Doublet Group distance statistics: 53062

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.023 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.010, 0.027, 0.044, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.027 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.014, 0.037, 0.059, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.037 std_dev=0.022
C5	A	0, 0.020, 0.047, 0.074, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.047 std_dev=0.027
N3	A	0, 0.019, 0.050, 0.081, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.050 std_dev=0.031
N1	A	0, 0.024, 0.057, 0.090, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.057 std_dev=0.033
N9	A	0, 0.022, 0.058, 0.093, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.058 std_dev=0.035
C4	A	0, 0.024, 0.059, 0.095, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.059 std_dev=0.035
N6	A	0, 0.029, 0.070, 0.110, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.070 std_dev=0.040
N7	A	0, 0.036, 0.085, 0.134, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.085 std_dev=0.049
C8	A	0, 0.041, 0.098, 0.156, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.098 std_dev=0.058
O2'	A	0, 0.190, 0.479, 0.767, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.479 std_dev=0.288
P	B	0, 0.242, 0.579, 0.916, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.579 std_dev=0.337
C2'	A	0, 0.251, 0.625, 0.999, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.625 std_dev=0.374
O4'	A	0, 0.320, 0.794, 1.269, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.794 std_dev=0.474
O5'	B	0, 0.339, 0.822, 1.305, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.822 std_dev=0.483
C5'	B	0, 0.338, 0.990, 1.642, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.990 std_dev=0.652
OP2	B	0, 0.447, 1.126, 1.804, 1.807 max_d=1.807 avg_d=1.126 std_dev=0.679
OP1	B	0, 0.470, 1.154, 1.839, 1.729 max_d=1.729 avg_d=1.154 std_dev=0.685
C3'	A	0, 0.500, 1.226, 1.953, 1.901 max_d=1.901 avg_d=1.226 std_dev=0.726
C4'	A	0, 0.541, 1.321, 2.100, 2.024 max_d=2.024 avg_d=1.321 std_dev=0.779
O4'	B	0, 0.448, 1.252, 2.056, 2.245 max_d=2.245 avg_d=1.252 std_dev=0.804
O3'	A	0, 0.638, 1.556, 2.473, 2.377 max_d=2.377 avg_d=1.556 std_dev=0.918
C4'	B	0, 0.564, 1.496, 2.427, 2.564 max_d=2.564 avg_d=1.496 std_dev=0.931
C6	B	0, 0.839, 1.994, 3.148, 2.741 max_d=2.741 avg_d=1.994 std_dev=1.154
C1'	B	0, 0.825, 2.003, 3.180, 3.029 max_d=3.029 avg_d=2.003 std_dev=1.178
N1	B	0, 0.894, 2.127, 3.360, 2.993 max_d=2.993 avg_d=2.127 std_dev=1.233
C5'	A	0, 0.926, 2.264, 3.602, 3.482 max_d=3.482 avg_d=2.264 std_dev=1.338
C3'	B	0, 0.917, 2.263, 3.609, 3.545 max_d=3.545 avg_d=2.263 std_dev=1.346
O5'	A	0, 1.145, 2.719, 4.293, 3.819 max_d=3.819 avg_d=2.719 std_dev=1.574
C5	B	0, 1.178, 2.792, 4.405, 3.846 max_d=3.846 avg_d=2.792 std_dev=1.614
C2	B	0, 1.241, 2.940, 4.639, 4.015 max_d=4.015 avg_d=2.940 std_dev=1.699
C2'	B	0, 1.228, 2.949, 4.671, 4.343 max_d=4.343 avg_d=2.949 std_dev=1.722
O3'	B	0, 1.195, 2.929, 4.664, 4.534 max_d=4.534 avg_d=2.929 std_dev=1.735
OP1	A	0, 1.351, 3.202, 5.053, 4.426 max_d=4.426 avg_d=3.202 std_dev=1.851
C4	B	0, 1.426, 3.379, 5.332, 4.654 max_d=4.654 avg_d=3.379 std_dev=1.953
O2	B	0, 1.434, 3.400, 5.366, 4.709 max_d=4.709 avg_d=3.400 std_dev=1.966
N3	B	0, 1.438, 3.406, 5.373, 4.649 max_d=4.649 avg_d=3.406 std_dev=1.967
P	A	0, 1.487, 3.532, 5.578, 4.957 max_d=4.957 avg_d=3.532 std_dev=2.045
O2'	B	0, 1.540, 3.686, 5.833, 5.360 max_d=5.360 avg_d=3.686 std_dev=2.146
OP2	A	0, 1.720, 4.091, 6.462, 5.783 max_d=5.783 avg_d=4.091 std_dev=2.371
N4	B	0, 1.757, 4.166, 6.576, 5.733 max_d=5.733 avg_d=4.166 std_dev=2.409

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.09	0.20	0.05	0.07
C2	0.02	0.00	0.16	0.21	0.01	0.07	0.01	0.12	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.24	0.06	0.23	0.26	0.07	0.18
C2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.09	0.01	0.07	0.02	0.10	0.03	0.14	0.15	0.09	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.26	0.03	0.11
C3'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.15	0.00	0.14	0.01	0.19	0.03	0.22	0.18	0.18	0.08	0.07	0.03	0.01	0.01	0.10	0.27	0.04	0.14
C4	0.01	0.01	0.09	0.15	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.15	0.03	0.20	0.30	0.12	0.19
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.09	0.08	0.09	0.05	0.10	0.09	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.16	0.05	0.03
C5	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.15	0.04	0.26	0.35	0.22	0.27
C5'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.11	0.00	0.15	0.00	0.17	0.15	0.15	0.08	0.18	0.17	0.09	0.04	0.01	0.01	0.00	0.11	0.04	0.01
C6	0.02	0.02	0.10	0.19	0.01	0.09	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.20	0.04	0.28	0.34	0.21	0.28
C8	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.07	0.21	0.39	0.27	0.27
N1	0.02	0.01	0.14	0.22	0.02	0.09	0.02	0.15	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.05	0.25	0.06	0.27	0.30	0.14	0.24
N3	0.03	0.01	0.15	0.18	0.01	0.05	0.02	0.08	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.05	0.20	0.06	0.18	0.26	0.05	0.14
N6	0.02	0.03	0.09	0.18	0.02	0.10	0.01	0.18	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.02	0.04	0.20	0.04	0.30	0.37	0.27	0.32
N7	0.03	0.01	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.09	0.06	0.26	0.42	0.31	0.32
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.06	0.02	0.16	0.29	0.13	0.17
O2'	0.02	0.05	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.02	0.00	0.07	0.05	0.05	0.22	0.06	0.08
O3'	0.04	0.24	0.04	0.01	0.15	0.02	0.15	0.01	0.20	0.03	0.25	0.20	0.20	0.09	0.06	0.07	0.00	0.03	0.18	0.27	0.05	0.17
O4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.06	0.06	0.04	0.06	0.02	0.05	0.03	0.00	0.13	0.11	0.07	0.03
O5'	0.09	0.23	0.05	0.10	0.20	0.01	0.26	0.00	0.28	0.21	0.27	0.18	0.30	0.26	0.16	0.05	0.18	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.20	0.26	0.26	0.27	0.30	0.16	0.35	0.11	0.34	0.39	0.30	0.26	0.37	0.42	0.29	0.22	0.27	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.05	0.07	0.03	0.04	0.12	0.05	0.22	0.04	0.21	0.27	0.14	0.05	0.27	0.31	0.13	0.06	0.05	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.18	0.11	0.14	0.19	0.03	0.27	0.01	0.28	0.27	0.24	0.14	0.32	0.32	0.17	0.08	0.17	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.43	0.25	0.64	0.58	0.12	0.53	0.19	0.37	0.15	0.22	0.14	0.17	0.39	0.88	0.77	0.38	0.28	0.05	0.08	0.09
C2	0.23	0.12	0.45	0.43	0.10	0.27	0.16	0.12	0.09	0.10	0.05	0.17	0.21	0.62	0.68	0.13	0.20	0.15	0.10	0.11
C2'	0.34	0.22	0.55	0.45	0.06	0.37	0.16	0.31	0.09	0.15	0.11	0.12	0.38	0.79	0.61	0.24	0.11	0.24	0.13	0.18
C3'	0.30	0.24	0.46	0.36	0.04	0.27	0.10	0.24	0.04	0.16	0.16	0.07	0.38	0.66	0.49	0.19	0.06	0.22	0.08	0.13
C4	0.35	0.20	0.60	0.54	0.07	0.40	0.16	0.22	0.06	0.15	0.08	0.15	0.33	0.82	0.78	0.22	0.23	0.11	0.09	0.09
C4'	0.39	0.26	0.55	0.49	0.09	0.45	0.13	0.32	0.13	0.22	0.17	0.09	0.38	0.74	0.63	0.36	0.26	0.05	0.13	0.11
C5	0.35	0.22	0.61	0.53	0.06	0.36	0.15	0.17	0.05	0.16	0.10	0.15	0.36	0.84	0.79	0.20	0.22	0.13	0.11	0.09
C5'	0.36	0.27	0.50	0.45	0.10	0.40	0.12	0.28	0.12	0.22	0.19	0.08	0.38	0.68	0.58	0.32	0.25	0.07	0.15	0.13
C6	0.30	0.19	0.54	0.48	0.07	0.29	0.15	0.11	0.06	0.14	0.09	0.15	0.31	0.75	0.74	0.16	0.20	0.15	0.13	0.10
C8	0.42	0.27	0.68	0.59	0.06	0.45	0.16	0.26	0.08	0.21	0.15	0.14	0.44	0.94	0.82	0.29	0.23	0.10	0.09	0.08
N1	0.25	0.14	0.47	0.42	0.09	0.24	0.15	0.11	0.08	0.11	0.06	0.16	0.24	0.64	0.69	0.14	0.20	0.16	0.12	0.11
N3	0.29	0.14	0.52	0.49	0.09	0.37	0.16	0.20	0.08	0.11	0.05	0.17	0.25	0.71	0.72	0.18	0.22	0.12	0.08	0.09
N6	0.30	0.20	0.54	0.46	0.08	0.26	0.14	0.10	0.07	0.16	0.11	0.15	0.33	0.75	0.73	0.16	0.20	0.16	0.14	0.11
N7	0.39	0.26	0.66	0.57	0.05	0.40	0.14	0.20	0.05	0.20	0.14	0.13	0.43	0.92	0.82	0.24	0.22	0.12	0.11	0.08
N9	0.40	0.24	0.65	0.57	0.08	0.46	0.17	0.29	0.09	0.19	0.12	0.15	0.39	0.89	0.79	0.30	0.24	0.09	0.08	0.08
O2'	0.46	0.27	0.64	0.56	0.06	0.53	0.14	0.40	0.13	0.24	0.15	0.09	0.42	0.85	0.69	0.41	0.20	0.14	0.05	0.11
O3'	0.28	0.30	0.39	0.28	0.15	0.20	0.08	0.18	0.07	0.21	0.25	0.15	0.41	0.55	0.39	0.15	0.04	0.24	0.11	0.14
O4'	0.43	0.25	0.62	0.57	0.15	0.53	0.21	0.38	0.17	0.23	0.16	0.19	0.38	0.83	0.75	0.40	0.34	0.11	0.14	0.16
O5'	0.28	0.20	0.44	0.37	0.06	0.31	0.13	0.22	0.08	0.14	0.13	0.09	0.33	0.63	0.52	0.22	0.16	0.11	0.06	0.05
OP1	0.36	0.26	0.51	0.50	0.28	0.47	0.35	0.46	0.31	0.25	0.24	0.30	0.35	0.68	0.66	0.36	0.34	0.18	0.22	0.23
OP2	0.39	0.31	0.52	0.48	0.13	0.44	0.11	0.32	0.15	0.27	0.23	0.08	0.41	0.68	0.62	0.36	0.36	0.19	0.25	0.25
P	0.30	0.22	0.45	0.41	0.11	0.36	0.18	0.31	0.15	0.17	0.15	0.12	0.33	0.63	0.56	0.27	0.24	0.03	0.09	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.03	0.00	0.19	0.22	0.02	0.15
C2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.03	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.09	0.01	0.31	0.30	0.15	0.25
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.09	0.01	0.06	0.02	0.03	0.02	0.08	0.11	0.09	0.01	0.03	0.00	0.14	0.22	0.05	0.13
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.10	0.00	0.08	0.02	0.05	0.03	0.08	0.12	0.08	0.02	0.01	0.01	0.11	0.23	0.02	0.12
C4	0.03	0.03	0.09	0.10	0.00	0.03	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.08	0.14	0.01	0.36	0.31	0.20	0.30
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.05	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.14	0.13	0.01
C5	0.02	0.02	0.06	0.08	0.01	0.04	0.00	0.14	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.11	0.02	0.36	0.29	0.18	0.29
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.11	0.00	0.14	0.00	0.12	0.07	0.09	0.12	0.03	0.04	0.02	0.00	0.00	0.20	0.23	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.06	0.01	0.34	0.29	0.12	0.26
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.07	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.30	0.28	0.11	0.23
N3	0.02	0.01	0.08	0.08	0.01	0.01	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.07	0.12	0.02	0.34	0.30	0.19	0.28
N4	0.04	0.04	0.11	0.12	0.01	0.05	0.03	0.12	0.03	0.03	0.03	0.00	0.05	0.10	0.17	0.02	0.37	0.32	0.24	0.32
O2	0.04	0.01	0.09	0.08	0.04	0.05	0.03	0.03	0.02	0.02	0.04	0.05	0.00	0.09	0.11	0.04	0.29	0.30	0.15	0.24
O2'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.08	0.04	0.05	0.04	0.03	0.02	0.07	0.10	0.09	0.00	0.06	0.03	0.05	0.16	0.03	0.06
O3'	0.03	0.09	0.03	0.01	0.14	0.01	0.11	0.02	0.06	0.03	0.12	0.17	0.11	0.06	0.00	0.02	0.05	0.18	0.06	0.06
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.00	0.16	0.21	0.07	0.11
O5'	0.19	0.31	0.14	0.11	0.36	0.01	0.36	0.00	0.34	0.30	0.34	0.37	0.29	0.05	0.05	0.16	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.22	0.30	0.22	0.23	0.31	0.14	0.29	0.20	0.29	0.28	0.30	0.32	0.30	0.16	0.18	0.21	0.01	0.00	0.02	0.02
OP2	0.02	0.15	0.05	0.02	0.20	0.13	0.18	0.23	0.12	0.11	0.19	0.24	0.15	0.03	0.06	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.25	0.13	0.12	0.30	0.01	0.29	0.01	0.26	0.23	0.28	0.32	0.24	0.06	0.06	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00