Doublet Group distance statistics: 53059

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.001, 0.007, 0.012, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N6	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.001, 0.008, 0.014, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N7	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C8	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.010 std_dev=0.010
O4'	A	0, 0.094, 0.474, 0.853, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.474 std_dev=0.379
C2'	A	0, 0.084, 0.466, 0.847, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.466 std_dev=0.382
P	B	0, 0.083, 0.496, 0.908, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.496 std_dev=0.413
OP2	B	0, 0.151, 0.616, 1.081, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.616 std_dev=0.465
OP1	B	0, 0.160, 0.832, 1.504, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.832 std_dev=0.672
O2'	A	0, 0.169, 0.880, 1.590, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.880 std_dev=0.710
C4'	A	0, 0.191, 0.947, 1.703, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.947 std_dev=0.756
C3'	A	0, 0.202, 1.060, 1.918, 1.851 max_d=1.851 avg_d=1.060 std_dev=0.858
OP2	A	0, 0.205, 1.100, 1.994, 2.241 max_d=2.241 avg_d=1.100 std_dev=0.895
C5'	A	0, 0.235, 1.131, 2.028, 1.879 max_d=1.879 avg_d=1.131 std_dev=0.896
O5'	B	0, 0.292, 1.352, 2.412, 2.345 max_d=2.345 avg_d=1.352 std_dev=1.060
C5'	B	0, 0.269, 1.365, 2.461, 2.493 max_d=2.493 avg_d=1.365 std_dev=1.096
O3'	A	0, 0.325, 1.707, 3.089, 3.068 max_d=3.068 avg_d=1.707 std_dev=1.382
O5'	A	0, 0.217, 1.698, 3.179, 3.895 max_d=3.895 avg_d=1.698 std_dev=1.481
P	A	0, 0.400, 2.139, 3.877, 4.098 max_d=4.098 avg_d=2.139 std_dev=1.738
C4'	B	0, 0.452, 2.353, 4.254, 4.237 max_d=4.237 avg_d=2.353 std_dev=1.901
O3'	B	0, 0.530, 2.819, 5.107, 5.030 max_d=5.030 avg_d=2.819 std_dev=2.288
C3'	B	0, 0.559, 2.923, 5.287, 5.198 max_d=5.198 avg_d=2.923 std_dev=2.364
O4'	B	0, 0.648, 3.330, 6.013, 5.875 max_d=5.875 avg_d=3.330 std_dev=2.683
OP1	A	0, 0.673, 3.522, 6.371, 6.460 max_d=6.460 avg_d=3.522 std_dev=2.849
C2'	B	0, 0.775, 4.070, 7.364, 7.182 max_d=7.182 avg_d=4.070 std_dev=3.294
C6	B	0, 0.810, 4.151, 7.491, 7.276 max_d=7.276 avg_d=4.151 std_dev=3.341
C1'	B	0, 0.812, 4.204, 7.595, 7.389 max_d=7.389 avg_d=4.204 std_dev=3.392
O2'	B	0, 0.801, 4.309, 7.816, 7.670 max_d=7.670 avg_d=4.309 std_dev=3.508
C5	B	0, 0.866, 4.469, 8.072, 7.805 max_d=7.805 avg_d=4.469 std_dev=3.603
N1	B	0, 0.892, 4.574, 8.257, 7.991 max_d=7.991 avg_d=4.574 std_dev=3.683
C4	B	0, 1.017, 5.266, 9.516, 9.161 max_d=9.161 avg_d=5.266 std_dev=4.250
C2	B	0, 1.046, 5.372, 9.698, 9.324 max_d=9.324 avg_d=5.372 std_dev=4.326
N4	B	0, 1.078, 5.604, 10.130, 9.742 max_d=9.742 avg_d=5.604 std_dev=4.526
N3	B	0, 1.102, 5.701, 10.299, 9.897 max_d=9.897 avg_d=5.701 std_dev=4.598
O2	B	0, 1.131, 5.760, 10.389, 9.965 max_d=9.965 avg_d=5.760 std_dev=4.629

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.26	0.00	0.18	0.32	0.26	0.23
C2	0.02	0.00	0.21	0.20	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.20	0.13	0.27	0.56	0.31	0.45
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.12	0.00	0.06	0.16	0.10	0.08	0.17	0.21	0.08	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.17	0.10	0.42	0.20
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.24	0.01	0.34	0.03	0.34	0.35	0.28	0.16	0.39	0.39	0.23	0.02	0.01	0.01	0.30	0.40	0.40	0.22
C4	0.01	0.00	0.12	0.24	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.20	0.08	0.08	0.21	0.45	0.31	0.40
C4'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.12	0.23	0.06	0.02	0.16	0.23	0.11	0.26	0.03	0.00	0.01	0.21	0.32	0.05
C5	0.01	0.00	0.06	0.34	0.00	0.14	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.27	0.09	0.04	0.18	0.42	0.32	0.43
C5'	0.05	0.07	0.16	0.03	0.11	0.01	0.20	0.00	0.19	0.26	0.13	0.05	0.25	0.29	0.11	0.08	0.18	0.02	0.00	0.37	0.39	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.34	0.01	0.12	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.28	0.06	0.07	0.21	0.49	0.33	0.47
C8	0.00	0.01	0.08	0.35	0.01	0.23	0.00	0.26	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.20	0.07	0.10	0.26	0.31	0.34
N1	0.02	0.00	0.17	0.28	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.07	0.11	0.25	0.56	0.33	0.48
N3	0.02	0.00	0.21	0.16	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.24	0.13	0.26	0.51	0.29	0.40
N6	0.01	0.01	0.08	0.39	0.01	0.16	0.01	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.31	0.15	0.05	0.21	0.48	0.34	0.49
N7	0.00	0.01	0.03	0.39	0.01	0.23	0.00	0.29	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.24	0.04	0.15	0.30	0.33	0.40
N9	0.00	0.01	0.02	0.23	0.00	0.11	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.05	0.02	0.15	0.35	0.29	0.33
O2'	0.01	0.20	0.00	0.02	0.20	0.26	0.27	0.08	0.28	0.25	0.25	0.16	0.31	0.30	0.17	0.00	0.01	0.21	0.26	0.30	0.39	0.26
O3'	0.26	0.20	0.01	0.01	0.08	0.03	0.09	0.18	0.06	0.20	0.07	0.24	0.15	0.24	0.05	0.01	0.00	0.19	0.51	0.73	0.45	0.58
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.08	0.00	0.04	0.02	0.07	0.07	0.11	0.13	0.05	0.04	0.02	0.21	0.19	0.00	0.30	0.41	0.20	0.24
O5'	0.18	0.27	0.17	0.30	0.21	0.01	0.18	0.00	0.21	0.10	0.25	0.26	0.21	0.15	0.15	0.26	0.51	0.30	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.32	0.56	0.10	0.40	0.45	0.21	0.42	0.37	0.49	0.26	0.56	0.51	0.48	0.30	0.35	0.30	0.73	0.41	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.31	0.42	0.40	0.31	0.32	0.32	0.39	0.33	0.31	0.33	0.29	0.34	0.33	0.29	0.39	0.45	0.20	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.45	0.20	0.22	0.40	0.05	0.43	0.01	0.47	0.34	0.48	0.40	0.49	0.40	0.33	0.26	0.58	0.24	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.32	0.79	0.78	0.22	0.26	0.20	0.05	0.26	0.32	0.27	0.17	0.36	0.77	1.02	0.05	0.18	0.13	0.21	0.13
C2	0.24	0.19	0.62	0.67	0.08	0.20	0.07	0.09	0.13	0.19	0.14	0.04	0.23	0.61	0.93	0.06	0.13	0.22	0.20	0.18
C2'	0.23	0.31	0.24	0.29	0.43	0.21	0.43	0.40	0.35	0.30	0.38	0.49	0.28	0.25	0.57	0.49	0.25	0.34	0.28	0.47
C3'	0.12	0.14	0.55	0.57	0.15	0.05	0.13	0.21	0.12	0.12	0.15	0.16	0.15	0.51	0.81	0.26	0.07	0.20	0.24	0.23
C4	0.29	0.25	0.73	0.76	0.13	0.22	0.11	0.08	0.17	0.24	0.20	0.08	0.29	0.73	1.05	0.03	0.14	0.18	0.20	0.17
C4'	0.54	0.58	1.02	0.98	0.51	0.39	0.47	0.09	0.49	0.54	0.56	0.49	0.61	1.00	1.22	0.19	0.31	0.09	0.36	0.07
C5	0.25	0.22	0.73	0.77	0.10	0.19	0.06	0.10	0.13	0.21	0.17	0.05	0.28	0.74	1.10	0.08	0.12	0.20	0.20	0.20
C5'	0.53	0.59	1.05	1.00	0.53	0.36	0.47	0.07	0.48	0.54	0.58	0.52	0.63	1.02	1.26	0.14	0.28	0.09	0.33	0.07
C6	0.21	0.18	0.67	0.72	0.05	0.15	0.02	0.12	0.08	0.16	0.13	0.01	0.23	0.68	1.07	0.11	0.10	0.24	0.20	0.21
C8	0.30	0.28	0.80	0.81	0.15	0.21	0.12	0.09	0.18	0.26	0.23	0.11	0.33	0.81	1.13	0.05	0.14	0.17	0.20	0.18
N1	0.20	0.16	0.61	0.67	0.04	0.16	0.04	0.12	0.08	0.15	0.11	0.03	0.21	0.62	0.98	0.10	0.10	0.25	0.20	0.20
N3	0.29	0.24	0.68	0.71	0.13	0.23	0.12	0.08	0.19	0.24	0.19	0.08	0.28	0.67	0.96	0.05	0.16	0.17	0.21	0.16
N6	0.17	0.15	0.65	0.70	0.02	0.12	0.02	0.15	0.03	0.12	0.10	0.02	0.21	0.67	1.07	0.16	0.07	0.25	0.20	0.23
N7	0.26	0.24	0.78	0.80	0.12	0.19	0.08	0.11	0.14	0.22	0.19	0.07	0.30	0.79	1.15	0.09	0.12	0.20	0.20	0.20
N9	0.31	0.28	0.78	0.79	0.17	0.23	0.14	0.07	0.20	0.27	0.23	0.12	0.33	0.77	1.07	0.02	0.15	0.16	0.20	0.16
O2'	0.22	0.36	0.31	0.38	0.53	0.16	0.49	0.21	0.36	0.31	0.46	0.63	0.32	0.36	0.63	0.35	0.19	0.21	0.29	0.28
O3'	0.53	0.54	0.97	1.00	0.52	0.47	0.50	0.27	0.52	0.53	0.53	0.50	0.55	0.92	1.22	0.27	0.50	0.39	0.67	0.33
O4'	0.72	0.74	1.18	1.13	0.64	0.55	0.60	0.24	0.64	0.71	0.70	0.59	0.78	1.17	1.36	0.36	0.42	0.03	0.38	0.06
O5'	0.99	1.05	1.55	1.46	0.93	0.78	0.86	0.40	0.90	0.99	1.02	0.90	1.11	1.55	1.73	0.55	0.60	0.19	0.53	0.20
OP1	1.41	1.47	2.07	1.94	1.29	1.16	1.18	0.71	1.24	1.38	1.42	1.23	1.57	2.12	2.30	0.90	0.91	0.48	0.77	0.46
OP2	0.97	1.03	1.51	1.40	0.91	0.75	0.84	0.42	0.87	0.97	1.01	0.88	1.10	1.52	1.66	0.55	0.56	0.17	0.41	0.22
P	1.11	1.12	1.71	1.61	0.95	0.91	0.87	0.52	0.95	1.07	1.07	0.88	1.21	1.75	1.94	0.65	0.69	0.27	0.55	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.09	0.12	0.14	0.08
C2	0.02	0.00	0.09	0.12	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.13	0.06	0.16	0.21	0.26	0.17
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.02	0.10	0.01	0.11	0.03	0.08	0.06	0.17	0.00	0.01	0.01	0.06	0.17	0.15	0.10
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.08	0.04	0.12	0.09	0.17	0.01	0.01	0.01	0.06	0.18	0.13	0.10
C4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.02	0.22	0.31	0.37	0.26
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.02	0.05	0.03	0.00	0.03	0.08	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.10	0.07	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.07	0.22	0.30	0.35	0.26
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.10	0.01	0.12	0.00	0.11	0.06	0.07	0.11	0.01	0.04	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.11	0.08	0.01	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.09	0.20	0.24	0.26	0.20
N1	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.15	0.20	0.22	0.15
N3	0.02	0.00	0.08	0.12	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.04	0.19	0.27	0.33	0.21
N4	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.13	0.03	0.23	0.34	0.41	0.28
O2	0.02	0.01	0.17	0.17	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.19	0.10	0.13	0.18	0.23	0.13
O2'	0.03	0.04	0.00	0.01	0.07	0.05	0.10	0.04	0.09	0.05	0.06	0.08	0.08	0.00	0.04	0.04	0.03	0.11	0.11	0.05
O3'	0.02	0.13	0.01	0.01	0.11	0.03	0.10	0.03	0.10	0.04	0.14	0.13	0.19	0.04	0.00	0.03	0.08	0.20	0.15	0.12
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.04	0.03	0.10	0.04	0.03	0.00	0.09	0.07	0.09	0.05
O5'	0.09	0.16	0.06	0.06	0.22	0.03	0.22	0.00	0.20	0.15	0.19	0.23	0.13	0.03	0.08	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.12	0.21	0.17	0.18	0.31	0.08	0.30	0.03	0.24	0.20	0.27	0.34	0.18	0.11	0.20	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.26	0.15	0.13	0.37	0.05	0.35	0.01	0.26	0.22	0.33	0.41	0.23	0.11	0.15	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.17	0.10	0.10	0.26	0.03	0.26	0.01	0.20	0.15	0.21	0.28	0.13	0.05	0.12	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00