Doublet Group distance statistics: 53057

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N6	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.013, 0.028, 0.043, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.028 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.013, 0.029, 0.044, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.029 std_dev=0.016
O3'	A	0, 0.113, 0.277, 0.442, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.277 std_dev=0.164
C2'	A	0, 0.097, 0.294, 0.491, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.294 std_dev=0.197
O4'	A	0, 0.104, 0.302, 0.500, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.302 std_dev=0.198
P	A	0, 0.033, 0.247, 0.461, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.247 std_dev=0.214
C3'	A	0, 0.109, 0.324, 0.539, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.324 std_dev=0.215
C4'	A	0, 0.121, 0.358, 0.595, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.358 std_dev=0.237
O5'	A	0, 0.143, 0.399, 0.655, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.399 std_dev=0.256
OP2	A	0, 0.014, 0.334, 0.653, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.334 std_dev=0.320
O2'	A	0, 0.140, 0.487, 0.835, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.487 std_dev=0.347
OP1	A	0, 0.115, 0.491, 0.866, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.491 std_dev=0.376
O5'	B	0, 0.271, 0.704, 1.138, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.704 std_dev=0.434
P	B	0, 0.241, 0.684, 1.126, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.684 std_dev=0.443
OP2	B	0, 0.258, 0.718, 1.178, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.718 std_dev=0.460
C5'	A	0, 0.234, 0.713, 1.192, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.713 std_dev=0.479
OP1	B	0, 0.227, 0.721, 1.214, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.721 std_dev=0.493
C3'	B	0, 0.273, 0.783, 1.293, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.783 std_dev=0.510
C5	B	0, 0.314, 0.825, 1.337, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.825 std_dev=0.512
C6	B	0, 0.314, 0.832, 1.350, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.832 std_dev=0.518
O3'	B	0, 0.310, 0.834, 1.357, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.834 std_dev=0.523
C5'	B	0, 0.276, 0.803, 1.329, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.803 std_dev=0.527
C2'	B	0, 0.289, 0.829, 1.369, 1.485 max_d=1.485 avg_d=0.829 std_dev=0.540
N4	B	0, 0.308, 0.868, 1.429, 1.563 max_d=1.563 avg_d=0.868 std_dev=0.560
C4	B	0, 0.308, 0.872, 1.436, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.872 std_dev=0.564
C4'	B	0, 0.289, 0.855, 1.420, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.855 std_dev=0.566
N1	B	0, 0.304, 0.874, 1.445, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.874 std_dev=0.570
C1'	B	0, 0.308, 0.896, 1.484, 1.579 max_d=1.579 avg_d=0.896 std_dev=0.588
O4'	B	0, 0.305, 0.898, 1.491, 1.566 max_d=1.566 avg_d=0.898 std_dev=0.593
O2'	B	0, 0.326, 0.928, 1.531, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.928 std_dev=0.603
N3	B	0, 0.322, 0.976, 1.629, 1.825 max_d=1.825 avg_d=0.976 std_dev=0.654
C2	B	0, 0.327, 0.990, 1.652, 1.828 max_d=1.828 avg_d=0.990 std_dev=0.662
O2	B	0, 0.372, 1.117, 1.862, 2.067 max_d=2.067 avg_d=1.117 std_dev=0.745

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.00	0.18	0.23	0.18	0.09
C2	0.02	0.00	0.17	0.09	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.32	0.12	0.15	0.23	0.28	0.16	0.13
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.10	0.02	0.05	0.09	0.09	0.09	0.14	0.17	0.07	0.05	0.01	0.00	0.03	0.01	0.46	0.43	0.34	0.34
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.02	0.05	0.03	0.07	0.08	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.37	0.40	0.26	0.26
C4	0.01	0.01	0.10	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.15	0.10	0.08	0.24	0.25	0.16	0.12
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.06	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.19	0.01
C5	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.04	0.26	0.22	0.15	0.13
C5'	0.05	0.13	0.09	0.02	0.10	0.01	0.09	0.00	0.11	0.06	0.13	0.12	0.10	0.06	0.07	0.09	0.05	0.03	0.00	0.35	0.25	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.05	0.01	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.10	0.07	0.26	0.23	0.15	0.13
C8	0.01	0.01	0.09	0.03	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.14	0.10	0.09	0.27	0.18	0.16	0.12
N1	0.02	0.00	0.14	0.07	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.25	0.11	0.12	0.25	0.26	0.16	0.13
N3	0.02	0.00	0.17	0.08	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.31	0.11	0.15	0.21	0.28	0.16	0.12
N6	0.02	0.01	0.07	0.04	0.02	0.03	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.11	0.09	0.06	0.26	0.20	0.13	0.12
N7	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.10	0.09	0.05	0.28	0.17	0.15	0.13
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.24	0.23	0.16	0.11
O2'	0.01	0.32	0.00	0.02	0.15	0.01	0.08	0.09	0.15	0.14	0.25	0.31	0.11	0.10	0.03	0.00	0.03	0.01	0.49	0.45	0.42	0.40
O3'	0.10	0.12	0.03	0.00	0.10	0.01	0.09	0.05	0.10	0.10	0.11	0.11	0.09	0.09	0.09	0.03	0.00	0.07	0.24	0.31	0.20	0.18
O4'	0.00	0.15	0.01	0.01	0.08	0.00	0.04	0.03	0.07	0.09	0.12	0.15	0.06	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.17	0.15	0.23	0.13
O5'	0.18	0.23	0.46	0.37	0.24	0.01	0.26	0.00	0.26	0.27	0.25	0.21	0.26	0.28	0.24	0.49	0.24	0.17	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.23	0.28	0.43	0.40	0.25	0.24	0.22	0.35	0.23	0.18	0.26	0.28	0.20	0.17	0.23	0.45	0.31	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.16	0.34	0.26	0.16	0.19	0.15	0.25	0.15	0.16	0.16	0.16	0.13	0.15	0.16	0.42	0.20	0.23	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.13	0.34	0.26	0.12	0.01	0.13	0.01	0.13	0.12	0.13	0.12	0.12	0.13	0.11	0.40	0.18	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.07	0.10	0.09	0.15	0.07	0.17	0.08	0.13	0.06	0.12	0.18	0.09	0.14	0.18	0.04	0.16	0.16	0.12	0.07
C2	0.10	0.13	0.12	0.12	0.18	0.08	0.19	0.06	0.15	0.11	0.16	0.21	0.14	0.15	0.20	0.08	0.22	0.06	0.23	0.12
C2'	0.17	0.17	0.19	0.19	0.27	0.17	0.30	0.16	0.26	0.19	0.22	0.30	0.14	0.22	0.24	0.15	0.13	0.15	0.29	0.21
C3'	0.07	0.05	0.10	0.10	0.13	0.08	0.17	0.07	0.14	0.07	0.09	0.16	0.06	0.13	0.19	0.05	0.12	0.13	0.14	0.09
C4	0.05	0.11	0.09	0.07	0.17	0.03	0.17	0.02	0.13	0.08	0.15	0.20	0.13	0.12	0.15	0.03	0.16	0.06	0.19	0.07
C4'	0.20	0.18	0.20	0.19	0.13	0.21	0.16	0.22	0.19	0.19	0.15	0.11	0.22	0.19	0.25	0.22	0.31	0.28	0.11	0.20
C5	0.09	0.15	0.11	0.10	0.19	0.06	0.20	0.06	0.16	0.11	0.18	0.22	0.17	0.14	0.13	0.07	0.17	0.06	0.23	0.11
C5'	0.34	0.33	0.33	0.32	0.26	0.32	0.27	0.31	0.31	0.33	0.29	0.23	0.37	0.33	0.36	0.33	0.41	0.31	0.16	0.25
C6	0.12	0.17	0.13	0.12	0.21	0.10	0.22	0.10	0.18	0.14	0.20	0.23	0.18	0.15	0.13	0.11	0.21	0.13	0.27	0.17
C8	0.08	0.14	0.11	0.09	0.18	0.05	0.19	0.03	0.15	0.10	0.18	0.21	0.17	0.15	0.13	0.05	0.14	0.05	0.19	0.06
N1	0.11	0.16	0.13	0.12	0.21	0.09	0.21	0.08	0.17	0.14	0.19	0.23	0.16	0.15	0.17	0.10	0.23	0.14	0.27	0.18
N3	0.06	0.10	0.10	0.09	0.16	0.07	0.16	0.06	0.12	0.07	0.14	0.19	0.11	0.13	0.19	0.05	0.18	0.09	0.18	0.06
N6	0.16	0.21	0.16	0.16	0.24	0.15	0.24	0.15	0.21	0.18	0.23	0.25	0.22	0.17	0.14	0.16	0.24	0.19	0.29	0.21
N7	0.11	0.17	0.13	0.11	0.20	0.08	0.21	0.07	0.17	0.13	0.20	0.23	0.19	0.16	0.13	0.09	0.16	0.06	0.23	0.10
N9	0.05	0.11	0.09	0.07	0.16	0.03	0.17	0.03	0.13	0.07	0.15	0.19	0.13	0.13	0.15	0.02	0.15	0.09	0.16	0.04
O2'	0.40	0.42	0.40	0.40	0.52	0.37	0.54	0.36	0.49	0.43	0.47	0.55	0.38	0.41	0.40	0.37	0.32	0.28	0.52	0.42
O3'	0.02	0.08	0.06	0.06	0.15	0.05	0.14	0.08	0.09	0.03	0.13	0.19	0.10	0.08	0.14	0.06	0.13	0.20	0.05	0.05
O4'	0.22	0.21	0.20	0.21	0.14	0.24	0.15	0.27	0.19	0.21	0.18	0.12	0.26	0.19	0.25	0.25	0.37	0.32	0.12	0.24
O5'	0.13	0.21	0.13	0.13	0.18	0.15	0.15	0.19	0.10	0.13	0.22	0.22	0.27	0.14	0.09	0.16	0.22	0.23	0.10	0.13
OP1	0.24	0.24	0.23	0.23	0.21	0.24	0.24	0.26	0.25	0.23	0.23	0.21	0.28	0.23	0.25	0.25	0.42	0.33	0.18	0.28
OP2	0.10	0.18	0.07	0.09	0.12	0.12	0.08	0.17	0.06	0.11	0.18	0.14	0.25	0.07	0.04	0.15	0.21	0.18	0.15	0.13
P	0.06	0.13	0.07	0.06	0.10	0.07	0.11	0.12	0.08	0.05	0.13	0.13	0.19	0.09	0.08	0.09	0.23	0.18	0.03	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.00	0.07	0.11	0.04	0.02
C2	0.02	0.00	0.08	0.06	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.01	0.12	0.10	0.05	0.04
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.15	0.00	0.03	0.01	0.02	0.14	0.07	0.03
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.03	0.05	0.06	0.12	0.01	0.00	0.01	0.06	0.15	0.11	0.06
C4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.15	0.09	0.07	0.06
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.04	0.02
C5	0.02	0.02	0.05	0.10	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.12	0.05	0.15	0.09	0.07	0.05
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.05	0.02	0.04	0.06	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.13	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.11	0.05	0.13	0.09	0.05	0.02
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.11	0.10	0.04	0.03
N3	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02	0.14	0.10	0.06	0.05
N4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.03	0.15	0.09	0.08	0.07
O2	0.05	0.01	0.15	0.12	0.01	0.06	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.18	0.16	0.03	0.12	0.12	0.07	0.06
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.08	0.04	0.18	0.00	0.04	0.02	0.04	0.15	0.09	0.04
O3'	0.02	0.08	0.03	0.00	0.06	0.01	0.12	0.02	0.11	0.03	0.07	0.07	0.16	0.04	0.00	0.01	0.14	0.19	0.17	0.11
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.09	0.11	0.06	0.05
O5'	0.07	0.12	0.02	0.06	0.15	0.01	0.15	0.01	0.13	0.11	0.14	0.15	0.12	0.04	0.14	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.11	0.10	0.14	0.15	0.09	0.14	0.09	0.13	0.09	0.10	0.10	0.09	0.12	0.15	0.19	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.05	0.07	0.11	0.07	0.04	0.07	0.03	0.05	0.04	0.06	0.08	0.07	0.09	0.17	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.04	0.03	0.06	0.06	0.02	0.05	0.01	0.02	0.03	0.05	0.07	0.06	0.04	0.11	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00