Doublet Group distance statistics: 53063

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N9	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.005, 0.028, 0.052, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.028 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.009, 0.032, 0.056, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.032 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.004, 0.029, 0.055, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.029 std_dev=0.025
P	B	0, 0.152, 0.519, 0.886, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.519 std_dev=0.367
OP2	B	0, 0.163, 0.560, 0.957, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.560 std_dev=0.397
O4'	A	0, 0.175, 0.597, 1.020, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.597 std_dev=0.422
C2'	A	0, 0.188, 0.642, 1.096, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.642 std_dev=0.454
C4'	A	0, 0.319, 1.090, 1.861, 1.644 max_d=1.644 avg_d=1.090 std_dev=0.771
O5'	B	0, 0.329, 1.129, 1.928, 1.747 max_d=1.747 avg_d=1.129 std_dev=0.799
C3'	A	0, 0.339, 1.158, 1.976, 1.745 max_d=1.745 avg_d=1.158 std_dev=0.819
O2'	A	0, 0.351, 1.201, 2.050, 1.833 max_d=1.833 avg_d=1.201 std_dev=0.849
C5'	A	0, 0.400, 1.365, 2.330, 2.061 max_d=2.061 avg_d=1.365 std_dev=0.965
C5'	B	0, 0.414, 1.415, 2.416, 2.154 max_d=2.154 avg_d=1.415 std_dev=1.001
OP1	B	0, 0.416, 1.423, 2.430, 2.192 max_d=2.192 avg_d=1.423 std_dev=1.007
O5'	A	0, 0.521, 1.781, 3.040, 2.693 max_d=2.693 avg_d=1.781 std_dev=1.259
O3'	A	0, 0.544, 1.857, 3.170, 2.795 max_d=2.795 avg_d=1.857 std_dev=1.313
OP1	A	0, 0.559, 1.911, 3.263, 2.919 max_d=2.919 avg_d=1.911 std_dev=1.352
P	A	0, 0.584, 1.996, 3.408, 3.035 max_d=3.035 avg_d=1.996 std_dev=1.412
C4'	B	0, 0.683, 2.333, 3.983, 3.558 max_d=3.558 avg_d=2.333 std_dev=1.650
OP2	A	0, 0.714, 2.440, 4.166, 3.705 max_d=3.705 avg_d=2.440 std_dev=1.726
O3'	B	0, 0.718, 2.456, 4.193, 3.754 max_d=3.754 avg_d=2.456 std_dev=1.737
C3'	B	0, 0.808, 2.763, 4.717, 4.215 max_d=4.215 avg_d=2.763 std_dev=1.954
O4'	B	0, 1.093, 3.734, 6.374, 5.667 max_d=5.667 avg_d=3.734 std_dev=2.641
C2'	B	0, 1.260, 4.305, 7.349, 6.540 max_d=6.540 avg_d=4.305 std_dev=3.045
C6	B	0, 1.280, 4.374, 7.468, 6.664 max_d=6.664 avg_d=4.374 std_dev=3.094
O2'	B	0, 1.333, 4.556, 7.778, 6.926 max_d=6.926 avg_d=4.556 std_dev=3.222
C1'	B	0, 1.376, 4.699, 8.023, 7.133 max_d=7.133 avg_d=4.699 std_dev=3.324
C5	B	0, 1.403, 4.793, 8.183, 7.288 max_d=7.288 avg_d=4.793 std_dev=3.390
N1	B	0, 1.519, 5.190, 8.860, 7.885 max_d=7.885 avg_d=5.190 std_dev=3.671
C4	B	0, 1.793, 6.123, 10.454, 9.292 max_d=9.292 avg_d=6.123 std_dev=4.331
C2	B	0, 1.897, 6.479, 11.061, 9.828 max_d=9.828 avg_d=6.479 std_dev=4.582
N4	B	0, 1.931, 6.595, 11.259, 9.994 max_d=9.994 avg_d=6.595 std_dev=4.664
N3	B	0, 2.028, 6.928, 11.827, 10.502 max_d=10.502 avg_d=6.928 std_dev=4.900
O2	B	0, 2.110, 7.205, 12.301, 10.921 max_d=10.921 avg_d=7.205 std_dev=5.096

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.00	0.01	0.06	0.07	0.04
C2	0.00	0.00	0.17	0.19	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.05	0.06	0.14	0.14	0.15	0.15
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.09	0.00	0.04	0.10	0.08	0.08	0.13	0.17	0.05	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.05	0.17	0.13
C3'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.18	0.00	0.23	0.00	0.25	0.18	0.23	0.16	0.27	0.22	0.14	0.01	0.00	0.01	0.17	0.17	0.06	0.12
C4	0.00	0.01	0.09	0.18	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.03	0.03	0.13	0.14	0.11	0.12
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.10	0.06	0.03	0.09	0.11	0.06	0.18	0.01	0.00	0.01	0.07	0.04	0.01
C5	0.00	0.01	0.04	0.23	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.06	0.01	0.18	0.19	0.18	0.18
C5'	0.02	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.12	0.11	0.10	0.04	0.14	0.14	0.06	0.06	0.11	0.01	0.00	0.09	0.06	0.01
C6	0.00	0.01	0.08	0.25	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.21	0.07	0.02	0.20	0.20	0.23	0.22
C8	0.00	0.02	0.08	0.18	0.01	0.10	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.20	0.06	0.04	0.15	0.18	0.09	0.12
N1	0.00	0.00	0.13	0.23	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.02	0.04	0.18	0.17	0.21	0.19
N3	0.00	0.00	0.17	0.16	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.05	0.11	0.12	0.10	0.10
N6	0.01	0.02	0.05	0.27	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.24	0.12	0.02	0.22	0.22	0.27	0.25
N7	0.01	0.01	0.04	0.22	0.00	0.11	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.23	0.10	0.03	0.20	0.22	0.18	0.19
N9	0.00	0.01	0.00	0.14	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.04	0.00	0.10	0.12	0.04	0.07
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.15	0.18	0.21	0.06	0.21	0.20	0.16	0.07	0.24	0.23	0.13	0.00	0.03	0.13	0.05	0.04	0.09	0.06
O3'	0.19	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.11	0.07	0.06	0.02	0.10	0.12	0.10	0.04	0.03	0.00	0.12	0.24	0.25	0.29	0.26
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.05	0.02	0.03	0.00	0.13	0.12	0.00	0.05	0.05	0.07	0.05
O5'	0.01	0.14	0.04	0.17	0.13	0.01	0.18	0.00	0.20	0.15	0.18	0.11	0.22	0.20	0.10	0.05	0.24	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.06	0.14	0.05	0.17	0.14	0.07	0.19	0.09	0.20	0.18	0.17	0.12	0.22	0.22	0.12	0.04	0.25	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.15	0.17	0.06	0.11	0.04	0.18	0.06	0.23	0.09	0.21	0.10	0.27	0.18	0.04	0.09	0.29	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.15	0.13	0.12	0.12	0.01	0.18	0.01	0.22	0.12	0.19	0.10	0.25	0.19	0.07	0.06	0.26	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.03	0.24	0.25	0.05	0.21	0.01	0.36	0.06	0.06	0.05	0.11	0.04	0.18	0.45	0.38	0.15	0.21	0.17	0.21
C2	0.47	0.44	0.14	0.01	0.38	0.43	0.38	0.49	0.42	0.45	0.41	0.34	0.46	0.19	0.25	0.67	0.26	0.06	0.15	0.16
C2'	0.51	0.46	0.13	0.08	0.40	0.52	0.44	0.62	0.48	0.48	0.42	0.35	0.47	0.19	0.17	0.75	0.43	0.34	0.10	0.44
C3'	0.29	0.17	0.09	0.13	0.05	0.34	0.10	0.45	0.18	0.21	0.10	0.05	0.20	0.03	0.34	0.55	0.20	0.18	0.19	0.21
C4	0.26	0.18	0.11	0.17	0.13	0.30	0.16	0.43	0.21	0.21	0.15	0.08	0.20	0.05	0.42	0.51	0.19	0.11	0.18	0.18
C4'	0.07	0.23	0.45	0.43	0.32	0.07	0.24	0.24	0.15	0.16	0.31	0.40	0.23	0.37	0.62	0.24	0.01	0.13	0.31	0.09
C5	0.27	0.19	0.11	0.19	0.13	0.31	0.16	0.44	0.21	0.22	0.15	0.08	0.21	0.05	0.46	0.53	0.18	0.08	0.18	0.16
C5'	0.08	0.28	0.48	0.45	0.37	0.09	0.28	0.27	0.18	0.18	0.36	0.47	0.27	0.40	0.65	0.25	0.02	0.15	0.32	0.10
C6	0.38	0.32	0.02	0.11	0.25	0.38	0.26	0.46	0.31	0.34	0.28	0.20	0.35	0.08	0.40	0.62	0.21	0.01	0.17	0.14
C8	0.13	0.03	0.27	0.29	0.06	0.23	0.01	0.40	0.07	0.06	0.06	0.12	0.05	0.20	0.54	0.43	0.15	0.17	0.19	0.19
N1	0.50	0.46	0.14	0.00	0.38	0.45	0.37	0.49	0.42	0.46	0.42	0.34	0.48	0.21	0.29	0.70	0.25	0.09	0.15	0.13
N3	0.35	0.30	0.01	0.08	0.24	0.34	0.26	0.44	0.30	0.31	0.27	0.20	0.31	0.07	0.31	0.56	0.22	0.05	0.16	0.19
N6	0.40	0.34	0.03	0.11	0.26	0.39	0.26	0.45	0.31	0.35	0.30	0.21	0.37	0.10	0.41	0.63	0.20	0.03	0.16	0.12
N7	0.19	0.08	0.22	0.27	0.02	0.27	0.06	0.42	0.12	0.12	0.04	0.05	0.09	0.15	0.53	0.47	0.16	0.13	0.19	0.17
N9	0.16	0.06	0.22	0.25	0.02	0.24	0.05	0.39	0.10	0.10	0.03	0.07	0.07	0.15	0.48	0.43	0.16	0.17	0.18	0.20
O2'	0.49	0.52	0.14	0.07	0.53	0.42	0.54	0.49	0.53	0.51	0.53	0.52	0.51	0.16	0.18	0.66	0.37	0.23	0.14	0.38
O3'	0.01	0.10	0.36	0.41	0.21	0.03	0.19	0.11	0.11	0.07	0.16	0.30	0.06	0.27	0.61	0.25	0.14	0.18	0.54	0.14
O4'	0.17	0.33	0.53	0.50	0.39	0.02	0.30	0.19	0.23	0.25	0.39	0.46	0.33	0.47	0.69	0.15	0.04	0.13	0.33	0.07
O5'	0.04	0.25	0.47	0.45	0.35	0.13	0.25	0.33	0.14	0.15	0.34	0.45	0.24	0.39	0.67	0.31	0.05	0.18	0.29	0.14
OP1	0.19	0.44	0.63	0.56	0.53	0.06	0.39	0.30	0.28	0.31	0.54	0.64	0.45	0.56	0.78	0.21	0.02	0.23	0.29	0.14
OP2	0.07	0.15	0.39	0.39	0.28	0.21	0.18	0.38	0.07	0.06	0.26	0.39	0.14	0.30	0.63	0.42	0.09	0.17	0.29	0.15
P	0.01	0.22	0.45	0.43	0.33	0.17	0.23	0.37	0.12	0.12	0.32	0.44	0.21	0.36	0.67	0.36	0.08	0.19	0.28	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02
C2	0.01	0.00	0.06	0.09	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.05	0.06	0.09	0.07
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.05	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.10	0.00	0.07	0.00	0.05	0.05	0.11	0.11	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.03
C4	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.01	0.07	0.11	0.15	0.11
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.03	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00
C5	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.01	0.07	0.11	0.14	0.12
C5'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01
C6	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.06	0.08	0.09	0.09
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.05	0.07	0.06
N3	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.04	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.01	0.06	0.09	0.13	0.10
N4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.00	0.07	0.12	0.16	0.12
O2	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.02	0.04	0.04	0.08	0.06
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02
O3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.12	0.00	0.09	0.01	0.05	0.05	0.12	0.13	0.09	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.03	0.04
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.04
O5'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.06	0.04	0.06	0.07	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.01	0.06	0.05	0.06	0.11	0.02	0.11	0.02	0.08	0.05	0.09	0.12	0.04	0.04	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.02	0.09	0.03	0.02	0.15	0.01	0.14	0.00	0.09	0.07	0.13	0.16	0.08	0.03	0.03	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.07	0.02	0.03	0.11	0.00	0.12	0.01	0.09	0.06	0.10	0.12	0.06	0.02	0.04	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00