Doublet Group distance statistics: 53061

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.010, 0.022, 0.035, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.008, 0.024, 0.039, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.024 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.008, 0.027, 0.045, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.027 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.005, 0.024, 0.043, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.024 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.015, 0.036, 0.056, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.036 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.012, 0.033, 0.054, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.033 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.013, 0.035, 0.056, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.035 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.019, 0.042, 0.065, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.042 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.009, 0.066, 0.124, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.066 std_dev=0.057
C2'	A	0, 0.026, 0.125, 0.223, 0.278 max_d=0.278 avg_d=0.125 std_dev=0.098
O2'	A	0, 0.032, 0.137, 0.243, 0.290 max_d=0.290 avg_d=0.137 std_dev=0.105
O4'	A	0, 0.047, 0.178, 0.308, 0.329 max_d=0.329 avg_d=0.178 std_dev=0.130
O5'	A	0, 0.075, 0.238, 0.401, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.238 std_dev=0.163
C3'	A	0, 0.044, 0.244, 0.443, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.244 std_dev=0.199
C4'	A	0, 0.056, 0.273, 0.490, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.273 std_dev=0.217
O3'	A	0, 0.060, 0.329, 0.599, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.329 std_dev=0.269
C5'	A	0, 0.081, 0.439, 0.797, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.439 std_dev=0.358
P	A	0, 0.056, 0.427, 0.797, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.427 std_dev=0.370
OP2	A	0, 0.089, 0.555, 1.021, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.555 std_dev=0.466
OP1	A	0, 0.048, 0.516, 0.983, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.516 std_dev=0.468
C4'	B	0, 0.069, 0.574, 1.079, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.574 std_dev=0.505
P	B	0, 0.121, 0.627, 1.132, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.627 std_dev=0.505
C3'	B	0, 0.054, 0.565, 1.077, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.565 std_dev=0.512
C5'	B	0, 0.123, 0.635, 1.148, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.635 std_dev=0.512
OP1	B	0, 0.119, 0.632, 1.145, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.632 std_dev=0.513
O3'	B	0, 0.134, 0.649, 1.164, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.649 std_dev=0.515
C2'	B	0, 0.112, 0.645, 1.178, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.645 std_dev=0.533
O5'	B	0, 0.112, 0.647, 1.182, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.647 std_dev=0.535
O4'	B	0, 0.141, 0.697, 1.252, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.697 std_dev=0.556
C1'	B	0, 0.140, 0.703, 1.267, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.703 std_dev=0.564
OP2	B	0, 0.147, 0.724, 1.301, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.724 std_dev=0.577
O2'	B	0, 0.133, 0.748, 1.363, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.748 std_dev=0.615
N1	B	0, 0.158, 0.777, 1.395, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.777 std_dev=0.619
O2	B	0, 0.132, 0.801, 1.470, 1.635 max_d=1.635 avg_d=0.801 std_dev=0.669
C6	B	0, 0.190, 0.859, 1.528, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.859 std_dev=0.669
C2	B	0, 0.146, 0.821, 1.496, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.821 std_dev=0.675
N3	B	0, 0.161, 0.889, 1.617, 1.769 max_d=1.769 avg_d=0.889 std_dev=0.728
C5	B	0, 0.197, 0.947, 1.697, 1.677 max_d=1.677 avg_d=0.947 std_dev=0.750
C4	B	0, 0.190, 0.947, 1.705, 1.781 max_d=1.781 avg_d=0.947 std_dev=0.758
N4	B	0, 0.233, 1.045, 1.856, 1.903 max_d=1.903 avg_d=1.045 std_dev=0.811

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.12	0.14	0.10
C2	0.03	0.00	0.06	0.11	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.14	0.03	0.13	0.22	0.26	0.18
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03	0.06	0.06	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.09	0.06
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.08	0.01	0.07	0.01	0.10	0.03	0.11	0.09	0.11	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.11	0.05	0.05	0.05
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.08	0.01	0.13	0.20	0.23	0.17
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.06	0.04	0.05	0.03	0.08	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.14	0.22	0.26	0.19
C5'	0.03	0.08	0.02	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.10	0.06	0.10	0.07	0.12	0.07	0.05	0.02	0.02	0.03	0.00	0.10	0.03	0.01
C6	0.01	0.02	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.11	0.02	0.15	0.24	0.28	0.21
C8	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.00	0.01	0.02	0.04	0.04	0.14	0.17	0.21	0.16
N1	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.14	0.02	0.14	0.24	0.28	0.20
N3	0.03	0.01	0.06	0.09	0.01	0.03	0.02	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.11	0.03	0.12	0.19	0.23	0.16
N6	0.02	0.02	0.06	0.11	0.02	0.08	0.03	0.12	0.00	0.04	0.02	0.03	0.00	0.05	0.03	0.06	0.12	0.05	0.17	0.26	0.30	0.23
N7	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.14	0.20	0.24	0.18
N9	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.13	0.17	0.20	0.15
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.06	0.02	0.06	0.04	0.06	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.04	0.07	0.08	0.05
O3'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.08	0.01	0.07	0.02	0.11	0.04	0.14	0.11	0.12	0.03	0.03	0.03	0.00	0.02	0.17	0.04	0.08	0.10
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.05	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.12	0.13	0.12	0.09
O5'	0.10	0.13	0.06	0.11	0.13	0.02	0.14	0.00	0.15	0.14	0.14	0.12	0.17	0.14	0.13	0.04	0.17	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.22	0.08	0.05	0.20	0.09	0.22	0.10	0.24	0.17	0.24	0.19	0.26	0.20	0.17	0.07	0.04	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.14	0.26	0.09	0.05	0.23	0.05	0.26	0.03	0.28	0.21	0.28	0.23	0.30	0.24	0.20	0.08	0.08	0.12	0.02	0.02	0.00	0.02
P	0.10	0.18	0.06	0.05	0.17	0.03	0.19	0.01	0.21	0.16	0.20	0.16	0.23	0.18	0.15	0.05	0.10	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.13	0.16	0.21	0.06	0.17	0.05	0.19	0.05	0.09	0.11	0.08	0.20	0.28	0.32	0.10	0.05	0.20	0.20	0.13
C2	0.24	0.26	0.21	0.29	0.22	0.27	0.19	0.30	0.20	0.23	0.24	0.23	0.30	0.29	0.47	0.26	0.19	0.15	0.24	0.16
C2'	0.14	0.12	0.24	0.27	0.11	0.23	0.15	0.21	0.14	0.12	0.11	0.09	0.15	0.39	0.39	0.14	0.10	0.23	0.20	0.15
C3'	0.16	0.13	0.28	0.31	0.12	0.26	0.16	0.23	0.16	0.14	0.12	0.09	0.14	0.45	0.44	0.16	0.12	0.22	0.18	0.14
C4	0.15	0.19	0.16	0.24	0.13	0.20	0.09	0.23	0.10	0.15	0.17	0.16	0.24	0.27	0.41	0.16	0.10	0.13	0.21	0.11
C4'	0.10	0.10	0.20	0.24	0.05	0.20	0.09	0.19	0.09	0.08	0.09	0.06	0.16	0.36	0.35	0.11	0.08	0.22	0.20	0.14
C5	0.19	0.23	0.19	0.27	0.19	0.23	0.16	0.27	0.16	0.20	0.22	0.22	0.28	0.29	0.45	0.21	0.16	0.17	0.24	0.16
C5'	0.11	0.11	0.22	0.26	0.06	0.21	0.08	0.21	0.09	0.08	0.10	0.07	0.16	0.37	0.38	0.12	0.08	0.18	0.16	0.10
C6	0.25	0.29	0.24	0.33	0.26	0.29	0.24	0.33	0.24	0.26	0.28	0.29	0.32	0.31	0.51	0.27	0.24	0.24	0.28	0.23
C8	0.13	0.18	0.15	0.22	0.12	0.18	0.07	0.21	0.08	0.14	0.16	0.15	0.24	0.27	0.38	0.14	0.09	0.16	0.22	0.13
N1	0.28	0.31	0.25	0.33	0.29	0.31	0.27	0.35	0.27	0.29	0.30	0.31	0.34	0.32	0.52	0.31	0.27	0.26	0.29	0.25
N3	0.16	0.18	0.17	0.25	0.12	0.21	0.08	0.24	0.10	0.15	0.17	0.14	0.24	0.28	0.41	0.17	0.08	0.13	0.21	0.10
N6	0.30	0.34	0.28	0.37	0.33	0.33	0.31	0.36	0.30	0.31	0.34	0.36	0.37	0.34	0.55	0.31	0.31	0.32	0.34	0.31
N7	0.17	0.21	0.18	0.26	0.18	0.22	0.14	0.25	0.14	0.18	0.21	0.20	0.27	0.28	0.43	0.18	0.14	0.17	0.24	0.15
N9	0.12	0.15	0.15	0.22	0.09	0.18	0.04	0.20	0.05	0.11	0.14	0.12	0.22	0.27	0.36	0.12	0.06	0.16	0.21	0.12
O2'	0.12	0.11	0.20	0.21	0.11	0.18	0.16	0.16	0.15	0.11	0.11	0.10	0.15	0.35	0.28	0.13	0.10	0.31	0.23	0.21
O3'	0.24	0.18	0.35	0.35	0.19	0.30	0.23	0.25	0.24	0.21	0.18	0.16	0.17	0.53	0.47	0.22	0.17	0.26	0.20	0.18
O4'	0.09	0.14	0.16	0.21	0.07	0.17	0.04	0.19	0.05	0.09	0.13	0.10	0.21	0.29	0.31	0.10	0.05	0.20	0.20	0.13
O5'	0.16	0.14	0.27	0.31	0.10	0.26	0.13	0.25	0.14	0.13	0.12	0.07	0.18	0.42	0.44	0.16	0.11	0.08	0.11	0.03
OP1	0.18	0.13	0.32	0.36	0.12	0.30	0.17	0.28	0.18	0.15	0.12	0.08	0.14	0.48	0.51	0.18	0.15	0.10	0.06	0.06
OP2	0.22	0.19	0.36	0.43	0.17	0.36	0.20	0.36	0.21	0.20	0.19	0.15	0.21	0.51	0.60	0.22	0.22	0.11	0.06	0.13
P	0.17	0.14	0.29	0.35	0.11	0.29	0.14	0.29	0.15	0.14	0.13	0.09	0.18	0.44	0.50	0.17	0.14	0.05	0.07	0.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.06	0.04	0.12	0.10
C2	0.03	0.00	0.08	0.08	0.02	0.05	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.19	0.07	0.03	0.05	0.06	0.04	0.02
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.07	0.03	0.04	0.01	0.03	0.02	0.08	0.08	0.11	0.01	0.02	0.01	0.04	0.12	0.07	0.05
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.14	0.01	0.18	0.01	0.17	0.10	0.13	0.14	0.08	0.01	0.01	0.02	0.12	0.20	0.14	0.15
C4	0.05	0.02	0.07	0.14	0.00	0.10	0.01	0.18	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.16	0.13	0.05	0.14	0.14	0.11	0.11
C4'	0.02	0.05	0.03	0.01	0.10	0.00	0.14	0.00	0.13	0.06	0.09	0.09	0.08	0.08	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02
C5	0.03	0.01	0.04	0.18	0.01	0.14	0.00	0.22	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.08	0.19	0.07	0.17	0.14	0.09	0.12
C5'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.18	0.00	0.22	0.00	0.19	0.09	0.14	0.18	0.05	0.07	0.05	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.03	0.02	0.03	0.17	0.02	0.13	0.01	0.19	0.00	0.01	0.04	0.04	0.04	0.03	0.18	0.07	0.11	0.08	0.03	0.05
N1	0.02	0.02	0.02	0.10	0.04	0.06	0.01	0.09	0.01	0.00	0.03	0.05	0.04	0.07	0.08	0.03	0.04	0.04	0.06	0.03
N3	0.04	0.01	0.08	0.13	0.01	0.09	0.03	0.14	0.04	0.03	0.00	0.02	0.02	0.19	0.11	0.05	0.12	0.12	0.09	0.09
N4	0.06	0.03	0.08	0.14	0.01	0.09	0.04	0.18	0.04	0.05	0.02	0.00	0.03	0.18	0.14	0.05	0.14	0.15	0.13	0.12
O2	0.06	0.01	0.11	0.08	0.02	0.08	0.02	0.05	0.04	0.04	0.02	0.03	0.00	0.26	0.14	0.07	0.02	0.01	0.04	0.05
O2'	0.01	0.19	0.01	0.01	0.16	0.08	0.08	0.07	0.03	0.07	0.19	0.18	0.26	0.00	0.04	0.07	0.07	0.18	0.06	0.08
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.13	0.03	0.19	0.05	0.18	0.08	0.11	0.14	0.14	0.04	0.00	0.03	0.21	0.40	0.28	0.30
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.05	0.05	0.07	0.07	0.03	0.00	0.15	0.14	0.22	0.19
O5'	0.06	0.05	0.04	0.12	0.14	0.02	0.17	0.01	0.11	0.04	0.12	0.14	0.02	0.07	0.21	0.15	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.04	0.06	0.12	0.20	0.14	0.03	0.14	0.05	0.08	0.04	0.12	0.15	0.01	0.18	0.40	0.14	0.02	0.00	0.04	0.02
OP2	0.12	0.04	0.07	0.14	0.11	0.03	0.09	0.02	0.03	0.06	0.09	0.13	0.04	0.06	0.28	0.22	0.02	0.04	0.00	0.02
P	0.10	0.02	0.05	0.15	0.11	0.02	0.12	0.01	0.05	0.03	0.09	0.12	0.05	0.08	0.30	0.19	0.01	0.02	0.02	0.00