dev=4.084
O2	B	0, 0.000, 4.089, 8.178, 8.178 max_d=8.178 avg_d=4.089 std_dev=4.089
OP2	A	0, 0.000, 4.443, 8.886, 8.886 max_d=8.886 avg_d=4.443 std_dev=4.443
C5	B	0, 0.000, 4.538, 9.076, 9.076 max_d=9.076 avg_d=4.538 std_dev=4.538
N3	B	0, 0.000, 5.085, 10.171, 10.171 max_d=10.171 avg_d=5.085 std_dev=5.085
C4	B	0, 0.000, 5.419, 10.839, 10.839 max_d=10.839 avg_d=5.419 std_dev=5.419
O4	B	0, 0.000, 6.466, 12.931, 12.931 max_d=12.931 avg_d=6.466 std_dev=6.466

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.00	0.15	0.02	0.20	0.11
C2	0.04	0.00	0.32	0.27	0.01	0.25	0.01	0.61	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.14	0.03	0.11	0.72	0.70	0.76	0.75
C2'	0.00	0.32	0.00	0.00	0.17	0.00	0.07	0.00	0.13	0.19	0.25	0.31	0.08	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.03	0.01
C3'	0.01	0.27	0.00	0.00	0.13	0.00	0.06	0.01	0.11	0.12	0.21	0.26	0.07	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.21	0.16	0.15
C4	0.02	0.01	0.17	0.13	0.00	0.13	0.00	0.26	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.02	0.08	0.17	0.20	0.04	0.13
C4'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.13	0.00	0.07	0.00	0.11	0.08	0.19	0.25	0.08	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.14	0.02	0.06
C5	0.00	0.01	0.07	0.06	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.05	0.08	0.06	0.33	0.17
C5'	0.01	0.61	0.00	0.01	0.26	0.00	0.10	0.00	0.24	0.25	0.46	0.58	0.15	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01
C6	0.02	0.00	0.13	0.11	0.01	0.11	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.02	0.06	0.12	0.11	0.08	0.04
C8	0.03	0.01	0.19	0.12	0.00	0.08	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.09	0.01	0.60	0.53	0.98	0.73
N1	0.03	0.00	0.25	0.21	0.00	0.19	0.01	0.46	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.01	0.09	0.48	0.47	0.43	0.47
N3	0.04	0.00	0.31	0.26	0.00	0.25	0.00	0.58	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.02	0.11	0.67	0.64	0.66	0.67
N6	0.01	0.00	0.08	0.07	0.01	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.05	0.02	0.05	0.30	0.14
N7	0.02	0.01	0.10	0.07	0.01	0.04	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.01	0.49	0.47	0.90	0.65
N9	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.03	0.21	0.11	0.38	0.25
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.06	0.01	0.03	0.00	0.06	0.09	0.11	0.12	0.04	0.05	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.11	0.07	0.07
O3'	0.06	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.09	0.01	0.02	0.03	0.08	0.06	0.03	0.00	0.04	0.05	0.33	0.22	0.21
O4'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.09	0.11	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.15	0.01	0.19	0.12
O5'	0.15	0.72	0.05	0.04	0.17	0.02	0.08	0.00	0.12	0.60	0.48	0.67	0.02	0.49	0.21	0.01	0.05	0.15	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.02	0.70	0.04	0.21	0.20	0.14	0.06	0.01	0.11	0.53	0.47	0.64	0.05	0.47	0.11	0.11	0.33	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.76	0.03	0.16	0.04	0.02	0.33	0.02	0.08	0.98	0.43	0.66	0.30	0.90	0.38	0.07	0.22	0.19	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.75	0.01	0.15	0.13	0.06	0.17	0.01	0.04	0.73	0.47	0.67	0.14	0.65	0.25	0.07	0.21	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.83	1.94	0.44	0.14	2.28	0.34	1.79	0.40	1.40	1.44	2.34	1.92	0.05	0.22	2.52	0.72	0.05	0.11	0.31	0.13
C2	1.06	2.09	0.43	0.09	2.87	0.40	2.61	0.40	2.05	1.79	2.59	1.84	0.12	0.19	3.13	0.98	0.23	0.02	0.19	0.06
C2'	0.42	1.64	0.12	0.31	2.00	0.18	1.47	0.11	1.04	1.08	2.09	1.67	0.29	0.74	2.31	0.24	0.48	0.47	0.83	0.66
C3'	0.04	1.02	0.13	0.42	1.25	0.31	0.83	0.18	0.51	0.56	1.35	1.09	0.59	0.81	1.48	0.05	0.56	0.41	0.81	0.65
C4	1.04	2.28	0.47	0.10	3.00	0.37	2.49	0.38	1.92	1.80	2.85	2.10	0.06	0.24	3.34	0.91	0.13	0.03	0.27	0.13
C4'	0.28	0.56	0.49	0.58	0.77	0.43	0.39	0.24	0.11	0.16	0.84	0.63	1.00	0.83	0.97	0.27	0.61	0.30	0.75	0.64
C5	1.15	2.45	0.51	0.12	3.36	0.41	2.79	0.39	2.12	1.95	3.12	2.25	0.13	0.22	3.86	1.00	0.19	0.02	0.18	0.08
C5'	1.30	0.39	1.51	1.58	0.08	1.41	0.47	1.14	0.83	0.82	0.04	0.32	1.95	1.76	0.20	1.29	1.46	1.00	1.35	1.36
C6	1.20	2.45	0.52	0.13	3.47	0.44	2.99	0.40	2.26	2.01	3.12	2.21	0.18	0.18	4.00	1.07	0.26	0.02	0.07	0.02
C8	1.04	2.37	0.50	0.12	3.07	0.37	2.43	0.38	1.85	1.80	3.00	2.27	0.06	0.25	3.53	0.89	0.10	0.04	0.26	0.13
N1	1.16	2.27	0.47	0.11	3.22	0.43	2.90	0.39	2.23	1.93	2.86	2.01	0.18	0.17	3.62	1.05	0.28	0.01	0.05	0.00
N3	0.98	2.06	0.41	0.08	2.69	0.36	2.33	0.38	1.85	1.70	2.53	1.86	0.04	0.24	2.92	0.88	0.12	0.03	0.31	0.14
N6	1.26	2.53	0.54	0.14	3.61	0.46	3.11	0.39	2.34	2.08	3.24	2.29	0.22	0.17	4.24	1.11	0.29	0.02	0.01	0.02
N7	1.14	2.50	0.53	0.13	3.37	0.40	2.73	0.39	2.06	1.94	3.20	2.35	0.12	0.23	3.93	0.98	0.16	0.03	0.19	0.09
N9	0.97	2.22	0.46	0.10	2.79	0.35	2.23	0.37	1.72	1.69	2.76	2.12	0.01	0.26	3.14	0.83	0.07	0.04	0.30	0.15
O2'	0.99	2.30	0.67	0.11	2.65	0.24	2.07	0.24	1.63	1.68	2.77	2.35	0.30	0.37	2.95	0.74	0.12	0.26	0.60	0.37
O3'	0.67	1.47	0.56	0.29	1.51	0.37	1.16	0.44	0.94	1.06	1.67	1.61	0.10	0.06	1.65	0.59	0.02	0.13	0.34	0.12
O4'	0.23	1.15	0.10	0.22	1.41	0.03	1.00	0.11	0.68	0.72	1.47	1.17	0.60	0.47	1.63	0.21	0.26	0.01	0.47	0.35
O5'	1.53	0.38	1.72	2.06	0.14	1.90	0.32	1.61	0.79	0.87	0.11	0.38	2.07	2.41	0.52	1.63	1.88	1.51	1.71	1.78
OP1	2.23	1.29	2.19	2.39	0.72	2.33	1.08	1.88	1.49	1.65	0.82	1.36	2.66	2.97	0.36	2.23	2.03	1.68	1.76	1.88
OP2	2.03	0.74	2.07	2.59	0.04	2.61	0.45	2.22	1.03	1.23	0.11	0.86	2.34	3.27	0.53	2.25	2.35	2.20	2.07	2.24
P	2.22	1.07	2.27	2.64	0.42	2.55	0.85	2.11	1.35	1.52	0.53	1.14	2.61	3.26	0.00	2.32	2.26	1.92	1.92	2.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.06	0.00	0.22	0.03	0.00	0.28	0.13	0.42	0.28
C2	0.05	0.00	0.11	0.11	0.01	0.03	0.01	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.20	0.01	0.08	0.61	0.43	1.02	0.66
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.02	0.19	0.11	0.21	0.04	0.05	0.27	0.00	0.02	0.07	0.02	0.16	0.12	0.16	0.17
C3'	0.04	0.11	0.00	0.00	0.09	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.13	0.14	0.00	0.01	0.11	0.00	0.30	0.15	0.38	0.28
C4	0.03	0.01	0.07	0.09	0.00	0.10	0.00	0.26	0.01	0.01	0.00	0.01	0.33	0.15	0.00	0.00	0.93	0.79	1.67	1.08
C4'	0.02	0.03	0.02	0.00	0.10	0.00	0.11	0.01	0.09	0.04	0.07	0.02	0.09	0.01	0.11	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.19	0.03	0.00	0.11	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.37	0.14	0.01	0.06	0.95	0.79	1.67	1.10
C5'	0.00	0.16	0.11	0.01	0.26	0.01	0.23	0.00	0.16	0.12	0.23	0.11	0.04	0.06	0.30	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01
C6	0.00	0.00	0.21	0.01	0.01	0.09	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00	0.32	0.15	0.01	0.08	0.81	0.60	1.30	0.88
N1	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.18	0.01	0.01	0.60	0.40	0.94	0.63
N3	0.04	0.00	0.05	0.13	0.00	0.07	0.00	0.23	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.17	0.01	0.05	0.79	0.62	1.37	0.89
O2	0.06	0.00	0.27	0.14	0.01	0.02	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.23	0.01	0.14	0.45	0.28	0.77	0.48
O2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.33	0.09	0.37	0.04	0.32	0.18	0.22	0.07	0.00	0.03	0.35	0.09	0.19	0.10	0.29	0.20
O3'	0.22	0.20	0.02	0.01	0.15	0.01	0.14	0.06	0.15	0.18	0.17	0.23	0.03	0.00	0.15	0.10	0.34	0.14	0.53	0.31
O4	0.03	0.01	0.07	0.11	0.00	0.11	0.01	0.30	0.01	0.01	0.01	0.01	0.35	0.15	0.00	0.01	1.00	0.89	1.86	1.20
O4'	0.00	0.08	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.05	0.14	0.09	0.10	0.01	0.00	0.39	0.15	0.48	0.37
O5'	0.28	0.61	0.16	0.30	0.93	0.01	0.95	0.00	0.81	0.60	0.79	0.45	0.19	0.34	1.00	0.39	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.13	0.43	0.12	0.15	0.79	0.04	0.79	0.03	0.60	0.40	0.62	0.28	0.10	0.14	0.89	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.42	1.02	0.16	0.38	1.67	0.02	1.67	0.03	1.30	0.94	1.37	0.77	0.29	0.53	1.86	0.48	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.28	0.66	0.17	0.28	1.08	0.01	1.10	0.01	0.88	0.63	0.89	0.48	0.20	0.31	1.20	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00